Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400067008
CDS Infomation

pacid=37439951 polypeptide=PGSC0003DMP400045193 locus=PGSC0003DMG402026044 ID=PGSC0003DMT400067008.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAATGATAGAAAAACCTTTGGGGTGTGGAGCAGAATAGAGAGAGAATGCCATGTTTTG
CTTCAACGGAGGAACTCCAAAGCCACTCTTCTACGTATTCACGCCATAATGCTTCGAAAT
GCCATTGAAAATAACGTCAGTCTACTCACCATGCTCATTTCAAGCTTCTCCGTCAACGAC
CCAGTTGCTGGAATTAGCCATGCACGCCGCATGTTCGACAAAAGTCTCCAAAAGGACAAG
ACTTTCCTCTGTAACGCCATGATAAAATCCCACATGGGTGTTGGTCAATTCGCCGACTCA
ACATTTCTGTACAGAGATTTATTAAGACATACAAGTTTTAAACCCGATAATTACACGCTT
TCGAGCCTTTCCAAGTGTTGTGGCGCAAGATTGGTGTTGTGGGAAGGCTTGGAAATTCAT
AATCATGTGTTGAAATGTGGGTTTGCTTCGAATTTGTTTGTGGCCACTTCGTTGGTTGAT
ATGTATGGGAAGTTTGGTGAAATGGATTTTGCTAGGAAGTTGTTTGATGAAATGCCCCAG
AGAAGTCCAGTCTCGTGGACAGCTTTAATTGGAGGTTATTTGAAGTGCAGATGTATGGGT
ATTGCTGAAGGACTTTTTGATGCAATGCCTGAGAAAGATGTTGCTGCGTTCAATGTGATG
ATTGATGCTTACGTGAAGAAAGGAGATATGCTGTCAGCAAATAGATTGTTTTGGGCAATG
CCGGAGAGAAATGTGATTTCTTGGACTAGTATGATTGATGGGCACTGCAGTAATGGTAAT
GTAAGTGAAGCCAGGGTGTTATTTGATGTAATGCCGCAAAGGAATTTGTACTCTTGGAAC
GCAATGATTGGTGGATACTGTCAAAACAAACAGCCACAAGAGGCTTTGAAGTTGTTTCAT
GAGCTGCAGATGGGGACGACATTGGAGCCGGATGGTGTTACTGTTGTCAGTGTACTTCCC
GCTATTGCTGATTTGGGTGCTTTAGATTTGGGTAACTGGATTCACCAGTATGTGAAGAGG
AGGAAATTAGATAGATCTTCAAATGTTTGCACTGCTTTAGTTGATATGTATGCCAAGTGT
GGGGAAATTGCAAAAGCCAGGGAATTTTTCGATGAGATAAAAGTAAAAGAGTCATCAAGT
TGGAATGCTTTAATTAATGGGTTGGCGATCAATGGATCTGCTAAGGAAGCATTGGAGGTG
TTTGAGAAGATGAAGAGTAAAGGATACGAGCCGAATGAGATTACTATGCTTGGTGTTTTG
TCAGCTTGCAACCATGGTGGATTGGTGGAGGAAGGCAAGAAATGGTTTGTCGAAATGGAG
AAATATGGGCTCACTCCACAAATTGAGCATTATGGTTGTCTGGTTGATCTCTTGGGGAGG
TCAGGGTGTTTGGAGGAAGCCGAAAACTTGATTGAGACCATGCCTTATGAGGCCAATGGA
ATAATATTGAGTTCCTTTCTATTTGCATGTGGTTATGCCAAAGATGTTACAAGGGCTGAG
AAGGTCAAGAAAAAAGCAATTGAGATGGAACCGTGGAATGATGGGATCTACATAATGCTA
AGGAACATGTATGCCACTGATAAGAGGTGGAGTGATGTTGAAGACATTAAGGGGCGGATG
CGGAGAGAAGGGGCAAAAAAGGAGGCAGGTTGCAGTACCATTGAAGTTAATGGTATGGTT
TGTGAATTTATTGCTGGGGATAAAATACATGCACAGCGTGAGGAAATACATCTTCTATTG
GAACATATGCTGTTGTACATGCGAGGTTTGGATACACCTTATAGTAATGATATTGGATTG
GCTGAATTATGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400045193
PEP Infomation

