Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400063804
CDS Infomation

pacid=37475214 polypeptide=PGSC0003DMP400042980 locus=PGSC0003DMG400024803 ID=PGSC0003DMT400063804.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCGTCACATAGTTTCCTCTCTCAGACAACATTCTCTACTTCTCCATCGCCGTCGCAAA
TTCTCGGCAACCGCGCCGGCGAAACAGTCCAGAAACGAAGACCCAGAACCTCAATCAGCT
CCAATTACTCTCCTATACAACAATCTCCTGAAAATATGTCTACAGGAATGCAAGAACCTT
CAGTCCCGCCGGGTGTTCGACGAAATGCCCCAGAGAGCTGCACGTGCTGTGAAAGCTTGC
AAAACCATCCATTTGCAGAGCCTGAAACTTGGGTTTGCTTCACAAGGACATTTGGGGAAT
TCCATTGTGGATTTATACGCCAAATGTGGAGACATGGTTTCGGCTGAGAAAGCATTTTTC
TGGCTTGAGAACAAGGATAGTATTGCTTGGAATTCAATTATATTGATGTATTCGCGAAAT
GGGTTGTTGGAGAATGTTGTAGAAGCTTTTGGGTCGATGTGGAATTCTGGAGTGTGGCCG
AATCAGTTTAGTTATGCTATTGTTTTGTCTGCTTGTGCTAGGCTAGTGGAGGTTGAGATT
GGAAAACAAGTGCATTGTAGTGTGGTGAAAACAGGGTTTGAGTTTGATTCTTTCACTGAA
GGTTCTCTTATTGATATGTATGCAAAATGTGGTTATTTGATTGATGCTCGGAGAATCTTT
GATGGGGCGGTGGAGCCGGACAATGTTTCTTGGACAGCAATGATTTCTGCTTATATTCAA
GTAGGTCTACCTCAAAAAGCAATGGAGGTGTTTGAGGAGATGCAGGAACGAGGGTGTGTG
CCGGATCAAGTGGCATCCGTGACCATCATAAATGCATGTGTGGGACTAGGTAGGCTTGAT
GCTGCTCGTCAATTGTTTACTCAGATTACTAGTCCAAATGTTGTGGCATGGAATGTGATG
ATTTCTGGTCATGCCAAGGGAGGGAAAGAGGTGGAAGCTATACAGTTTTTTCAAGACATG
ATTAAAGCTAGCATTCGACCCACACGTTCTACCTTGGGAAGTGTTTTGAGTGCAGTTGCA
AGCGTTGCAAATTTATCCTTTGGCTTGCAGGTCCATGCTTTGGCAGTTAAACAGGGATTA
GAATCCAACGTCTATGTTGGGAGTTCTTTGATTAATATGTATGCCAAATGTCAAAAGATG
GAAGCTGCAAGCGAAATATTTAATAGCTTGGGAGAGAAAAATGAGGTGTTGTGGAATGCA
TTGCTTGCAGGTTATGCACAGAATGGCAGTGCTTGTAAAGTTGTGAAGTTATTCAGGAGT
ATGAGACTATCTAGTTTTGAAACTGATGAGTATACTTACACTAGCATACTGAGTGCATGT
GCTTGTTTGGAAGATGTGGAAATGGGGCGGCAACTGCACTCAATTATCATTAAGAATAAA
TTTGCATCTAATTTATTTGTTGGAAATGCATTAATAGACATGTATGCCAAATGTGGGGCT
CTAGGTGATGCCAGGCGTCAGTTTGACAAAATGCTAATGAGAGACCATATTTCCTGGAAT
GCAATAATAGTTGGCTATGTACAGGACGAAGAAGAAGAAGAAGCTTTTATCATGTTCCAC
AAAATGACATTGGAAAGGATTATTCCTGATGAGGCATGTTTGGCTAGCGTACTCAGTGCC
TGTGCCAATATTCACGATCTTAATAAAGGGAAACAAGTTCATTCCTTGCTGGTTAAATAT
GGTCTAGAAAGTGGCCTTTTTGCTGGAAGCTCCCTTGTTGACATGTATTGCAAGTGTGGT
