Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400060906
CDS Infomation

pacid=37480234 polypeptide=PGSC0003DMP400040986 locus=PGSC0003DMG400023690 ID=PGSC0003DMT400060906.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCAACCCCAGAAACACCTGTTACTCCGGCAACTCCCACCGAAAACCATGAGATGGTC
CATGAACATGAGATGATACCTGAACATGAGATGGGCCATGAACATGAGATGGGCCATGAA
CATGATATGAGCCATGAACTTGATATGGGCCATGAACATGAGATGGGCCATGAACATGAG
ATGATGCATGAACATGAGATGGTTGAACACGAGATAGTGCTTGGCAATGAGATGGTCCCG
GGCAATGGAATGGTTCAGGACTATGAGATGATTCCAGGAAATGAGATGGTTCTTGCAGAG
CCACAACCCAACAATGTTGAAACACCAGAAACTCAACCTGGTAAGCATAGGAAAAAGAAA
TCGATAGTTTGGGAGCACTTCACCATTGAAAATGTTGCTGTTGGGACTAGAAGGGCACAA
TGTAAGAAGTGCAAGCAATCATTTGCATATAGTACAGGGTCAAAAGTAGCAGGAACTAGT
CATCTGAAGCGCCATATTGCCAAAGGATCATGTCCGGTAGTCCTGCGTAATCAGCAGAAT
GATCAATTGACCCCATATAGTGCTCCTCCTAAGATGACTGGATATGGGGGTAGTAATGGT
GCACCTAAAAGACGTTATCGAACTGCTTCTACTCCTTACGTTGCTTTTGATCCAGACCGG
TGCCGCCAGGAAATCTCTAAGATGATTATCATGCATGACTATCCCCTTCACATGGTTGAG
CATCCAGGCTTTCTTACTTTTGTTCAGAATCTTCAGCCTCGTTTTGATATGGTGAGTTTC
AACACTGTGCAAGGAGATTGTGTGGCAACTTACCTTAGAGAAAAGCAAGCCATCCAGAAG
GTGATTGAGGGAGTGCCTGGGTGGATCTGCTTAACACTAGATATGTGGTCCTCCCACCAC
ACTGTGGGCTATGTATTCATAACTGGGCAGTATGTTGACAGTGAGTGGAAAATTCATAGG
AAAATACTCAATGTCATCATGGAACCATATCCAGATTCTGAGATGGCTTTCAGCCATGCT
GTTGCGGCTTGCCTTTCTGACTGGAGTATGGAGGGGAAGTTATTTTCTGTCACTATTAAT
CAACCACTGGGTGATGCTGCTATTGATAATCTTAGAGCTTTACTCTCTGTGAAGAACCCA
CTTGTGCTTAACGGTCAATTATTGGTTGGAAATTGTCTTGCTCGAACTTTAAGCAGCATT
GCCCAAGATGCGTTTAAAGTTGTGCAAGGAACTGTCAAAAAAGTTAGAGATAGTGTTAAG
TATGTGAAAACATCGGAATCTCATGAGGAAAAGTTTATTGAGCTCAAACAGCAGCTTCAG
GTGCCTAGCACAAAGATGCTGACCCTTGATGACCGAACTCAATGGAACACAACATATGAG
ATGTTGTTGGCTGCAACGGAGTTGAAGGAAGTATTTTCATGCTTGGATGCATTAGATCCT
GATTTCAAAGATGCCCCATCATTGGAAGACTGGAAGCAAGTTGAGACTCTGTGCACTTAC
TTGAAAATCTTCTTTGACACTGCCAATCTCCTGACTGCACCAACAATTCCAACAACCAAC
ACATTCTTCCATGAAGCGTGGAAGATTCAATTGGAATTGGCTCGTGCTGCAGCAAGTGAA
GACCCATTCACCAGCAGACTTACCAAAATGATGCAAGAGATGTTTGATAATTATTGGAAG
AGCTGTTGCTTAATGTTGGCTATTGCCGTAGTAATGGATCCACGCTTCAAAATGAAACTT
GTTGAGTTCAGTTTTTCCAAAATATATGGGGAAGAAGCAGCTGCCTACGTGAAGACTGTT
