Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400063839
CDS Infomation

pacid=37473777 polypeptide=PGSC0003DMP400043005 locus=PGSC0003DMG402024815 ID=PGSC0003DMT400063839.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGATCACAAACCCATTAAAGAATTGGTCTTACAGTATAAAGAACTGCATATCTCAAGGA
AAATTCAAAGAAGCCCTTTTAACATATAAACATAATCGTATCAATGGAAGTTTTATAATG
GGTGTTGTTCCTTTGGTGCTAAAGGCATGTGCTTCACTTTCAATGCTTAGCCTTGGCAAA
GCCTTACATGCTGAATCTGTGAAATCAGGATTTGATTGTAATGTAATGGTGGGGACTGCG
TTATTGGATATGTATGGTAAATGTGGTGAAATTCGGAGTGCCCGGAAAGTGTTTGATTAT
ATGCCTGAAAGAAATGTGATTACATGGAATGCTATGATAGGAGGATGTATAAAGAATGGT
GATATAAAGACTGCTTTTTTATTGTTTGAGAATATGTCTGAGAAGACAATTGTGACTTGG
AATGAAATGATTGATGGGTATGCGAGGAATGGAGATATGGTGATGGCTAGGAGTTTTTTT
GACCGGGTACCAGATGAGTTGAGGAATGTTGTTACATGGAGTGTGATGGTTGATGGGTAT
ACTAGTAATGGGGATATGGATGCTGCAAGGGAATTGTTTGAGATTATGCCAACAAGGAAT
TTTTATGTCTGGTCGTCGATGGTTTCTGGTTATTTTAAGAAGGGTGATGTTAAGAGTGCC
GAGGCCATATTTGATAGGATGAGTATGAAGAACTTGGTGAATTGGAATTCATTGATATGT
GGTTATACACAAAATGGGTTGTGTGAAGAAGCCTTGGAAGCATTTACAAAAATGCAAGAT
GAGGGTCTTGAACCAGATGAGGTTACTGTAGTTAGTGTTTTATCGGCTTGTGCCCAGTTG
GCTTTACTGGATGTTGGCAAGGATATACATGAAATGATAATTCGGAAAGGGATTGAATTG
AATGAATATGTTCTTAATGGGTTGGTTGACATGTATGCAAAATGTGGGGATTTAAGTAAC
GCCAGATTGATTTTTGAAGGAATGTTGGTTAAGAATGATGCTGCTTGGAACTCACTAATA
TCTGGTTTTGCTAACCATGGCCACTGTGTGGAGGCAATTAATTTTTTTGAGAGAATGGCT
AGTTCAGGAGTGAAACCTAATGATATAACATTTCTCTCAGTGCTATCGGCTTGTGCCCAT
GGTGGATTTGTGGAGGAAGGTTTAGAGATCTTCTCCAGGATGGAGAAATATGCATTGACA
GCGAGCATCAAGCATTATGGTTGTCTTGTAGACCTTTTGGGAAGGGCTGGAAGATTAGAG
GAGGCTTGTGACTTGATAAAAGGGATGCCTGTCACACCAAATGACACAGTTTTAGGGGCT
CTGCTTGGAGCATGTCGGGTTCACTCGGACACAGATGTGGTGGAAAATGTGCTGAAAGAG
GTCAGAAAATTGAACTACATTAGTGATTCCGGTGATGATGCACATTATGTGATTTTTTCA
AATATATATGCTGCTGCTGAAAGGTGGGAGAAAGCTGAAAGGATGAGGTTTGCCTTGTCA
AATAAAGGGTCTCAGAAGACACCAGGGTGTAGCGTGGTCATGCTCGATGGACCAGAGACT
AGTTTTATGCAAGTATTGACAGCATAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400043005
PEP Infomation

