Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400067960
CDS Infomation

pacid=37456728 polypeptide=PGSC0003DMP400045899 locus=PGSC0003DMG400026431 ID=PGSC0003DMT400067960.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAGGGAGTATCTGATAATGTTCATGGTGTTATATTAGCAATATCATCCAGTATTTTT
ATTGGTTCCAGCTTTGTTATCAAAAAACAAGGTCTAAAGAAGGCTGGCGCAAATGGAAAA
AGAGCAGGTTCAGGAGGCCATTCCTACTTGTTGGAACCTTGTTGGTGGGCCGGAATGTTA
TCTATGATTGTTGGAGAGGGAGCTAACTTTGCAGCTTATGCATATGCCCCAGCAGTACTA
GTGACACCTTTAGGGGCTTTAAGTATGATTGTCAGTGCAGTGTTAGCCCATTTTATTTTG
AAGGAGAGATTGCATATGTTTGGTATAGTTGGTTGTCTCCTCTGCGTGGTTGGGTCTGTC
ACTATAGTCTTACATGCCCCATTAGAGAAGAGTATTCAATCTGTCAAGGATGTTTGGAAC
CTAGCAACAGAGCCAGGGTTCCTCGCCTACACTTTCACGGTTCTGGTGCTGATACTTATC
CTTATTGTCCGGTATGTGCCTCGTTTTGGGCGGTCTCATTTGGTTGTCTACATCGGGATC
TGTTCACTTGCGGGTTCTCTCACGGTTATGGGTGTCAAAGCAATAGGAATTGCTATAAAG
CTCACAATTGGAGGGCAAAATCAATTCAAGTATTTTGAGACATGGGTTTTTATAGTGCTT
GTCCTCATCTTTTGCCTTTTGCAGCTGAACTATTTGAACAAGGCACTTGACACATTTAAC
ACCGCTGTGGTTTCCCCGATATACTACGTCATGTTTACAACACTGACCATTCTTGCAAGC
ATGATAATGTTTAAGGACTATGTTCATCAAAATACGACACAGATAATTACAGAGTTATGT
GGTTTTGTAACTATCCTCTGTGGTACTTTTCTCCTTCACAAAACAAAGGACATGGGAAAC
AATCCATCCATACCATTACCTGTTATCGTTCCAACAACAGATATGGATTATAAGCAAGAA
AGTGAAACCACAAAAGTTACAGTTGAGGTTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400045899
PEP Infomation

pacid=37456728 transcript=PGSC0003DMT400067960 locus=PGSC0003DMG400026431 ID=PGSC0003DMT400067960.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MEGVSDNVHGVILAISSSIFIGSSFVIKKQGLKKAGANGKRAGSGGHSYLLEPCWWAGML
SMIVGEGANFAAYAYAPAVLVTPLGALSMIVSAVLAHFILKERLHMFGIVGCLLCVVGSV
TIVLHAPLEKSIQSVKDVWNLATEPGFLAYTFTVLVLILILIVRYVPRFGRSHLVVYIGI
CSLAGSLTVMGVKAIGIAIKLTIGGQNQFKYFETWVFIVLVLIFCLLQLNYLNKALDTFN
TAVVSPIYYVMFTTLTILASMIMFKDYVHQNTTQIITELCGFVTILCGTFLLHKTKDMGN
NPSIPLPVIVPTTDMDYKQESETTKVTVEV*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400067960
Transcript Infomation

pacid=37456728 locus=PGSC0003DMG400026431 ID=PGSC0003DMT400067960.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAGGGAGTATCTGATAATGTTCATGGTGTTATATTAGCAATATCATCCAGTATTTTT
ATTGGTTCCAGCTTTGTTATCAAAAAACAAGGTCTAAAGAAGGCTGGCGCAAATGGAAAA
AGAGCAGGTTCAGGAGGCCATTCCTACTTGTTGGAACCTTGTTGGTGGGCCGGAATGTTA
TCTATGATTGTTGGAGAGGGAGCTAACTTTGCAGCTTATGCATATGCCCCAGCAGTACTA
GTGACACCTTTAGGGGCTTTAAGTATGATTGTCAGTGCAGTGTTAGCCCATTTTATTTTG
AAGGAGAGATTGCATATGTTTGGTATAGTTGGTTGTCTCCTCTGCGTGGTTGGGTCTGTC
ACTATAGTCTTACATGCCCCATTAGAGAAGAGTATTCAATCTGTCAAGGATGTTTGGAAC
CTAGCAACAGAGCCAGGGTTCCTCGCCTACACTTTCACGGTTCTGGTGCTGATACTTATC
CTTATTGTCCGGTATGTGCCTCGTTTTGGGCGGTCTCATTTGGTTGTCTACATCGGGATC
TGTTCACTTGCGGGTTCTCTCACGGTTATGGGTGTCAAAGCAATAGGAATTGCTATAAAG
CTCACAATTGGAGGGCAAAATCAATTCAAGTATTTTGAGACATGGGTTTTTATAGTGCTT
GTCCTCATCTTTTGCCTTTTGCAGCTGAACTATTTGAACAAGGCACTTGACACATTTAAC
ACCGCTGTGGTTTCCCCGATATACTACGTCATGTTTACAACACTGACCATTCTTGCAAGC
ATGATAATGTTTAAGGACTATGTTCATCAAAATACGACACAGATAATTACAGAGTTATGT
GGTTTTGTAACTATCCTCTGTGGTACTTTTCTCCTTCACAAAACAAAGGACATGGGAAAC
AATCCATCCATACCATTACCTGTTATCGTTCCAACAACAGATATGGATTATAAGCAAGAA
AGTGAAACCACAAAAGTTACAGTTGAGGTTTGA