Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400062353
CDS Infomation

pacid=37454921 polypeptide=PGSC0003DMP400041981 locus=PGSC0003DMG400024267 ID=PGSC0003DMT400062353.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTGAAGGATTTGAACCATATCATGTCCCACAACAAAGTAGAAGAGATAAGCTTAGA
GTTTTACTTGATGAAAATAATAATAGTAATTGTCAAATCCCTCTTTATGATCCATCTATT
GTTTTGCCTTCAGATTTGTCAATTTTTCAAGAAATTAATGGTAACCCTTTTCTCTATACA
TCTCAAATTCCAAGATTTCTTGATCATAATAATAATAGTTGTAGTAGTAATAGTAACACA
AATGGTCAAGGTAATTTATCTTTGTCTTTGTCATCTCTTCATCATACTACTAATGACTTG
TCATCGTCTAAGAGTATTACTATGACTACTAGTTGTGTACCACTTGGACCTTTTACGGGG
TACTCTTTAATTTTGAAGAGATCAAGGTTTTTGAAACCTGCACAAATTTTGTTGGATGAA
TTGTGTCATGTTAGTAAAGGGATTTATGTTGATGATGATGGTAATTCTAATTTGATGATG
GATCCTCCACAAGGTTTTAGTAATGGAGATGAGCAATTTGGGAAAAAGAAATCCAGGTTA
ATTTCAATGCTTGATGAGGTATACCATAAGTACAAGCAATATCATGAGCAACTACAAATG
GTTGTGGCATCATTTGAATCAGTTGCTGGACTTGGAAATGCAGCACCATTTGCAAACATA
GCTATAAAAACTATGTCAAAACACTTCAAATACCTTAAAGATGCCATAATTGACCAACTC
CAATTTACAACAAGCAAATCTTCACATCATATGCATGGTCAAATTAATTGTGAAAGAGCT
GTTGGAATTTCTGGCAAAGGAATTTATTGCCAAAGACAAGAAACTCAACCTGTTTGGAGA
CCACAAAGAGGGCTTCCTGAACGTGCTGTCACTGTACTTAGGGCTTGGTTGTTTGACCAT
TTTCTTCACCCTTACCCCACGGACAGCGATAAAGTAATGTTAGCCAAACAAACTGGCCTC
TCAAGAAATCAGGTTTCTAATTGGTTCATTAACGCGAGAGTAAGACTTTGGAAACCTATG
GTAGAGGAGATTCATATGCTTGAAACTCGAGAAGGTCATAATAAATCTTCCCAGAGAGAA
GAACCTAGCAACAACAACAACGACAATAATAATCCGATTGAACATTTTCCTATGAGTAAT
TCACATGTATGTGAAAGTAACACTCCATCTACATCAACATCAAGATTACAAGACCTTCCA
TCAAAACGAACTCGAAATGAGTTACCAAATATTCCCAATAATATTGGAAGAGTCGCGGAT
TCAATAAATTTATCATATAACGGAAATTTGTCAACTGGAGTTGGTGGTGGTGTGTCATTA
ACGTTAGGGCTTCATCAGAACTCCGGTAATATTGGTTTATCGGAGCCATTTCCGATGAAT
GCAGCTCGACGTTTTGGTATCGATAATAATACGAATAGTGGAAGGTTCATTGTTGGTGGA
TTTGATGAACAAAATGGACAATTTGGAAGAAATAATACTATGGTTGGTGGGCAATTCTTG
CATGATTTTGGTGGTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400041981
PEP Infomation

