Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400063625
CDS Infomation	pacid=37435587 polypeptide=PGSC0003DMP400042838 locus=PGSC0003DMG402024734 ID=PGSC0003DMT400063625.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGCAAGCAGCTTCTCATTGCTATCCTCTTGTTCACTTTTCTGGAAGAGGCAGGTATAGT AAGGTGAGTAATCACTCAAGTGTAAAAATTTTGAGGAGCTTGAATTGGCTTCCCCAGAAA TTTGACTTTAATCAAGGAGCTCAGATCCAGAAGATTTTAAAATCTTCCAAACCGAAAAGG TTCTGTGTGATTCCCAACTCTAATGATAGTTATCCAAGTCTCTCTGTTTCTGAAGAGGAC ACAACTGCATCTAAAAAAGACACATCTACAATGGAAGAATGGGAATATGGAGGAGAAGCG TTCTTGAGTAAGTGGTCGCCTCCCAGGTACTTATGGAGGGGATTATCAGTTCTTATCTTG GCAGGACAGGTTATTATTAGGATTATGAAGGGTAAAATCCACTGGAAGAATACTCTTCAA CAGTTGGAAAGAGTTGGACCTAAGTCAGTTGGTGTCTGTTTGTTAACTGCAGCTTTTGTT GGCATGGCCTTCACTATCCAATTTGTTAGAGAATTCACTAGATTAGGGTTAAATAGATCT GTTGGTGGGGTGTTGGCCCTTGCCTTTTCAAGAGAGTTAAGTCCAGTTGTCACATCAATT GTAGTTGCCGGGCGTATCGGTAGTGCATTTGCTGCGGAACTGGGCACCATGCAGGTATCT GAGCAGACAGACACGTTGAGAGTTCTCGGTGCAAATCCTGTTGATTATTTGGTGACACCA AGAGTGATTGCTTCCTGCATTGCCTTACCATTTTTGACCCTAATGTGCTTTACAGTTGGA ATGGCATCCAGCGCCCTTTTAGCTGACGGTGTTTATGGAATTAGCATAAACATAATCTTG GATTCTGCTCAGAGAGCTCTCAAGTCATGGGACCTTATCAGTGCGATGATTAAGTCACAG GTTTTTGGTGCTATTATATCCATCATAAGCTGTGCTTGGGGAGTCACCACACTGGGAGGT GCTAAAGGGGTTGGAGAGTCTACTACTTCAGCGGTAGTTTTATCTCTTGTTGGCATATTC GTAGCGGACTTTGCTCTCTCATGTTGTTTCTTCCAGGGTGCTGGTGATTCCCTGAAGAAC TGTATGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400042838
PEP Infomation	pacid=37435587 transcript=PGSC0003DMT400063625 locus=PGSC0003DMG402024734 ID=PGSC0003DMT400063625.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	MQAASHCYPLVHFSGRGRYSKVSNHSSVKILRSLNWLPQKFDFNQGAQIQKILKSSKPKR FCVIPNSNDSYPSLSVSEEDTTASKKDTSTMEEWEYGGEAFLSKWSPPRYLWRGLSVLIL AGQVIIRIMKGKIHWKNTLQQLERVGPKSVGVCLLTAAFVGMAFTIQFVREFTRLGLNRS VGGVLALAFSRELSPVVTSIVVAGRIGSAFAAELGTMQVSEQTDTLRVLGANPVDYLVTP RVIASCIALPFLTLMCFTVGMASSALLADGVYGISINIILDSAQRALKSWDLISAMIKSQ VFGAIISIISCAWGVTTLGGAKGVGESTTSAVVLSLVGIFVADFALSCCFFQGAGDSLKN CM*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400063625
Transcript Infomation	pacid=37435587 locus=PGSC0003DMG402024734 ID=PGSC0003DMT400063625.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGCAAGCAGCTTCTCATTGCTATCCTCTTGTTCACTTTTCTGGAAGAGGCAGGTATAGT AAGGTGAGTAATCACTCAAGTGTAAAAATTTTGAGGAGCTTGAATTGGCTTCCCCAGAAA TTTGACTTTAATCAAGGAGCTCAGATCCAGAAGATTTTAAAATCTTCCAAACCGAAAAGG TTCTGTGTGATTCCCAACTCTAATGATAGTTATCCAAGTCTCTCTGTTTCTGAAGAGGAC ACAACTGCATCTAAAAAAGACACATCTACAATGGAAGAATGGGAATATGGAGGAGAAGCG TTCTTGAGTAAGTGGTCGCCTCCCAGGTACTTATGGAGGGGATTATCAGTTCTTATCTTG GCAGGACAGGTTATTATTAGGATTATGAAGGGTAAAATCCACTGGAAGAATACTCTTCAA CAGTTGGAAAGAGTTGGACCTAAGTCAGTTGGTGTCTGTTTGTTAACTGCAGCTTTTGTT GGCATGGCCTTCACTATCCAATTTGTTAGAGAATTCACTAGATTAGGGTTAAATAGATCT GTTGGTGGGGTGTTGGCCCTTGCCTTTTCAAGAGAGTTAAGTCCAGTTGTCACATCAATT GTAGTTGCCGGGCGTATCGGTAGTGCATTTGCTGCGGAACTGGGCACCATGCAGGTATCT GAGCAGACAGACACGTTGAGAGTTCTCGGTGCAAATCCTGTTGATTATTTGGTGACACCA AGAGTGATTGCTTCCTGCATTGCCTTACCATTTTTGACCCTAATGTGCTTTACAGTTGGA ATGGCATCCAGCGCCCTTTTAGCTGACGGTGTTTATGGAATTAGCATAAACATAATCTTG GATTCTGCTCAGAGAGCTCTCAAGTCATGGGACCTTATCAGTGCGATGATTAAGTCACAG GTTTTTGGTGCTATTATATCCATCATAAGCTGTGCTTGGGGAGTCACCACACTGGGAGGT GCTAAAGGGGTTGGAGAGTCTACTACTTCAGCGGTAGTTTTATCTCTTGTTGGCATATTC GTAGCGGACTTTGCTCTCTCATGTTGTTTCTTCCAGGGTGCTGGTGATTCCCTGAAGAAC TGTATGTGA