Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400059061
CDS Infomation

pacid=37466499 polypeptide=PGSC0003DMP400039786 locus=PGSC0003DMG400022938 ID=PGSC0003DMT400059061.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTCCACCAAAATCCGTCCGTTCAATATCTCAACAAGCCTTCGATGAATTGGTGAAG
GAAAATATTGAAGATCTTGGAATGGATTCCACTGAAGCCCTTGAAGACGCTATTCAAACC
CTAACTCTCCAAGGCGTTGATCTCTCCGGGATTGTGACTAGCATTTTGGGTTCTGGGGAG
GAAAATCCAGTAATTCAATCACTTGAGAAGCTGAAGGAATTGGATCGTGATTGGAAGCAG
GGAGGCGGGGATGAGACTGATGTGAAGGAAATTATTGAATGGTTAGATAAATTGAATGAT
GCGTGTAATGTTGATGGATCAGGAAATGCTGCTATAGCAACTAAGAATGGTGCTATAAAA
TTGGTGTGTTCGATATGCGGTAAACTTGGGAGCGAGGGCCTTGTTTCAGCTCTGAAGACA
TTGGTTTCCTTACTTCATGATCTACAGAGCACTGAAATATTTAGGGAGACTAATGGTCCA
AAGATGGTTATGAATATCCTAAACAATAGGAAAGAAAACTTAAGCATCTTGAACAGTGGA
TTCGCTGTTGTTTCTGCCGCTGCAACTGGGAATGAGGTCCTCAAGGAGGCATTTATGAAC
TTGAAAATTGATGAGCTGATTCTTCAATGTCTAAGAGAATTTAGTAGGGGGAGTATTCCT
TGTTTATATGATGCTGTACGAGTCCTGCTAACCTCTGATGACAATCGTGTTGTGGCCTCT
GAAGTTTATGGGTATGCCAGAAGGTTTGCAAAAATAGGAATTGTTGAAGCACTTGTTGAT
TCACTTCATGATGGGATCAAGGCGCCTAGTCTGGTGTCTGCAAGTGTTGCTTTAAAAGCT
ATTGCTGTTAATGATGATATATGCAGAGCCGTTGCTGAAAATGGTGGTATAGACGCAATT
CTTCGATGTATAGATGACAGCAGTGAACAGGGTGAAAAAGTCGTAGCCATAACTTGCTGC
TCCTTGTTATCTAAGTTGGCAGGAAGTGACATAAACAAGAGTGCTATTGTAGATAAGGAT
GGCATGGACAAGCTTATGAAACTTGCAATGAGATTTTCCGATGATCCGGCTGTGCTACAT
GAGGTTATGTCTATGATAACTGTATTGTCCTTGAGGTCTCCACATAATGCTGCATGTGCA
ATTGAAGCCGGAGCTGGTGATATTGTTATCCAAGCTATGCAGAGGTTTCCAGAATCAGAG
CTACTGCAAAGAAGCTCTTGTTTCATGATCCGAAATCTTGTGGTTAGGAATCCAGAAAAC
AGAACTATTTTGCTTGGTAATGGCATTGAGAAGCTTATAAGAAAGGCTAAGATGAATTAC
AAGAGCTGTAAGAATGCTGCAACTGATGCTCTTAGGGATCTAGGACTAGATAACTATAAC
TTGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400039786
PEP Infomation

