Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400059578
CDS Infomation

pacid=37467807 polypeptide=PGSC0003DMP400040097 locus=PGSC0003DMG400023149 ID=PGSC0003DMT400059578.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAGTTTATCATCTCCACCAGCCTTTAACTTTTCTATGCTCCCATCAAACTTGATCCCG
GGGGACGCGAATCCTCCGTGGATGAGCAAAGGTGACAATGCATGGCAACTTGTAGCAGCT
ACCTTAGTGGGGCTACAAAGTGTACCAGGCCTTATAATACTCTATGGAGGAGCTGTCAAA
AAAAAATGGGCAGTAAATTCAGCTTTCATGGTTTTATATGCCTTTGCTTGTGTACTACTA
TGTTGGGTTTGTTGGGGATATAGAATGTCATTTGGAGAAAAACTAATACCAATATGGGGT
AAAGTAAACGTTGCGTTAGAACAAGATTACCTCTTCCAGAAAGCATTTCTGGGGATGTTT
CCTAACGCGACTATGGTCTTTTTCCAGTTTGTATTCGCGGCTATCACTTTGGTTCTGATA
GCGGGTGCAGTGCTTGGAAGGATGAATTTTTATGCTTGGATGTTGTTTGTACCATTGTGG
CTAACATTTTCTTATACTTTTGGTGCATATACTATTTGGTCTTCTAATGGTTGGTTGTCT
GTTAATGGTATTATTGACTATTCGGGTGGATATGTCATTCATTTGTCTTCTGGTGTTGCT
GGCTTTACTGCTGCTTATTGGGTGGGTCCAAGATCAACCAAGGATAGAGAGAGATTTCCA
CCAAATAACATACTTCTGATGTTGGCTGGGGCAGGACTCCTATGGATGGGGTGGTCAGGG
TTCAATGGAGGTGATCCATATGCAGCCAACATTGATGCATCCTTGGCTGTTTTAAACACA
CATGTTGCTGCTGCTACAAGCTTGTTAACATGGCTCATTCTTGATGTCATCTTCTTTGGA
AAGCCTTCTGTTATTGGTGCTGTCCAAGGCATGATCACTGGCTTAGTTTCAATCACACCT
GCTGCAGGTGTTGTTCAAGGATGGGCAGCCATAGCCATAGGACTATGTTCAGGCTCAATT
CCATGGTTCACAATGATGGTAGTCCACAAGAAGTCTGAGCTTCTTCAAAAAGTAGACGAC
ACAATGGCTGTCTTCCACACCCATGCTGTGGCTGGATGCCTAGGAGGACTCCTCACGGGG
TTCTTTGCTCACCCGAAACTATGTTACCTTTTCTATGGCAACTACAACAAATATTATGGC
CTCTTCTATGGGATTCACGACGGACAATCTCACAAAGGACTCAGGCAAATGGGTCTCCAA
CTTATTGGGATTCTGTTCATCGTGGTGGTGAACGTTGTGATGACAAGCTTGATATGTTTG
TTGGTGCAGCTCATTGTACCACTGAGAATGTCAGAGGAAGATATGGAAATTGGAGATGAA
GCTGCACATGGTGAGGAAGCTTATGCTATTTGGGGACAAGGTGATAGGCTTGAGAAATCT
GCAGGATTTTCTGATACTGCTGCTGGAGCTGCTAAGTCTAGTTATAATACGTCTAGAAGT
CAGGTCGAAATGGTCTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400040097
PEP Infomation

