Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400058890
CDS Infomation

pacid=37463428 polypeptide=PGSC0003DMP400039670 locus=PGSC0003DMG400022883 ID=PGSC0003DMT400058890.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGATGATCTTGAAAAGGCAATACTTATAAGTTTTGATGAATCTGGGGCAGTTGATTCT
GCTCTTAAAGCACAAGCAGTTGGCTATTGCCAACAAATTAAAGAAACCCCATCAATTTGT
AGTATATGTATTGAGCGTTTATGTTTCTCTAAACTGGTTCAAGTTCAGTTCTGGTGCTTA
CAATGTCTGCACGAGGTTCTTCGGGTTCGGTATTCATCAATGGGTCCAGAGGAGAAATCC
TTTATCCGGAAATCTGTGTTTTCATTGGCTTGTTATGAGAGCATTGATGATAAGAATTTG
GTAAGAGTTTTGGATGGTCCAGCTTTCATAAAGAATAAGCTTGCTCAGGTTATGGTTACT
TTAATTTGTTTCGAGTATCCCATGATATGGCCTTCCGTATTTGTTGATTTTTTATCAAAT
CTTAGTAAAGGTGTAGTGGTTATTGATATGTTTTGTCGGGTTCTCAATGCATTGGATGAA
GAAGTTATTAGCTTGGACTATCCGAGAAGCCAAGAGGAGGTGGCTATCGCTGGGCAAATT
AAGGATGCAATGAGGCAGCAGTGTATTTCTCAGGTTGTTAGGGCTTGGTATGATATCCTT
TTAATGTACAGGAATTCGGATCCGGATTTATGTTGCAGTGTGTTAGATTCTATGAGGAGG
TATGTTTCGTGGATCGACATAGGTTTGATAGCAAATGATGCGTTTGTCGGGTTGTTATTT
GAGTTGATGTTGGTGAGTGGTTTTCCCGATCAACTCAGAGGTGCTGCTGCTGGTTGCATC
CACGCTGTTGCTGCTAAGCGCATGGATCCAAAAGCAAAACTCACTCTTTTGCAGAGCCTT
CAAATTAGAAAGGTTTTTGGTTTGGTAGCAGAGGATAATGACTCCGAGTTGGTATCAAGT
GTTTCCTCTTTGCTTACTGGATATTCAACTGAGGTTTTGGAGTGTTCAAAGCGTTTGAAC
TCTGAGGATGGGAAAGCTGTCTCAACTGAACTATTGAATGAGGTTTTGCCCTCTGTTTTC
TATGTAATGCAAAATTGTGAAATTGATGAAACCTTCAGTATTGTGCAGTTCCTCTCTGGG
TATGTTGGCACATTGAAGAGTCTGGCTCCATTGACCGAGACACAATCACTTCATGTAGGT
CAGATACTGGATGTTATTCGGTCCCAGATCCGATTTGACCCAGCATATCGCAATAACCTC
GATATGTTGGACAAAACAGGAAAGGAAGAGGAAGATCGGATGGCTGAGTTTAGGAAGGAT
TTGTTTGTTCTACTTCGGAGTGTGGGACGTGTAGCACCTGATGCAACTCAGCTTTTCATC
AGGAACTCCTTAGCTAGTGCTGTTGCATCTAATGGGGATGTGAATGTTGAGGAGATAGAA
GCTGCACTCTCTCTCCTATATGCCTTTGGGGAATCACTTAGTGATGAAACCATGAAAACA
GGAAATGGTCTCTTGGGAGAACTAATACCAATGCTTTTGTCGACAAAGTTTCCTTGCCAC
AACAACAGGCTTGTTGCACTTATCTACTTGGAAACAGTAACGAGGTATATGAAGTTTTTT
CAGGAGAATACACAATACATACCTTTGGTTTTGAGTGCCTTTCTCGATGAAAGAGGCATA
CATCATCCAAATAGGAATGTGAGTCGAAGGGCAAGTTATCTTTTCATGAGGATTGTGAAG
