Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400062418
CDS Infomation

pacid=37455996 polypeptide=PGSC0003DMP400042022 locus=PGSC0003DMG400024291 ID=PGSC0003DMT400062418.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAAACTGTTACTGTTGCTTCTTCGACATCAAGGTTTCGGTTCAGGGATATTCCCGCT
GATGACGATTCAACGGATGCTCATTCCGCCTCTGATTTTTCCTCTGTTTCCAGTGATTTT
GATGTTGATACAGAGCTCCAGTCCATGACTGCTAAGGGCATTACTCACCTTTGTTCAGAA
CTCCTTGAGTTGAAAAGAGAGTCCGAGGAAGATTTTCAGAAAATCATCTTCACAAATTAC
TCGGTATTTATTGGGATATTTGAAGGGACAAAAAATCTAGAGAGTGACTTATTGCAACTG
AAGTACCAGGTTGCAAAGCAGAAAGGGCTCATAAAAGATCTTACAAATGGTGTTTTTCTA
AAGTTTCTCGAAGAGGTGAAGACAGAGTCAAATCTTGAAGACAGTTTAACAGATTATACG
TCTTTGTCCAGCATTATTGATGCTCACACAAACGAGGTTTCTGAAATTCTGGATGATCTT
CTTTCAGAACATCAATTGGATGAAGCTATTTCTTTCTTGGAGAAGGAAGCTGAGTTCTTC
AAATATAGCCAGTTGACGGAGAACCCTTTAACGGATGAATTGATGTGTTATAACTCTAAA
ATATCAGAAAAGACATCTATGATTGCAGATCAGTTGACAGTAGTAGCTAAGAATCCTCGC
GTTTCTGCACCTGAACTGCAGAAAGCATTGGTTGGACTCCGTAGAATTGGTGAAAGTGAT
CTTGCAACTGAATTATTGCTTAAGTATTATAAATCACGTATTGCAGATGGCACACATGAT
TTGTTTTTCTCCAAGGCCTATACACACGAACTATATCTCCGAGAAGTCACAAAGTTTTTA
TTTTCCATGATCTCCCAAGCAGCTAAAAGTTTCACCCTTTTGCATGGTGAGAATTCATCT
TATGAGTCGGAATTACATCGGTGGGTGATGGAACAAACTGGAATCTTTTCTGTTTGTTTC
AATAATTATGTTATATCCATGGTAGAGCCAAGTACTGGCTTATCAACAGCAGTAGAGGCT
GTACAATCCACAATGGCTTATTGCTCTTTGTTAGAGGCACAGGGAATTGAATTGCAATCG
TCTTTGATAGAACATATCCGTCCATGTATACACGAGGTCTTACAGATCCATGTACAACAC
TTTAAGAAAGTGATCGGTATCTTTACCTCATGCGAGACTTGGGTTCTGGGAAGATATCTA
GTATCAGGAATTTTATCGCCTGATAGTTATTCCACCAACACTGGCCAGCCGCTATCAGAC
TATTGTCTGCTCACCAACAGTGGTCGGAAGTTCATAACACTAAATCAGGCCATACTTGAA
GAAGTTTCTCCGCTAATCCAACTACATATGGAAGGCTTGCTTTTAAGAGGCCTTCTAGTT
CTTTTTACAGAGTATACTTCTATTTTGGAAAGCGCACTGACAAATCAGACAGAAATTGAG
GAAGTTGATTCAAGAATCAATATTGCAGAGTCAGTAGAACAACAAGTTTCTCTTATTTCC
AACTTATCAAAACTAGGACAAATCTTCTCCAGTATGATTCGGAGGGCGTTCTGTGACACC
TACCACTTGGAGTTCGAGATTGATAATTATGAGCTCTTCATTAACGACAACTGTAGTCGT
CTAAGATCTCAATTCTGCAAGCAATTAATTCTTAAAAGTGGCCATAGATGTAGTCCTCCT
CCAGCATGTTGCACTGATCTACAGCCCTCTATTTCTTACCAGGAATTGTATTTCGCGTTA
