Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400065528
CDS Infomation

pacid=37431570 polypeptide=PGSC0003DMP400044206 locus=PGSC0003DMG400025495 ID=PGSC0003DMT400065528.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCCTTTTCTTCAGTAAAATATTTTGGACTTTCCACAACTTTTGATCCCCTACATAAA
AACCTCTTTAGTTCAAAACCTTGTGTTTCATCATTTTTTTCCAAGAAAATTGCCCTGCCA
AATTGTGACAAGGCCAATAATATTATGTCCAAAAAGCCTTTATATATTTCAGCGGTGAGT
GGATTTGGGCATGTTAATGAATCAAAATCTAGGGACCCTTTAGTCCAATGTAATGCCTAT
GAAGCTAGTAGGCCACCAATTAGCATTGAATTTGATGAAGAAACTCAGATTGTTGCTGCT
CATAAATTCAAGATTGGGTTATATTTTGCAACATGGTGGGCTCTGAATGTGGTATTCAAT
ATTTATAACAAGAAAGTGTTGAATGCTTTTCCATTTCCATGGCTTACTTCAACTCTATCA
CTTGCTGCTGGCTCATTCATAATGTTAGTTTCTTGGGCTACAAGAATTGCTGAAACTCCA
AAGACTGATATTGATTTCTTGAAAGCTCTGTTTCCTGTTGCTGTGGCACATACAATTGGA
CATGTTGCTGCAACAGTGAGCATGTCAAAAGTTGCAGTTTCATTCACACACATAATCAAA
AGTGGAGAGCCTGCTTTCAGTGTTTTGGTTTCAAGTTTGTTTTTGGGTGAAACTTTTCCA
TTGCCAGTTTATCTTTCACTTGTGCCAATTATTGGTGGTTGTGCACTTGCTGCTGTTACT
GAGCTCAATTTTAATCTAACTGGGTTCATGGGGGCTATGATATCAAACTTGGCATTTGTA
TTCAGAAACATATTTTCAAAGAAAGGGATGAAAGGGAAATCTGTTGGAGGAATGAATTAC
TATGCTTGTCTTTCCATGATGTCCCTTTTGATTCTTACACCCTTTGCCATTGCTGTTGAG
GGTCCAAAAGTGTGGGCACTTGGATGGCAAAATGCAGTCTCCCAAATTGGCCCTAATTTT
ATATGGTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400044206
PEP Infomation

pacid=37431570 transcript=PGSC0003DMT400065528 locus=PGSC0003DMG400025495 ID=PGSC0003DMT400065528.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MAFSSVKYFGLSTTFDPLHKNLFSSKPCVSSFFSKKIALPNCDKANNIMSKKPLYISAVS
GFGHVNESKSRDPLVQCNAYEASRPPISIEFDEETQIVAAHKFKIGLYFATWWALNVVFN
IYNKKVLNAFPFPWLTSTLSLAAGSFIMLVSWATRIAETPKTDIDFLKALFPVAVAHTIG
HVAATVSMSKVAVSFTHIIKSGEPAFSVLVSSLFLGETFPLPVYLSLVPIIGGCALAAVT
ELNFNLTGFMGAMISNLAFVFRNIFSKKGMKGKSVGGMNYYACLSMMSLLILTPFAIAVE
GPKVWALGWQNAVSQIGPNFIW*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400065528
Transcript Infomation

pacid=37431570 locus=PGSC0003DMG400025495 ID=PGSC0003DMT400065528.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCCTTTTCTTCAGTAAAATATTTTGGACTTTCCACAACTTTTGATCCCCTACATAAA
AACCTCTTTAGTTCAAAACCTTGTGTTTCATCATTTTTTTCCAAGAAAATTGCCCTGCCA
AATTGTGACAAGGCCAATAATATTATGTCCAAAAAGCCTTTATATATTTCAGCGGTGAGT
GGATTTGGGCATGTTAATGAATCAAAATCTAGGGACCCTTTAGTCCAATGTAATGCCTAT
GAAGCTAGTAGGCCACCAATTAGCATTGAATTTGATGAAGAAACTCAGATTGTTGCTGCT
CATAAATTCAAGATTGGGTTATATTTTGCAACATGGTGGGCTCTGAATGTGGTATTCAAT
ATTTATAACAAGAAAGTGTTGAATGCTTTTCCATTTCCATGGCTTACTTCAACTCTATCA
CTTGCTGCTGGCTCATTCATAATGTTAGTTTCTTGGGCTACAAGAATTGCTGAAACTCCA
AAGACTGATATTGATTTCTTGAAAGCTCTGTTTCCTGTTGCTGTGGCACATACAATTGGA
CATGTTGCTGCAACAGTGAGCATGTCAAAAGTTGCAGTTTCATTCACACACATAATCAAA
AGTGGAGAGCCTGCTTTCAGTGTTTTGGTTTCAAGTTTGTTTTTGGGTGAAACTTTTCCA
TTGCCAGTTTATCTTTCACTTGTGCCAATTATTGGTGGTTGTGCACTTGCTGCTGTTACT
GAGCTCAATTTTAATCTAACTGGGTTCATGGGGGCTATGATATCAAACTTGGCATTTGTA
TTCAGAAACATATTTTCAAAGAAAGGGATGAAAGGGAAATCTGTTGGAGGAATGAATTAC
TATGCTTGTCTTTCCATGATGTCCCTTTTGATTCTTACACCCTTTGCCATTGCTGTTGAG
GGTCCAAAAGTGTGGGCACTTGGATGGCAAAATGCAGTCTCCCAAATTGGCCCTAATTTT
ATATGGTAA