Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400065518
CDS Infomation

pacid=37433184 polypeptide=PGSC0003DMP400044199 locus=PGSC0003DMG400025492 ID=PGSC0003DMT400065518.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTTCATTTAGCTATTTGATGAGTGTTTTGGTATTATGTGTAATCATAGGTTATGCA
AATGCTCAATTGGAGCTTAATTTCTATGCTAAAAGCTGTCCAAAAGCTGAGAAAATTATT
AAAGATTTTGTTGAGCAACAAGTTCCTAAGGCTCCAAATACTGCAGCAGCCATACTCAGA
ATGCATTTCCATGATTGCTTTGTCAGGGGTTGTGATGGATCTGTACTTCTTAATTTCACT
TCGACTAACGGAAATCAGACGGAAAAACTAGCTAATCCTAATCTGACAGTAAGAGGTTTC
TCATTCATTGATGCTGTGAAGAGATTAGTTGAAGCTGAATGCCCCGAAGTTGTTTCTTGT
GCTGATATTGTCGCGTTGGTTGCTAGAGACGCAGTTGTGGCTACAGGAGGTCCTTTTTGG
AATGTACCAACTGGTAGAAGAGATGGAACGATATCAAATGTCTCAGAAGCCAATGCTGAT
ATCCCAGCTCCAACTAGTAACTTCACTAGACTACAACAATCTTTCGCGAAGAAAGGTCTT
GATCTGAATGATCTGGTCCTTCTATCAGGTGCCCATACTATTGGAGTGTCTCGTTGCTCA
TCATTTACAGAGCGTCTATACAATTTCACCGGGGTTCTAGGTACACAAGATCCATCTCTA
GACAGTGAATACGCGGATAATCTCAAGTCAAGAAAATGCAGATCAATCAACGATAATACT
ACTATAGTCGAGATGGATCCAGGTAGTTTCAAGACATTCGATCTTAGCTACTTCAAACTT
TTGCTCAAAAGGAGAGGTCTATTCCAATCAGATGCAGCATTGACAACACGTACCTCAACG
AAATCATTTATCGAGCAGCTTGTCGATGGACCACTCAAAGAATTTTTCGATGAATTTGGT
AAATCGATGGAGAAAATGGGAAGAGTTGAAGTTAAGACAGGGAGTGCTGGTGAAATCAGG
AAGCATTGTGCATTTGTGAATAATTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400044199
PEP Infomation

pacid=37433184 transcript=PGSC0003DMT400065518 locus=PGSC0003DMG400025492 ID=PGSC0003DMT400065518.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MASFSYLMSVLVLCVIIGYANAQLELNFYAKSCPKAEKIIKDFVEQQVPKAPNTAAAILR
MHFHDCFVRGCDGSVLLNFTSTNGNQTEKLANPNLTVRGFSFIDAVKRLVEAECPEVVSC
ADIVALVARDAVVATGGPFWNVPTGRRDGTISNVSEANADIPAPTSNFTRLQQSFAKKGL
DLNDLVLLSGAHTIGVSRCSSFTERLYNFTGVLGTQDPSLDSEYADNLKSRKCRSINDNT
TIVEMDPGSFKTFDLSYFKLLLKRRGLFQSDAALTTRTSTKSFIEQLVDGPLKEFFDEFG
KSMEKMGRVEVKTGSAGEIRKHCAFVNN*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400065518
Transcript Infomation

pacid=37433184 locus=PGSC0003DMG400025492 ID=PGSC0003DMT400065518.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTTCATTTAGCTATTTGATGAGTGTTTTGGTATTATGTGTAATCATAGGTTATGCA
AATGCTCAATTGGAGCTTAATTTCTATGCTAAAAGCTGTCCAAAAGCTGAGAAAATTATT
AAAGATTTTGTTGAGCAACAAGTTCCTAAGGCTCCAAATACTGCAGCAGCCATACTCAGA
ATGCATTTCCATGATTGCTTTGTCAGGGGTTGTGATGGATCTGTACTTCTTAATTTCACT
TCGACTAACGGAAATCAGACGGAAAAACTAGCTAATCCTAATCTGACAGTAAGAGGTTTC
TCATTCATTGATGCTGTGAAGAGATTAGTTGAAGCTGAATGCCCCGAAGTTGTTTCTTGT
GCTGATATTGTCGCGTTGGTTGCTAGAGACGCAGTTGTGGCTACAGGAGGTCCTTTTTGG
AATGTACCAACTGGTAGAAGAGATGGAACGATATCAAATGTCTCAGAAGCCAATGCTGAT
ATCCCAGCTCCAACTAGTAACTTCACTAGACTACAACAATCTTTCGCGAAGAAAGGTCTT
GATCTGAATGATCTGGTCCTTCTATCAGGTGCCCATACTATTGGAGTGTCTCGTTGCTCA
TCATTTACAGAGCGTCTATACAATTTCACCGGGGTTCTAGGTACACAAGATCCATCTCTA
GACAGTGAATACGCGGATAATCTCAAGTCAAGAAAATGCAGATCAATCAACGATAATACT
ACTATAGTCGAGATGGATCCAGGTAGTTTCAAGACATTCGATCTTAGCTACTTCAAACTT
TTGCTCAAAAGGAGAGGTCTATTCCAATCAGATGCAGCATTGACAACACGTACCTCAACG
AAATCATTTATCGAGCAGCTTGTCGATGGACCACTCAAAGAATTTTTCGATGAATTTGGT
AAATCGATGGAGAAAATGGGAAGAGTTGAAGTTAAGACAGGGAGTGCTGGTGAAATCAGG
AAGCATTGTGCATTTGTGAATAATTGA