pacid=37467807 transcript=PGSC0003DMT400059578 locus=PGSC0003DMG400023149 ID=PGSC0003DMT400059578.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MSLSSPPAFNFSMLPSNLIPGDANPPWMSKGDNAWQLVAATLVGLQSVPGLIILYGGAVK
KKWAVNSAFMVLYAFACVLLCWVCWGYRMSFGEKLIPIWGKVNVALEQDYLFQKAFLGMF
PNATMVFFQFVFAAITLVLIAGAVLGRMNFYAWMLFVPLWLTFSYTFGAYTIWSSNGWLS
VNGIIDYSGGYVIHLSSGVAGFTAAYWVGPRSTKDRERFPPNNILLMLAGAGLLWMGWSG
FNGGDPYAANIDASLAVLNTHVAAATSLLTWLILDVIFFGKPSVIGAVQGMITGLVSITP
AAGVVQGWAAIAIGLCSGSIPWFTMMVVHKKSELLQKVDDTMAVFHTHAVAGCLGGLLTG
FFAHPKLCYLFYGNYNKYYGLFYGIHDGQSHKGLRQMGLQLIGILFIVVVNVVMTSLICL
LVQLIVPLRMSEEDMEIGDEAAHGEEAYAIWGQGDRLEKSAGFSDTAAGAAKSSYNTSRS
QVEMV*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400059578
Transcript Infomation

pacid=37467807 locus=PGSC0003DMG400023149 ID=PGSC0003DMT400059578.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAGTTTATCATCTCCACCAGCCTTTAACTTTTCTATGCTCCCATCAAACTTGATCCCG
GGGGACGCGAATCCTCCGTGGATGAGCAAAGGTGACAATGCATGGCAACTTGTAGCAGCT
ACCTTAGTGGGGCTACAAAGTGTACCAGGCCTTATAATACTCTATGGAGGAGCTGTCAAA
AAAAAATGGGCAGTAAATTCAGCTTTCATGGTTTTATATGCCTTTGCTTGTGTACTACTA
TGTTGGGTTTGTTGGGGATATAGAATGTCATTTGGAGAAAAACTAATACCAATATGGGGT
AAAGTAAACGTTGCGTTAGAACAAGATTACCTCTTCCAGAAAGCATTTCTGGGGATGTTT
CCTAACGCGACTATGGTCTTTTTCCAGTTTGTATTCGCGGCTATCACTTTGGTTCTGATA
GCGGGTGCAGTGCTTGGAAGGATGAATTTTTATGCTTGGATGTTGTTTGTACCATTGTGG
CTAACATTTTCTTATACTTTTGGTGCATATACTATTTGGTCTTCTAATGGTTGGTTGTCT
GTTAATGGTATTATTGACTATTCGGGTGGATATGTCATTCATTTGTCTTCTGGTGTTGCT
GGCTTTACTGCTGCTTATTGGGTGGGTCCAAGATCAACCAAGGATAGAGAGAGATTTCCA
CCAAATAACATACTTCTGATGTTGGCTGGGGCAGGACTCCTATGGATGGGGTGGTCAGGG
TTCAATGGAGGTGATCCATATGCAGCCAACATTGATGCATCCTTGGCTGTTTTAAACACA
CATGTTGCTGCTGCTACAAGCTTGTTAACATGGCTCATTCTTGATGTCATCTTCTTTGGA
AAGCCTTCTGTTATTGGTGCTGTCCAAGGCATGATCACTGGCTTAGTTTCAATCACACCT
GCTGCAGGTGTTGTTCAAGGATGGGCAGCCATAGCCATAGGACTATGTTCAGGCTCAATT
CCATGGTTCACAATGATGGTAGTCCACAAGAAGTCTGAGCTTCTTCAAAAAGTAGACGAC
ACAATGGCTGTCTTCCACACCCATGCTGTGGCTGGATGCCTAGGAGGACTCCTCACGGGG
TTCTTTGCTCACCCGAAACTATGTTACCTTTTCTATGGCAACTACAACAAATATTATGGC
CTCTTCTATGGGATTCACGACGGACAATCTCACAAAGGACTCAGGCAAATGGGTCTCCAA
CTTATTGGGATTCTGTTCATCGTGGTGGTGAACGTTGTGATGACAAGCTTGATATGTTTG
TTGGTGCAGCTCATTGTACCACTGAGAATGTCAGAGGAAGATATGGAAATTGGAGATGAA
GCTGCACATGGTGAGGAAGCTTATGCTATTTGGGGACAAGGTGATAGGCTTGAGAAATCT
GCAGGATTTTCTGATACTGCTGCTGGAGCTGCTAAGTCTAGTTATAATACGTCTAGAAGT
CAGGTCGAAATGGTCTAA