Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400060876
CDS Infomation

pacid=37480416 polypeptide=PGSC0003DMP400040965 locus=PGSC0003DMG400023681 ID=PGSC0003DMT400060876.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAAGCTGATATCAGTGAGAAGTTGTTGAGTGAAGTGCAAGCTGTGGGGGATGGTGAA
AAGGAAGTGAATTTCAAGGAGAAGTTATGGAACGAGACGAAGAAGATGTGGGTGATTGCT
GCTCCAGCCATGTTTACAAAGTTTTCGACGTTTGGAGTAACTGTTATTACTCACTCATTT
GTTGGTCATATTGGACCTAATGAACTTGCTGCTTATGCTTTAGTCAGTACTGTCCTCCTG
AGATTTGGCAATGGCATTCTGATGGGAATGGCAAGTGGATTAGAAACTTTATGTGGACAA
TCGTATGGTGCAAAACAATATCACATGCTCGGGATTTATCTCCAAAGATCTTGGATTGTC
TTGACAGTAACCACAACCCTGCTTTTACCACTCTATATCTTCACCACGCCGATCCTAAAA
GCTTTAGGACAGAATGAAGAGATAGCAAAAGAGGCTGGGCTCATTTCTTTATGGTTAATA
CCGGTGACTTACTCCTTCGTTGCATCATATACATGTCAAATGTTCTTACAAGCTCAAAGC
AAGAACAAGATTATTACATACTTGGCAGCTTGTACCTTAGCTATCCACATTTCCCTCTCC
TGGCTTTTAACTGTGAAGTTTAAGTTTGGAATCACCGGTGCCATGATATCTACAATTTTG
GCATACTGGCTTCCCAATGTTGGTCAGTTAATGTTTGTAATGTGTGGAGGATGCAAAGAA
ACTTGGAAAGGCTTTACATGTTTGGCATTCAAGGATCTTTGGCCTGTAATCAAGCTTTCT
TTGTCTTCTGGTGCCATGCTTTGCCTTGAATTCTGGTACAATAGTATACTAGTTCTTATT
ACAGGAAACTTGAAAAATGCTATGGTTCAGATTGGTGCTCTTTCTATATGCCTTAACATC
AATGCTTGGGAAATGATGATATCTCTTGGTTTCTTAGCTGCAGCATGTGTACGAGTGTCA
AATGAGTTGGGAAGAGGGAGCGCGAAAGCAGCAAGATTTTCAATATGGAATACAGCAACA
ACATCATTTGTCATTGGGTTCATTCTGTTTCTGTTCTTTCTGTTCTTGCGTGGACGTCTG
TCTTACTTATTCACAGACAGTCCAGACGTGGCTAAAGAAGTCGAAAAATTGTCTCCTCTA
TTAGCATTTTCCATACTCATGAACAGTATTCAACCAGTTCTCTCTGGCGTTGCTGTTGGC
GCCGGATGGCAGAGCATTGTAGCCTATGTTAACATAGGCTGCTATTATTTAGTAGGCATT
CCAGTTGGAGTTGTACTTGGTTATGTTTTCAAACTGCAAGTTAAAGGTGTTTGGGTTGGA
ATGATTTTTGGTACACTGGTGCAGACAATTGTACTACTTATAATCACATTGAAAACAGAT
TGGAATAAACAGGTTTTAATTGCTCAACTGAGAGTGAAGAGATGGCTAGTAGAAGATAAA
ACTAATGACGATTCACAAACTGCTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400040965
PEP Infomation

