Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400060202
CDS Infomation

pacid=37443826 polypeptide=PGSC0003DMP400040507 locus=PGSC0003DMG400023418 ID=PGSC0003DMT400060202.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCCGGGAAAGGAAGATGCGTCAGCTGGTGGAGCTGATGGTTCTCAGGAACAATGTCAA
CTTGCAAATGGTCGGAGAATGTACTGGCGGTCAGCATCTTGGTCGTCTTCGAGGACTTCA
CTGCCTCCGCTTAACCCAGATATGGAAAAAGATGGCTTGGACCCAAATGGAAGTAATAGT
TCTCACAGTCGGAGGCCTTTAACTCCTAGGTCACAACATAGTTTCAAGGCTAGGTCGTGT
CTGCCACCGTTGCAGCCATTAGCAATTGCTCGTAGAAGTTTAGATGAGTGGCCGAGAGCA
GGATCTGATGATATTGGAGAGTGGCCACTTCCTGCCACCCCCAGTGGGAGGGATTCACAC
AGCAACAGTGAGAGGCTTAAGCTAGATTTGTCAAACATACATAAAAATCCAGAGGCTAAT
GGTGGGCTTGTGAGAAGAGAAAAAATTGCTTTCTTCGATAAAGAGTGTTCAAAGGTGGCT
GAACACATTTATCTTGGTGGGGATGCAGTGGCAAGAGATAAGGATATACTAAAACAAAAT
GGGATTACCCATGTTCTTAACTGTGTGGGGTTTGTATGCCCCGAGTATTTCAAGTCTGAT
TTCGTATACCGGACTTTGTGGTTGCAGGATAGCCCGTCAGAAGATATTACTAGTATTCTC
TATGATGTTTTTGACTACTTTGAAGATGTCAGGGAGCAACATGGAAAGATTTTTGTTCAT
TGCTGCCAAGGGGTCTCTCGGTCAACCTCGTTGGTTATTGCTTATCGTATGTGGAGAGAA
GGACAAAGTTTTGATGACGCCTTCGAGTATGTAAAGGCAGCAAGGGGTATTGCGGATCCA
AATATGGGTTTTGCTTGTCAGTTGTTACAATGCCAAAAAAGGGTTCATGCTTCTCCTTTG
AGCCCAAGTTCATTATTAAGGTTGTACCGAGTCGCACCTCATTCACCATACGATCCTTTG
CATCTCGTCCCAAAAATGTTAAATGATCCCTCACCGTCAGCATTAGATTCTAGAGGTGCG
TTTATTATACATATACCTTCTTCAATATATGTTTGGATTGGTAAGAAATGTGAAGCAATC
ATGGAGAGAGATGCCAGAGGGGCTGTTTGCCAGATTGTTCGTTATGAGAAAGTGCAGGGC
CCTATCATAACAGTTATGGAAGGTGAGGAACCTCTGTACTTCTGGGACGCTTTCTCCAAT
TTCCTGCCATTGATGGACAAATTAAAGAATGGAGGGGATGTTGTTGAGTCATCAAGTAAG
GTTTGTCCAGGGGAAAGAAAGGTGGATAATTACGATGTTGACTTTGAGATTTTCCAAAAA
GCTACTTCAGGTGGCTTTGTTCCTCCTTTTGCGTCGTGTGAGACTGAGCATGAAACCCAC
CTTCCAGTTAGAGAAAGTTCTTGGAGCATGCTAAGGCGAAAATTTGTATCGGCAAATATG
AGGGATTTTGTCTTTTCAACAAAGTCAGGTATCTCTAGAGTCTATCCTGATTCTATGTTT
ATAACGAGAGACAATTGTGCAACTAAACAACTACATTCTTCTTCTTCTATGTTGTCGTCA
TCGTCTTTGTGTTCACCCTCACCAACTACAATATCCTTATCTTCAACATCTTCTTCATCA
TCAGCCTCATCACCTCCTTATCTCTCGCCAGACTCCATCTCGTCTGATTCAAGCATCAAT
TCAAAATGTCTTTCTGATTCTCCAGTTGTGTCACCTTCAGTTATCTCTTGTGCAGATTTA
GCTTCTTCAACTCCATCTAACTCCAGTGTGTCTGTTCTCCCTTCCAAGATTTCTCCACAG
TCCATATCTAAAACTTCAAAGTATATTGATGTCAACTTCACTTCCCAGACTTCTTCACAA
ACAGCTCCTCCGCTGTCTAAAAAGTTTCCCCTCTCTATTGCGGAGCGGAGAGGTAGTTTG
TCGAAGGGTCTCAAGCTGCCATTGCTTACTGATGATTTTGAGAGTAAAGCAGGTCATTTG
AAGAGTGTTGCCAATGACCAAGGTGACATTGGCATATCAGAAGTGACAAATGAGTCTTTT
