Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400058744
CDS Infomation	pacid=37479489 polypeptide=PGSC0003DMP400039571 locus=PGSC0003DMG400022820 ID=PGSC0003DMT400058744.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGATTTTTCCTTGTAAGTTTATTCTCTTTTTGCCCATTCTTCTCATTATTATTTTCCAA AATAAAATTCAAGGTCGAACATTATTATTAAACAATAATAATAATACAGTTTCGGCTGTT TTTGTGTTCGGAGATTCCACGGTTGATTCCGGCAACAACAACTACATAAACACCATCGCA AAGTGCGATTTTCCACCGTACGGTCGCGATTTCGCAAACCACGTTCCCACCGGAAGGTTC ACTAATGGCCGTCTCGTCACAGATTACTTAGCTTCGTATGTGGGAATCAAAGATTTCGTG CCACCCTATTTGGACCCAAGTCTTAGCTTGGACGAACTCATGACCGGAGTTAGTTTTGCC TCTGGTAGCTCTGGCTTTGACCCTCTTACTGCTCAATTAGTTGATGTAATTACAATGGAA AAACAGCTGGAATATTTTAAAGAATACAAAAGAAAACTTGAAAATTCAATTGGAAAAGAA AAGACAAAATTATTAATAAGCAAAGCAGCATTTATAATAAGTGCAGGGACAAATGACTTT GTTGTAAATTATTATAACACCCCATTTAGAAGACAAAAATATTATAATGTCTCTCAATAT CAACAATTCTTGATGCAAATGGTCCAACAATTTATCCAAGGTTTGATGAACGAAGGAGCT AGAGTGATCGGCGTCGCCGGAGTTCCACCTTTCGGGTGCTTACCGATAGTCATCACGATA GATTCCGGTGACGCACTTCAACCCCGTCGATGTATCGAATCGTACTCCGCCGTTGCAAGA GAGTACAACTCGCTTCTTCAACGTTTATTAAAGACTATGGAAATTCATGGCACAAAATTA TTCTACGTCGATATCTACGATCCAATAAATGACATGATACAAAATCCAATTAACTATGGA TTTAGTGAAGTTACCATGGGATGTTGTGGAAGTGGACTTATTGAAGCATCAATTCTTTGC AATCCAAAATCAATTGTATGCAATAATCCTTCAAATCATATGTTTTGGGATGCAGTCCAC CCAAGTCAAGCTACTTATTACACTGTTTTCCAAGCAATACGTCCTTCTATTGATTTTGCT ATCAACCAATTATAA

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400039571
PEP Infomation	pacid=37479489 transcript=PGSC0003DMT400058744 locus=PGSC0003DMG400022820 ID=PGSC0003DMT400058744.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	MIFPCKFILFLPILLIIIFQNKIQGRTLLLNNNNNTVSAVFVFGDSTVDSGNNNYINTIA KCDFPPYGRDFANHVPTGRFTNGRLVTDYLASYVGIKDFVPPYLDPSLSLDELMTGVSFA SGSSGFDPLTAQLVDVITMEKQLEYFKEYKRKLENSIGKEKTKLLISKAAFIISAGTNDF VVNYYNTPFRRQKYYNVSQYQQFLMQMVQQFIQGLMNEGARVIGVAGVPPFGCLPIVITI DSGDALQPRRCIESYSAVAREYNSLLQRLLKTMEIHGTKLFYVDIYDPINDMIQNPINYG FSEVTMGCCGSGLIEASILCNPKSIVCNNPSNHMFWDAVHPSQATYYTVFQAIRPSIDFA INQL*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400058744
Transcript Infomation	pacid=37479489 locus=PGSC0003DMG400022820 ID=PGSC0003DMT400058744.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGATTTTTCCTTGTAAGTTTATTCTCTTTTTGCCCATTCTTCTCATTATTATTTTCCAA AATAAAATTCAAGGTCGAACATTATTATTAAACAATAATAATAATACAGTTTCGGCTGTT TTTGTGTTCGGAGATTCCACGGTTGATTCCGGCAACAACAACTACATAAACACCATCGCA AAGTGCGATTTTCCACCGTACGGTCGCGATTTCGCAAACCACGTTCCCACCGGAAGGTTC ACTAATGGCCGTCTCGTCACAGATTACTTAGCTTCGTATGTGGGAATCAAAGATTTCGTG CCACCCTATTTGGACCCAAGTCTTAGCTTGGACGAACTCATGACCGGAGTTAGTTTTGCC TCTGGTAGCTCTGGCTTTGACCCTCTTACTGCTCAATTAGTTGATGTAATTACAATGGAA AAACAGCTGGAATATTTTAAAGAATACAAAAGAAAACTTGAAAATTCAATTGGAAAAGAA AAGACAAAATTATTAATAAGCAAAGCAGCATTTATAATAAGTGCAGGGACAAATGACTTT GTTGTAAATTATTATAACACCCCATTTAGAAGACAAAAATATTATAATGTCTCTCAATAT CAACAATTCTTGATGCAAATGGTCCAACAATTTATCCAAGGTTTGATGAACGAAGGAGCT AGAGTGATCGGCGTCGCCGGAGTTCCACCTTTCGGGTGCTTACCGATAGTCATCACGATA GATTCCGGTGACGCACTTCAACCCCGTCGATGTATCGAATCGTACTCCGCCGTTGCAAGA GAGTACAACTCGCTTCTTCAACGTTTATTAAAGACTATGGAAATTCATGGCACAAAATTA TTCTACGTCGATATCTACGATCCAATAAATGACATGATACAAAATCCAATTAACTATGGA TTTAGTGAAGTTACCATGGGATGTTGTGGAAGTGGACTTATTGAAGCATCAATTCTTTGC AATCCAAAATCAATTGTATGCAATAATCCTTCAAATCATATGTTTTGGGATGCAGTCCAC CCAAGTCAAGCTACTTATTACACTGTTTTCCAAGCAATACGTCCTTCTATTGATTTTGCT ATCAACCAATTATAA