pacid=37473777 transcript=PGSC0003DMT400063839 locus=PGSC0003DMG402024815 ID=PGSC0003DMT400063839.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MITNPLKNWSYSIKNCISQGKFKEALLTYKHNRINGSFIMGVVPLVLKACASLSMLSLGK
ALHAESVKSGFDCNVMVGTALLDMYGKCGEIRSARKVFDYMPERNVITWNAMIGGCIKNG
DIKTAFLLFENMSEKTIVTWNEMIDGYARNGDMVMARSFFDRVPDELRNVVTWSVMVDGY
TSNGDMDAARELFEIMPTRNFYVWSSMVSGYFKKGDVKSAEAIFDRMSMKNLVNWNSLIC
GYTQNGLCEEALEAFTKMQDEGLEPDEVTVVSVLSACAQLALLDVGKDIHEMIIRKGIEL
NEYVLNGLVDMYAKCGDLSNARLIFEGMLVKNDAAWNSLISGFANHGHCVEAINFFERMA
SSGVKPNDITFLSVLSACAHGGFVEEGLEIFSRMEKYALTASIKHYGCLVDLLGRAGRLE
EACDLIKGMPVTPNDTVLGALLGACRVHSDTDVVENVLKEVRKLNYISDSGDDAHYVIFS
NIYAAAERWEKAERMRFALSNKGSQKTPGCSVVMLDGPETSFMQVLTA*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400063839
Transcript Infomation

pacid=37473777 locus=PGSC0003DMG402024815 ID=PGSC0003DMT400063839.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGATCACAAACCCATTAAAGAATTGGTCTTACAGTATAAAGAACTGCATATCTCAAGGA
AAATTCAAAGAAGCCCTTTTAACATATAAACATAATCGTATCAATGGAAGTTTTATAATG
GGTGTTGTTCCTTTGGTGCTAAAGGCATGTGCTTCACTTTCAATGCTTAGCCTTGGCAAA
GCCTTACATGCTGAATCTGTGAAATCAGGATTTGATTGTAATGTAATGGTGGGGACTGCG
TTATTGGATATGTATGGTAAATGTGGTGAAATTCGGAGTGCCCGGAAAGTGTTTGATTAT
ATGCCTGAAAGAAATGTGATTACATGGAATGCTATGATAGGAGGATGTATAAAGAATGGT
GATATAAAGACTGCTTTTTTATTGTTTGAGAATATGTCTGAGAAGACAATTGTGACTTGG
AATGAAATGATTGATGGGTATGCGAGGAATGGAGATATGGTGATGGCTAGGAGTTTTTTT
GACCGGGTACCAGATGAGTTGAGGAATGTTGTTACATGGAGTGTGATGGTTGATGGGTAT
ACTAGTAATGGGGATATGGATGCTGCAAGGGAATTGTTTGAGATTATGCCAACAAGGAAT
TTTTATGTCTGGTCGTCGATGGTTTCTGGTTATTTTAAGAAGGGTGATGTTAAGAGTGCC
GAGGCCATATTTGATAGGATGAGTATGAAGAACTTGGTGAATTGGAATTCATTGATATGT
GGTTATACACAAAATGGGTTGTGTGAAGAAGCCTTGGAAGCATTTACAAAAATGCAAGAT
GAGGGTCTTGAACCAGATGAGGTTACTGTAGTTAGTGTTTTATCGGCTTGTGCCCAGTTG
GCTTTACTGGATGTTGGCAAGGATATACATGAAATGATAATTCGGAAAGGGATTGAATTG
AATGAATATGTTCTTAATGGGTTGGTTGACATGTATGCAAAATGTGGGGATTTAAGTAAC
GCCAGATTGATTTTTGAAGGAATGTTGGTTAAGAATGATGCTGCTTGGAACTCACTAATA
TCTGGTTTTGCTAACCATGGCCACTGTGTGGAGGCAATTAATTTTTTTGAGAGAATGGCT
AGTTCAGGAGTGAAACCTAATGATATAACATTTCTCTCAGTGCTATCGGCTTGTGCCCAT
GGTGGATTTGTGGAGGAAGGTTTAGAGATCTTCTCCAGGATGGAGAAATATGCATTGACA
GCGAGCATCAAGCATTATGGTTGTCTTGTAGACCTTTTGGGAAGGGCTGGAAGATTAGAG
GAGGCTTGTGACTTGATAAAAGGGATGCCTGTCACACCAAATGACACAGTTTTAGGGGCT
CTGCTTGGAGCATGTCGGGTTCACTCGGACACAGATGTGGTGGAAAATGTGCTGAAAGAG
GTCAGAAAATTGAACTACATTAGTGATTCCGGTGATGATGCACATTATGTGATTTTTTCA
AATATATATGCTGCTGCTGAAAGGTGGGAGAAAGCTGAAAGGATGAGGTTTGCCTTGTCA
AATAAAGGGTCTCAGAAGACACCAGGGTGTAGCGTGGTCATGCTCGATGGACCAGAGACT
AGTTTTATGCAAGTATTGACAGCATAA