AATGAAGCAGCGACTGCGGCTGAGATTTTACATTCCCCACAAGAGATAATTGAGTGTAAA
ATGGATGAATTGCATAGTTCTTTGGATATTTTAGGCATTGGTATTCCATCTGATAAAGAA
CCTGCTGTTTTTAGTGGCTTTCATGAATATTTGGAGAAAATACCATGCAATGAAAGGAGC
ACGGCTATGTTAAATGGTGTTGTGGATACTGGTGGAGCATCTTGTAACGTAGTGGAGCAT
GTTGTATATCGTTGGCCCAGCTTGGAGAAACTTGCTATTTGTAGCATTGATGATTTGGAT
TCTAAAGGTGCATATATTTTCATTATTCCAACTTCAGGTTCTGGAAAAGATGCAGGTAGA
GCTGTGTATGTTTGGGTAGGAAGGTCTTTTATTTGTGAGATTAGCAAGATTCGGAAGGTA
AGGTGCAAAGGGCTTGGTGATCCAGGGGAGATTGACTGGAAACAGGCTGCTACAGATGTT
CTTCATCGAATGGTTCTGCCAAATGATACCAACATTGAGGTTGTGAAAGAAGATGAAGAA
CCTGCTGAGCTCCTAGCATTTTTGAGTTCCCCGGTTAAGCTAACATGTTCAAGGACACAT
CAGGAATTCCAGTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400040507
PEP Infomation

pacid=37443826 transcript=PGSC0003DMT400060202 locus=PGSC0003DMG400023418 ID=PGSC0003DMT400060202.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MPGKEDASAGGADGSQEQCQLANGRRMYWRSASWSSSRTSLPPLNPDMEKDGLDPNGSNS
SHSRRPLTPRSQHSFKARSCLPPLQPLAIARRSLDEWPRAGSDDIGEWPLPATPSGRDSH
SNSERLKLDLSNIHKNPEANGGLVRREKIAFFDKECSKVAEHIYLGGDAVARDKDILKQN
GITHVLNCVGFVCPEYFKSDFVYRTLWLQDSPSEDITSILYDVFDYFEDVREQHGKIFVH
CCQGVSRSTSLVIAYRMWREGQSFDDAFEYVKAARGIADPNMGFACQLLQCQKRVHASPL
SPSSLLRLYRVAPHSPYDPLHLVPKMLNDPSPSALDSRGAFIIHIPSSIYVWIGKKCEAI
MERDARGAVCQIVRYEKVQGPIITVMEGEEPLYFWDAFSNFLPLMDKLKNGGDVVESSSK
VCPGERKVDNYDVDFEIFQKATSGGFVPPFASCETEHETHLPVRESSWSMLRRKFVSANM
RDFVFSTKSGISRVYPDSMFITRDNCATKQLHSSSSMLSSSSLCSPSPTTISLSSTSSSS
SASSPPYLSPDSISSDSSINSKCLSDSPVVSPSVISCADLASSTPSNSSVSVLPSKISPQ
SISKTSKYIDVNFTSQTSSQTAPPLSKKFPLSIAERRGSLSKGLKLPLLTDDFESKAGHL
KSVANDQGDIGISEVTNESFNEAATAAEILHSPQEIIECKMDELHSSLDILGIGIPSDKE
PAVFSGFHEYLEKIPCNERSTAMLNGVVDTGGASCNVVEHVVYRWPSLEKLAICSIDDLD
SKGAYIFIIPTSGSGKDAGRAVYVWVGRSFICEISKIRKVRCKGLGDPGEIDWKQAATDV
LHRMVLPNDTNIEVVKEDEEPAELLAFLSSPVKLTCSRTHQEFQ*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400060202
Transcript Infomation

pacid=37443826 locus=PGSC0003DMG400023418 ID=PGSC0003DMT400060202.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCCGGGAAAGGAAGATGCGTCAGCTGGTGGAGCTGATGGTTCTCAGGAACAATGTCAA
CTTGCAAATGGTCGGAGAATGTACTGGCGGTCAGCATCTTGGTCGTCTTCGAGGACTTCA
CTGCCTCCGCTTAACCCAGATATGGAAAAAGATGGCTTGGACCCAAATGGAAGTAATAGT
TCTCACAGTCGGAGGCCTTTAACTCCTAGGTCACAACATAGTTTCAAGGCTAGGTCGTGT
CTGCCACCGTTGCAGCCATTAGCAATTGCTCGTAGAAGTTTAGATGAGTGGCCGAGAGCA
GGATCTGATGATATTGGAGAGTGGCCACTTCCTGCCACCCCCAGTGGGAGGGATTCACAC
