Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400066727
CDS Infomation

pacid=37438208 polypeptide=PGSC0003DMP400044991 locus=PGSC0003DMG400025929 ID=PGSC0003DMT400066727.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTCGATTTTCATCAAGAAACAGATGTTCATACCCTTTACTGGTTTGTAGCTTGGTG
GGGTTCTTGATTTTGCTTCATTTCTCATCTTTGGGTAGTTATAGAGGTATTCAAAAAGGG
CAGATTCAAGAAAGATATGAAGAGTTGGAGGAGATCCAAATTCCTCAACCAAGTGGAAGC
CAATCCTCAGAGGCCAACATGCTAATTGATGAATTCCTTGATAAGTCTTCTAAATTCAGA
CACATTTTCTTTCCTGACATGACAACTAGCATAGACCCTAGAAAGAATACTAAAGATGAC
ACCTTTTACTATTACCCTGGGAGAATTTGGTTAGATACTGATGGACATCCTATTCAAGCT
CATGGGGGTGGGATTCTTTATGATGAAAGATCAAGAATGTATTATTGGTATGGAGAGTAC
AAGAATGGTCCTACTTATCAAGCTCCCGGGAAGAATGTAGCTCGGGTAGACATCATTGGT
GTTGGCTGCTACTCTTCTAAGGATTTGTGGACTTGGAAGAATGAGGGTATTGTACTAGCT
GCGGATGAACACGATGAGGATCATGACCTTCACAAGACTAAAGTATTGGAGAGGCCTAAA
GTGATCTACAATGAGAAGACAGGTAAATATGTAATGTGGATGCACATTGATGATTCAAAT
TATACCAAAGCCTCTGTTGGAATTGCCATGAGCAATTCCCCTACTGGTCCTTTTCGATAT
CTATACAGTAAAAGGCCTCATGGTTTTGAAAGTAGGGACATGACTTTGTTCAAAGATGAT
GATGGTAAGGCATATGTTATTTACTCCTCTGTACACAACAGGGAGCTTCATATTGGTCTT
CTTGACCAAGATTATGTAGATGTTACTAATGTTATGTCAAGGGTTCTCGTGGGGCAGTTT
AGAGAGGCCCCCGCCTTGTTCAAGTACCAAGGAACTTACTACATGATCACATCAGGATGC
AGTGGTTGGGCACCAAATGAGGCACTGGCTCATGTGGCTGAATCAATTATGGGTCCATGG
GAGACTATAGGCAACCCATGTATAGGAGCTAACAAAGTTTTTCGAGTCACCACATTCTTT
GCTCAGAGCACATATGTGCTCCCCATTGCACCTGGTTCGTTTATTTTCATGGCAGATCGC
TGGAATCCAGATGATTTGGGTGATTCTAGATATATATGGCTTCCTTTGAATATGGAAGAA
GTAACTGACAGTCAACGACCAAGAGTATCTATCTTTTGGCACAAAAGATGGAAGCTCTTT
AAAAGTCCAGTATAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400044991
PEP Infomation

pacid=37438208 transcript=PGSC0003DMT400066727 locus=PGSC0003DMG400025929 ID=PGSC0003DMT400066727.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MARFSSRNRCSYPLLVCSLVGFLILLHFSSLGSYRGIQKGQIQERYEELEEIQIPQPSGS
QSSEANMLIDEFLDKSSKFRHIFFPDMTTSIDPRKNTKDDTFYYYPGRIWLDTDGHPIQA
HGGGILYDERSRMYYWYGEYKNGPTYQAPGKNVARVDIIGVGCYSSKDLWTWKNEGIVLA
ADEHDEDHDLHKTKVLERPKVIYNEKTGKYVMWMHIDDSNYTKASVGIAMSNSPTGPFRY
LYSKRPHGFESRDMTLFKDDDGKAYVIYSSVHNRELHIGLLDQDYVDVTNVMSRVLVGQF
REAPALFKYQGTYYMITSGCSGWAPNEALAHVAESIMGPWETIGNPCIGANKVFRVTTFF
AQSTYVLPIAPGSFIFMADRWNPDDLGDSRYIWLPLNMEEVTDSQRPRVSIFWHKRWKLF
KSPV*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400066727
Transcript Infomation

pacid=37438208 locus=PGSC0003DMG400025929 ID=PGSC0003DMT400066727.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTCGATTTTCATCAAGAAACAGATGTTCATACCCTTTACTGGTTTGTAGCTTGGTG
GGGTTCTTGATTTTGCTTCATTTCTCATCTTTGGGTAGTTATAGAGGTATTCAAAAAGGG
CAGATTCAAGAAAGATATGAAGAGTTGGAGGAGATCCAAATTCCTCAACCAAGTGGAAGC
CAATCCTCAGAGGCCAACATGCTAATTGATGAATTCCTTGATAAGTCTTCTAAATTCAGA
CACATTTTCTTTCCTGACATGACAACTAGCATAGACCCTAGAAAGAATACTAAAGATGAC
ACCTTTTACTATTACCCTGGGAGAATTTGGTTAGATACTGATGGACATCCTATTCAAGCT
CATGGGGGTGGGATTCTTTATGATGAAAGATCAAGAATGTATTATTGGTATGGAGAGTAC
AAGAATGGTCCTACTTATCAAGCTCCCGGGAAGAATGTAGCTCGGGTAGACATCATTGGT
GTTGGCTGCTACTCTTCTAAGGATTTGTGGACTTGGAAGAATGAGGGTATTGTACTAGCT
GCGGATGAACACGATGAGGATCATGACCTTCACAAGACTAAAGTATTGGAGAGGCCTAAA
GTGATCTACAATGAGAAGACAGGTAAATATGTAATGTGGATGCACATTGATGATTCAAAT
TATACCAAAGCCTCTGTTGGAATTGCCATGAGCAATTCCCCTACTGGTCCTTTTCGATAT
CTATACAGTAAAAGGCCTCATGGTTTTGAAAGTAGGGACATGACTTTGTTCAAAGATGAT
GATGGTAAGGCATATGTTATTTACTCCTCTGTACACAACAGGGAGCTTCATATTGGTCTT
CTTGACCAAGATTATGTAGATGTTACTAATGTTATGTCAAGGGTTCTCGTGGGGCAGTTT
AGAGAGGCCCCCGCCTTGTTCAAGTACCAAGGAACTTACTACATGATCACATCAGGATGC
AGTGGTTGGGCACCAAATGAGGCACTGGCTCATGTGGCTGAATCAATTATGGGTCCATGG
GAGACTATAGGCAACCCATGTATAGGAGCTAACAAAGTTTTTCGAGTCACCACATTCTTT
GCTCAGAGCACATATGTGCTCCCCATTGCACCTGGTTCGTTTATTTTCATGGCAGATCGC
TGGAATCCAGATGATTTGGGTGATTCTAGATATATATGGCTTCCTTTGAATATGGAAGAA
GTAACTGACAGTCAACGACCAAGAGTATCTATCTTTTGGCACAAAAGATGGAAGCTCTTT
AAAAGTCCAGTATAG