Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400067458
CDS Infomation

pacid=37467799 polypeptide=PGSC0003DMP400045514 locus=PGSC0003DMG400026221 ID=PGSC0003DMT400067458.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGATCGTTCACTTAAATATTCTTGCATTTTTATGTGCATGAATATTATGCTTATGCCA
GCATTTTCCTACAGCCAAACCTTAGTTTCCAAGGCATCATTTTATAGTACTTCTGATGGC
ATGGGAACACCATCTGGAGCATGTGGTTATGGAGACTATGGTAAAGATGTGAACAATGGT
GAAGTGTGCACAGCCTCTAGGCGTCTCTACAGAAATGGAGTTGGTTGTGGTGCATGTTAC
CAGGTTAGGTGCAAGAACAATGCATTGTGTAGTGAAGAGGGTACAAAAGTTGTGGTGACA
GACAGTGCAGATGGACAAGAAACAGATTTAATTCTTAGCTTTAAAGCCTATGCAAAATTA
GCTAAAACTCCAAGTTTGGCAGCTCATTTATGTGGAAAAGGGGTTGTTGACATAGAATAT
AGAAGAGTTTCTTGTGGTTATGGTGGAAATCTTATGGTTAAAATTCATGAACATAGCAAG
TATGCTGATTATCTTGCTATTGTTGTATTGAACCAAGGTGGTGCCACCGACATCCATGCT
GTAGAAATCTATGAGGAAGAGAGTCAACAATGGATATCAATGAGAAAGGCATATGGGGCA
GTGTGGGACTTGTCAAATCCACCATGTGGAGACCTTAAAGTAAGGTTTCTAACAAGTACA
AGTGTTGAAAGCAAATGGGTACAATCAGACAAAGCTGTTATTCCTGCTCAATGGAAAGTT
GGACTTACAATTGAAACTGACATTCAGCTTACTTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400045514
PEP Infomation

pacid=37467799 transcript=PGSC0003DMT400067458 locus=PGSC0003DMG400026221 ID=PGSC0003DMT400067458.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MDRSLKYSCIFMCMNIMLMPAFSYSQTLVSKASFYSTSDGMGTPSGACGYGDYGKDVNNG
EVCTASRRLYRNGVGCGACYQVRCKNNALCSEEGTKVVVTDSADGQETDLILSFKAYAKL
AKTPSLAAHLCGKGVVDIEYRRVSCGYGGNLMVKIHEHSKYADYLAIVVLNQGGATDIHA
VEIYEEESQQWISMRKAYGAVWDLSNPPCGDLKVRFLTSTSVESKWVQSDKAVIPAQWKV
GLTIETDIQLT*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400067458
Transcript Infomation

pacid=37467799 locus=PGSC0003DMG400026221 ID=PGSC0003DMT400067458.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGATCGTTCACTTAAATATTCTTGCATTTTTATGTGCATGAATATTATGCTTATGCCA
GCATTTTCCTACAGCCAAACCTTAGTTTCCAAGGCATCATTTTATAGTACTTCTGATGGC
ATGGGAACACCATCTGGAGCATGTGGTTATGGAGACTATGGTAAAGATGTGAACAATGGT
GAAGTGTGCACAGCCTCTAGGCGTCTCTACAGAAATGGAGTTGGTTGTGGTGCATGTTAC
CAGGTTAGGTGCAAGAACAATGCATTGTGTAGTGAAGAGGGTACAAAAGTTGTGGTGACA
GACAGTGCAGATGGACAAGAAACAGATTTAATTCTTAGCTTTAAAGCCTATGCAAAATTA
GCTAAAACTCCAAGTTTGGCAGCTCATTTATGTGGAAAAGGGGTTGTTGACATAGAATAT
AGAAGAGTTTCTTGTGGTTATGGTGGAAATCTTATGGTTAAAATTCATGAACATAGCAAG
TATGCTGATTATCTTGCTATTGTTGTATTGAACCAAGGTGGTGCCACCGACATCCATGCT
GTAGAAATCTATGAGGAAGAGAGTCAACAATGGATATCAATGAGAAAGGCATATGGGGCA
GTGTGGGACTTGTCAAATCCACCATGTGGAGACCTTAAAGTAAGGTTTCTAACAAGTACA
AGTGTTGAAAGCAAATGGGTACAATCAGACAAAGCTGTTATTCCTGCTCAATGGAAAGTT
GGACTTACAATTGAAACTGACATTCAGCTTACTTAA