AGCAACAGTGAGAGGCTTAAGCTAGATTTGTCAAACATACATAAAAATCCAGAGGCTAAT
GGTGGGCTTGTGAGAAGAGAAAAAATTGCTTTCTTCGATAAAGAGTGTTCAAAGGTGGCT
GAACACATTTATCTTGGTGGGGATGCAGTGGCAAGAGATAAGGATATACTAAAACAAAAT
GGGATTACCCATGTTCTTAACTGTGTGGGGTTTGTATGCCCCGAGTATTTCAAGTCTGAT
TTCGTATACCGGACTTTGTGGTTGCAGGATAGCCCGTCAGAAGATATTACTAGTATTCTC
TATGATGTTTTTGACTACTTTGAAGATGTCAGGGAGCAACATGGAAAGATTTTTGTTCAT
TGCTGCCAAGGGGTCTCTCGGTCAACCTCGTTGGTTATTGCTTATCGTATGTGGAGAGAA
GGACAAAGTTTTGATGACGCCTTCGAGTATGTAAAGGCAGCAAGGGGTATTGCGGATCCA
AATATGGGTTTTGCTTGTCAGTTGTTACAATGCCAAAAAAGGGTTCATGCTTCTCCTTTG
AGCCCAAGTTCATTATTAAGGTTGTACCGAGTCGCACCTCATTCACCATACGATCCTTTG
CATCTCGTCCCAAAAATGTTAAATGATCCCTCACCGTCAGCATTAGATTCTAGAGGTGCG
TTTATTATACATATACCTTCTTCAATATATGTTTGGATTGGTAAGAAATGTGAAGCAATC
ATGGAGAGAGATGCCAGAGGGGCTGTTTGCCAGATTGTTCGTTATGAGAAAGTGCAGGGC
CCTATCATAACAGTTATGGAAGGTGAGGAACCTCTGTACTTCTGGGACGCTTTCTCCAAT
TTCCTGCCATTGATGGACAAATTAAAGAATGGAGGGGATGTTGTTGAGTCATCAAGTAAG
GTTTGTCCAGGGGAAAGAAAGGTGGATAATTACGATGTTGACTTTGAGATTTTCCAAAAA
GCTACTTCAGGTGGCTTTGTTCCTCCTTTTGCGTCGTGTGAGACTGAGCATGAAACCCAC
CTTCCAGTTAGAGAAAGTTCTTGGAGCATGCTAAGGCGAAAATTTGTATCGGCAAATATG
AGGGATTTTGTCTTTTCAACAAAGTCAGGTATCTCTAGAGTCTATCCTGATTCTATGTTT
ATAACGAGAGACAATTGTGCAACTAAACAACTACATTCTTCTTCTTCTATGTTGTCGTCA
TCGTCTTTGTGTTCACCCTCACCAACTACAATATCCTTATCTTCAACATCTTCTTCATCA
TCAGCCTCATCACCTCCTTATCTCTCGCCAGACTCCATCTCGTCTGATTCAAGCATCAAT
TCAAAATGTCTTTCTGATTCTCCAGTTGTGTCACCTTCAGTTATCTCTTGTGCAGATTTA
GCTTCTTCAACTCCATCTAACTCCAGTGTGTCTGTTCTCCCTTCCAAGATTTCTCCACAG
TCCATATCTAAAACTTCAAAGTATATTGATGTCAACTTCACTTCCCAGACTTCTTCACAA
ACAGCTCCTCCGCTGTCTAAAAAGTTTCCCCTCTCTATTGCGGAGCGGAGAGGTAGTTTG
TCGAAGGGTCTCAAGCTGCCATTGCTTACTGATGATTTTGAGAGTAAAGCAGGTCATTTG
AAGAGTGTTGCCAATGACCAAGGTGACATTGGCATATCAGAAGTGACAAATGAGTCTTTT
AATGAAGCAGCGACTGCGGCTGAGATTTTACATTCCCCACAAGAGATAATTGAGTGTAAA
ATGGATGAATTGCATAGTTCTTTGGATATTTTAGGCATTGGTATTCCATCTGATAAAGAA
CCTGCTGTTTTTAGTGGCTTTCATGAATATTTGGAGAAAATACCATGCAATGAAAGGAGC
ACGGCTATGTTAAATGGTGTTGTGGATACTGGTGGAGCATCTTGTAACGTAGTGGAGCAT
GTTGTATATCGTTGGCCCAGCTTGGAGAAACTTGCTATTTGTAGCATTGATGATTTGGAT
TCTAAAGGTGCATATATTTTCATTATTCCAACTTCAGGTTCTGGAAAAGATGCAGGTAGA
GCTGTGTATGTTTGGGTAGGAAGGTCTTTTATTTGTGAGATTAGCAAGATTCGGAAGGTA
AGGTGCAAAGGGCTTGGTGATCCAGGGGAGATTGACTGGAAACAGGCTGCTACAGATGTT
CTTCATCGAATGGTTCTGCCAAATGATACCAACATTGAGGTTGTGAAAGAAGATGAAGAA
CCTGCTGAGCTCCTAGCATTTTTGAGTTCCCCGGTTAAGCTAACATGTTCAAGGACACAT
CAGGAATTCCAGTAG