Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400066245
CDS Infomation

pacid=37435225 polypeptide=PGSC0003DMP400044653 locus=PGSC0003DMG400025777 ID=PGSC0003DMT400066245.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCGCAGGTTCAGGTGCAGCCACAGGGTGCGAATGCTGGTGGTGTGAACCAGTTTGTG
ACGTCTCTGTACGTGGGTGACCTTGATGTCAATGTGACCGATTCACAGCTGTATGATCTG
TTCAATCACCTAGGACAAGTTGTTTCGGTTAGGGTTTGCAGGGATTTGACTACCCAGAGG
TCGCTCGGTTATGGTTATGTCAATTATGGGAACCCGCAAGATGCTGCAAGGGCTTTGGAA
GTGCTAAACTTTACTCCTCTCAGTGGAAAGCCCATCAGGATAATGTACTCAAACCGGGAC
CCAACTGTTCGAAGAAGTGGCACTGCAAACATATTTATTAAGAATTTGGACAAGGCAATT
GACCACAAAGCACTACATGATACATTTTCTGCATTTGGAAATATCCTGTCTTGTAAGGTA
GCTGTGGATTCATCAGGTCAGTCCAAGGGGTATGGGTTTGTGCAGTATGACGGTGAGGAT
GCTGCCCAAAAAGCTATTGAGAAACTGAATGGTATGCTGCTGAATGACAAGCAAGTATAT
GTTGGACCCTTCGTTCGTAAGCAAGAAAGAGATAGTGCTGTAGATAAGACAAGATTTACC
AATGTCTTTGTGAAAAATTTATCTGAAGCAACATTAGAAGAAGATCTCAAGAAAGCCTTT
GGTGAATTTGGTACCATTACTAGCATTGCAATTATGAAGGATGAAGATGGAAAATCTAGG
TCCTTTGGATTTATTAACTTTGAAAATGCTGAAGATGCTGCGAGAGCAGTTGAGGCTTTG
AATGGTCACAAATTTGATAACAAAGAATGGTTTGTAGGAAGAGCTCAGAAGAAATCAGAG
AGGGAAATGGAATTGAAAAATCGATATGAGCAAAGTGCCAAGGAGGCAGTTGATAAATCA
CAAGGTTTGAATCTATACATAAAAAATTTAGATGACAGCATTAGTGATGACAAGCTCAAG
GAAATGTTCTCTACATATGGCACAATCACTTCATGCAAGGTTATGAGAGATCCTAGTGGA
GGAAGCAAAGGATCAGGATTTGTTGCATTCTCATCTCCCGAAGAGGCTTCAAGAGCGCTT
GCAGAGATGAATGGAAAGATGATTGTTAGCAAACCTCTGTATGTTGCCCTTGCGCAACGC
AAGGAAGAGAGAAGAGCAAGGTTACAGGCTCAGTTTTCTCAGATGCGTCCAATTGGAATG
GCATCTACAGTTGCACCTAGAATGCCTATGTATCCTCCTGGCGGTCCTGGTCTAGGTCAA
CAAATATTCTACGGCCAGCCACAACCAGCCATGCTTCCCCCACAAGCTGGTTTTGGATAT
CAGCAGCAACTTGTACCTGGAATGAGGCCTGGTGGGGGCCCTATGCCGAATTTCTTTATG
CCCATGGTTCAGCAAGGGCAGCAAGGTCAACGTCCGGGTGGCCGACGTGGAGGTGCTGTT
CCATTGCAGCAAGGACAGCAGCCAGTTCCGCTGATGCAGCAACAGATGTTTCCGAGGGGG
CGTGGATATCGATATCCTCCAGGACGTGGCCTTCCTGATGTTGGCTTTCCAGGAGTAGGT
GGTGGCATGTTCTCTGTCCCATATGATATGGGTGGCATGCCTGTGCGTGATGCAGGAATT
GCCCAACCAATTCCAGTAGGGGCTTTGGCTACTGCTCTGGCTAATGCTTCTCCAACAGAG
CAAAGGACGATGCTAGGTGAAAATCTGTACCCCTTGGTCGAACAGCTTGAACCAGAAACA
GCAGCGAAGGTAACTGGCATGCTTTTGGAGATGGACCAGACAGAGGTATTGCACTTGCTT
GAGTCTCCTGAGGCTCTGAAAGCCAAGGTTGCAGAGGCGATGGATGTTCTGAGGAATGTT
CCTCAGCAGCAGGCCAGTAATGCTGCTGATCAGTTGGCTTCATTGTCACTGAATGATGGT
CTGGTTTCTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400044653
PEP Infomation