AACATTACTTCTGCCAGTGAGGTTTTCTTTTGCCTTCCTGATCGAAGTGTGGTGTCTACT
AATGCTTTAATTTCTGGCTATGCTCAGACAAACATTAATTATGCGGTGCGTTTATTCCAG
AATATGCTTGTTGAAGGACTAAGGCCTTCGGAAGTGACATTTGCTAGCATTCTAGATGCA
TGTAGTGACCAGGCTTACATGCTTGGGAGGCAATTGCACTCTTTCATTTTAAAGCTTGGA
TTTTCATACGATGATGAATTCTTGGCAATCTCTTTGATAGGCATGTATTATAACTCCAGA
AAATTAGAAGACGCGAGCTTTCTCTTCTCAGAGTTTACCAAGCTAAATAGCCCAGTTCTG
TGGACTGCTATGATATCCGGCAATATTCAAAATGACTGCGGTGAGGAAGCTTTGATTGGT
TATCAGAAAATGCGCAAGTTTAATGTCATGCCAGATCAGGCAACTTTTGCCAGTGCCTTA
AAAGCGTGTTCGACCTTGGCTTCTATGCAGGATGGCAGGAAAATTCACTCTCTCATTTTC
CATACTGGTTTTGACATGGATGAATTGACCAGTAGCTCCCTAATAGATATGTATGCTAAA
TGTGGGGATGTTAAATGTTCAGTGCAAGTGTTTAGTGAAATGGTCAGCAAGAAAGACATT
ATCTCATGGAACTCTATGATAGTTGGCTTTGCAAAAAATGGTTTTGCGGAAGATGCACTG
AAAGTCTTTGAAGAAATGAAGAGGGAATCTGTGAAGCCTGATGATATCACATTCCTTGGG
GTTCTGACTGCTTGTAGCCATGCAGGAATGGTATCTGAAGGTCGTCAAATCTTCAAGGAT
ATGACTAGCCTCTATGATGTTCGGCCACGTGCCGATCACTGTGCCTGTATGGTTGATCTG
CTTGGTCGTTGGGGAAATCTCAAAGAGGCAGAGGAATTTATTGAAAGATTAGATTTTGAA
CTAGATGCTATGATATGGTCTGCTTACCTTGGTGCTTGCAAATTACACGGGGATGATATA
AGGGGACAGAAGGCTGCTGAAAAGCTTATTGAGTTGGAACCCCAAAATTCCTCTTCATAC
ATACTGCTATCTAATATATATGCTGCATCAGGCAATTGGGGTGGAGTTAACTTCTTAAGG
AAAGAAATGAAAGAGAGAGGAGTGAGGAAGCCTCCTGGCTGCAGTTGGATTATAGTGGGG
CAGAAAACAAATATGTTTGTTGCAGGGGATAAATTTCATCCTTGTGCGGGTGAAATTCAT
GCACTTTTGAAAGATTTGACTGCATTAATGAAAGATGAAGGCTATTTTGCTGATATAGGA
TCTGTAATGGATGGTAGCGTGAACTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400042980
PEP Infomation

pacid=37475214 transcript=PGSC0003DMT400063804 locus=PGSC0003DMG400024803 ID=PGSC0003DMT400063804.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MRHIVSSLRQHSLLLHRRRKFSATAPAKQSRNEDPEPQSAPITLLYNNLLKICLQECKNL
QSRRVFDEMPQRAARAVKACKTIHLQSLKLGFASQGHLGNSIVDLYAKCGDMVSAEKAFF
WLENKDSIAWNSIILMYSRNGLLENVVEAFGSMWNSGVWPNQFSYAIVLSACARLVEVEI
GKQVHCSVVKTGFEFDSFTEGSLIDMYAKCGYLIDARRIFDGAVEPDNVSWTAMISAYIQ
VGLPQKAMEVFEEMQERGCVPDQVASVTIINACVGLGRLDAARQLFTQITSPNVVAWNVM
ISGHAKGGKEVEAIQFFQDMIKASIRPTRSTLGSVLSAVASVANLSFGLQVHALAVKQGL
