Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400058812
CDS Infomation

pacid=37435939 polypeptide=PGSC0003DMP400039617 locus=PGSC0003DMG400022852 ID=PGSC0003DMT400058812.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTTAGATCGATTTCTGAGTGCTCGTAGAGCATGGCAAGTCAGGAGAATTATGAGAAAT
GGGAAGCTTACATTCTTGTGTTTGTTCCTTACCGTTATTGTCCTTAGAGGAAATTTGGGT
GCTGGAAGATTTGGTACTCCTGGCCAAGATTTGAAGGAAATTCGTGAAACATTTAGCTAT
TACAGGAAGCGCGTGGAGCCCAGACGCGTTCTTGAAGAAGCACAACAGGTATCTTCTACA
AGCACTGTAAGTGATGGTGGTGATTCATCATCAGATAGTAATAATTATGCTACTTTTGAT
TTAAAGAAGATTTTAGTTGATGAGGATGATGGTGAGCCTGAGTTTAAGAGAGATCCAAAT
CAACCTTATGCTCTTGGTCCAAAGATAACAGATTGGGATGAGCAAAGAGGGGAGTGGTTG
AAAAAAAATCCTAATTTTCCTAATTTTGTAGGAACAAATAAGCCAAGGGTGTTGTTGGTT
ACTGGTTCATCTCCTAAGCCATGTGAGAATCCAGTTGGTGATCATTACTTGTTGAAGTCA
ATAAAGAATAAGATTGATTACTGTAGGCTTCATGGGATGGAGATTTTTTATAATATGGCT
TTGCTTGATGCTGAAATGGCTGGTTTTTGGGCTAAATTGCCTTTGCTTAGGAAGCTTTTG
CTTTCACATCCTGAGGTTGAGTTTTTGTGGTGGATGGATAGTGATGCTATGTTTACTGAT
ATGGCTTTTGAGCTTCCATGGGAGAGGTATAAAGATGCTAATCTTGTGATGCATGGATGG
AATGAGATGGTTTATGATCAGAAGAATTGGATTGGTTTGAATACTGGTAGCTTCTTATTG
AGGAATACTCAATGGGCTTTGGATTTACTTGATGTGTTGGCTCCTATGGGGCCAAAGGGA
AAGGTAAGGGAGGAAGCCGGGGCGCTTCTTACTCGGGAGCTTAAAGATAGACCAGTTTTT
GAAGCTGATGATCAGTCTGCAATGGTATATATATTGGCAACACAGAAGGAGATATGGGGT
GATAAGGTTTATCTTGAGAATGCTTATTACTTGCACGGTTACTGGGGAATTCTGGTAGAT
AAATATGAAGAGATGATTGAGAATTACCACCCTGGTCTTGGTGACCATAGGTGGCCACTT
GTTACTCACTTTGTGGGTTGCAAGCCTTGTGCAAAGTTTGGAGATTATTCAGTAGAGAGG
TGCTTGAAGCAAATGGATCGTGCATTCAACTTTGGTGACAACCAGATCCTGCAGATGTAT
GGATTCACTCATAAATCACTTGGTAGTAGGAGAGTGAAGAGAACGCGAAACGAAACAAGC
AATCCACTTGAAGTGAATGATGAGCTTGGATTACTTCACCCTCCATTTAAAGCTGTCAAG
GTACCATCTTCTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400039617
PEP Infomation