GAGGAGGGAATCCATGAGCTCTTCAATGAATATGTGTCTCTTCCTCTACCTCTAACACCA
ACTTATGTTGAAGAAGTAAATGGCAGTGCTATGGGGCAGGAGGATGGCCAAGGCTTCGAT
GCCTCTTGTAACGGGCTTGGACTTACTGATTTTGACGTCTACATTATGGAGACTTCGAGC
CAGCAGTCAAGGTCAGAACTTGATCAATATCTGGAAGAGTCCTTGCTGCCTCGTGTTCAC
GAGTTTGATGTGGTGGGTTGGTGGAAGCTTAACAGAATGAAGTACCCAACCTTGTCAAAA
ATGGCTCGTGATATCTTGTCAGTTCCTGTTTCAACAGTAACTGCTGATTCTATATTTAGC
ACGGTTAGCAAAGAGATGGATCATTACAGGTGTTCCTTGCGACCTGAGACCGTGGAGGCC
CTCATCTGTGCCAAGGACTGGCTTCAGAATGCATCTATAGACACTTCACCTGTACCAATA
AAAATGGAAGTTCCGATTTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400040986
PEP Infomation

pacid=37480234 transcript=PGSC0003DMT400060906 locus=PGSC0003DMG400023690 ID=PGSC0003DMT400060906.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MATPETPVTPATPTENHEMVHEHEMIPEHEMGHEHEMGHEHDMSHELDMGHEHEMGHEHE
MMHEHEMVEHEIVLGNEMVPGNGMVQDYEMIPGNEMVLAEPQPNNVETPETQPGKHRKKK
SIVWEHFTIENVAVGTRRAQCKKCKQSFAYSTGSKVAGTSHLKRHIAKGSCPVVLRNQQN
DQLTPYSAPPKMTGYGGSNGAPKRRYRTASTPYVAFDPDRCRQEISKMIIMHDYPLHMVE
HPGFLTFVQNLQPRFDMVSFNTVQGDCVATYLREKQAIQKVIEGVPGWICLTLDMWSSHH
TVGYVFITGQYVDSEWKIHRKILNVIMEPYPDSEMAFSHAVAACLSDWSMEGKLFSVTIN
QPLGDAAIDNLRALLSVKNPLVLNGQLLVGNCLARTLSSIAQDAFKVVQGTVKKVRDSVK
YVKTSESHEEKFIELKQQLQVPSTKMLTLDDRTQWNTTYEMLLAATELKEVFSCLDALDP
DFKDAPSLEDWKQVETLCTYLKIFFDTANLLTAPTIPTTNTFFHEAWKIQLELARAAASE
DPFTSRLTKMMQEMFDNYWKSCCLMLAIAVVMDPRFKMKLVEFSFSKIYGEEAAAYVKTV
EEGIHELFNEYVSLPLPLTPTYVEEVNGSAMGQEDGQGFDASCNGLGLTDFDVYIMETSS
QQSRSELDQYLEESLLPRVHEFDVVGWWKLNRMKYPTLSKMARDILSVPVSTVTADSIFS
TVSKEMDHYRCSLRPETVEALICAKDWLQNASIDTSPVPIKMEVPI*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400060906
Transcript Infomation

pacid=37480234 locus=PGSC0003DMG400023690 ID=PGSC0003DMT400060906.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCAACCCCAGAAACACCTGTTACTCCGGCAACTCCCACCGAAAACCATGAGATGGTC
CATGAACATGAGATGATACCTGAACATGAGATGGGCCATGAACATGAGATGGGCCATGAA
CATGATATGAGCCATGAACTTGATATGGGCCATGAACATGAGATGGGCCATGAACATGAG
ATGATGCATGAACATGAGATGGTTGAACACGAGATAGTGCTTGGCAATGAGATGGTCCCG
GGCAATGGAATGGTTCAGGACTATGAGATGATTCCAGGAAATGAGATGGTTCTTGCAGAG
