Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400061701
CDS Infomation

pacid=37436796 polypeptide=PGSC0003DMP400041522 locus=PGSC0003DMG400024011 ID=PGSC0003DMT400061701.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCATCTACTTTTGCTGGTATGTCCTCAGCAGGTCCCTTGGCTGCTCCCAGCACTTCC
TCAAACAAGCTTTCCTCTGTTGCTAATATATCTTCCACCTCTTTCGGGAGCAAAAGAAAT
GTTGCACTAAGAAAGTCACGCAGGCCGACAATTTTGGCTGCAGCTAAAGAGTTGCACTTC
AACAAGGATGGGTCAGCTATCAAGAAGCTACAGAATGGTGTGAACAAACTTGCTGATCTA
GTTGGAGTTACTCTTGGCCCAAAAGGCAGGAATGTTGTCCTTGAGAGCAAGTATGGTGCT
CCAAAAATTGTTAATGATGGAGTTACTGTGGCCAGAGAGGTTGAATTAGAGGATCCAGTA
GAAAACATTGGTGCGAAACTAGTGAGACAAGCTGCTGCCAAAACCAATGACCTGGCTGGG
GATGGGACTACAACATCTGTCGTGCTAGCTCAGGGCCTAATTGCTGAAGGTGTTAAGGTG
GTTGCAGCTGGTGCAAACCCTGTCCTAATCACCAGAGGAATTGAGAAGACAGCAAAAGCA
TTAGTAGCTGAGTTGAAGAATATGTCAAAAGAGGTGGAAGACAGTGAACTAGCAGATGTG
GCTGCAGTAAGTGCTGGGAACAATTTGGAAGTAGGGAGTATGATTGCTGAAGCCATGAGC
AAGGTTGGAAGGAAAGGTGTTGTGACACTAGAGGAGGGTAAAAGTGCTGAAAACAGTCTG
CGTGTGGTTGAAGGAATGCAATTTGAACGTGGTTACGTCTCTCCTTACTTTGTTACCGAC
AGTGAGAAAATGTCAGTTGAATATGAGAACTGTAAGTTGCTACTGGTTGATAAAAAGATA
ACAAATGCAAGAGATCTTGTTAATGTCCTGGAAGATGCTATCAGAAATGGTTACCCAATT
TTAATTATTGCCGAAGATATTGAGCAAGAAGCTTTGGCGACTCTTGTTGTCAATAAGCTT
AGAGGTGCCTTAAAGGTCGCTGCGCTTAAAGCTCCTGGTTTTGGTGAGCGAAAAAGCCAG
TATCTTGATGACATAGCAACCCTTACTGGAGGCACTGTTATTAGGGAGGAACTTGGCCTT
ACCTTGGACAAGGCTGACAAGGAAGTTCTAGGTCATGCTGCTAAAGTAGTGCTGACTAAG
GATGCCACTACAATTGTTGGTGATGGTAGCACTCAGGAAGCAGTCAACAAGCGTGTTGCT
CAGATTAAAAACCTGATAGAGGCTGCAGATCAAGATTATGAAAAGGAAAAGCTAAATGAA
AGAATTGCTAAGTTATCAGGAGGTGTGGCTGTCATACAGGTTGGAGCTCAAACTGAAACT
GAATTGAAGGAGAAGAAACTTAGAGTGGAAGATGCTCTCAATGCAACAAAGGCGGCTGTT
GAGGAAGGTATTGTTGTTGGAGGAGGGTGCACGCTCCTCAGACTTGCTGCAAAAGTTGAT
GCAATAAAGGGAACCCTTGCAAATGATGAGGAGAAGGTTGGAGCTGATATTGTCAAAAGA
GCATTGAGCTACCCTTTGAAATTAATTGCTAAAAATGCTGGCGTTAATGGAAGTGTCGTC
AGTGAGAAGGTGCTGTCAAGTGATGATCCCAAATTTGGATATAATGCTGCAACTGGCAAC
TATGAAGACTTAATGGCTGCTGGCATCATTGATCCAACAAAGGTGGTGAGGTGTTGTCTG
GAACACGCTGCATCTGTGGCTAAGACATTCTTGATGTCAGATTGTGTGGTGGTTGAGATC
AAGGAGCCCGAAGCAGCAGTTGCTGGCAACCCAATGGACAACTCAGGTAGCCTTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400041522
PEP Infomation