CTGCTCAAAGCAAAACTTGTACCCTACATAGAGACTATTCTGCAGAGTTTGCAAGATACA
GTTGCTCAATTCACAACAATTTATGCTGTCTCCAAGGAGCTCTCAGGTTGTGAAGATGGT
AGTCACATTTTTGAGGCGATTGGCTTATTAATTGGAATGGAAGATGTACCCCTTGAAAAG
CAATCAGAGTACCTGACCGCCTTGCTTACTCCTCTTTGTCAGCAGGTTGAGGCTTTGCTC
TTAAATGCCAAAGCCCAGAATCCTGAAGAGTCTCCAGCAAAGATCACAAATATCCAGCAG
ATAATTATGGCCATTAATGCTCTGAGCAAGGGTTTTAGCGAGCGTCTTGTAACTGCCAGT
CGTCCTGCAATTGGTCTCATGTTCAAACAGACATTGGATGTCCTTCTACGTATTCTTATC
ATATATCCAAAGATAGAACCCCTGCGGTGCAAGGTCACATCATTCATTCACCGCATGGTG
GACATACTAGGATCATCTGTATTTCCATATCTACCAAAGGCACTGGAGCAATTGCTAGCC
GAAAGTGAGCCGAAAGAACTAGCAGGCTTTTTGCTATTGCTTAATCAGCTTATCTGCAAA
TTCAACACTGGAGTTCAAGACATTCTGGAGGAAGTTTACCCTGCTATTGCTAGCCGAGTA
TTTAATATCCTGCCGAGAGATGCTTTCCCTACAGGTCCTGGAAGCAATACAGAGGAAATC
CGTGAGCTACAGGAACTTCAGAGGACGTTTTACACTTTCCTTCACGTGATTGCTACGCAT
GATCTATCATCAGTTTTTCTTTCCTCCAAAAGTAGGGCTTACTTGGATCCGATGATGCAG
CTGATCGTACATGCATCCTGTAATCACAAGGATATCCTTGTTCGTAAGGCATGTGTACAG
ATATTTATAAGACTAATCAAAGACTGGTGTGTGAGTCCTTATGGTGAAGAAAAGGTGCCT
GGTTTCCGAAGTTTTGTGATGGAGGCCTTTGCAACAAACTGTTGTCTGTACAGTGTCCTT
GACAAATCCTTTGAGTTCCGTGATGCAAATACGCTTGTTCTTTTCGGCGAGATTGTATTG
GTTCAGAAGGTCATGTTTGAGAAATTTGGGAATGATTTTCTTGTTCATTTTGTATCAAAA
AGCTTGCAAAGTGCTCATTGCCCTCAAGATTTGGCTGAGCAGTATTGTCAGAAATTGCAG
GGTAGTGATATTAAAGCGCTGAAATCATTTTACCAGTCACTTATTGAAAATTTGAGACGT
CAACAGAATGGAAGCTTGGTGTTTAGATAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400039670
PEP Infomation

pacid=37463428 transcript=PGSC0003DMT400058890 locus=PGSC0003DMG400022883 ID=PGSC0003DMT400058890.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MDDLEKAILISFDESGAVDSALKAQAVGYCQQIKETPSICSICIERLCFSKLVQVQFWCL
QCLHEVLRVRYSSMGPEEKSFIRKSVFSLACYESIDDKNLVRVLDGPAFIKNKLAQVMVT
LICFEYPMIWPSVFVDFLSNLSKGVVVIDMFCRVLNALDEEVISLDYPRSQEEVAIAGQI
KDAMRQQCISQVVRAWYDILLMYRNSDPDLCCSVLDSMRRYVSWIDIGLIANDAFVGLLF
ELMLVSGFPDQLRGAAAGCIHAVAAKRMDPKAKLTLLQSLQIRKVFGLVAEDNDSELVSS
VSSLLTGYSTEVLECSKRLNSEDGKAVSTELLNEVLPSVFYVMQNCEIDETFSIVQFLSG
