Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400066769
CDS Infomation

pacid=37440412 polypeptide=PGSC0003DMP400045021 locus=PGSC0003DMG400025959 ID=PGSC0003DMT400066769.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCTTCTTGTAGCAAATTCAAGTCAAGCATGGAACTTAGCACACCCAACACTGACTTTC
TCCCAGAAATGCAAAACACAAGTGGACATTGATCAAATTCATGCTCAATTGATAACCACA
GGACTTGTAAAAAATCCATTTTTGACCACAAAACTTATCTTGAAGTTATCTTCTTCCCCT
CACACACCCATCGTTGAATTTGCTCGGTTTCTCTTCTTTTCTGACGATTTCTGTTGTTCA
AAGCGAAATAAAAAAGACCCATTTCTCTGGAATGTCATAATGAAGTCATTTTCACATGGA
AATGACCCGTATAAGGCTTTTCAAGTGTTCTGTTTGATGCTTGAAAATGGGGTTTTTGTG
GATGAGTATTCATTATCTATAGTTTTGAAAGCGTGTTCAAGAATGGGTTTTGTTAAGCGA
GGAATGCAGGTTCATGGGTTATTGAGGAAAATAGGATTTGGGTCTGATGTGTTTTTGCAA
AATTGTTTGATTTCTATGTATGTGAGGTGTGGGTTTGTTGAGTATGGTCACCACGTGTTT
GATAGAATGTGTTTGAGAGACTCTGTTTCGTATAATACAATGATTGATGGGTATGTGAAA
TGTGGAATGCTTGATGTTGCTTGTCGTTTGTTTGATTTTATGCCAATAGAGATGAGGAAT
TTGGTTTCTTGGAATGCTATGCTTACTGGGTATGTCAAATTGGATCAAGGGTTTGATGTT
GCTTGGGAGCTGTTTGATAAAATGCCCGAAAGGGATTTGGTTTCTTGGAATTTGATGCTT
TATTGTTGTGTTAAAAGTGGAAATGCTGAAAAGGCTACTGCTTTATTTGACATGATACCG
AAGAAGGATGTTGTTAGCTGGGCTATAATGGTAGATGGGTATGCAAAAATTGGTAAGATT
GATATTGCAAGACGTTATTTTGATGACATGCCTGTAAGAGATGTGATTTCCTGCAATGCT
ATTATGGCTGGGTATGTCAAGAATGGCCACTGCCTTGAAGCATTAAAAGTGTTTCATGAT
ATGTTAAGAGGGAATAGTCTTGCTCCTGATAGTACCACCGCATTGCTTGCGCTTTCTGCA
GTTGCAGAGTTAGGTTATATTGATGAAGGGATTGCACTGCACTGTTATATAGAGGAGAAT
GGGTTTCTTGTGGCTGGAAAGCTTGGTGTAGCTTTGATAGACATGTATGCAAAATGTGGC
AGCATAGATAGTGCAATGGGTGTGTTCAATGACATCCAAGAAAAAAATGTTGATCACTGG
AATGCTATGATTGGTGGTTTGGCTATTCATGGCTTTGGGGACGTAGCTTTCGAATTGTTC
ATGGAGATGGAAAGACTTTCACTAGATATAGATGATATCACATTTATTGCGGTTTTGAAT
GCCTGTGCTCATTCTGGACTGGTAAAGGAAGGCATGATCTGTTTTGAGATCATGAGAAGG
GCACATCGTATGGAACCTAAGCTCCAGCATTATGGATGCATGGTTGACATCCTTAGTCGA
GCAGGGCATGTGGAAGAGGCCATAAAATTTGTCGATGAAATGCCAATCCATCCTAATGAT
GTAGTTTGGCGAACATTGCTAAGTTCATGTAGGAATCAAGAAAACGTCCACATTGGAGAC
CCAACGGATAAGCAACTAGTTGGACTAAATTCTCATAATTCAAGTTCCTACGTGCTTTTG
TCTAACATATATGCTCAATTTGGTAAGTGGGACTATGTTAGAAGGGTTCGAACAATAATG
AAAGAAAAGGACCTGAAGAAAACTGTTGGCAGCAGTAGGATTGAGCTCCAAGGAATTGTC
CATGAGTTCTCTGTAGGAGACAAATCCCATGATCAAGTTGAAGAAATATATTCCACATTA
CAGATGGTTTGTGTATAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400045021
PEP Infomation