AGGAATCTAAAAGAGCATGCTGATGACACTCTTATCGAAATGAAATGGTTAAAGGATCTA
TTCATTGAGCTGATGGAGATGATGTTAGATACGAATATGGATAAAGAAGAAACTTTTCTA
ATTTTGAATCTCAAACAGCTTACTCTTGATATCCACTTTCTCCTTGAAATTGCTAAATGG
GGAGGATACTTGTCTGATACCATCATGAATGTCTATTTTAATTCGGAACCTCGTATAAAA
TCAGCGTTCCTCTATGCTGGAATGGATCTTGAAAGGTACATGATCTATGTCGGATGGGCG
ACAAAGACTGCTATTGAAGCCCTGCAGAAGCTGCATGAACTTGATAAAGCGGAAATGCTT
AGCAGTGAGTTTATTGATAATATTGAAGATGAAACAAACAAATCTACTGAATCATGCGGG
AGCATTGATGCTTCCAAATCAGAAGAGGTTACAGCTTGTATCGAGATGTTTGAAATCGGT
ATTGTATCCAAGGAAGGTAACGCAAGTGTTGAAGAAGAAAATGAGAAGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400042022
PEP Infomation

pacid=37455996 transcript=PGSC0003DMT400062418 locus=PGSC0003DMG400024291 ID=PGSC0003DMT400062418.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

METVTVASSTSRFRFRDIPADDDSTDAHSASDFSSVSSDFDVDTELQSMTAKGITHLCSE
LLELKRESEEDFQKIIFTNYSVFIGIFEGTKNLESDLLQLKYQVAKQKGLIKDLTNGVFL
KFLEEVKTESNLEDSLTDYTSLSSIIDAHTNEVSEILDDLLSEHQLDEAISFLEKEAEFF
KYSQLTENPLTDELMCYNSKISEKTSMIADQLTVVAKNPRVSAPELQKALVGLRRIGESD
LATELLLKYYKSRIADGTHDLFFSKAYTHELYLREVTKFLFSMISQAAKSFTLLHGENSS
YESELHRWVMEQTGIFSVCFNNYVISMVEPSTGLSTAVEAVQSTMAYCSLLEAQGIELQS
SLIEHIRPCIHEVLQIHVQHFKKVIGIFTSCETWVLGRYLVSGILSPDSYSTNTGQPLSD
YCLLTNSGRKFITLNQAILEEVSPLIQLHMEGLLLRGLLVLFTEYTSILESALTNQTEIE
EVDSRINIAESVEQQVSLISNLSKLGQIFSSMIRRAFCDTYHLEFEIDNYELFINDNCSR
LRSQFCKQLILKSGHRCSPPPACCTDLQPSISYQELYFALRNLKEHADDTLIEMKWLKDL
FIELMEMMLDTNMDKEETFLILNLKQLTLDIHFLLEIAKWGGYLSDTIMNVYFNSEPRIK
SAFLYAGMDLERYMIYVGWATKTAIEALQKLHELDKAEMLSSEFIDNIEDETNKSTESCG
SIDASKSEEVTACIEMFEIGIVSKEGNASVEEENEK*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400062418
Transcript Infomation

pacid=37455996 locus=PGSC0003DMG400024291 ID=PGSC0003DMT400062418.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAAACTGTTACTGTTGCTTCTTCGACATCAAGGTTTCGGTTCAGGGATATTCCCGCT
GATGACGATTCAACGGATGCTCATTCCGCCTCTGATTTTTCCTCTGTTTCCAGTGATTTT
GATGTTGATACAGAGCTCCAGTCCATGACTGCTAAGGGCATTACTCACCTTTGTTCAGAA
CTCCTTGAGTTGAAAAGAGAGTCCGAGGAAGATTTTCAGAAAATCATCTTCACAAATTAC
TCGGTATTTATTGGGATATTTGAAGGGACAAAAAATCTAGAGAGTGACTTATTGCAACTG