ESNVYVGSSLINMYAKCQKMEAASEIFNSLGEKNEVLWNALLAGYAQNGSACKVVKLFRS
MRLSSFETDEYTYTSILSACACLEDVEMGRQLHSIIIKNKFASNLFVGNALIDMYAKCGA
LGDARRQFDKMLMRDHISWNAIIVGYVQDEEEEEAFIMFHKMTLERIIPDEACLASVLSA
CANIHDLNKGKQVHSLLVKYGLESGLFAGSSLVDMYCKCGNITSASEVFFCLPDRSVVST
NALISGYAQTNINYAVRLFQNMLVEGLRPSEVTFASILDACSDQAYMLGRQLHSFILKLG
FSYDDEFLAISLIGMYYNSRKLEDASFLFSEFTKLNSPVLWTAMISGNIQNDCGEEALIG
YQKMRKFNVMPDQATFASALKACSTLASMQDGRKIHSLIFHTGFDMDELTSSSLIDMYAK
CGDVKCSVQVFSEMVSKKDIISWNSMIVGFAKNGFAEDALKVFEEMKRESVKPDDITFLG
VLTACSHAGMVSEGRQIFKDMTSLYDVRPRADHCACMVDLLGRWGNLKEAEEFIERLDFE
LDAMIWSAYLGACKLHGDDIRGQKAAEKLIELEPQNSSSYILLSNIYAASGNWGGVNFLR
KEMKERGVRKPPGCSWIIVGQKTNMFVAGDKFHPCAGEIHALLKDLTALMKDEGYFADIG
SVMDGSVN*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400063804
Transcript Infomation

pacid=37475214 locus=PGSC0003DMG400024803 ID=PGSC0003DMT400063804.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCGTCACATAGTTTCCTCTCTCAGACAACATTCTCTACTTCTCCATCGCCGTCGCAAA
TTCTCGGCAACCGCGCCGGCGAAACAGTCCAGAAACGAAGACCCAGAACCTCAATCAGCT
CCAATTACTCTCCTATACAACAATCTCCTGAAAATATGTCTACAGGAATGCAAGAACCTT
CAGTCCCGCCGGGTGTTCGACGAAATGCCCCAGAGAGCTGCACGTGCTGTGAAAGCTTGC
AAAACCATCCATTTGCAGAGCCTGAAACTTGGGTTTGCTTCACAAGGACATTTGGGGAAT
TCCATTGTGGATTTATACGCCAAATGTGGAGACATGGTTTCGGCTGAGAAAGCATTTTTC
TGGCTTGAGAACAAGGATAGTATTGCTTGGAATTCAATTATATTGATGTATTCGCGAAAT
GGGTTGTTGGAGAATGTTGTAGAAGCTTTTGGGTCGATGTGGAATTCTGGAGTGTGGCCG
AATCAGTTTAGTTATGCTATTGTTTTGTCTGCTTGTGCTAGGCTAGTGGAGGTTGAGATT
GGAAAACAAGTGCATTGTAGTGTGGTGAAAACAGGGTTTGAGTTTGATTCTTTCACTGAA
GGTTCTCTTATTGATATGTATGCAAAATGTGGTTATTTGATTGATGCTCGGAGAATCTTT
GATGGGGCGGTGGAGCCGGACAATGTTTCTTGGACAGCAATGATTTCTGCTTATATTCAA
GTAGGTCTACCTCAAAAAGCAATGGAGGTGTTTGAGGAGATGCAGGAACGAGGGTGTGTG
CCGGATCAAGTGGCATCCGTGACCATCATAAATGCATGTGTGGGACTAGGTAGGCTTGAT
GCTGCTCGTCAATTGTTTACTCAGATTACTAGTCCAAATGTTGTGGCATGGAATGTGATG
ATTTCTGGTCATGCCAAGGGAGGGAAAGAGGTGGAAGCTATACAGTTTTTTCAAGACATG
ATTAAAGCTAGCATTCGACCCACACGTTCTACCTTGGGAAGTGTTTTGAGTGCAGTTGCA
AGCGTTGCAAATTTATCCTTTGGCTTGCAGGTCCATGCTTTGGCAGTTAAACAGGGATTA
GAATCCAACGTCTATGTTGGGAGTTCTTTGATTAATATGTATGCCAAATGTCAAAAGATG
