Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400058564
CDS Infomation

pacid=37471235 polypeptide=PGSC0003DMP400039440 locus=PGSC0003DMG400022750 ID=PGSC0003DMT400058564.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTTCTCAACCGAAGAATGTTGGAATTCTCGCCATGGAGATTTACTTTCCTCCTACT
TGTCTTCAGCAGGAAGTATTGGAGGCTCATGATGGAGCAAGCAAAGGCAAGTATACAATT
GGTCTTGGACAAGATTGCATGGGCTTTTGCACTGAGGTTGAAGATGTCATATCAATGAGT
TTGACAGCTGTTAATTCCCTACTGGAGAAGTATTCTGTTGATCCGAAGCAAATTGGTCGG
CTAGAGGTTGGAAGTGAAACTGTTATTGATAAGAGCAAATCCATCAAGACATTCTTAATG
CAAATATTTGAGAAACATGGAAATACTGACATTGAAGGAGTTGACTCAACTAATGCCTGC
TATGGGGGAACTGCTGCGTTGTTCAACTGTGTAAATTGGGTGGAGAGTGCTTCATGGGAT
GGACGCTATGGTCTTGTAGTATGCACGGATAGCGCGGTCTATGCAGAGGGGCCTGCTCGG
CCTACTGGAGGAGCTGCAGCTGTTGCTATGCTTGTTGGGCCTGATGCTCCTATAGTATTT
GAAAGCAAGATCAGGGCTAGCCATATGTCCCATGTCTATGATTTTTACAAGCCCATCCTT
GACAGTGAATATCCAGTGGTTGATGGTAAGCTTTCACAAACTTGTTATCTCATGGCACTT
GATGCTTGCTACAAGAGTTTATGCAACAAATATGAGAAATTGGAAGGCAAGCAATTTTCA
ATGACGGATGCAGCCTACTTTGTGTTCCATTCACCATACAACAAGCTCGTGCAGAAGAGT
TTTAGTCGATTGCTGTTCAATGATTTTCTAAGGAATGCTAGCTCTATTGATGAGTCTGCC
AAAAAAATCCTGGCCCCCTTTGAATCCTTAACCGGTGATGAAAGCTACCAGAGCCGTGAT
CTTGAGAAGACATCCCAACAACTTGCTAAACCGCTTTATGATGAGAAGGTGCAGCCTACC
ACATTGATACCAAAACAAGTTGGCAACATGTATACCGCATCTCTTTATGCTGCTTTTGCA
TCCCTCCTTCACAATAAGCACAATACATTGGCTGGTCAGCGGGTAATCATGTTTTCCTAT
GGGAGTGGATTGACTGCGACTATGTTTTCGCTAAAGTTTAACGAAGGTCAACATCCTTTT
AGTTTGTCAAACATTGCAAGCGTGATGAATGTCGCAGAGAAGTTGGAATCGAGACATGAG
TTCACTCCTGAAAAATTCATCGAAATATTGAAACTAATGGAGCACAGATATGGTGCCAAG
GACTTTGTGACCAGCAAGGATTGCAGCCTTCTCGCACCAGGAACCTACTACCTAACAGAG
GTTGATTCCAAGTACAGAAGATTTTATGCAAAGAAGGCTCACGAGAATGGGCAGGTCAAC
GGACACTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400039440
PEP Infomation