pacid=37435225 transcript=PGSC0003DMT400066245 locus=PGSC0003DMG400025777 ID=PGSC0003DMT400066245.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MAQVQVQPQGANAGGVNQFVTSLYVGDLDVNVTDSQLYDLFNHLGQVVSVRVCRDLTTQR
SLGYGYVNYGNPQDAARALEVLNFTPLSGKPIRIMYSNRDPTVRRSGTANIFIKNLDKAI
DHKALHDTFSAFGNILSCKVAVDSSGQSKGYGFVQYDGEDAAQKAIEKLNGMLLNDKQVY
VGPFVRKQERDSAVDKTRFTNVFVKNLSEATLEEDLKKAFGEFGTITSIAIMKDEDGKSR
SFGFINFENAEDAARAVEALNGHKFDNKEWFVGRAQKKSEREMELKNRYEQSAKEAVDKS
QGLNLYIKNLDDSISDDKLKEMFSTYGTITSCKVMRDPSGGSKGSGFVAFSSPEEASRAL
AEMNGKMIVSKPLYVALAQRKEERRARLQAQFSQMRPIGMASTVAPRMPMYPPGGPGLGQ
QIFYGQPQPAMLPPQAGFGYQQQLVPGMRPGGGPMPNFFMPMVQQGQQGQRPGGRRGGAV
PLQQGQQPVPLMQQQMFPRGRGYRYPPGRGLPDVGFPGVGGGMFSVPYDMGGMPVRDAGI
AQPIPVGALATALANASPTEQRTMLGENLYPLVEQLEPETAAKVTGMLLEMDQTEVLHLL
ESPEALKAKVAEAMDVLRNVPQQQASNAADQLASLSLNDGLVS*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400066245
Transcript Infomation

pacid=37435225 locus=PGSC0003DMG400025777 ID=PGSC0003DMT400066245.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCGCAGGTTCAGGTGCAGCCACAGGGTGCGAATGCTGGTGGTGTGAACCAGTTTGTG
ACGTCTCTGTACGTGGGTGACCTTGATGTCAATGTGACCGATTCACAGCTGTATGATCTG
TTCAATCACCTAGGACAAGTTGTTTCGGTTAGGGTTTGCAGGGATTTGACTACCCAGAGG
TCGCTCGGTTATGGTTATGTCAATTATGGGAACCCGCAAGATGCTGCAAGGGCTTTGGAA
GTGCTAAACTTTACTCCTCTCAGTGGAAAGCCCATCAGGATAATGTACTCAAACCGGGAC
CCAACTGTTCGAAGAAGTGGCACTGCAAACATATTTATTAAGAATTTGGACAAGGCAATT
GACCACAAAGCACTACATGATACATTTTCTGCATTTGGAAATATCCTGTCTTGTAAGGTA
GCTGTGGATTCATCAGGTCAGTCCAAGGGGTATGGGTTTGTGCAGTATGACGGTGAGGAT
GCTGCCCAAAAAGCTATTGAGAAACTGAATGGTATGCTGCTGAATGACAAGCAAGTATAT
GTTGGACCCTTCGTTCGTAAGCAAGAAAGAGATAGTGCTGTAGATAAGACAAGATTTACC
AATGTCTTTGTGAAAAATTTATCTGAAGCAACATTAGAAGAAGATCTCAAGAAAGCCTTT
GGTGAATTTGGTACCATTACTAGCATTGCAATTATGAAGGATGAAGATGGAAAATCTAGG
TCCTTTGGATTTATTAACTTTGAAAATGCTGAAGATGCTGCGAGAGCAGTTGAGGCTTTG
AATGGTCACAAATTTGATAACAAAGAATGGTTTGTAGGAAGAGCTCAGAAGAAATCAGAG
AGGGAAATGGAATTGAAAAATCGATATGAGCAAAGTGCCAAGGAGGCAGTTGATAAATCA
CAAGGTTTGAATCTATACATAAAAAATTTAGATGACAGCATTAGTGATGACAAGCTCAAG
GAAATGTTCTCTACATATGGCACAATCACTTCATGCAAGGTTATGAGAGATCCTAGTGGA
GGAAGCAAAGGATCAGGATTTGTTGCATTCTCATCTCCCGAAGAGGCTTCAAGAGCGCTT
GCAGAGATGAATGGAAAGATGATTGTTAGCAAACCTCTGTATGTTGCCCTTGCGCAACGC
AAGGAAGAGAGAAGAGCAAGGTTACAGGCTCAGTTTTCTCAGATGCGTCCAATTGGAATG
GCATCTACAGTTGCACCTAGAATGCCTATGTATCCTCCTGGCGGTCCTGGTCTAGGTCAA
CAAATATTCTACGGCCAGCCACAACCAGCCATGCTTCCCCCACAAGCTGGTTTTGGATAT
CAGCAGCAACTTGTACCTGGAATGAGGCCTGGTGGGGGCCCTATGCCGAATTTCTTTATG
CCCATGGTTCAGCAAGGGCAGCAAGGTCAACGTCCGGGTGGCCGACGTGGAGGTGCTGTT
CCATTGCAGCAAGGACAGCAGCCAGTTCCGCTGATGCAGCAACAGATGTTTCCGAGGGGG
CGTGGATATCGATATCCTCCAGGACGTGGCCTTCCTGATGTTGGCTTTCCAGGAGTAGGT
GGTGGCATGTTCTCTGTCCCATATGATATGGGTGGCATGCCTGTGCGTGATGCAGGAATT
GCCCAACCAATTCCAGTAGGGGCTTTGGCTACTGCTCTGGCTAATGCTTCTCCAACAGAG
CAAAGGACGATGCTAGGTGAAAATCTGTACCCCTTGGTCGAACAGCTTGAACCAGAAACA
GCAGCGAAGGTAACTGGCATGCTTTTGGAGATGGACCAGACAGAGGTATTGCACTTGCTT
GAGTCTCCTGAGGCTCTGAAAGCCAAGGTTGCAGAGGCGATGGATGTTCTGAGGAATGTT
CCTCAGCAGCAGGCCAGTAATGCTGCTGATCAGTTGGCTTCATTGTCACTGAATGATGGT
CTGGTTTCTTGA