pacid=37436796 transcript=PGSC0003DMT400061701 locus=PGSC0003DMG400024011 ID=PGSC0003DMT400061701.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MASTFAGMSSAGPLAAPSTSSNKLSSVANISSTSFGSKRNVALRKSRRPTILAAAKELHF
NKDGSAIKKLQNGVNKLADLVGVTLGPKGRNVVLESKYGAPKIVNDGVTVAREVELEDPV
ENIGAKLVRQAAAKTNDLAGDGTTTSVVLAQGLIAEGVKVVAAGANPVLITRGIEKTAKA
LVAELKNMSKEVEDSELADVAAVSAGNNLEVGSMIAEAMSKVGRKGVVTLEEGKSAENSL
RVVEGMQFERGYVSPYFVTDSEKMSVEYENCKLLLVDKKITNARDLVNVLEDAIRNGYPI
LIIAEDIEQEALATLVVNKLRGALKVAALKAPGFGERKSQYLDDIATLTGGTVIREELGL
TLDKADKEVLGHAAKVVLTKDATTIVGDGSTQEAVNKRVAQIKNLIEAADQDYEKEKLNE
RIAKLSGGVAVIQVGAQTETELKEKKLRVEDALNATKAAVEEGIVVGGGCTLLRLAAKVD
AIKGTLANDEEKVGADIVKRALSYPLKLIAKNAGVNGSVVSEKVLSSDDPKFGYNAATGN
YEDLMAAGIIDPTKVVRCCLEHAASVAKTFLMSDCVVVEIKEPEAAVAGNPMDNSGSL*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400061701
Transcript Infomation

pacid=37436796 locus=PGSC0003DMG400024011 ID=PGSC0003DMT400061701.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCATCTACTTTTGCTGGTATGTCCTCAGCAGGTCCCTTGGCTGCTCCCAGCACTTCC
TCAAACAAGCTTTCCTCTGTTGCTAATATATCTTCCACCTCTTTCGGGAGCAAAAGAAAT
GTTGCACTAAGAAAGTCACGCAGGCCGACAATTTTGGCTGCAGCTAAAGAGTTGCACTTC
AACAAGGATGGGTCAGCTATCAAGAAGCTACAGAATGGTGTGAACAAACTTGCTGATCTA
GTTGGAGTTACTCTTGGCCCAAAAGGCAGGAATGTTGTCCTTGAGAGCAAGTATGGTGCT
CCAAAAATTGTTAATGATGGAGTTACTGTGGCCAGAGAGGTTGAATTAGAGGATCCAGTA
GAAAACATTGGTGCGAAACTAGTGAGACAAGCTGCTGCCAAAACCAATGACCTGGCTGGG
GATGGGACTACAACATCTGTCGTGCTAGCTCAGGGCCTAATTGCTGAAGGTGTTAAGGTG
GTTGCAGCTGGTGCAAACCCTGTCCTAATCACCAGAGGAATTGAGAAGACAGCAAAAGCA
TTAGTAGCTGAGTTGAAGAATATGTCAAAAGAGGTGGAAGACAGTGAACTAGCAGATGTG
GCTGCAGTAAGTGCTGGGAACAATTTGGAAGTAGGGAGTATGATTGCTGAAGCCATGAGC
AAGGTTGGAAGGAAAGGTGTTGTGACACTAGAGGAGGGTAAAAGTGCTGAAAACAGTCTG
CGTGTGGTTGAAGGAATGCAATTTGAACGTGGTTACGTCTCTCCTTACTTTGTTACCGAC
AGTGAGAAAATGTCAGTTGAATATGAGAACTGTAAGTTGCTACTGGTTGATAAAAAGATA
ACAAATGCAAGAGATCTTGTTAATGTCCTGGAAGATGCTATCAGAAATGGTTACCCAATT
TTAATTATTGCCGAAGATATTGAGCAAGAAGCTTTGGCGACTCTTGTTGTCAATAAGCTT
AGAGGTGCCTTAAAGGTCGCTGCGCTTAAAGCTCCTGGTTTTGGTGAGCGAAAAAGCCAG
TATCTTGATGACATAGCAACCCTTACTGGAGGCACTGTTATTAGGGAGGAACTTGGCCTT
ACCTTGGACAAGGCTGACAAGGAAGTTCTAGGTCATGCTGCTAAAGTAGTGCTGACTAAG
GATGCCACTACAATTGTTGGTGATGGTAGCACTCAGGAAGCAGTCAACAAGCGTGTTGCT
CAGATTAAAAACCTGATAGAGGCTGCAGATCAAGATTATGAAAAGGAAAAGCTAAATGAA
AGAATTGCTAAGTTATCAGGAGGTGTGGCTGTCATACAGGTTGGAGCTCAAACTGAAACT
GAATTGAAGGAGAAGAAACTTAGAGTGGAAGATGCTCTCAATGCAACAAAGGCGGCTGTT
GAGGAAGGTATTGTTGTTGGAGGAGGGTGCACGCTCCTCAGACTTGCTGCAAAAGTTGAT
GCAATAAAGGGAACCCTTGCAAATGATGAGGAGAAGGTTGGAGCTGATATTGTCAAAAGA
GCATTGAGCTACCCTTTGAAATTAATTGCTAAAAATGCTGGCGTTAATGGAAGTGTCGTC
AGTGAGAAGGTGCTGTCAAGTGATGATCCCAAATTTGGATATAATGCTGCAACTGGCAAC
TATGAAGACTTAATGGCTGCTGGCATCATTGATCCAACAAAGGTGGTGAGGTGTTGTCTG
GAACACGCTGCATCTGTGGCTAAGACATTCTTGATGTCAGATTGTGTGGTGGTTGAGATC
AAGGAGCCCGAAGCAGCAGTTGCTGGCAACCCAATGGACAACTCAGGTAGCCTTTGA