pacid=37480416 transcript=PGSC0003DMT400060876 locus=PGSC0003DMG400023681 ID=PGSC0003DMT400060876.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MEADISEKLLSEVQAVGDGEKEVNFKEKLWNETKKMWVIAAPAMFTKFSTFGVTVITHSF
VGHIGPNELAAYALVSTVLLRFGNGILMGMASGLETLCGQSYGAKQYHMLGIYLQRSWIV
LTVTTTLLLPLYIFTTPILKALGQNEEIAKEAGLISLWLIPVTYSFVASYTCQMFLQAQS
KNKIITYLAACTLAIHISLSWLLTVKFKFGITGAMISTILAYWLPNVGQLMFVMCGGCKE
TWKGFTCLAFKDLWPVIKLSLSSGAMLCLEFWYNSILVLITGNLKNAMVQIGALSICLNI
NAWEMMISLGFLAAACVRVSNELGRGSAKAARFSIWNTATTSFVIGFILFLFFLFLRGRL
SYLFTDSPDVAKEVEKLSPLLAFSILMNSIQPVLSGVAVGAGWQSIVAYVNIGCYYLVGI
PVGVVLGYVFKLQVKGVWVGMIFGTLVQTIVLLIITLKTDWNKQVLIAQLRVKRWLVEDK
TNDDSQTA*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400060876
Transcript Infomation

pacid=37480416 locus=PGSC0003DMG400023681 ID=PGSC0003DMT400060876.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAAGCTGATATCAGTGAGAAGTTGTTGAGTGAAGTGCAAGCTGTGGGGGATGGTGAA
AAGGAAGTGAATTTCAAGGAGAAGTTATGGAACGAGACGAAGAAGATGTGGGTGATTGCT
GCTCCAGCCATGTTTACAAAGTTTTCGACGTTTGGAGTAACTGTTATTACTCACTCATTT
GTTGGTCATATTGGACCTAATGAACTTGCTGCTTATGCTTTAGTCAGTACTGTCCTCCTG
AGATTTGGCAATGGCATTCTGATGGGAATGGCAAGTGGATTAGAAACTTTATGTGGACAA
TCGTATGGTGCAAAACAATATCACATGCTCGGGATTTATCTCCAAAGATCTTGGATTGTC
TTGACAGTAACCACAACCCTGCTTTTACCACTCTATATCTTCACCACGCCGATCCTAAAA
GCTTTAGGACAGAATGAAGAGATAGCAAAAGAGGCTGGGCTCATTTCTTTATGGTTAATA
CCGGTGACTTACTCCTTCGTTGCATCATATACATGTCAAATGTTCTTACAAGCTCAAAGC
AAGAACAAGATTATTACATACTTGGCAGCTTGTACCTTAGCTATCCACATTTCCCTCTCC
TGGCTTTTAACTGTGAAGTTTAAGTTTGGAATCACCGGTGCCATGATATCTACAATTTTG
GCATACTGGCTTCCCAATGTTGGTCAGTTAATGTTTGTAATGTGTGGAGGATGCAAAGAA
ACTTGGAAAGGCTTTACATGTTTGGCATTCAAGGATCTTTGGCCTGTAATCAAGCTTTCT
TTGTCTTCTGGTGCCATGCTTTGCCTTGAATTCTGGTACAATAGTATACTAGTTCTTATT
ACAGGAAACTTGAAAAATGCTATGGTTCAGATTGGTGCTCTTTCTATATGCCTTAACATC
AATGCTTGGGAAATGATGATATCTCTTGGTTTCTTAGCTGCAGCATGTGTACGAGTGTCA
AATGAGTTGGGAAGAGGGAGCGCGAAAGCAGCAAGATTTTCAATATGGAATACAGCAACA
ACATCATTTGTCATTGGGTTCATTCTGTTTCTGTTCTTTCTGTTCTTGCGTGGACGTCTG
TCTTACTTATTCACAGACAGTCCAGACGTGGCTAAAGAAGTCGAAAAATTGTCTCCTCTA
TTAGCATTTTCCATACTCATGAACAGTATTCAACCAGTTCTCTCTGGCGTTGCTGTTGGC
GCCGGATGGCAGAGCATTGTAGCCTATGTTAACATAGGCTGCTATTATTTAGTAGGCATT
CCAGTTGGAGTTGTACTTGGTTATGTTTTCAAACTGCAAGTTAAAGGTGTTTGGGTTGGA
ATGATTTTTGGTACACTGGTGCAGACAATTGTACTACTTATAATCACATTGAAAACAGAT
TGGAATAAACAGGTTTTAATTGCTCAACTGAGAGTGAAGAGATGGCTAGTAGAAGATAAA
ACTAATGACGATTCACAAACTGCTTGA