CCACAACCCAACAATGTTGAAACACCAGAAACTCAACCTGGTAAGCATAGGAAAAAGAAA
TCGATAGTTTGGGAGCACTTCACCATTGAAAATGTTGCTGTTGGGACTAGAAGGGCACAA
TGTAAGAAGTGCAAGCAATCATTTGCATATAGTACAGGGTCAAAAGTAGCAGGAACTAGT
CATCTGAAGCGCCATATTGCCAAAGGATCATGTCCGGTAGTCCTGCGTAATCAGCAGAAT
GATCAATTGACCCCATATAGTGCTCCTCCTAAGATGACTGGATATGGGGGTAGTAATGGT
GCACCTAAAAGACGTTATCGAACTGCTTCTACTCCTTACGTTGCTTTTGATCCAGACCGG
TGCCGCCAGGAAATCTCTAAGATGATTATCATGCATGACTATCCCCTTCACATGGTTGAG
CATCCAGGCTTTCTTACTTTTGTTCAGAATCTTCAGCCTCGTTTTGATATGGTGAGTTTC
AACACTGTGCAAGGAGATTGTGTGGCAACTTACCTTAGAGAAAAGCAAGCCATCCAGAAG
GTGATTGAGGGAGTGCCTGGGTGGATCTGCTTAACACTAGATATGTGGTCCTCCCACCAC
ACTGTGGGCTATGTATTCATAACTGGGCAGTATGTTGACAGTGAGTGGAAAATTCATAGG
AAAATACTCAATGTCATCATGGAACCATATCCAGATTCTGAGATGGCTTTCAGCCATGCT
GTTGCGGCTTGCCTTTCTGACTGGAGTATGGAGGGGAAGTTATTTTCTGTCACTATTAAT
CAACCACTGGGTGATGCTGCTATTGATAATCTTAGAGCTTTACTCTCTGTGAAGAACCCA
CTTGTGCTTAACGGTCAATTATTGGTTGGAAATTGTCTTGCTCGAACTTTAAGCAGCATT
GCCCAAGATGCGTTTAAAGTTGTGCAAGGAACTGTCAAAAAAGTTAGAGATAGTGTTAAG
TATGTGAAAACATCGGAATCTCATGAGGAAAAGTTTATTGAGCTCAAACAGCAGCTTCAG
GTGCCTAGCACAAAGATGCTGACCCTTGATGACCGAACTCAATGGAACACAACATATGAG
ATGTTGTTGGCTGCAACGGAGTTGAAGGAAGTATTTTCATGCTTGGATGCATTAGATCCT
GATTTCAAAGATGCCCCATCATTGGAAGACTGGAAGCAAGTTGAGACTCTGTGCACTTAC
TTGAAAATCTTCTTTGACACTGCCAATCTCCTGACTGCACCAACAATTCCAACAACCAAC
ACATTCTTCCATGAAGCGTGGAAGATTCAATTGGAATTGGCTCGTGCTGCAGCAAGTGAA
GACCCATTCACCAGCAGACTTACCAAAATGATGCAAGAGATGTTTGATAATTATTGGAAG
AGCTGTTGCTTAATGTTGGCTATTGCCGTAGTAATGGATCCACGCTTCAAAATGAAACTT
GTTGAGTTCAGTTTTTCCAAAATATATGGGGAAGAAGCAGCTGCCTACGTGAAGACTGTT
GAGGAGGGAATCCATGAGCTCTTCAATGAATATGTGTCTCTTCCTCTACCTCTAACACCA
ACTTATGTTGAAGAAGTAAATGGCAGTGCTATGGGGCAGGAGGATGGCCAAGGCTTCGAT
GCCTCTTGTAACGGGCTTGGACTTACTGATTTTGACGTCTACATTATGGAGACTTCGAGC
CAGCAGTCAAGGTCAGAACTTGATCAATATCTGGAAGAGTCCTTGCTGCCTCGTGTTCAC
GAGTTTGATGTGGTGGGTTGGTGGAAGCTTAACAGAATGAAGTACCCAACCTTGTCAAAA
ATGGCTCGTGATATCTTGTCAGTTCCTGTTTCAACAGTAACTGCTGATTCTATATTTAGC
ACGGTTAGCAAAGAGATGGATCATTACAGGTGTTCCTTGCGACCTGAGACCGTGGAGGCC
CTCATCTGTGCCAAGGACTGGCTTCAGAATGCATCTATAGACACTTCACCTGTACCAATA
AAAATGGAAGTTCCGATTTAG