Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400063965
CDS Infomation

pacid=37473581 polypeptide=PGSC0003DMP400043095 locus=PGSC0003DMG400024862 ID=PGSC0003DMT400063965.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGTATGAACGCAGCTTCCGTCCTGAACCATATCATCAATGGCGAACCCACCACCCCC
CGTAGCTCCAAAGAGGCAACATCTTCACAAGCGAAAGCCTTAACCACTACAATCATCAAC
CATCTTCGTTTGGGTCGACTTGGAAAAGCTGTCTCTGTTTTGTTCTCAGCTCCAGTTCCT
TTCCCTTTTGCTCTCTATGCTCATCTCTTCAGAATCTGTGCATCAAAGAAGGCCATTGTT
GAAGTCCGTAAAGTTGAGTCGCATTTGGTCAGTTTTGCTCCAACCCCACCTGTATTCTTG
CTCAATCGAGCAATTGAAGCTTATGGTAAATGTGGGTGTTTGGTTGATGCAAGAGAGCTG
TTTGATGAAATGCCTCAAAAAGATGGTGGGTCTTGGAATGCTATGGTTACTGCTTATTCA
CAAAATGGGTATGCTGGGAAGGCATTGGGTGTGTTTTCTGATATGCATAAGTCTGGGATT
TTTGCTGCTGAGGTTACTTTTGCGAGTGTTCTTGCTTCGTGTGCTTCTACCTTGGCGCTT
TGGCTTTCTAGACAGGTGCATGCCCTTGTTTTTAAATATGGTTTTGGTGGTAATGTGATT
TTAGAGAGTTCGCTTGTGGATGTGTATGGGAAGTGTAGGAGAATGGGGGATGCACGGAGA
ATGTTTGATGAAATTGAGAGACCAAATGCTGTTACTTGGAATGTGATTGTTAGAAGGTAT
CTTGAGATGGGTAATGGAAAAGAGTCTGTCTTTCTGTTTTTCAAAATGATTAGTCTTAAT
GTGAGGCCGCTGACATTTACAGTCTCAAATGCTCTAGTTGCTTGTTCTAGTTTTAGAGGA
TTTCGTGAAGGAATTCAAATTCATGGATTAATTATCAAGATTAGTTATGAAGAGGACGAG
GTTGTTTCGTGCTCTCTAATTGATGTGTATGCCAAATGTGGGGATTTAGTGTGTGCTCGG
ACAATTTTTGACCTGCTATCCCCTAAAAATTTGATTCATTGGACTTCTATGGTGTCAGGA
TATGCGCTGAGTGGGAAAACTAGGTTAGCAAGGGAGCTTTTTGATAGGATGCCTGAACGC
AGTATAGTTTCATGGAATGCAATGCTAGCAGGATATGCACATAATTCACAATGGGATGAA
GCAATGGAGTTAATCATTTTAATGTGCAATGATATGAGGGACACTGATCGTGTGACTGTA
AGTTTGATCCTGAATGTTTCTGCAGGACTTTCAGATCTTGAATTGGGGAAGCAGGTTCAT
GGATACATGTATAGGCACGGTTTCTACTCCGACTTGAGCGTTGCTAATGCGCTTCTTGAT
ATGTATGGGAAATGTGGGAACTTGAGAAAGGCTAGAGCTTGGTTTTACGAAATGAGCTAT
TTCCGAGATATGGTTTCTTGGAATGCTTTGTTGAGTAGCTATGCTCGTCATAGGATGAGT
GAAGAAGCTTTAGTAATTTTCTGGGAAATGCAACAAGAGGTGACACCTAGTAAATTCACT
TTTGCTACTCTCTTGGCGGTTTGTGCAAATATTTTTGCTCGTGAACAAGGTAAACAAATC
CATGGGTTTTTGATTAGAAATGGTTATGATTTGGACATCGTTATCAGAGGAGCTTTGGTT
