Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400067353
CDS Infomation

pacid=37433648 polypeptide=PGSC0003DMP400045440 locus=PGSC0003DMG400026186 ID=PGSC0003DMT400067353.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCCAGAGGCTCCTTCAATAGATGATGGAAATTTTGATGAAAATAATAAAAAACTTCTT
CAATTCTTTGAAGACATCACTAGTAATGCTAATGATGTTCAAAAAAATGTTCTTAATGAG
ATACTTTCTCGTAATTCTGGTGTTGAGTACTTACAAAGGCATGGCCTTATTATAAATGAC
AACAATGATGACTATGAAAATTTCAAAAAAATCATGCCTATTGTTACTTATGAAGATCTC
AAACCCGATATTGATCGTATCGCGGATGGTGATCGTTCATCCATCCTTTGTTCTCAACCA
ATTTCCGAGTTCCTAACAAGTTCTGGCACGTCTGGGGGAGAGAGGAAATTGATGCCAACA
ATTGAAGAAGAGCTAGGAAGAAGGTCATTATTGTACAGCCTTTTAATGCCAGTAATGAAT
AAATTTGTGCCAGATTTACAAAAAGGCAAAGGAATGTACTTTTTATTTATAAAATCAGAA
GCAAAAACTCCAGGTGGTTTATTAGCTCGTCCAGTTTTAACAAGTTACTATAAAAGTTCA
TATTTCAAAAAAAGACCATATGATCCCTACACAAATTACACAAGCCCAAATGAAACAATT
CTTTGTTTAGATTCATACCAAAGTATGTATTCCCAAATGCTTTGTGGTCTTTGTCAAAAC
ACTCAAGTTTTACGAGTTGGTGCGGTTTTCGCTTCAGGTTTTATTCGTGCTATTCATTTC
CTTGAAAAGCACTGGCCTATACTTTGTCGGGATATAAAAACTGGAACGTTGAATCCACAA
ATAAATGACCCTATGGTACGCGAATCCGTGATGAAAATACTCAAACCGGATCCGGACCTT
GCTGAATTTATTGAAATGGAATGTAGTAAAGAGTCATGGAAAGGGATTATTCCAAGATTA
TGGCCTAATACAAAATACGTCGATGTAATTGTTACTGGGACTATGTCACAATATATTCCA
ACTCTTAAATACTATGGTAATGATCTACCACTTGTTTGTACCATGTACGCTTCTTCTGAG
TGTTACTTTGGTATAAATCTTGATCCTCTTTGTAAACCTAGTGAAGTTGCTTATACTCTC
ATACCTACCATGGGATTTTTCGAGTTCTTGCCCGTTGCTCGTGATGATCAAGGGCCAGAA
AAATCTAACAAGTATGACAAAGATAATTTGGTTGATCTTGTTGATGTCAAACTTGGACAT
GAGTACGAGCTCGTGGTCACCACTTATGCAGGATTGTATCGTTATCGTGTTGGTGACATA
CTTAAAGTTGCTGGATTTAAAAACAAGGCTCCTCAATTTCATTTTGTGTGTAGAAAGAAT
GTTGCATTAAGCATTGATTCAGACAAAACGGATGAAGTTGAGCTACACGACGCCGTTTTA
AAAGCATCGACTCATCTTGTACCATTTGAAACATCATTAACAGAATATACAAGTTATGCA
GACACATCGACAAATCCAGGACACTACGTTTTGTACTGGGAAATCAACAATGATGAATCC
GATGAAACATTAATCCCGACATCAGTGTTTGAAGATTGTTGTCTAACGATTGAAGAATCG
TTAAACAGTGTCTATCGACAGTGTCGCGTTTCGGATAAATCGATTGGTCCCCTTGAAATT
AAGGTAGTTGAGAATGGCACATTTGATAAGCTTATGGATTATGCTATTAGCAATGGTGCT
TCCATTAATCAGTACAAAGCTCCACGGTGTGTTAACTATGCTCCAATTATTGAGTTATTG
AATTCGAGAGTTGTTTCGAGTTATTTTAGCCCGAAATGTCCTAAATGGGTTCCAGGTCAG
AAGCAATGGTTATCAAGCTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400045440
PEP Infomation

