Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400065063
CDS Infomation

pacid=37452743 polypeptide=PGSC0003DMP400043871 locus=PGSC0003DMG400025281 ID=PGSC0003DMT400065063.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCAGATGAAGTAGAAGAAGAGAACTTGGCAGTTTGGCTTCTTGCTATCAAAACACTT
CGGATTCAGCCCTTTAGTCTCCCATCTCTTGGTCCTTATGATGTCAAGATTCGAATTAAA
GCTGTTGGTATATGTGGAAGTGATATCCATCACTTTAAGAATATGAGAGTAGCTAATTTC
GTGGTTAAAAAGCCAATGGTACTTGGCCATGAGTGTGCTGGAATTGTAGAACAAGTTGGT
AGCCAAGTGAAGTTTCTGATGATCGGTGATCGTGTAGCTTTGGAACCTGGTATTAGTTGC
AGGCAGTGTCAACTATGCAAAGACGGTCGCTACAATCTCTGCCGTAAAATGAAGTTCTTT
GGCTCTCCTCCAACAAATGGTGCTTTAGCCAACCAGGTGGTGCATCCTGCAGATCTATGT
TTTAAGTTACCTGATAATGTAAGCTTGGAGGAAGGTGCAATATGTGAACCTTTGAGTGTT
GGTGTCCATGCTTGCCGCCGTGCCAATGTAGGTCCTGACACCAAACTAATCATCATAGGT
GCGGGACCTATTGGCCTGGTCACTATGCTGGCAGCTCGTGCTTTTGGATCACCCAAGATA
GTCATCGTTGATGTGGATGATTGTCGTTTATCTTTCGCGAAAGACCTGGGTGCTGATGAG
ATCATTAAAGTTTCTTCCATTATGCAGGATGTGGAGGAGGAAGTGGTGCGAATACGTAAT
GCAATGGGTGGTCCAGTGGATTTGAGCTTTGATTGTGTTGGTTTTAACAAGACTATGACA
ACGGCTCTACAAGCCACCCGCACTGGTGGTAAAGTATGCCTCGTTGGATTAGGCCAGAGT
GAGATGACTCTCCCTCTTACTTCAGCTGCTGCAAGGGAGGTGGATGTCATAGGCATTTTC
AGATACCGAAATACATGGCCGCTCTGCATTGAACTTCTGAGAACTGGGGAAATAGATGTG
AAGCCTCTCATAACCCACAGGTATAACTTTACTCAAGAGGGTGTGGATGAAGCATTTGAG
ACCAGTTCTCGCGGCGGAAATGCCATCAAGGTCATGTTCAACCTGTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400043871
PEP Infomation

pacid=37452743 transcript=PGSC0003DMT400065063 locus=PGSC0003DMG400025281 ID=PGSC0003DMT400065063.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MADEVEEENLAVWLLAIKTLRIQPFSLPSLGPYDVKIRIKAVGICGSDIHHFKNMRVANF
VVKKPMVLGHECAGIVEQVGSQVKFLMIGDRVALEPGISCRQCQLCKDGRYNLCRKMKFF
GSPPTNGALANQVVHPADLCFKLPDNVSLEEGAICEPLSVGVHACRRANVGPDTKLIIIG
AGPIGLVTMLAARAFGSPKIVIVDVDDCRLSFAKDLGADEIIKVSSIMQDVEEEVVRIRN
AMGGPVDLSFDCVGFNKTMTTALQATRTGGKVCLVGLGQSEMTLPLTSAAAREVDVIGIF
RYRNTWPLCIELLRTGEIDVKPLITHRYNFTQEGVDEAFETSSRGGNAIKVMFNL*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400065063
Transcript Infomation

pacid=37452743 locus=PGSC0003DMG400025281 ID=PGSC0003DMT400065063.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCAGATGAAGTAGAAGAAGAGAACTTGGCAGTTTGGCTTCTTGCTATCAAAACACTT
CGGATTCAGCCCTTTAGTCTCCCATCTCTTGGTCCTTATGATGTCAAGATTCGAATTAAA
GCTGTTGGTATATGTGGAAGTGATATCCATCACTTTAAGAATATGAGAGTAGCTAATTTC
GTGGTTAAAAAGCCAATGGTACTTGGCCATGAGTGTGCTGGAATTGTAGAACAAGTTGGT
AGCCAAGTGAAGTTTCTGATGATCGGTGATCGTGTAGCTTTGGAACCTGGTATTAGTTGC
AGGCAGTGTCAACTATGCAAAGACGGTCGCTACAATCTCTGCCGTAAAATGAAGTTCTTT
GGCTCTCCTCCAACAAATGGTGCTTTAGCCAACCAGGTGGTGCATCCTGCAGATCTATGT
TTTAAGTTACCTGATAATGTAAGCTTGGAGGAAGGTGCAATATGTGAACCTTTGAGTGTT
GGTGTCCATGCTTGCCGCCGTGCCAATGTAGGTCCTGACACCAAACTAATCATCATAGGT
GCGGGACCTATTGGCCTGGTCACTATGCTGGCAGCTCGTGCTTTTGGATCACCCAAGATA
GTCATCGTTGATGTGGATGATTGTCGTTTATCTTTCGCGAAAGACCTGGGTGCTGATGAG
ATCATTAAAGTTTCTTCCATTATGCAGGATGTGGAGGAGGAAGTGGTGCGAATACGTAAT
GCAATGGGTGGTCCAGTGGATTTGAGCTTTGATTGTGTTGGTTTTAACAAGACTATGACA
ACGGCTCTACAAGCCACCCGCACTGGTGGTAAAGTATGCCTCGTTGGATTAGGCCAGAGT
GAGATGACTCTCCCTCTTACTTCAGCTGCTGCAAGGGAGGTGGATGTCATAGGCATTTTC
AGATACCGAAATACATGGCCGCTCTGCATTGAACTTCTGAGAACTGGGGAAATAGATGTG
AAGCCTCTCATAACCCACAGGTATAACTTTACTCAAGAGGGTGTGGATGAAGCATTTGAG
ACCAGTTCTCGCGGCGGAAATGCCATCAAGGTCATGTTCAACCTGTAG