Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400063400
CDS Infomation

pacid=37460860 polypeptide=PGSC0003DMP400042691 locus=PGSC0003DMG400024661 ID=PGSC0003DMT400063400.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTCAGAAGAGGAATCTGATATTCTTCTTCCTGTTGTATTATTCCACTTCTTGCTTCTA
ATCACTACTGTTTGTGGAGATACCCTGGAGAGTGACAGGCAAGTGTTACTGAGTTACAAG
TATTTTCTTGAACATCAAAATCCGGTTAATAAAGGATACAGGCATACAGAATGGAATGCT
TCTGATTCGTCTCCGTGTAATTGGCGTGGGGTTTTTTGTGATGGTGGAGTTGATCGTGTT
ACTCGAATTGATCTCTCTGGTGATAGTTTGGCTGGGAATATGTTTTACAACTTCTCAGCT
ATGACAGAGTTGACATATATTGATTTGTCTATGAATACAATTGGAGGGTCTATTCCTGCA
GACTTAGGCCAATGTAAAAACCTGAGATTCTTGAATTTATCGCATAATATTATTGATGGG
GAGCTTAATTTGACTGGTTTGAACAATTTGCAAGTTCTTGATTTGACCATGAACAGGATT
CATGGTGAGATCAGTTTAACTTTCCCTGGAATTTGTGATAGTTTGGTGGTTGCTAACATT
TCGAATAACAATTTTACTGGTGAGATTGGAAGTACTTTTGATCAGTGCTGGAATCTTAGA
TATCTTGATTTGAGCTACAATAACTTGACTGGAGGATTGTCATTTGGTTTTGATAAGCTT
AAGGAGTTTTCGGTGTCTAAAAACAAGTGTAATGGCTCTCTGCCTTCGTCATTTTTCACT
CAAAACTGCACCTTGCAGGTGTTGGATTTATCAGAAAATGGATTCGTTGGAGGAGTGCCT
AAAGAGATATCGAATTGTAAGAACTTGGAGGACTTGAATTTGTCTGGAAATAACTTTTCA
GGGCCAATTCCTGAGGAAATTGGATCAGTTATGAGTCTTCAAGCACTTTACTTGGGAAGC
AACAATTTTTCAAGGGATATTCCAGAGAGTCTATTAAGTTTAAGTAACTTAGTGTTTCTT
GATCTTAGTAGAAACAACTTCAGAGGAGAAATACAAGAAATTTTCAGGCAATTTACACAG
GTAAAGTTTCTTCTGTTGCATGGTAATTCTTATACTGGAGGTATAGTTACCTCTGGAATT
CCCAACTTAGTGAACCTTTCTCGATTGGACTTGAGCGATAACCAATTCTCCGGTCCATTG
CCAGTTGAACTTTCCAAGATGAAAGGGTTGAAGTTTCTGATTCTTGCATATAACCACTTT
AATGGAAGTATACCATCAGTATACGGGGATATTCCGACACTTCAGGCCCTTGATCTTTCA
TCTAATAAGTTAACTGGCTCAATACCACCAAGTTTAGGGAAGCTAAGCTCACTTTTGTGG
TTGATGCTTGCTAACAATTCACTGACCGGTGGAATCCCACCCGAGTTGGGAAATTGCAGT
AGCTTATTGTGGTTGAATCTTGCAAACAATCAGCTTTCTGGTTCAATTCCACCTCAGTTA
GCAAGAATTGGCTCAAATCCTATGCCTACTTTCTTGTCGAATAGGGCTAAGGATAAGGTG
ACTGCTGGCTCGGGGGAGTGCTTTGCTATGAAGAGATGGATACCAGCTGATTACCCTCCA
TTTAGCTTTGTATATCCTCTCCTTACCAGGAAGAATTGTAGAAGCCTATGGGATAAATTG
CTCAAAGGGTATGGTTTATTTCCAGTGTGTGAACCGGGTAGTAATGTTCGTTCAAATCAG
ATATCAGGCTATCTTCAACTTAGTATGAACAAATTTTCTGGTGGGATCCCTCCTGAAATT
GGCAGCATGCAGAATTTCAGTATGCTTCATTTGGGTGTAAATGAATTCGGTGGCACGCTC
CCTTCAGAGATTGGAAAAATGCAGCTAGTAGTCCTTAATATTTCACAAAACAGAATATCT