GATATGTATTCCAAATGTCATTGTCTTGACTATGCACTGAATGTTTTCATTGGGACTTCT
GTGAAAGATGTTGTTCTCTGGAATTCTCTGATGCTTGGATGTTATTATAACAAACAAAGT
GAAGCAATATTAAAATTGTTTGAGTTGATGAAGGAGGATGGAGTGAAGCCAGATAGTACA
ACGTTCCAAGCTGTACTGCTTGCATGTATTTCTCAGGGTTGTGTGAAATTGGGTGGACAG
TATTTCAATTCACTGAGTCAAGATTATTTTATTATACCACAATTGGAGCATTACGAATCC
ATGATAAAGCTATATGGTCTGCATGGATTCTTTGATGAGCTTGAAGATTTTGTTGAGAAG
ATGCCATTTCAACCCACAGCCCCTATGTTAGCAAGAGTTTTTGACTCTTCCAAAGAATAC
AATAACACAAGGTTAGGAAAATGGGCTGTCAGACATCTTAATTTTCTGAAGGACTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400043095
PEP Infomation

pacid=37473581 transcript=PGSC0003DMT400063965 locus=PGSC0003DMG400024862 ID=PGSC0003DMT400063965.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MGMNAASVLNHIINGEPTTPRSSKEATSSQAKALTTTIINHLRLGRLGKAVSVLFSAPVP
FPFALYAHLFRICASKKAIVEVRKVESHLVSFAPTPPVFLLNRAIEAYGKCGCLVDAREL
FDEMPQKDGGSWNAMVTAYSQNGYAGKALGVFSDMHKSGIFAAEVTFASVLASCASTLAL
WLSRQVHALVFKYGFGGNVILESSLVDVYGKCRRMGDARRMFDEIERPNAVTWNVIVRRY
LEMGNGKESVFLFFKMISLNVRPLTFTVSNALVACSSFRGFREGIQIHGLIIKISYEEDE
VVSCSLIDVYAKCGDLVCARTIFDLLSPKNLIHWTSMVSGYALSGKTRLARELFDRMPER
SIVSWNAMLAGYAHNSQWDEAMELIILMCNDMRDTDRVTVSLILNVSAGLSDLELGKQVH
GYMYRHGFYSDLSVANALLDMYGKCGNLRKARAWFYEMSYFRDMVSWNALLSSYARHRMS
EEALVIFWEMQQEVTPSKFTFATLLAVCANIFAREQGKQIHGFLIRNGYDLDIVIRGALV
DMYSKCHCLDYALNVFIGTSVKDVVLWNSLMLGCYYNKQSEAILKLFELMKEDGVKPDST
TFQAVLLACISQGCVKLGGQYFNSLSQDYFIIPQLEHYESMIKLYGLHGFFDELEDFVEK
MPFQPTAPMLARVFDSSKEYNNTRLGKWAVRHLNFLKD*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400063965
Transcript Infomation

pacid=37473581 locus=PGSC0003DMG400024862 ID=PGSC0003DMT400063965.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGTATGAACGCAGCTTCCGTCCTGAACCATATCATCAATGGCGAACCCACCACCCCC
CGTAGCTCCAAAGAGGCAACATCTTCACAAGCGAAAGCCTTAACCACTACAATCATCAAC
CATCTTCGTTTGGGTCGACTTGGAAAAGCTGTCTCTGTTTTGTTCTCAGCTCCAGTTCCT
TTCCCTTTTGCTCTCTATGCTCATCTCTTCAGAATCTGTGCATCAAAGAAGGCCATTGTT