YVGTLKSLAPLTETQSLHVGQILDVIRSQIRFDPAYRNNLDMLDKTGKEEEDRMAEFRKD
LFVLLRSVGRVAPDATQLFIRNSLASAVASNGDVNVEEIEAALSLLYAFGESLSDETMKT
GNGLLGELIPMLLSTKFPCHNNRLVALIYLETVTRYMKFFQENTQYIPLVLSAFLDERGI
HHPNRNVSRRASYLFMRIVKLLKAKLVPYIETILQSLQDTVAQFTTIYAVSKELSGCEDG
SHIFEAIGLLIGMEDVPLEKQSEYLTALLTPLCQQVEALLLNAKAQNPEESPAKITNIQQ
IIMAINALSKGFSERLVTASRPAIGLMFKQTLDVLLRILIIYPKIEPLRCKVTSFIHRMV
DILGSSVFPYLPKALEQLLAESEPKELAGFLLLLNQLICKFNTGVQDILEEVYPAIASRV
FNILPRDAFPTGPGSNTEEIRELQELQRTFYTFLHVIATHDLSSVFLSSKSRAYLDPMMQ
LIVHASCNHKDILVRKACVQIFIRLIKDWCVSPYGEEKVPGFRSFVMEAFATNCCLYSVL
DKSFEFRDANTLVLFGEIVLVQKVMFEKFGNDFLVHFVSKSLQSAHCPQDLAEQYCQKLQ
GSDIKALKSFYQSLIENLRRQQNGSLVFR*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400058890
Transcript Infomation

pacid=37463428 locus=PGSC0003DMG400022883 ID=PGSC0003DMT400058890.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGATGATCTTGAAAAGGCAATACTTATAAGTTTTGATGAATCTGGGGCAGTTGATTCT
GCTCTTAAAGCACAAGCAGTTGGCTATTGCCAACAAATTAAAGAAACCCCATCAATTTGT
AGTATATGTATTGAGCGTTTATGTTTCTCTAAACTGGTTCAAGTTCAGTTCTGGTGCTTA
CAATGTCTGCACGAGGTTCTTCGGGTTCGGTATTCATCAATGGGTCCAGAGGAGAAATCC
TTTATCCGGAAATCTGTGTTTTCATTGGCTTGTTATGAGAGCATTGATGATAAGAATTTG
GTAAGAGTTTTGGATGGTCCAGCTTTCATAAAGAATAAGCTTGCTCAGGTTATGGTTACT
TTAATTTGTTTCGAGTATCCCATGATATGGCCTTCCGTATTTGTTGATTTTTTATCAAAT
CTTAGTAAAGGTGTAGTGGTTATTGATATGTTTTGTCGGGTTCTCAATGCATTGGATGAA
GAAGTTATTAGCTTGGACTATCCGAGAAGCCAAGAGGAGGTGGCTATCGCTGGGCAAATT
AAGGATGCAATGAGGCAGCAGTGTATTTCTCAGGTTGTTAGGGCTTGGTATGATATCCTT
TTAATGTACAGGAATTCGGATCCGGATTTATGTTGCAGTGTGTTAGATTCTATGAGGAGG
TATGTTTCGTGGATCGACATAGGTTTGATAGCAAATGATGCGTTTGTCGGGTTGTTATTT
GAGTTGATGTTGGTGAGTGGTTTTCCCGATCAACTCAGAGGTGCTGCTGCTGGTTGCATC
CACGCTGTTGCTGCTAAGCGCATGGATCCAAAAGCAAAACTCACTCTTTTGCAGAGCCTT
CAAATTAGAAAGGTTTTTGGTTTGGTAGCAGAGGATAATGACTCCGAGTTGGTATCAAGT
GTTTCCTCTTTGCTTACTGGATATTCAACTGAGGTTTTGGAGTGTTCAAAGCGTTTGAAC
TCTGAGGATGGGAAAGCTGTCTCAACTGAACTATTGAATGAGGTTTTGCCCTCTGTTTTC
TATGTAATGCAAAATTGTGAAATTGATGAAACCTTCAGTATTGTGCAGTTCCTCTCTGGG
