Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400065310
CDS Infomation

pacid=37467413 polypeptide=PGSC0003DMP400044035 locus=PGSC0003DMG400025389 ID=PGSC0003DMT400065310.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGATGGAGAATCACAAATCTTGAAAAGCTCATCTGGACACGGAAAACGAGGAGGGTGG
ATTACATTCCCTTTTACAATAGCAACGACAGCGGGATTGAACATAGCAGCAGCAGGTTGG
ATGAATAACTTGACAGTGTACTTAATTGAGGAATTTGGAATGAATAGTATTGATGCTGCT
CAAGTTTCTAATATTATGAATGGCTCTGTCAATTTTGTTCCTGTTGTTGCTGCTATTCTT
GCTGATTCATTCTTTGGTTGTTTCTCTGTTGTATGGACTTCTTGTTTAATCTCTCTACTG
GGCATAGTTCTCTTAGCTTTAACATCAACAATTGACACATTGAGACCTCAACAACTATGC
ACAAATGGTTCAGGTATTTGTATGTCACCAACAAAACTTCAATTTGCCTTCTTATACGGA
GGAATCGCGTTGGCCTCCATCGGATTAGGTGGAATGAGAACCAACATCGCAACAATTGGC
GCGAACCAATTTCGCGACTCAAAGTACCAAAACATGTTCTTCAATTGGTTCTTCTTCACC
ATGTACATTGGGACAGTAATTGGTGCAACTGTTATTGTGTACATTGAAGACAATGTGAGC
TGGAAATTTGGGTATTTTGTATGTGTAGCTGCTAATTTTGTTGGTTTAGTTGTTTTCTTA
TGTGGAAGTAGATTTTACCATTATGCTAAACTTGAAGGTAGTCCTTTTACTAGTTTGGCT
CATGTGATTGTGGCAACTATTAGAAAAAGGAAACTTCCAATTTTAGATGAGAATAATTGG
TATTATGGACCACATGCCAATGTTGATCAAACCATGTCAATAGCACCCTCAAGAAGTTTT
GGGTTTTTGAACCGTGCAGCGTTAAAATGTGAAGGAGATGTTAAACAGGACAACTCAATC
GCGAAACCATGGAGACTCTGTACAGTAAGTGAAGTAGAAGACTTTAAAAGTCTAATGAGA
ACTCTGCCATTGTGTTCATCAAGCATATTTCTTTCGACTCCAATTGCGGTCCTAATTAGT
TTGTCTGTTCTTCAAGCCTTAGCCATGGACAGACATTTAGGACCTCATTTTCAAATTCCA
GCTGGTTCAATCCCTGTCATTGTACTCGTCACCACCTCGATTTTTCTAACAATATTCGAT
AGATTTCTCTTCCCCACGTGGGAAAAATTGATTGGCCACAATGTTACGCCTTTCAAACGA
ATTGGAGTTGGCCATGTGCTTACTTTTATTGGCTTGGGAGTTGCAGCTTTAGTAGAGTCT
AAAAGACTTAATGAAGTCAGAGACAGAGACGGATTCAGGATTTCTGTCTTGTGGCTCGTG
CCACATTTAGTTCTTATTGGGATAGGTGAGGCATTTCATTTTCCAGGACAAGTATCATTG
TACTATCAAGAATTTCCAACGTCGTTGAAGAGTGTTTCAACTGCCCTAACATGGTTAGCC
ATCGCAATTTCATTTTATGTGAGCACCGCGTTGATTGATCTTGTTCGAAAAACGACTAGT
TGGTTACCTAATGACATAAATCAGGGGAGAATTGACAAGTTTTATTGGGTGTTTGCTGTG
GTTGGAGTGGTGAATTTTGGGTATTATTTACTATGTGTTTGGTTTTACAAGAGAAAAGTT
GGGAACAAAGTGGTTGATCATGGTGCATCCAATGCTTTCAATAAGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400044035
PEP Infomation