GAAGTCCGTAAAGTTGAGTCGCATTTGGTCAGTTTTGCTCCAACCCCACCTGTATTCTTG
CTCAATCGAGCAATTGAAGCTTATGGTAAATGTGGGTGTTTGGTTGATGCAAGAGAGCTG
TTTGATGAAATGCCTCAAAAAGATGGTGGGTCTTGGAATGCTATGGTTACTGCTTATTCA
CAAAATGGGTATGCTGGGAAGGCATTGGGTGTGTTTTCTGATATGCATAAGTCTGGGATT
TTTGCTGCTGAGGTTACTTTTGCGAGTGTTCTTGCTTCGTGTGCTTCTACCTTGGCGCTT
TGGCTTTCTAGACAGGTGCATGCCCTTGTTTTTAAATATGGTTTTGGTGGTAATGTGATT
TTAGAGAGTTCGCTTGTGGATGTGTATGGGAAGTGTAGGAGAATGGGGGATGCACGGAGA
ATGTTTGATGAAATTGAGAGACCAAATGCTGTTACTTGGAATGTGATTGTTAGAAGGTAT
CTTGAGATGGGTAATGGAAAAGAGTCTGTCTTTCTGTTTTTCAAAATGATTAGTCTTAAT
GTGAGGCCGCTGACATTTACAGTCTCAAATGCTCTAGTTGCTTGTTCTAGTTTTAGAGGA
TTTCGTGAAGGAATTCAAATTCATGGATTAATTATCAAGATTAGTTATGAAGAGGACGAG
GTTGTTTCGTGCTCTCTAATTGATGTGTATGCCAAATGTGGGGATTTAGTGTGTGCTCGG
ACAATTTTTGACCTGCTATCCCCTAAAAATTTGATTCATTGGACTTCTATGGTGTCAGGA
TATGCGCTGAGTGGGAAAACTAGGTTAGCAAGGGAGCTTTTTGATAGGATGCCTGAACGC
AGTATAGTTTCATGGAATGCAATGCTAGCAGGATATGCACATAATTCACAATGGGATGAA
GCAATGGAGTTAATCATTTTAATGTGCAATGATATGAGGGACACTGATCGTGTGACTGTA
AGTTTGATCCTGAATGTTTCTGCAGGACTTTCAGATCTTGAATTGGGGAAGCAGGTTCAT
GGATACATGTATAGGCACGGTTTCTACTCCGACTTGAGCGTTGCTAATGCGCTTCTTGAT
ATGTATGGGAAATGTGGGAACTTGAGAAAGGCTAGAGCTTGGTTTTACGAAATGAGCTAT
TTCCGAGATATGGTTTCTTGGAATGCTTTGTTGAGTAGCTATGCTCGTCATAGGATGAGT
GAAGAAGCTTTAGTAATTTTCTGGGAAATGCAACAAGAGGTGACACCTAGTAAATTCACT
TTTGCTACTCTCTTGGCGGTTTGTGCAAATATTTTTGCTCGTGAACAAGGTAAACAAATC
CATGGGTTTTTGATTAGAAATGGTTATGATTTGGACATCGTTATCAGAGGAGCTTTGGTT
GATATGTATTCCAAATGTCATTGTCTTGACTATGCACTGAATGTTTTCATTGGGACTTCT
GTGAAAGATGTTGTTCTCTGGAATTCTCTGATGCTTGGATGTTATTATAACAAACAAAGT
GAAGCAATATTAAAATTGTTTGAGTTGATGAAGGAGGATGGAGTGAAGCCAGATAGTACA
ACGTTCCAAGCTGTACTGCTTGCATGTATTTCTCAGGGTTGTGTGAAATTGGGTGGACAG
TATTTCAATTCACTGAGTCAAGATTATTTTATTATACCACAATTGGAGCATTACGAATCC
ATGATAAAGCTATATGGTCTGCATGGATTCTTTGATGAGCTTGAAGATTTTGTTGAGAAG
ATGCCATTTCAACCCACAGCCCCTATGTTAGCAAGAGTTTTTGACTCTTCCAAAGAATAC
AATAACACAAGGTTAGGAAAATGGGCTGTCAGACATCTTAATTTTCTGAAGGACTGA