GGTGAGATTCCAAGCCAGATTGGCAACATTAAGTGCTTACTGAATCTTGATCTGTCCAGC
AACAATTTCTCTGGTCTGTTCCCAGCTAGTTTTAGTAACTTGACTGATCTAAGCAAGTTC
AATATCTCTTACAACGCGTACATCTATGGTACTATACCAGAAAGTGGGCAATTAGCCACA
TTCGAGAAGTCATCATACCTTGGTGTTCCATTGCTGCACCTTCCACCTTTCATTGATAAC
ACTAGGAATAATACTATAAACAAGGGTGGAAGTTTCAAAAGGCCTACAAAGGTTGGTACA
GTTTTGGTATTCATGGCTTTGCTACTGGCTTTGCTAGTTTGTGGACTTATGACACTTGTT
ATCTGCCTTGTTCTAAAATCTCCGATAGATACACCAGGATACCTACTGGAGGATTCAAAG
GGCCGACACGATCTTGCATCGAGTTCAGGTGCATCCTCACCATGGTTGTCTAATGATGTT
AAGGTTATCCGCTTGGACAAAACAAGCTTCACACATTCTGACATATTGAAGGCCACAGGC
AGATTCTCGAATGACAGAATTATAGGGAAGGGAGGATTTGGGACAGTTTATCGCGGAGTC
TTGCCTGATGGAAGGCAAGTGGCGGTGAAAAAGCTACAAAGAGAGGGAATTGAAGGGGAA
AGAGAGTTTAGAGCTGAAATGGAAGTACTAAGTGGAAATGACTTTGGTTGGCATCCGAAT
CTTGTAACACTTTACGGTTGGTGCCTTAATGGATCAGAGAAATTGTTAGTCTATGAATAC
ATGGGAGGTGGAAGCTTAGATGAGATCATCACAGATAGAACCAAATTCACATGGAAGAAA
CGACTCAACGTGGCAATTGATGTTGCACGTGCTTTAGTCTTCTTACACCACGAGTGTTAC
CCTTGTATCGTCCACAGAGATGTCAAGGCTAGCAACGTGCTGCTAGACAAAGACGGAAGG
GCAAGAGTCACAGATTTTGGCCTAGCTAGGGTTATGGATGCTGGAGATAGTCATGTTAGC
ACAATGGTTGCTGGTACAGTCGGGTACGTTGCACCAGAATATGGACAGACATGGCAGGCC
ACAACAAAAGGCGATGTCTACAGTTATGGAGTGCTGGCAATGGAGTTAGCCACAGGGAGA
CGCGCTGTAGATGGAGGCGAGGAATGTCTAGTTGAATGGGCGAGACGTGTGATGGGAGAC
GGAAGGCATGGATTCACCAGAGCCATAATACCAGTTTCTCTTTTGGTATCAGGCCTAGCA
GAGGGAGCAGAGGAATTGTGTGAGTTGCTTAGAATAGGAATAAGGTGCATTGCTGATAGT
CCTCATGCTAGGCCTAACATGAAGGAAGTATTGGATTTGTTAATCGCGATTTTGCGCAGC
CAAAGATCAGGATCCAGTCGTAGCACTTCTCCTTCATTTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400042691
PEP Infomation

pacid=37460860 transcript=PGSC0003DMT400063400 locus=PGSC0003DMG400024661 ID=PGSC0003DMT400063400.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MSEEESDILLPVVLFHFLLLITTVCGDTLESDRQVLLSYKYFLEHQNPVNKGYRHTEWNA
SDSSPCNWRGVFCDGGVDRVTRIDLSGDSLAGNMFYNFSAMTELTYIDLSMNTIGGSIPA
DLGQCKNLRFLNLSHNIIDGELNLTGLNNLQVLDLTMNRIHGEISLTFPGICDSLVVANI
SNNNFTGEIGSTFDQCWNLRYLDLSYNNLTGGLSFGFDKLKEFSVSKNKCNGSLPSSFFT
QNCTLQVLDLSENGFVGGVPKEISNCKNLEDLNLSGNNFSGPIPEEIGSVMSLQALYLGS
NNFSRDIPESLLSLSNLVFLDLSRNNFRGEIQEIFRQFTQVKFLLLHGNSYTGGIVTSGI
PNLVNLSRLDLSDNQFSGPLPVELSKMKGLKFLILAYNHFNGSIPSVYGDIPTLQALDLS