TATGTTGGCACATTGAAGAGTCTGGCTCCATTGACCGAGACACAATCACTTCATGTAGGT
CAGATACTGGATGTTATTCGGTCCCAGATCCGATTTGACCCAGCATATCGCAATAACCTC
GATATGTTGGACAAAACAGGAAAGGAAGAGGAAGATCGGATGGCTGAGTTTAGGAAGGAT
TTGTTTGTTCTACTTCGGAGTGTGGGACGTGTAGCACCTGATGCAACTCAGCTTTTCATC
AGGAACTCCTTAGCTAGTGCTGTTGCATCTAATGGGGATGTGAATGTTGAGGAGATAGAA
GCTGCACTCTCTCTCCTATATGCCTTTGGGGAATCACTTAGTGATGAAACCATGAAAACA
GGAAATGGTCTCTTGGGAGAACTAATACCAATGCTTTTGTCGACAAAGTTTCCTTGCCAC
AACAACAGGCTTGTTGCACTTATCTACTTGGAAACAGTAACGAGGTATATGAAGTTTTTT
CAGGAGAATACACAATACATACCTTTGGTTTTGAGTGCCTTTCTCGATGAAAGAGGCATA
CATCATCCAAATAGGAATGTGAGTCGAAGGGCAAGTTATCTTTTCATGAGGATTGTGAAG
CTGCTCAAAGCAAAACTTGTACCCTACATAGAGACTATTCTGCAGAGTTTGCAAGATACA
GTTGCTCAATTCACAACAATTTATGCTGTCTCCAAGGAGCTCTCAGGTTGTGAAGATGGT
AGTCACATTTTTGAGGCGATTGGCTTATTAATTGGAATGGAAGATGTACCCCTTGAAAAG
CAATCAGAGTACCTGACCGCCTTGCTTACTCCTCTTTGTCAGCAGGTTGAGGCTTTGCTC
TTAAATGCCAAAGCCCAGAATCCTGAAGAGTCTCCAGCAAAGATCACAAATATCCAGCAG
ATAATTATGGCCATTAATGCTCTGAGCAAGGGTTTTAGCGAGCGTCTTGTAACTGCCAGT
CGTCCTGCAATTGGTCTCATGTTCAAACAGACATTGGATGTCCTTCTACGTATTCTTATC
ATATATCCAAAGATAGAACCCCTGCGGTGCAAGGTCACATCATTCATTCACCGCATGGTG
GACATACTAGGATCATCTGTATTTCCATATCTACCAAAGGCACTGGAGCAATTGCTAGCC
GAAAGTGAGCCGAAAGAACTAGCAGGCTTTTTGCTATTGCTTAATCAGCTTATCTGCAAA
TTCAACACTGGAGTTCAAGACATTCTGGAGGAAGTTTACCCTGCTATTGCTAGCCGAGTA
TTTAATATCCTGCCGAGAGATGCTTTCCCTACAGGTCCTGGAAGCAATACAGAGGAAATC
CGTGAGCTACAGGAACTTCAGAGGACGTTTTACACTTTCCTTCACGTGATTGCTACGCAT
GATCTATCATCAGTTTTTCTTTCCTCCAAAAGTAGGGCTTACTTGGATCCGATGATGCAG
CTGATCGTACATGCATCCTGTAATCACAAGGATATCCTTGTTCGTAAGGCATGTGTACAG
ATATTTATAAGACTAATCAAAGACTGGTGTGTGAGTCCTTATGGTGAAGAAAAGGTGCCT
GGTTTCCGAAGTTTTGTGATGGAGGCCTTTGCAACAAACTGTTGTCTGTACAGTGTCCTT
GACAAATCCTTTGAGTTCCGTGATGCAAATACGCTTGTTCTTTTCGGCGAGATTGTATTG
GTTCAGAAGGTCATGTTTGAGAAATTTGGGAATGATTTTCTTGTTCATTTTGTATCAAAA
AGCTTGCAAAGTGCTCATTGCCCTCAAGATTTGGCTGAGCAGTATTGTCAGAAATTGCAG
GGTAGTGATATTAAAGCGCTGAAATCATTTTACCAGTCACTTATTGAAAATTTGAGACGT
CAACAGAATGGAAGCTTGGTGTTTAGATAG