pacid=37454921 transcript=PGSC0003DMT400062353 locus=PGSC0003DMG400024267 ID=PGSC0003DMT400062353.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MAEGFEPYHVPQQSRRDKLRVLLDENNNSNCQIPLYDPSIVLPSDLSIFQEINGNPFLYT
SQIPRFLDHNNNSCSSNSNTNGQGNLSLSLSSLHHTTNDLSSSKSITMTTSCVPLGPFTG
YSLILKRSRFLKPAQILLDELCHVSKGIYVDDDGNSNLMMDPPQGFSNGDEQFGKKKSRL
ISMLDEVYHKYKQYHEQLQMVVASFESVAGLGNAAPFANIAIKTMSKHFKYLKDAIIDQL
QFTTSKSSHHMHGQINCERAVGISGKGIYCQRQETQPVWRPQRGLPERAVTVLRAWLFDH
FLHPYPTDSDKVMLAKQTGLSRNQVSNWFINARVRLWKPMVEEIHMLETREGHNKSSQRE
EPSNNNNDNNNPIEHFPMSNSHVCESNTPSTSTSRLQDLPSKRTRNELPNIPNNIGRVAD
SINLSYNGNLSTGVGGGVSLTLGLHQNSGNIGLSEPFPMNAARRFGIDNNTNSGRFIVGG
FDEQNGQFGRNNTMVGGQFLHDFGG*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400062353
Transcript Infomation

pacid=37454921 locus=PGSC0003DMG400024267 ID=PGSC0003DMT400062353.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTGAAGGATTTGAACCATATCATGTCCCACAACAAAGTAGAAGAGATAAGCTTAGA
GTTTTACTTGATGAAAATAATAATAGTAATTGTCAAATCCCTCTTTATGATCCATCTATT
GTTTTGCCTTCAGATTTGTCAATTTTTCAAGAAATTAATGGTAACCCTTTTCTCTATACA
TCTCAAATTCCAAGATTTCTTGATCATAATAATAATAGTTGTAGTAGTAATAGTAACACA
AATGGTCAAGGTAATTTATCTTTGTCTTTGTCATCTCTTCATCATACTACTAATGACTTG
TCATCGTCTAAGAGTATTACTATGACTACTAGTTGTGTACCACTTGGACCTTTTACGGGG
TACTCTTTAATTTTGAAGAGATCAAGGTTTTTGAAACCTGCACAAATTTTGTTGGATGAA
TTGTGTCATGTTAGTAAAGGGATTTATGTTGATGATGATGGTAATTCTAATTTGATGATG
GATCCTCCACAAGGTTTTAGTAATGGAGATGAGCAATTTGGGAAAAAGAAATCCAGGTTA
ATTTCAATGCTTGATGAGGTATACCATAAGTACAAGCAATATCATGAGCAACTACAAATG
GTTGTGGCATCATTTGAATCAGTTGCTGGACTTGGAAATGCAGCACCATTTGCAAACATA
GCTATAAAAACTATGTCAAAACACTTCAAATACCTTAAAGATGCCATAATTGACCAACTC
CAATTTACAACAAGCAAATCTTCACATCATATGCATGGTCAAATTAATTGTGAAAGAGCT
GTTGGAATTTCTGGCAAAGGAATTTATTGCCAAAGACAAGAAACTCAACCTGTTTGGAGA
CCACAAAGAGGGCTTCCTGAACGTGCTGTCACTGTACTTAGGGCTTGGTTGTTTGACCAT
TTTCTTCACCCTTACCCCACGGACAGCGATAAAGTAATGTTAGCCAAACAAACTGGCCTC
TCAAGAAATCAGGTTTCTAATTGGTTCATTAACGCGAGAGTAAGACTTTGGAAACCTATG
GTAGAGGAGATTCATATGCTTGAAACTCGAGAAGGTCATAATAAATCTTCCCAGAGAGAA
GAACCTAGCAACAACAACAACGACAATAATAATCCGATTGAACATTTTCCTATGAGTAAT
TCACATGTATGTGAAAGTAACACTCCATCTACATCAACATCAAGATTACAAGACCTTCCA
TCAAAACGAACTCGAAATGAGTTACCAAATATTCCCAATAATATTGGAAGAGTCGCGGAT
TCAATAAATTTATCATATAACGGAAATTTGTCAACTGGAGTTGGTGGTGGTGTGTCATTA
ACGTTAGGGCTTCATCAGAACTCCGGTAATATTGGTTTATCGGAGCCATTTCCGATGAAT
GCAGCTCGACGTTTTGGTATCGATAATAATACGAATAGTGGAAGGTTCATTGTTGGTGGA
TTTGATGAACAAAATGGACAATTTGGAAGAAATAATACTATGGTTGGTGGGCAATTCTTG
CATGATTTTGGTGGTTGA