SNKLTGSIPPSLGKLSSLLWLMLANNSLTGGIPPELGNCSSLLWLNLANNQLSGSIPPQL
ARIGSNPMPTFLSNRAKDKVTAGSGECFAMKRWIPADYPPFSFVYPLLTRKNCRSLWDKL
LKGYGLFPVCEPGSNVRSNQISGYLQLSMNKFSGGIPPEIGSMQNFSMLHLGVNEFGGTL
PSEIGKMQLVVLNISQNRISGEIPSQIGNIKCLLNLDLSSNNFSGLFPASFSNLTDLSKF
NISYNAYIYGTIPESGQLATFEKSSYLGVPLLHLPPFIDNTRNNTINKGGSFKRPTKVGT
VLVFMALLLALLVCGLMTLVICLVLKSPIDTPGYLLEDSKGRHDLASSSGASSPWLSNDV
KVIRLDKTSFTHSDILKATGRFSNDRIIGKGGFGTVYRGVLPDGRQVAVKKLQREGIEGE
REFRAEMEVLSGNDFGWHPNLVTLYGWCLNGSEKLLVYEYMGGGSLDEIITDRTKFTWKK
RLNVAIDVARALVFLHHECYPCIVHRDVKASNVLLDKDGRARVTDFGLARVMDAGDSHVS
TMVAGTVGYVAPEYGQTWQATTKGDVYSYGVLAMELATGRRAVDGGEECLVEWARRVMGD
GRHGFTRAIIPVSLLVSGLAEGAEELCELLRIGIRCIADSPHARPNMKEVLDLLIAILRS
QRSGSSRSTSPSF*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400063400
Transcript Infomation

pacid=37460860 locus=PGSC0003DMG400024661 ID=PGSC0003DMT400063400.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTCAGAAGAGGAATCTGATATTCTTCTTCCTGTTGTATTATTCCACTTCTTGCTTCTA
ATCACTACTGTTTGTGGAGATACCCTGGAGAGTGACAGGCAAGTGTTACTGAGTTACAAG
TATTTTCTTGAACATCAAAATCCGGTTAATAAAGGATACAGGCATACAGAATGGAATGCT
TCTGATTCGTCTCCGTGTAATTGGCGTGGGGTTTTTTGTGATGGTGGAGTTGATCGTGTT
ACTCGAATTGATCTCTCTGGTGATAGTTTGGCTGGGAATATGTTTTACAACTTCTCAGCT
ATGACAGAGTTGACATATATTGATTTGTCTATGAATACAATTGGAGGGTCTATTCCTGCA
GACTTAGGCCAATGTAAAAACCTGAGATTCTTGAATTTATCGCATAATATTATTGATGGG
GAGCTTAATTTGACTGGTTTGAACAATTTGCAAGTTCTTGATTTGACCATGAACAGGATT
CATGGTGAGATCAGTTTAACTTTCCCTGGAATTTGTGATAGTTTGGTGGTTGCTAACATT
TCGAATAACAATTTTACTGGTGAGATTGGAAGTACTTTTGATCAGTGCTGGAATCTTAGA
TATCTTGATTTGAGCTACAATAACTTGACTGGAGGATTGTCATTTGGTTTTGATAAGCTT
AAGGAGTTTTCGGTGTCTAAAAACAAGTGTAATGGCTCTCTGCCTTCGTCATTTTTCACT
CAAAACTGCACCTTGCAGGTGTTGGATTTATCAGAAAATGGATTCGTTGGAGGAGTGCCT
AAAGAGATATCGAATTGTAAGAACTTGGAGGACTTGAATTTGTCTGGAAATAACTTTTCA
GGGCCAATTCCTGAGGAAATTGGATCAGTTATGAGTCTTCAAGCACTTTACTTGGGAAGC
AACAATTTTTCAAGGGATATTCCAGAGAGTCTATTAAGTTTAAGTAACTTAGTGTTTCTT
GATCTTAGTAGAAACAACTTCAGAGGAGAAATACAAGAAATTTTCAGGCAATTTACACAG
GTAAAGTTTCTTCTGTTGCATGGTAATTCTTATACTGGAGGTATAGTTACCTCTGGAATT
CCCAACTTAGTGAACCTTTCTCGATTGGACTTGAGCGATAACCAATTCTCCGGTCCATTG
CCAGTTGAACTTTCCAAGATGAAAGGGTTGAAGTTTCTGATTCTTGCATATAACCACTTT
