Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400059284
CDS Infomation	pacid=37471824 polypeptide=PGSC0003DMP400039920 locus=PGSC0003DMG400023033 ID=PGSC0003DMT400059284.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGTTCCAGAAATTGCTTTTGGCCAACGAACAAGAGTTGTCATGGATATTAGTTGTGGA ATAGCGAGTTTTGGGGCATATCTGATGGACCGCAATGTCAGCACATTGTCCATTGCAACA AAAGATGTGCATAACAATCAGATTCAATTTGCATTGGAACGTGGAGTGCCTGCTATGTTC GCAGCATTTACTACACACCGTCTTTTGTACCCTAGCCAGGCATTTGACATGATACATTGT TCCAGATGTAGCATAAATTGGACCCGTGATGATGGCATTCTGCTTCTAGAGGTAAACAGA ATGCTTAGGGCAGGAGGATATTTTATCTGGGCAGCAGAACCTGTTCACAAACATGAAGAG AACTTGTTTGCACCACTTAAAGAAATGGAGGATCTTACTCGACGCCTATGCTGGGAGTTA TTAAAGAAGGAGAGTGACATTTATATTTGGAGGAAGCCATTGAATAATAGTTGCTATCTC AGTCACGCTCCAGCAGTTCAACCTTCTCTATGTTCAGCTGGTGATGATCCAGATAATGTC TGGAACGTAAACCTAACGAAATGTATTACACAATTACCTGAGAATGGCTATGGAGCTAAC GTGACTGCTTGGCCTGCACGCCTTCACTCTCCACCGGACAGGCTGTTTAGTATAAAAATG GATGCTGAATTATCTAGGAGGGAGATTTATAGAGCAGAGTCAAATTTTTGGTATACCGTA ATAAAAGGATATATTGGTGCTTTCCGTTGGGAGACGTTAAACCTACGAAACGTGCTGGAC ATGAGAGCTGTATATGGGGGGTTTGCAGCTGCATTGCATGATTTCAACTTCGATTGCTGG GTTATGAATGTTGTTCCCGTTAGTGGTCCTAATACACTGCCTGTTCTATATGACCGGGGT TTCATTGGAGTCATGCATGACTGGTGTGAGCCATTTGATACTTATCCAAGAACGTATGAT TTAGTCCACGCAGCTGCTCTTTTCTCAGTCGAAAAAAACAGATGCAATGTGACAACTATC ATGCTTGAAATAGACAGAATTCTTAGACCCGGGGGACGAGTTTATATTCGCGACACCACA CCTGTTATCGAAGAGCTTGTAGAAATTGCACAAGCCTTAGGATGGGTGTCATTTAAATAT GATAGCAGCGAGGGACCTCATTCTAATTGGAAGCTTTTGATAGGCGAAAAGCGTCTATAA

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400039920
PEP Infomation	pacid=37471824 transcript=PGSC0003DMT400059284 locus=PGSC0003DMG400023033 ID=PGSC0003DMT400059284.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	MVPEIAFGQRTRVVMDISCGIASFGAYLMDRNVSTLSIATKDVHNNQIQFALERGVPAMF AAFTTHRLLYPSQAFDMIHCSRCSINWTRDDGILLLEVNRMLRAGGYFIWAAEPVHKHEE NLFAPLKEMEDLTRRLCWELLKKESDIYIWRKPLNNSCYLSHAPAVQPSLCSAGDDPDNV WNVNLTKCITQLPENGYGANVTAWPARLHSPPDRLFSIKMDAELSRREIYRAESNFWYTV IKGYIGAFRWETLNLRNVLDMRAVYGGFAAALHDFNFDCWVMNVVPVSGPNTLPVLYDRG FIGVMHDWCEPFDTYPRTYDLVHAAALFSVEKNRCNVTTIMLEIDRILRPGGRVYIRDTT PVIEELVEIAQALGWVSFKYDSSEGPHSNWKLLIGEKRL*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400059284
Transcript Infomation	pacid=37471824 locus=PGSC0003DMG400023033 ID=PGSC0003DMT400059284.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGTTCCAGAAATTGCTTTTGGCCAACGAACAAGAGTTGTCATGGATATTAGTTGTGGA ATAGCGAGTTTTGGGGCATATCTGATGGACCGCAATGTCAGCACATTGTCCATTGCAACA AAAGATGTGCATAACAATCAGATTCAATTTGCATTGGAACGTGGAGTGCCTGCTATGTTC GCAGCATTTACTACACACCGTCTTTTGTACCCTAGCCAGGCATTTGACATGATACATTGT TCCAGATGTAGCATAAATTGGACCCGTGATGATGGCATTCTGCTTCTAGAGGTAAACAGA ATGCTTAGGGCAGGAGGATATTTTATCTGGGCAGCAGAACCTGTTCACAAACATGAAGAG AACTTGTTTGCACCACTTAAAGAAATGGAGGATCTTACTCGACGCCTATGCTGGGAGTTA TTAAAGAAGGAGAGTGACATTTATATTTGGAGGAAGCCATTGAATAATAGTTGCTATCTC AGTCACGCTCCAGCAGTTCAACCTTCTCTATGTTCAGCTGGTGATGATCCAGATAATGTC TGGAACGTAAACCTAACGAAATGTATTACACAATTACCTGAGAATGGCTATGGAGCTAAC GTGACTGCTTGGCCTGCACGCCTTCACTCTCCACCGGACAGGCTGTTTAGTATAAAAATG GATGCTGAATTATCTAGGAGGGAGATTTATAGAGCAGAGTCAAATTTTTGGTATACCGTA ATAAAAGGATATATTGGTGCTTTCCGTTGGGAGACGTTAAACCTACGAAACGTGCTGGAC ATGAGAGCTGTATATGGGGGGTTTGCAGCTGCATTGCATGATTTCAACTTCGATTGCTGG GTTATGAATGTTGTTCCCGTTAGTGGTCCTAATACACTGCCTGTTCTATATGACCGGGGT TTCATTGGAGTCATGCATGACTGGTGTGAGCCATTTGATACTTATCCAAGAACGTATGAT TTAGTCCACGCAGCTGCTCTTTTCTCAGTCGAAAAAAACAGATGCAATGTGACAACTATC ATGCTTGAAATAGACAGAATTCTTAGACCCGGGGGACGAGTTTATATTCGCGACACCACA CCTGTTATCGAAGAGCTTGTAGAAATTGCACAAGCCTTAGGATGGGTGTCATTTAAATAT GATAGCAGCGAGGGACCTCATTCTAATTGGAAGCTTTTGATAGGCGAAAAGCGTCTATAA