pacid=37435939 transcript=PGSC0003DMT400058812 locus=PGSC0003DMG400022852 ID=PGSC0003DMT400058812.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MLDRFLSARRAWQVRRIMRNGKLTFLCLFLTVIVLRGNLGAGRFGTPGQDLKEIRETFSY
YRKRVEPRRVLEEAQQVSSTSTVSDGGDSSSDSNNYATFDLKKILVDEDDGEPEFKRDPN
QPYALGPKITDWDEQRGEWLKKNPNFPNFVGTNKPRVLLVTGSSPKPCENPVGDHYLLKS
IKNKIDYCRLHGMEIFYNMALLDAEMAGFWAKLPLLRKLLLSHPEVEFLWWMDSDAMFTD
MAFELPWERYKDANLVMHGWNEMVYDQKNWIGLNTGSFLLRNTQWALDLLDVLAPMGPKG
KVREEAGALLTRELKDRPVFEADDQSAMVYILATQKEIWGDKVYLENAYYLHGYWGILVD
KYEEMIENYHPGLGDHRWPLVTHFVGCKPCAKFGDYSVERCLKQMDRAFNFGDNQILQMY
GFTHKSLGSRRVKRTRNETSNPLEVNDELGLLHPPFKAVKVPSS*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400058812
Transcript Infomation

pacid=37435939 locus=PGSC0003DMG400022852 ID=PGSC0003DMT400058812.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTTAGATCGATTTCTGAGTGCTCGTAGAGCATGGCAAGTCAGGAGAATTATGAGAAAT
GGGAAGCTTACATTCTTGTGTTTGTTCCTTACCGTTATTGTCCTTAGAGGAAATTTGGGT
GCTGGAAGATTTGGTACTCCTGGCCAAGATTTGAAGGAAATTCGTGAAACATTTAGCTAT
TACAGGAAGCGCGTGGAGCCCAGACGCGTTCTTGAAGAAGCACAACAGGTATCTTCTACA
AGCACTGTAAGTGATGGTGGTGATTCATCATCAGATAGTAATAATTATGCTACTTTTGAT
TTAAAGAAGATTTTAGTTGATGAGGATGATGGTGAGCCTGAGTTTAAGAGAGATCCAAAT
CAACCTTATGCTCTTGGTCCAAAGATAACAGATTGGGATGAGCAAAGAGGGGAGTGGTTG
AAAAAAAATCCTAATTTTCCTAATTTTGTAGGAACAAATAAGCCAAGGGTGTTGTTGGTT
ACTGGTTCATCTCCTAAGCCATGTGAGAATCCAGTTGGTGATCATTACTTGTTGAAGTCA
ATAAAGAATAAGATTGATTACTGTAGGCTTCATGGGATGGAGATTTTTTATAATATGGCT
TTGCTTGATGCTGAAATGGCTGGTTTTTGGGCTAAATTGCCTTTGCTTAGGAAGCTTTTG
CTTTCACATCCTGAGGTTGAGTTTTTGTGGTGGATGGATAGTGATGCTATGTTTACTGAT
ATGGCTTTTGAGCTTCCATGGGAGAGGTATAAAGATGCTAATCTTGTGATGCATGGATGG
AATGAGATGGTTTATGATCAGAAGAATTGGATTGGTTTGAATACTGGTAGCTTCTTATTG
AGGAATACTCAATGGGCTTTGGATTTACTTGATGTGTTGGCTCCTATGGGGCCAAAGGGA
AAGGTAAGGGAGGAAGCCGGGGCGCTTCTTACTCGGGAGCTTAAAGATAGACCAGTTTTT
GAAGCTGATGATCAGTCTGCAATGGTATATATATTGGCAACACAGAAGGAGATATGGGGT
GATAAGGTTTATCTTGAGAATGCTTATTACTTGCACGGTTACTGGGGAATTCTGGTAGAT
AAATATGAAGAGATGATTGAGAATTACCACCCTGGTCTTGGTGACCATAGGTGGCCACTT
GTTACTCACTTTGTGGGTTGCAAGCCTTGTGCAAAGTTTGGAGATTATTCAGTAGAGAGG
TGCTTGAAGCAAATGGATCGTGCATTCAACTTTGGTGACAACCAGATCCTGCAGATGTAT
GGATTCACTCATAAATCACTTGGTAGTAGGAGAGTGAAGAGAACGCGAAACGAAACAAGC
AATCCACTTGAAGTGAATGATGAGCTTGGATTACTTCACCCTCCATTTAAAGCTGTCAAG
GTACCATCTTCTTGA