pacid=37440412 transcript=PGSC0003DMT400066769 locus=PGSC0003DMG400025959 ID=PGSC0003DMT400066769.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MLLVANSSQAWNLAHPTLTFSQKCKTQVDIDQIHAQLITTGLVKNPFLTTKLILKLSSSP
HTPIVEFARFLFFSDDFCCSKRNKKDPFLWNVIMKSFSHGNDPYKAFQVFCLMLENGVFV
DEYSLSIVLKACSRMGFVKRGMQVHGLLRKIGFGSDVFLQNCLISMYVRCGFVEYGHHVF
DRMCLRDSVSYNTMIDGYVKCGMLDVACRLFDFMPIEMRNLVSWNAMLTGYVKLDQGFDV
AWELFDKMPERDLVSWNLMLYCCVKSGNAEKATALFDMIPKKDVVSWAIMVDGYAKIGKI
DIARRYFDDMPVRDVISCNAIMAGYVKNGHCLEALKVFHDMLRGNSLAPDSTTALLALSA
VAELGYIDEGIALHCYIEENGFLVAGKLGVALIDMYAKCGSIDSAMGVFNDIQEKNVDHW
NAMIGGLAIHGFGDVAFELFMEMERLSLDIDDITFIAVLNACAHSGLVKEGMICFEIMRR
AHRMEPKLQHYGCMVDILSRAGHVEEAIKFVDEMPIHPNDVVWRTLLSSCRNQENVHIGD
PTDKQLVGLNSHNSSSYVLLSNIYAQFGKWDYVRRVRTIMKEKDLKKTVGSSRIELQGIV
HEFSVGDKSHDQVEEIYSTLQMVCV*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400066769
Transcript Infomation

pacid=37440412 locus=PGSC0003DMG400025959 ID=PGSC0003DMT400066769.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCTTCTTGTAGCAAATTCAAGTCAAGCATGGAACTTAGCACACCCAACACTGACTTTC
TCCCAGAAATGCAAAACACAAGTGGACATTGATCAAATTCATGCTCAATTGATAACCACA
GGACTTGTAAAAAATCCATTTTTGACCACAAAACTTATCTTGAAGTTATCTTCTTCCCCT
CACACACCCATCGTTGAATTTGCTCGGTTTCTCTTCTTTTCTGACGATTTCTGTTGTTCA
AAGCGAAATAAAAAAGACCCATTTCTCTGGAATGTCATAATGAAGTCATTTTCACATGGA
AATGACCCGTATAAGGCTTTTCAAGTGTTCTGTTTGATGCTTGAAAATGGGGTTTTTGTG
GATGAGTATTCATTATCTATAGTTTTGAAAGCGTGTTCAAGAATGGGTTTTGTTAAGCGA
GGAATGCAGGTTCATGGGTTATTGAGGAAAATAGGATTTGGGTCTGATGTGTTTTTGCAA
AATTGTTTGATTTCTATGTATGTGAGGTGTGGGTTTGTTGAGTATGGTCACCACGTGTTT
GATAGAATGTGTTTGAGAGACTCTGTTTCGTATAATACAATGATTGATGGGTATGTGAAA
TGTGGAATGCTTGATGTTGCTTGTCGTTTGTTTGATTTTATGCCAATAGAGATGAGGAAT
TTGGTTTCTTGGAATGCTATGCTTACTGGGTATGTCAAATTGGATCAAGGGTTTGATGTT
GCTTGGGAGCTGTTTGATAAAATGCCCGAAAGGGATTTGGTTTCTTGGAATTTGATGCTT
TATTGTTGTGTTAAAAGTGGAAATGCTGAAAAGGCTACTGCTTTATTTGACATGATACCG
AAGAAGGATGTTGTTAGCTGGGCTATAATGGTAGATGGGTATGCAAAAATTGGTAAGATT
GATATTGCAAGACGTTATTTTGATGACATGCCTGTAAGAGATGTGATTTCCTGCAATGCT
ATTATGGCTGGGTATGTCAAGAATGGCCACTGCCTTGAAGCATTAAAAGTGTTTCATGAT
ATGTTAAGAGGGAATAGTCTTGCTCCTGATAGTACCACCGCATTGCTTGCGCTTTCTGCA
GTTGCAGAGTTAGGTTATATTGATGAAGGGATTGCACTGCACTGTTATATAGAGGAGAAT
GGGTTTCTTGTGGCTGGAAAGCTTGGTGTAGCTTTGATAGACATGTATGCAAAATGTGGC
AGCATAGATAGTGCAATGGGTGTGTTCAATGACATCCAAGAAAAAAATGTTGATCACTGG
AATGCTATGATTGGTGGTTTGGCTATTCATGGCTTTGGGGACGTAGCTTTCGAATTGTTC
ATGGAGATGGAAAGACTTTCACTAGATATAGATGATATCACATTTATTGCGGTTTTGAAT
GCCTGTGCTCATTCTGGACTGGTAAAGGAAGGCATGATCTGTTTTGAGATCATGAGAAGG
GCACATCGTATGGAACCTAAGCTCCAGCATTATGGATGCATGGTTGACATCCTTAGTCGA
GCAGGGCATGTGGAAGAGGCCATAAAATTTGTCGATGAAATGCCAATCCATCCTAATGAT
GTAGTTTGGCGAACATTGCTAAGTTCATGTAGGAATCAAGAAAACGTCCACATTGGAGAC
CCAACGGATAAGCAACTAGTTGGACTAAATTCTCATAATTCAAGTTCCTACGTGCTTTTG
TCTAACATATATGCTCAATTTGGTAAGTGGGACTATGTTAGAAGGGTTCGAACAATAATG
AAAGAAAAGGACCTGAAGAAAACTGTTGGCAGCAGTAGGATTGAGCTCCAAGGAATTGTC
CATGAGTTCTCTGTAGGAGACAAATCCCATGATCAAGTTGAAGAAATATATTCCACATTA
CAGATGGTTTGTGTATAG