Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400061392
CDS Infomation

pacid=37428568 polypeptide=PGSC0003DMP400041301 locus=PGSC0003DMG400023893 ID=PGSC0003DMT400061392.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAGATTCAATTCACTAACTTAGTTGCATTTTTGCTCTTTCTCTCAACCATACTTCTT
TTATTAAAAAAATGGAAAACTCAAAACCTAAATTTGCCTCCTGGTCCATGGAAATTACCT
TTTATTGGAAGCTTACATCATTTGGCAGTGGCAGGCCCACTCCCTCATCATGGTCTAAAA
AATCTAGCAAAATGCTATGGGGCGCTCATGCACTTACAACTCGGAGAAATTCCTACTGTC
ATCATTTCTTCACCACGTATGGCTAAGGAAGTACTAAAAACTCATGACCTCGTTTTTGCA
ACGAGGCCAAAACTTGTAGTGGCCGACATCGTCCACTATGATAGTACGGACATAGCATTT
TCTCCTTATGGTGAATATTGGAGACAGATTCGTAAAATTTGCATACTTGAACTCCTTAGT
GCCAAGATGGTCAAATTCTTTAGCTCGATTCGTCAAGACGAGCTATCGAAGATGGTTTCA
TCTATACGAACGATGCCTAATAATCTTCCGGTCAACCTTACAGATAAAATATTTTGGTTT
ACAAGTTCGGTAACTTGTAGATCAGCTTTAGGAAAAATATGTTGTGACCAAGATAAATTG
ATAATTTTTATGAGGGAAATAATATCATTGGCAGGTGGATTTAGTGTTGCTGATTTTTTC
CCTACATGGAAAATGTTACATGACGTTGGTGGTTCGAAAACTAGACTGGTGAAGGCACAT
CGTAAAATCGATGAAATTTTGGAAAATGTAGTGAATGAGCACAAACAAAATCGAGCGGAT
GGTAAAAAGGGTAATGGTGAATTTGGAGGTGAAGATTTGATCGATGTTTTGTTAAGAGTT
AGAGAAAGTGGAGAAGTTCAAATTCCGATCACGGATGACAATATCAAAGCAATATTAGTC
GACATGTTCTCCGCGGGGTCTGAGACATCATCAACAACTATAATTTGGGCATTGGCTGAA
ATGATGAAGAAACCGAGTGTTTTAGCAAAGGCACAAGCTGAAGTGAGACAAGTCTTGAAG
GAGAAGAAAGGTTTTCAACAAATTGATCTTGATGAGTTAAAGTACTTGAAGTTAGTAATC
AAAGAAACTTTAAGGATGCACCCTCCAATTCCTTTGTTAGTCCCTAGAGAATGTATGGAG
GATACAAAGATTGATGGGTACAATATACCTTTCAAAACTCGAGTCATAGTTAATGCATGG
GCAATTGGACGAGATCCTGAAAGTTGGGATGACCCTGAAAGCTTTTCACCAGAGAGATTC
GAGAATAGTTCTATTGACTTTCTTGGAAGTCATCATCAATTTATTCCGTTTGGTGCAGGA
AGAAGGATTTGTCCAGGAATGCTATTTGGTTTAGCCAATGTTGGACAACCTTTAGCTCAA
TTGCTTTATCACTTCGATTGGAAACTCCCCAACGGACAAAGTCACGAAAATTTGGACTTA
ACAGAGTCACCTGGAATTTCTGCAACAAGAAAGGATGATCTTGTTTTGATTGCCACTCCT
TATGATCCTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400041301
PEP Infomation