GAAGCTGCAAGCGAAATATTTAATAGCTTGGGAGAGAAAAATGAGGTGTTGTGGAATGCA
TTGCTTGCAGGTTATGCACAGAATGGCAGTGCTTGTAAAGTTGTGAAGTTATTCAGGAGT
ATGAGACTATCTAGTTTTGAAACTGATGAGTATACTTACACTAGCATACTGAGTGCATGT
GCTTGTTTGGAAGATGTGGAAATGGGGCGGCAACTGCACTCAATTATCATTAAGAATAAA
TTTGCATCTAATTTATTTGTTGGAAATGCATTAATAGACATGTATGCCAAATGTGGGGCT
CTAGGTGATGCCAGGCGTCAGTTTGACAAAATGCTAATGAGAGACCATATTTCCTGGAAT
GCAATAATAGTTGGCTATGTACAGGACGAAGAAGAAGAAGAAGCTTTTATCATGTTCCAC
AAAATGACATTGGAAAGGATTATTCCTGATGAGGCATGTTTGGCTAGCGTACTCAGTGCC
TGTGCCAATATTCACGATCTTAATAAAGGGAAACAAGTTCATTCCTTGCTGGTTAAATAT
GGTCTAGAAAGTGGCCTTTTTGCTGGAAGCTCCCTTGTTGACATGTATTGCAAGTGTGGT
AACATTACTTCTGCCAGTGAGGTTTTCTTTTGCCTTCCTGATCGAAGTGTGGTGTCTACT
AATGCTTTAATTTCTGGCTATGCTCAGACAAACATTAATTATGCGGTGCGTTTATTCCAG
AATATGCTTGTTGAAGGACTAAGGCCTTCGGAAGTGACATTTGCTAGCATTCTAGATGCA
TGTAGTGACCAGGCTTACATGCTTGGGAGGCAATTGCACTCTTTCATTTTAAAGCTTGGA
TTTTCATACGATGATGAATTCTTGGCAATCTCTTTGATAGGCATGTATTATAACTCCAGA
AAATTAGAAGACGCGAGCTTTCTCTTCTCAGAGTTTACCAAGCTAAATAGCCCAGTTCTG
TGGACTGCTATGATATCCGGCAATATTCAAAATGACTGCGGTGAGGAAGCTTTGATTGGT
TATCAGAAAATGCGCAAGTTTAATGTCATGCCAGATCAGGCAACTTTTGCCAGTGCCTTA
AAAGCGTGTTCGACCTTGGCTTCTATGCAGGATGGCAGGAAAATTCACTCTCTCATTTTC
CATACTGGTTTTGACATGGATGAATTGACCAGTAGCTCCCTAATAGATATGTATGCTAAA
TGTGGGGATGTTAAATGTTCAGTGCAAGTGTTTAGTGAAATGGTCAGCAAGAAAGACATT
ATCTCATGGAACTCTATGATAGTTGGCTTTGCAAAAAATGGTTTTGCGGAAGATGCACTG
AAAGTCTTTGAAGAAATGAAGAGGGAATCTGTGAAGCCTGATGATATCACATTCCTTGGG
GTTCTGACTGCTTGTAGCCATGCAGGAATGGTATCTGAAGGTCGTCAAATCTTCAAGGAT
ATGACTAGCCTCTATGATGTTCGGCCACGTGCCGATCACTGTGCCTGTATGGTTGATCTG
CTTGGTCGTTGGGGAAATCTCAAAGAGGCAGAGGAATTTATTGAAAGATTAGATTTTGAA
CTAGATGCTATGATATGGTCTGCTTACCTTGGTGCTTGCAAATTACACGGGGATGATATA
AGGGGACAGAAGGCTGCTGAAAAGCTTATTGAGTTGGAACCCCAAAATTCCTCTTCATAC
ATACTGCTATCTAATATATATGCTGCATCAGGCAATTGGGGTGGAGTTAACTTCTTAAGG
AAAGAAATGAAAGAGAGAGGAGTGAGGAAGCCTCCTGGCTGCAGTTGGATTATAGTGGGG
CAGAAAACAAATATGTTTGTTGCAGGGGATAAATTTCATCCTTGTGCGGGTGAAATTCAT
GCACTTTTGAAAGATTTGACTGCATTAATGAAAGATGAAGGCTATTTTGCTGATATAGGA
TCTGTAATGGATGGTAGCGTGAACTAA