pacid=37467413 transcript=PGSC0003DMT400065310 locus=PGSC0003DMG400025389 ID=PGSC0003DMT400065310.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MDGESQILKSSSGHGKRGGWITFPFTIATTAGLNIAAAGWMNNLTVYLIEEFGMNSIDAA
QVSNIMNGSVNFVPVVAAILADSFFGCFSVVWTSCLISLLGIVLLALTSTIDTLRPQQLC
TNGSGICMSPTKLQFAFLYGGIALASIGLGGMRTNIATIGANQFRDSKYQNMFFNWFFFT
MYIGTVIGATVIVYIEDNVSWKFGYFVCVAANFVGLVVFLCGSRFYHYAKLEGSPFTSLA
HVIVATIRKRKLPILDENNWYYGPHANVDQTMSIAPSRSFGFLNRAALKCEGDVKQDNSI
AKPWRLCTVSEVEDFKSLMRTLPLCSSSIFLSTPIAVLISLSVLQALAMDRHLGPHFQIP
AGSIPVIVLVTTSIFLTIFDRFLFPTWEKLIGHNVTPFKRIGVGHVLTFIGLGVAALVES
KRLNEVRDRDGFRISVLWLVPHLVLIGIGEAFHFPGQVSLYYQEFPTSLKSVSTALTWLA
IAISFYVSTALIDLVRKTTSWLPNDINQGRIDKFYWVFAVVGVVNFGYYLLCVWFYKRKV
GNKVVDHGASNAFNK*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400065310
Transcript Infomation

pacid=37467413 locus=PGSC0003DMG400025389 ID=PGSC0003DMT400065310.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGATGGAGAATCACAAATCTTGAAAAGCTCATCTGGACACGGAAAACGAGGAGGGTGG
ATTACATTCCCTTTTACAATAGCAACGACAGCGGGATTGAACATAGCAGCAGCAGGTTGG
ATGAATAACTTGACAGTGTACTTAATTGAGGAATTTGGAATGAATAGTATTGATGCTGCT
CAAGTTTCTAATATTATGAATGGCTCTGTCAATTTTGTTCCTGTTGTTGCTGCTATTCTT
GCTGATTCATTCTTTGGTTGTTTCTCTGTTGTATGGACTTCTTGTTTAATCTCTCTACTG
GGCATAGTTCTCTTAGCTTTAACATCAACAATTGACACATTGAGACCTCAACAACTATGC
ACAAATGGTTCAGGTATTTGTATGTCACCAACAAAACTTCAATTTGCCTTCTTATACGGA
GGAATCGCGTTGGCCTCCATCGGATTAGGTGGAATGAGAACCAACATCGCAACAATTGGC
GCGAACCAATTTCGCGACTCAAAGTACCAAAACATGTTCTTCAATTGGTTCTTCTTCACC
ATGTACATTGGGACAGTAATTGGTGCAACTGTTATTGTGTACATTGAAGACAATGTGAGC
TGGAAATTTGGGTATTTTGTATGTGTAGCTGCTAATTTTGTTGGTTTAGTTGTTTTCTTA
TGTGGAAGTAGATTTTACCATTATGCTAAACTTGAAGGTAGTCCTTTTACTAGTTTGGCT
CATGTGATTGTGGCAACTATTAGAAAAAGGAAACTTCCAATTTTAGATGAGAATAATTGG
TATTATGGACCACATGCCAATGTTGATCAAACCATGTCAATAGCACCCTCAAGAAGTTTT
GGGTTTTTGAACCGTGCAGCGTTAAAATGTGAAGGAGATGTTAAACAGGACAACTCAATC
GCGAAACCATGGAGACTCTGTACAGTAAGTGAAGTAGAAGACTTTAAAAGTCTAATGAGA
ACTCTGCCATTGTGTTCATCAAGCATATTTCTTTCGACTCCAATTGCGGTCCTAATTAGT
TTGTCTGTTCTTCAAGCCTTAGCCATGGACAGACATTTAGGACCTCATTTTCAAATTCCA
GCTGGTTCAATCCCTGTCATTGTACTCGTCACCACCTCGATTTTTCTAACAATATTCGAT
AGATTTCTCTTCCCCACGTGGGAAAAATTGATTGGCCACAATGTTACGCCTTTCAAACGA
ATTGGAGTTGGCCATGTGCTTACTTTTATTGGCTTGGGAGTTGCAGCTTTAGTAGAGTCT
AAAAGACTTAATGAAGTCAGAGACAGAGACGGATTCAGGATTTCTGTCTTGTGGCTCGTG
CCACATTTAGTTCTTATTGGGATAGGTGAGGCATTTCATTTTCCAGGACAAGTATCATTG
TACTATCAAGAATTTCCAACGTCGTTGAAGAGTGTTTCAACTGCCCTAACATGGTTAGCC
ATCGCAATTTCATTTTATGTGAGCACCGCGTTGATTGATCTTGTTCGAAAAACGACTAGT
TGGTTACCTAATGACATAAATCAGGGGAGAATTGACAAGTTTTATTGGGTGTTTGCTGTG
GTTGGAGTGGTGAATTTTGGGTATTATTTACTATGTGTTTGGTTTTACAAGAGAAAAGTT
GGGAACAAAGTGGTTGATCATGGTGCATCCAATGCTTTCAATAAGTGA