Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400059645
CDS Infomation

pacid=37425025 polypeptide=PGSC0003DMP400040133 locus=PGSC0003DMG400023180 ID=PGSC0003DMT400059645.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTGAGGGTAATACTAGAGCTCCAGTTAGACTTGAGGGCAAGTATGGTGCAATGCTT
GTCTGTTGGGTTTTGGGCAATGGATGCCTCTTCTCTTGGAACAGTATGTTAACTATTCAG
GACTACTATGTCGCCCTCTTTCCGAATTACCATCCCTCAAGGGTCCTTACACTCATTTAT
CAACCATTTGCATTGGGAACACTTGCAATATTGGCTTACAATGAAGCAAAAATTAACACC
AGGAAAAGGAATCTTTTTGGATATACTCTTTTCTTCATCGCTACATTCATAGTTCTTGTT
TTGGATTTAGCTACATCTGGTAAGGGAGGGTTAGGAAGTTTTATTGGGATATGTGTCATT
AGTGGTGCCTTTGGAGTTGCAGATGCTCATGTGCAAGGTGGAATGATTGGAGACCTTTCA
TTCATGTTACCTGAATTTTTGCAGTCTTTCCTTGCTGGCTTGGCTGCCTCTGGTGCTCTA
ACATCTTCGTTAAGACTAATTACCAAAGCAGCATTTGACAATTCACAGGACGGTCTTCGA
AAGGGTGCAATTCTGTTCTTCTCGGTATCCACACTCTTTGAGCTGCTTTGTGTCCTCCTA
TATGCATTTGTCTTCCCTAAGCTACCAATAGTGAAGTACTATCGTGCAAAAGCAGCTTCA
GAGGGATCAAAGACAGTTGCTAGTGACCTTGCTGCAGCCGGAGTTTACAAACAAGGACCA
GAAACAAAGGATGAGCATGATCCTCAACAAGTTGAGCGACTTAACAACAAAGAATTGTTA
TTGCAGAACATAGACTATGCAATAGATTTGTTTCTGATATATGCTCTAACATTGTCGATT
TTCCCTGGATTCTTGTCTGAGGATACTGGATCTCACAGCTTAGGATCATGGTATGCACTT
GTCCTTATCGCTATGTACAATGTGTGGGATCTCATAGGGAGATACATCCCACTAATCAAA
TGCTTAAAGCTGGAATCGCGGAAAGGGCTGATGGTAGTGATTCTTTTGCGTTCTCTATTT
GTCCCAGCTTTCTACTTCACAGCCAAATATGGTGATCAAGGATGGATGATTATGTTAACA
TCCTTGTTGGGACTAAGTAATGGCCACCTCACAGTGTGTGTCCTCACTTGTGCACCAAAA
GGTTACAAGGGACCAGAGCAAAATGCACTAGGAAATCTTCTAGTTTTGTTTCTTTTAGGA
GGTATATTTGCTGGTGTAACTCTAGATTGGTTGTGGCTTATAGGCAAAGGTTGGTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400040133
PEP Infomation

pacid=37425025 transcript=PGSC0003DMT400059645 locus=PGSC0003DMG400023180 ID=PGSC0003DMT400059645.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MAEGNTRAPVRLEGKYGAMLVCWVLGNGCLFSWNSMLTIQDYYVALFPNYHPSRVLTLIY
QPFALGTLAILAYNEAKINTRKRNLFGYTLFFIATFIVLVLDLATSGKGGLGSFIGICVI
SGAFGVADAHVQGGMIGDLSFMLPEFLQSFLAGLAASGALTSSLRLITKAAFDNSQDGLR
KGAILFFSVSTLFELLCVLLYAFVFPKLPIVKYYRAKAASEGSKTVASDLAAAGVYKQGP
ETKDEHDPQQVERLNNKELLLQNIDYAIDLFLIYALTLSIFPGFLSEDTGSHSLGSWYAL
VLIAMYNVWDLIGRYIPLIKCLKLESRKGLMVVILLRSLFVPAFYFTAKYGDQGWMIMLT
SLLGLSNGHLTVCVLTCAPKGYKGPEQNALGNLLVLFLLGGIFAGVTLDWLWLIGKGW*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400059645
Transcript Infomation

pacid=37425025 locus=PGSC0003DMG400023180 ID=PGSC0003DMT400059645.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTGAGGGTAATACTAGAGCTCCAGTTAGACTTGAGGGCAAGTATGGTGCAATGCTT
GTCTGTTGGGTTTTGGGCAATGGATGCCTCTTCTCTTGGAACAGTATGTTAACTATTCAG
GACTACTATGTCGCCCTCTTTCCGAATTACCATCCCTCAAGGGTCCTTACACTCATTTAT
CAACCATTTGCATTGGGAACACTTGCAATATTGGCTTACAATGAAGCAAAAATTAACACC
AGGAAAAGGAATCTTTTTGGATATACTCTTTTCTTCATCGCTACATTCATAGTTCTTGTT
TTGGATTTAGCTACATCTGGTAAGGGAGGGTTAGGAAGTTTTATTGGGATATGTGTCATT
AGTGGTGCCTTTGGAGTTGCAGATGCTCATGTGCAAGGTGGAATGATTGGAGACCTTTCA
TTCATGTTACCTGAATTTTTGCAGTCTTTCCTTGCTGGCTTGGCTGCCTCTGGTGCTCTA
ACATCTTCGTTAAGACTAATTACCAAAGCAGCATTTGACAATTCACAGGACGGTCTTCGA
AAGGGTGCAATTCTGTTCTTCTCGGTATCCACACTCTTTGAGCTGCTTTGTGTCCTCCTA
TATGCATTTGTCTTCCCTAAGCTACCAATAGTGAAGTACTATCGTGCAAAAGCAGCTTCA
GAGGGATCAAAGACAGTTGCTAGTGACCTTGCTGCAGCCGGAGTTTACAAACAAGGACCA
GAAACAAAGGATGAGCATGATCCTCAACAAGTTGAGCGACTTAACAACAAAGAATTGTTA
TTGCAGAACATAGACTATGCAATAGATTTGTTTCTGATATATGCTCTAACATTGTCGATT
TTCCCTGGATTCTTGTCTGAGGATACTGGATCTCACAGCTTAGGATCATGGTATGCACTT
GTCCTTATCGCTATGTACAATGTGTGGGATCTCATAGGGAGATACATCCCACTAATCAAA
TGCTTAAAGCTGGAATCGCGGAAAGGGCTGATGGTAGTGATTCTTTTGCGTTCTCTATTT
GTCCCAGCTTTCTACTTCACAGCCAAATATGGTGATCAAGGATGGATGATTATGTTAACA
TCCTTGTTGGGACTAAGTAATGGCCACCTCACAGTGTGTGTCCTCACTTGTGCACCAAAA
GGTTACAAGGGACCAGAGCAAAATGCACTAGGAAATCTTCTAGTTTTGTTTCTTTTAGGA
GGTATATTTGCTGGTGTAACTCTAGATTGGTTGTGGCTTATAGGCAAAGGTTGGTAA