pacid=37428568 transcript=PGSC0003DMT400061392 locus=PGSC0003DMG400023893 ID=PGSC0003DMT400061392.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MEIQFTNLVAFLLFLSTILLLLKKWKTQNLNLPPGPWKLPFIGSLHHLAVAGPLPHHGLK
NLAKCYGALMHLQLGEIPTVIISSPRMAKEVLKTHDLVFATRPKLVVADIVHYDSTDIAF
SPYGEYWRQIRKICILELLSAKMVKFFSSIRQDELSKMVSSIRTMPNNLPVNLTDKIFWF
TSSVTCRSALGKICCDQDKLIIFMREIISLAGGFSVADFFPTWKMLHDVGGSKTRLVKAH
RKIDEILENVVNEHKQNRADGKKGNGEFGGEDLIDVLLRVRESGEVQIPITDDNIKAILV
DMFSAGSETSSTTIIWALAEMMKKPSVLAKAQAEVRQVLKEKKGFQQIDLDELKYLKLVI
KETLRMHPPIPLLVPRECMEDTKIDGYNIPFKTRVIVNAWAIGRDPESWDDPESFSPERF
ENSSIDFLGSHHQFIPFGAGRRICPGMLFGLANVGQPLAQLLYHFDWKLPNGQSHENLDL
TESPGISATRKDDLVLIATPYDP*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400061392
Transcript Infomation

pacid=37428568 locus=PGSC0003DMG400023893 ID=PGSC0003DMT400061392.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAGATTCAATTCACTAACTTAGTTGCATTTTTGCTCTTTCTCTCAACCATACTTCTT
TTATTAAAAAAATGGAAAACTCAAAACCTAAATTTGCCTCCTGGTCCATGGAAATTACCT
TTTATTGGAAGCTTACATCATTTGGCAGTGGCAGGCCCACTCCCTCATCATGGTCTAAAA
AATCTAGCAAAATGCTATGGGGCGCTCATGCACTTACAACTCGGAGAAATTCCTACTGTC
ATCATTTCTTCACCACGTATGGCTAAGGAAGTACTAAAAACTCATGACCTCGTTTTTGCA
ACGAGGCCAAAACTTGTAGTGGCCGACATCGTCCACTATGATAGTACGGACATAGCATTT
TCTCCTTATGGTGAATATTGGAGACAGATTCGTAAAATTTGCATACTTGAACTCCTTAGT
GCCAAGATGGTCAAATTCTTTAGCTCGATTCGTCAAGACGAGCTATCGAAGATGGTTTCA
TCTATACGAACGATGCCTAATAATCTTCCGGTCAACCTTACAGATAAAATATTTTGGTTT
ACAAGTTCGGTAACTTGTAGATCAGCTTTAGGAAAAATATGTTGTGACCAAGATAAATTG
ATAATTTTTATGAGGGAAATAATATCATTGGCAGGTGGATTTAGTGTTGCTGATTTTTTC
CCTACATGGAAAATGTTACATGACGTTGGTGGTTCGAAAACTAGACTGGTGAAGGCACAT
CGTAAAATCGATGAAATTTTGGAAAATGTAGTGAATGAGCACAAACAAAATCGAGCGGAT
GGTAAAAAGGGTAATGGTGAATTTGGAGGTGAAGATTTGATCGATGTTTTGTTAAGAGTT
AGAGAAAGTGGAGAAGTTCAAATTCCGATCACGGATGACAATATCAAAGCAATATTAGTC
GACATGTTCTCCGCGGGGTCTGAGACATCATCAACAACTATAATTTGGGCATTGGCTGAA
ATGATGAAGAAACCGAGTGTTTTAGCAAAGGCACAAGCTGAAGTGAGACAAGTCTTGAAG
GAGAAGAAAGGTTTTCAACAAATTGATCTTGATGAGTTAAAGTACTTGAAGTTAGTAATC
AAAGAAACTTTAAGGATGCACCCTCCAATTCCTTTGTTAGTCCCTAGAGAATGTATGGAG
GATACAAAGATTGATGGGTACAATATACCTTTCAAAACTCGAGTCATAGTTAATGCATGG
GCAATTGGACGAGATCCTGAAAGTTGGGATGACCCTGAAAGCTTTTCACCAGAGAGATTC
GAGAATAGTTCTATTGACTTTCTTGGAAGTCATCATCAATTTATTCCGTTTGGTGCAGGA
AGAAGGATTTGTCCAGGAATGCTATTTGGTTTAGCCAATGTTGGACAACCTTTAGCTCAA
TTGCTTTATCACTTCGATTGGAAACTCCCCAACGGACAAAGTCACGAAAATTTGGACTTA
ACAGAGTCACCTGGAATTTCTGCAACAAGAAAGGATGATCTTGTTTTGATTGCCACTCCT
TATGATCCTTGA