pacid=37433648 transcript=PGSC0003DMT400067353 locus=PGSC0003DMG400026186 ID=PGSC0003DMT400067353.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MPEAPSIDDGNFDENNKKLLQFFEDITSNANDVQKNVLNEILSRNSGVEYLQRHGLIIND
NNDDYENFKKIMPIVTYEDLKPDIDRIADGDRSSILCSQPISEFLTSSGTSGGERKLMPT
IEEELGRRSLLYSLLMPVMNKFVPDLQKGKGMYFLFIKSEAKTPGGLLARPVLTSYYKSS
YFKKRPYDPYTNYTSPNETILCLDSYQSMYSQMLCGLCQNTQVLRVGAVFASGFIRAIHF
LEKHWPILCRDIKTGTLNPQINDPMVRESVMKILKPDPDLAEFIEMECSKESWKGIIPRL
WPNTKYVDVIVTGTMSQYIPTLKYYGNDLPLVCTMYASSECYFGINLDPLCKPSEVAYTL
IPTMGFFEFLPVARDDQGPEKSNKYDKDNLVDLVDVKLGHEYELVVTTYAGLYRYRVGDI
LKVAGFKNKAPQFHFVCRKNVALSIDSDKTDEVELHDAVLKASTHLVPFETSLTEYTSYA
DTSTNPGHYVLYWEINNDESDETLIPTSVFEDCCLTIEESLNSVYRQCRVSDKSIGPLEI
KVVENGTFDKLMDYAISNGASINQYKAPRCVNYAPIIELLNSRVVSSYFSPKCPKWVPGQ
KQWLSS*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400067353
Transcript Infomation

pacid=37433648 locus=PGSC0003DMG400026186 ID=PGSC0003DMT400067353.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCCAGAGGCTCCTTCAATAGATGATGGAAATTTTGATGAAAATAATAAAAAACTTCTT
CAATTCTTTGAAGACATCACTAGTAATGCTAATGATGTTCAAAAAAATGTTCTTAATGAG
ATACTTTCTCGTAATTCTGGTGTTGAGTACTTACAAAGGCATGGCCTTATTATAAATGAC
AACAATGATGACTATGAAAATTTCAAAAAAATCATGCCTATTGTTACTTATGAAGATCTC
AAACCCGATATTGATCGTATCGCGGATGGTGATCGTTCATCCATCCTTTGTTCTCAACCA
ATTTCCGAGTTCCTAACAAGTTCTGGCACGTCTGGGGGAGAGAGGAAATTGATGCCAACA
ATTGAAGAAGAGCTAGGAAGAAGGTCATTATTGTACAGCCTTTTAATGCCAGTAATGAAT
AAATTTGTGCCAGATTTACAAAAAGGCAAAGGAATGTACTTTTTATTTATAAAATCAGAA
GCAAAAACTCCAGGTGGTTTATTAGCTCGTCCAGTTTTAACAAGTTACTATAAAAGTTCA
TATTTCAAAAAAAGACCATATGATCCCTACACAAATTACACAAGCCCAAATGAAACAATT
CTTTGTTTAGATTCATACCAAAGTATGTATTCCCAAATGCTTTGTGGTCTTTGTCAAAAC
ACTCAAGTTTTACGAGTTGGTGCGGTTTTCGCTTCAGGTTTTATTCGTGCTATTCATTTC
CTTGAAAAGCACTGGCCTATACTTTGTCGGGATATAAAAACTGGAACGTTGAATCCACAA
ATAAATGACCCTATGGTACGCGAATCCGTGATGAAAATACTCAAACCGGATCCGGACCTT
GCTGAATTTATTGAAATGGAATGTAGTAAAGAGTCATGGAAAGGGATTATTCCAAGATTA
TGGCCTAATACAAAATACGTCGATGTAATTGTTACTGGGACTATGTCACAATATATTCCA
ACTCTTAAATACTATGGTAATGATCTACCACTTGTTTGTACCATGTACGCTTCTTCTGAG
TGTTACTTTGGTATAAATCTTGATCCTCTTTGTAAACCTAGTGAAGTTGCTTATACTCTC
ATACCTACCATGGGATTTTTCGAGTTCTTGCCCGTTGCTCGTGATGATCAAGGGCCAGAA
AAATCTAACAAGTATGACAAAGATAATTTGGTTGATCTTGTTGATGTCAAACTTGGACAT
GAGTACGAGCTCGTGGTCACCACTTATGCAGGATTGTATCGTTATCGTGTTGGTGACATA
CTTAAAGTTGCTGGATTTAAAAACAAGGCTCCTCAATTTCATTTTGTGTGTAGAAAGAAT
GTTGCATTAAGCATTGATTCAGACAAAACGGATGAAGTTGAGCTACACGACGCCGTTTTA
AAAGCATCGACTCATCTTGTACCATTTGAAACATCATTAACAGAATATACAAGTTATGCA
GACACATCGACAAATCCAGGACACTACGTTTTGTACTGGGAAATCAACAATGATGAATCC
GATGAAACATTAATCCCGACATCAGTGTTTGAAGATTGTTGTCTAACGATTGAAGAATCG
TTAAACAGTGTCTATCGACAGTGTCGCGTTTCGGATAAATCGATTGGTCCCCTTGAAATT
AAGGTAGTTGAGAATGGCACATTTGATAAGCTTATGGATTATGCTATTAGCAATGGTGCT
TCCATTAATCAGTACAAAGCTCCACGGTGTGTTAACTATGCTCCAATTATTGAGTTATTG
AATTCGAGAGTTGTTTCGAGTTATTTTAGCCCGAAATGTCCTAAATGGGTTCCAGGTCAG
AAGCAATGGTTATCAAGCTAA