AATGGAAGTATACCATCAGTATACGGGGATATTCCGACACTTCAGGCCCTTGATCTTTCA
TCTAATAAGTTAACTGGCTCAATACCACCAAGTTTAGGGAAGCTAAGCTCACTTTTGTGG
TTGATGCTTGCTAACAATTCACTGACCGGTGGAATCCCACCCGAGTTGGGAAATTGCAGT
AGCTTATTGTGGTTGAATCTTGCAAACAATCAGCTTTCTGGTTCAATTCCACCTCAGTTA
GCAAGAATTGGCTCAAATCCTATGCCTACTTTCTTGTCGAATAGGGCTAAGGATAAGGTG
ACTGCTGGCTCGGGGGAGTGCTTTGCTATGAAGAGATGGATACCAGCTGATTACCCTCCA
TTTAGCTTTGTATATCCTCTCCTTACCAGGAAGAATTGTAGAAGCCTATGGGATAAATTG
CTCAAAGGGTATGGTTTATTTCCAGTGTGTGAACCGGGTAGTAATGTTCGTTCAAATCAG
ATATCAGGCTATCTTCAACTTAGTATGAACAAATTTTCTGGTGGGATCCCTCCTGAAATT
GGCAGCATGCAGAATTTCAGTATGCTTCATTTGGGTGTAAATGAATTCGGTGGCACGCTC
CCTTCAGAGATTGGAAAAATGCAGCTAGTAGTCCTTAATATTTCACAAAACAGAATATCT
GGTGAGATTCCAAGCCAGATTGGCAACATTAAGTGCTTACTGAATCTTGATCTGTCCAGC
AACAATTTCTCTGGTCTGTTCCCAGCTAGTTTTAGTAACTTGACTGATCTAAGCAAGTTC
AATATCTCTTACAACGCGTACATCTATGGTACTATACCAGAAAGTGGGCAATTAGCCACA
TTCGAGAAGTCATCATACCTTGGTGTTCCATTGCTGCACCTTCCACCTTTCATTGATAAC
ACTAGGAATAATACTATAAACAAGGGTGGAAGTTTCAAAAGGCCTACAAAGGTTGGTACA
GTTTTGGTATTCATGGCTTTGCTACTGGCTTTGCTAGTTTGTGGACTTATGACACTTGTT
ATCTGCCTTGTTCTAAAATCTCCGATAGATACACCAGGATACCTACTGGAGGATTCAAAG
GGCCGACACGATCTTGCATCGAGTTCAGGTGCATCCTCACCATGGTTGTCTAATGATGTT
AAGGTTATCCGCTTGGACAAAACAAGCTTCACACATTCTGACATATTGAAGGCCACAGGC
AGATTCTCGAATGACAGAATTATAGGGAAGGGAGGATTTGGGACAGTTTATCGCGGAGTC
TTGCCTGATGGAAGGCAAGTGGCGGTGAAAAAGCTACAAAGAGAGGGAATTGAAGGGGAA
AGAGAGTTTAGAGCTGAAATGGAAGTACTAAGTGGAAATGACTTTGGTTGGCATCCGAAT
CTTGTAACACTTTACGGTTGGTGCCTTAATGGATCAGAGAAATTGTTAGTCTATGAATAC
ATGGGAGGTGGAAGCTTAGATGAGATCATCACAGATAGAACCAAATTCACATGGAAGAAA
CGACTCAACGTGGCAATTGATGTTGCACGTGCTTTAGTCTTCTTACACCACGAGTGTTAC
CCTTGTATCGTCCACAGAGATGTCAAGGCTAGCAACGTGCTGCTAGACAAAGACGGAAGG
GCAAGAGTCACAGATTTTGGCCTAGCTAGGGTTATGGATGCTGGAGATAGTCATGTTAGC
ACAATGGTTGCTGGTACAGTCGGGTACGTTGCACCAGAATATGGACAGACATGGCAGGCC
ACAACAAAAGGCGATGTCTACAGTTATGGAGTGCTGGCAATGGAGTTAGCCACAGGGAGA
CGCGCTGTAGATGGAGGCGAGGAATGTCTAGTTGAATGGGCGAGACGTGTGATGGGAGAC
GGAAGGCATGGATTCACCAGAGCCATAATACCAGTTTCTCTTTTGGTATCAGGCCTAGCA
GAGGGAGCAGAGGAATTGTGTGAGTTGCTTAGAATAGGAATAAGGTGCATTGCTGATAGT
CCTCATGCTAGGCCTAACATGAAGGAAGTATTGGATTTGTTAATCGCGATTTTGCGCAGC
CAAAGATCAGGATCCAGTCGTAGCACTTCTCCTTCATTTTGA