pacid=37466499 transcript=PGSC0003DMT400059061 locus=PGSC0003DMG400022938 ID=PGSC0003DMT400059061.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MAPPKSVRSISQQAFDELVKENIEDLGMDSTEALEDAIQTLTLQGVDLSGIVTSILGSGE
ENPVIQSLEKLKELDRDWKQGGGDETDVKEIIEWLDKLNDACNVDGSGNAAIATKNGAIK
LVCSICGKLGSEGLVSALKTLVSLLHDLQSTEIFRETNGPKMVMNILNNRKENLSILNSG
FAVVSAAATGNEVLKEAFMNLKIDELILQCLREFSRGSIPCLYDAVRVLLTSDDNRVVAS
EVYGYARRFAKIGIVEALVDSLHDGIKAPSLVSASVALKAIAVNDDICRAVAENGGIDAI
LRCIDDSSEQGEKVVAITCCSLLSKLAGSDINKSAIVDKDGMDKLMKLAMRFSDDPAVLH
EVMSMITVLSLRSPHNAACAIEAGAGDIVIQAMQRFPESELLQRSSCFMIRNLVVRNPEN
RTILLGNGIEKLIRKAKMNYKSCKNAATDALRDLGLDNYNL*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400059061
Transcript Infomation

pacid=37466499 locus=PGSC0003DMG400022938 ID=PGSC0003DMT400059061.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTCCACCAAAATCCGTCCGTTCAATATCTCAACAAGCCTTCGATGAATTGGTGAAG
GAAAATATTGAAGATCTTGGAATGGATTCCACTGAAGCCCTTGAAGACGCTATTCAAACC
CTAACTCTCCAAGGCGTTGATCTCTCCGGGATTGTGACTAGCATTTTGGGTTCTGGGGAG
GAAAATCCAGTAATTCAATCACTTGAGAAGCTGAAGGAATTGGATCGTGATTGGAAGCAG
GGAGGCGGGGATGAGACTGATGTGAAGGAAATTATTGAATGGTTAGATAAATTGAATGAT
GCGTGTAATGTTGATGGATCAGGAAATGCTGCTATAGCAACTAAGAATGGTGCTATAAAA
TTGGTGTGTTCGATATGCGGTAAACTTGGGAGCGAGGGCCTTGTTTCAGCTCTGAAGACA
TTGGTTTCCTTACTTCATGATCTACAGAGCACTGAAATATTTAGGGAGACTAATGGTCCA
AAGATGGTTATGAATATCCTAAACAATAGGAAAGAAAACTTAAGCATCTTGAACAGTGGA
TTCGCTGTTGTTTCTGCCGCTGCAACTGGGAATGAGGTCCTCAAGGAGGCATTTATGAAC
TTGAAAATTGATGAGCTGATTCTTCAATGTCTAAGAGAATTTAGTAGGGGGAGTATTCCT
TGTTTATATGATGCTGTACGAGTCCTGCTAACCTCTGATGACAATCGTGTTGTGGCCTCT
GAAGTTTATGGGTATGCCAGAAGGTTTGCAAAAATAGGAATTGTTGAAGCACTTGTTGAT
TCACTTCATGATGGGATCAAGGCGCCTAGTCTGGTGTCTGCAAGTGTTGCTTTAAAAGCT
ATTGCTGTTAATGATGATATATGCAGAGCCGTTGCTGAAAATGGTGGTATAGACGCAATT
CTTCGATGTATAGATGACAGCAGTGAACAGGGTGAAAAAGTCGTAGCCATAACTTGCTGC
TCCTTGTTATCTAAGTTGGCAGGAAGTGACATAAACAAGAGTGCTATTGTAGATAAGGAT
GGCATGGACAAGCTTATGAAACTTGCAATGAGATTTTCCGATGATCCGGCTGTGCTACAT
GAGGTTATGTCTATGATAACTGTATTGTCCTTGAGGTCTCCACATAATGCTGCATGTGCA
ATTGAAGCCGGAGCTGGTGATATTGTTATCCAAGCTATGCAGAGGTTTCCAGAATCAGAG
CTACTGCAAAGAAGCTCTTGTTTCATGATCCGAAATCTTGTGGTTAGGAATCCAGAAAAC
AGAACTATTTTGCTTGGTAATGGCATTGAGAAGCTTATAAGAAAGGCTAAGATGAATTAC
AAGAGCTGTAAGAATGCTGCAACTGATGCTCTTAGGGATCTAGGACTAGATAACTATAAC
TTGTGA