pacid=37471235 transcript=PGSC0003DMT400058564 locus=PGSC0003DMG400022750 ID=PGSC0003DMT400058564.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MASQPKNVGILAMEIYFPPTCLQQEVLEAHDGASKGKYTIGLGQDCMGFCTEVEDVISMS
LTAVNSLLEKYSVDPKQIGRLEVGSETVIDKSKSIKTFLMQIFEKHGNTDIEGVDSTNAC
YGGTAALFNCVNWVESASWDGRYGLVVCTDSAVYAEGPARPTGGAAAVAMLVGPDAPIVF
ESKIRASHMSHVYDFYKPILDSEYPVVDGKLSQTCYLMALDACYKSLCNKYEKLEGKQFS
MTDAAYFVFHSPYNKLVQKSFSRLLFNDFLRNASSIDESAKKILAPFESLTGDESYQSRD
LEKTSQQLAKPLYDEKVQPTTLIPKQVGNMYTASLYAAFASLLHNKHNTLAGQRVIMFSY
GSGLTATMFSLKFNEGQHPFSLSNIASVMNVAEKLESRHEFTPEKFIEILKLMEHRYGAK
DFVTSKDCSLLAPGTYYLTEVDSKYRRFYAKKAHENGQVNGH*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400058564
Transcript Infomation

pacid=37471235 locus=PGSC0003DMG400022750 ID=PGSC0003DMT400058564.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTTCTCAACCGAAGAATGTTGGAATTCTCGCCATGGAGATTTACTTTCCTCCTACT
TGTCTTCAGCAGGAAGTATTGGAGGCTCATGATGGAGCAAGCAAAGGCAAGTATACAATT
GGTCTTGGACAAGATTGCATGGGCTTTTGCACTGAGGTTGAAGATGTCATATCAATGAGT
TTGACAGCTGTTAATTCCCTACTGGAGAAGTATTCTGTTGATCCGAAGCAAATTGGTCGG
CTAGAGGTTGGAAGTGAAACTGTTATTGATAAGAGCAAATCCATCAAGACATTCTTAATG
CAAATATTTGAGAAACATGGAAATACTGACATTGAAGGAGTTGACTCAACTAATGCCTGC
TATGGGGGAACTGCTGCGTTGTTCAACTGTGTAAATTGGGTGGAGAGTGCTTCATGGGAT
GGACGCTATGGTCTTGTAGTATGCACGGATAGCGCGGTCTATGCAGAGGGGCCTGCTCGG
CCTACTGGAGGAGCTGCAGCTGTTGCTATGCTTGTTGGGCCTGATGCTCCTATAGTATTT
GAAAGCAAGATCAGGGCTAGCCATATGTCCCATGTCTATGATTTTTACAAGCCCATCCTT
GACAGTGAATATCCAGTGGTTGATGGTAAGCTTTCACAAACTTGTTATCTCATGGCACTT
GATGCTTGCTACAAGAGTTTATGCAACAAATATGAGAAATTGGAAGGCAAGCAATTTTCA
ATGACGGATGCAGCCTACTTTGTGTTCCATTCACCATACAACAAGCTCGTGCAGAAGAGT
TTTAGTCGATTGCTGTTCAATGATTTTCTAAGGAATGCTAGCTCTATTGATGAGTCTGCC
AAAAAAATCCTGGCCCCCTTTGAATCCTTAACCGGTGATGAAAGCTACCAGAGCCGTGAT
CTTGAGAAGACATCCCAACAACTTGCTAAACCGCTTTATGATGAGAAGGTGCAGCCTACC
ACATTGATACCAAAACAAGTTGGCAACATGTATACCGCATCTCTTTATGCTGCTTTTGCA
TCCCTCCTTCACAATAAGCACAATACATTGGCTGGTCAGCGGGTAATCATGTTTTCCTAT
GGGAGTGGATTGACTGCGACTATGTTTTCGCTAAAGTTTAACGAAGGTCAACATCCTTTT
AGTTTGTCAAACATTGCAAGCGTGATGAATGTCGCAGAGAAGTTGGAATCGAGACATGAG
TTCACTCCTGAAAAATTCATCGAAATATTGAAACTAATGGAGCACAGATATGGTGCCAAG
GACTTTGTGACCAGCAAGGATTGCAGCCTTCTCGCACCAGGAACCTACTACCTAACAGAG
GTTGATTCCAAGTACAGAAGATTTTATGCAAAGAAGGCTCACGAGAATGGGCAGGTCAAC
GGACACTAA