pacid=37439951 transcript=PGSC0003DMT400067008 locus=PGSC0003DMG402026044 ID=PGSC0003DMT400067008.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MNDRKTFGVWSRIERECHVLLQRRNSKATLLRIHAIMLRNAIENNVSLLTMLISSFSVND
PVAGISHARRMFDKSLQKDKTFLCNAMIKSHMGVGQFADSTFLYRDLLRHTSFKPDNYTL
SSLSKCCGARLVLWEGLEIHNHVLKCGFASNLFVATSLVDMYGKFGEMDFARKLFDEMPQ
RSPVSWTALIGGYLKCRCMGIAEGLFDAMPEKDVAAFNVMIDAYVKKGDMLSANRLFWAM
PERNVISWTSMIDGHCSNGNVSEARVLFDVMPQRNLYSWNAMIGGYCQNKQPQEALKLFH
ELQMGTTLEPDGVTVVSVLPAIADLGALDLGNWIHQYVKRRKLDRSSNVCTALVDMYAKC
GEIAKAREFFDEIKVKESSSWNALINGLAINGSAKEALEVFEKMKSKGYEPNEITMLGVL
SACNHGGLVEEGKKWFVEMEKYGLTPQIEHYGCLVDLLGRSGCLEEAENLIETMPYEANG
IILSSFLFACGYAKDVTRAEKVKKKAIEMEPWNDGIYIMLRNMYATDKRWSDVEDIKGRM
RREGAKKEAGCSTIEVNGMVCEFIAGDKIHAQREEIHLLLEHMLLYMRGLDTPYSNDIGL
AEL*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400067008
Transcript Infomation

pacid=37439951 locus=PGSC0003DMG402026044 ID=PGSC0003DMT400067008.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAATGATAGAAAAACCTTTGGGGTGTGGAGCAGAATAGAGAGAGAATGCCATGTTTTG
CTTCAACGGAGGAACTCCAAAGCCACTCTTCTACGTATTCACGCCATAATGCTTCGAAAT
GCCATTGAAAATAACGTCAGTCTACTCACCATGCTCATTTCAAGCTTCTCCGTCAACGAC
CCAGTTGCTGGAATTAGCCATGCACGCCGCATGTTCGACAAAAGTCTCCAAAAGGACAAG
ACTTTCCTCTGTAACGCCATGATAAAATCCCACATGGGTGTTGGTCAATTCGCCGACTCA
ACATTTCTGTACAGAGATTTATTAAGACATACAAGTTTTAAACCCGATAATTACACGCTT
TCGAGCCTTTCCAAGTGTTGTGGCGCAAGATTGGTGTTGTGGGAAGGCTTGGAAATTCAT
AATCATGTGTTGAAATGTGGGTTTGCTTCGAATTTGTTTGTGGCCACTTCGTTGGTTGAT
ATGTATGGGAAGTTTGGTGAAATGGATTTTGCTAGGAAGTTGTTTGATGAAATGCCCCAG
AGAAGTCCAGTCTCGTGGACAGCTTTAATTGGAGGTTATTTGAAGTGCAGATGTATGGGT
ATTGCTGAAGGACTTTTTGATGCAATGCCTGAGAAAGATGTTGCTGCGTTCAATGTGATG
ATTGATGCTTACGTGAAGAAAGGAGATATGCTGTCAGCAAATAGATTGTTTTGGGCAATG
CCGGAGAGAAATGTGATTTCTTGGACTAGTATGATTGATGGGCACTGCAGTAATGGTAAT
GTAAGTGAAGCCAGGGTGTTATTTGATGTAATGCCGCAAAGGAATTTGTACTCTTGGAAC
GCAATGATTGGTGGATACTGTCAAAACAAACAGCCACAAGAGGCTTTGAAGTTGTTTCAT
GAGCTGCAGATGGGGACGACATTGGAGCCGGATGGTGTTACTGTTGTCAGTGTACTTCCC
GCTATTGCTGATTTGGGTGCTTTAGATTTGGGTAACTGGATTCACCAGTATGTGAAGAGG
AGGAAATTAGATAGATCTTCAAATGTTTGCACTGCTTTAGTTGATATGTATGCCAAGTGT
GGGGAAATTGCAAAAGCCAGGGAATTTTTCGATGAGATAAAAGTAAAAGAGTCATCAAGT
TGGAATGCTTTAATTAATGGGTTGGCGATCAATGGATCTGCTAAGGAAGCATTGGAGGTG
TTTGAGAAGATGAAGAGTAAAGGATACGAGCCGAATGAGATTACTATGCTTGGTGTTTTG
TCAGCTTGCAACCATGGTGGATTGGTGGAGGAAGGCAAGAAATGGTTTGTCGAAATGGAG
AAATATGGGCTCACTCCACAAATTGAGCATTATGGTTGTCTGGTTGATCTCTTGGGGAGG
TCAGGGTGTTTGGAGGAAGCCGAAAACTTGATTGAGACCATGCCTTATGAGGCCAATGGA
ATAATATTGAGTTCCTTTCTATTTGCATGTGGTTATGCCAAAGATGTTACAAGGGCTGAG
AAGGTCAAGAAAAAAGCAATTGAGATGGAACCGTGGAATGATGGGATCTACATAATGCTA
AGGAACATGTATGCCACTGATAAGAGGTGGAGTGATGTTGAAGACATTAAGGGGCGGATG
CGGAGAGAAGGGGCAAAAAAGGAGGCAGGTTGCAGTACCATTGAAGTTAATGGTATGGTT
TGTGAATTTATTGCTGGGGATAAAATACATGCACAGCGTGAGGAAATACATCTTCTATTG
GAACATATGCTGTTGTACATGCGAGGTTTGGATACACCTTATAGTAATGATATTGGATTG
GCTGAATTATGA