AAGTACCAGGTTGCAAAGCAGAAAGGGCTCATAAAAGATCTTACAAATGGTGTTTTTCTA
AAGTTTCTCGAAGAGGTGAAGACAGAGTCAAATCTTGAAGACAGTTTAACAGATTATACG
TCTTTGTCCAGCATTATTGATGCTCACACAAACGAGGTTTCTGAAATTCTGGATGATCTT
CTTTCAGAACATCAATTGGATGAAGCTATTTCTTTCTTGGAGAAGGAAGCTGAGTTCTTC
AAATATAGCCAGTTGACGGAGAACCCTTTAACGGATGAATTGATGTGTTATAACTCTAAA
ATATCAGAAAAGACATCTATGATTGCAGATCAGTTGACAGTAGTAGCTAAGAATCCTCGC
GTTTCTGCACCTGAACTGCAGAAAGCATTGGTTGGACTCCGTAGAATTGGTGAAAGTGAT
CTTGCAACTGAATTATTGCTTAAGTATTATAAATCACGTATTGCAGATGGCACACATGAT
TTGTTTTTCTCCAAGGCCTATACACACGAACTATATCTCCGAGAAGTCACAAAGTTTTTA
TTTTCCATGATCTCCCAAGCAGCTAAAAGTTTCACCCTTTTGCATGGTGAGAATTCATCT
TATGAGTCGGAATTACATCGGTGGGTGATGGAACAAACTGGAATCTTTTCTGTTTGTTTC
AATAATTATGTTATATCCATGGTAGAGCCAAGTACTGGCTTATCAACAGCAGTAGAGGCT
GTACAATCCACAATGGCTTATTGCTCTTTGTTAGAGGCACAGGGAATTGAATTGCAATCG
TCTTTGATAGAACATATCCGTCCATGTATACACGAGGTCTTACAGATCCATGTACAACAC
TTTAAGAAAGTGATCGGTATCTTTACCTCATGCGAGACTTGGGTTCTGGGAAGATATCTA
GTATCAGGAATTTTATCGCCTGATAGTTATTCCACCAACACTGGCCAGCCGCTATCAGAC
TATTGTCTGCTCACCAACAGTGGTCGGAAGTTCATAACACTAAATCAGGCCATACTTGAA
GAAGTTTCTCCGCTAATCCAACTACATATGGAAGGCTTGCTTTTAAGAGGCCTTCTAGTT
CTTTTTACAGAGTATACTTCTATTTTGGAAAGCGCACTGACAAATCAGACAGAAATTGAG
GAAGTTGATTCAAGAATCAATATTGCAGAGTCAGTAGAACAACAAGTTTCTCTTATTTCC
AACTTATCAAAACTAGGACAAATCTTCTCCAGTATGATTCGGAGGGCGTTCTGTGACACC
TACCACTTGGAGTTCGAGATTGATAATTATGAGCTCTTCATTAACGACAACTGTAGTCGT
CTAAGATCTCAATTCTGCAAGCAATTAATTCTTAAAAGTGGCCATAGATGTAGTCCTCCT
CCAGCATGTTGCACTGATCTACAGCCCTCTATTTCTTACCAGGAATTGTATTTCGCGTTA
AGGAATCTAAAAGAGCATGCTGATGACACTCTTATCGAAATGAAATGGTTAAAGGATCTA
TTCATTGAGCTGATGGAGATGATGTTAGATACGAATATGGATAAAGAAGAAACTTTTCTA
ATTTTGAATCTCAAACAGCTTACTCTTGATATCCACTTTCTCCTTGAAATTGCTAAATGG
GGAGGATACTTGTCTGATACCATCATGAATGTCTATTTTAATTCGGAACCTCGTATAAAA
TCAGCGTTCCTCTATGCTGGAATGGATCTTGAAAGGTACATGATCTATGTCGGATGGGCG
ACAAAGACTGCTATTGAAGCCCTGCAGAAGCTGCATGAACTTGATAAAGCGGAAATGCTT
AGCAGTGAGTTTATTGATAATATTGAAGATGAAACAAACAAATCTACTGAATCATGCGGG
AGCATTGATGCTTCCAAATCAGAAGAGGTTACAGCTTGTATCGAGATGTTTGAAATCGGT
ATTGTATCCAAGGAAGGTAACGCAAGTGTTGAAGAAGAAAATGAGAAGTGA