Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400058229
CDS Infomation

pacid=37443989 polypeptide=PGSC0003DMP400039184 locus=PGSC0003DMG400022610 ID=PGSC0003DMT400058229.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCAGTTTGGTGGAGGAATATAATCAGCTTAAGGAGGCAGCTAAGCTATCTGTATAGC
AGAGACATTGCATCATATATAATTGTTCAACAATCAGTTCAAAAAATACGTTATCATTCA
ACATTGAGGCGCAAGATTTCTGATGCTGCTCCAGATATACGTAGAGCGAACAAGAACATC
ACAAATTTGATTCGAAATGGTCGATTAGAGGATGCTCGGGAATTATTTGATAAGTTAATA
CATCGAAATACAGTTACTTGGAACTCAATGATTAGTGGGTATGTGCAACAGCGTGAGATT
GTGAAAGCACGGTACCTGTTTGATGAAATGCCACAGAGAGATGTTGTTTCTTGGAATTTG
ATGATTTCTGGTTATTTGTCTTGTAGAGGGAAAGGGTATTTAGAGGAGGGTAGGAATCTG
TTTGATGAAATGCCTGAGAGAGATTATGTTTCTTGGAATACTATGATTAGTGGGTATGCT
AAATGTGGGAGAATGGGTGAAGCATTGGAGGTTTTTGAATGTATGCCAGTGAAGAATGTT
GTGTCTTGGAATGCAGTGATTTCGGGTTTTTTGCGTAATGGGGATGTGAAAACTGCTGTT
GAGTATTTTAAGAGAATGCCAGAGAGGGATTCAGCTTCTTTTAGTGTACTGGTATCGGGG
TTGATACAGAACGAGGAATTGGATGAGGCGGAACATTTTCTCTATGAATTTGGAGAGAGT
AGTGATGGGAAAGAAGATATGGTTCATGCGTATAACACTTTGATTGCTGGATATGGTCAG
AAAGGAAGAGTTGGTGATGCTAGACGCATTTTTGATAAAGTTCCATCTTGTAGTGGTAAG
GGAATTAGCAAAAAGAAGAGATTTGAGAGGAATGTCGTATCGTGGAATTCCATGATCCTG
GCTTATAGCAAAGCAGACGATATGGTTTCTGCTAGGGAACTTTTTGATCAGATGACGGAG
AGGGATATATTTTCATGGAACACAATGGTTTGTGGCTATGTCCATGCCTCAAATATGAGT
GAAGCATCAAATCTGTTTTCTAAAATGCCAAATCCTGATGTACTAACATGGAATTCAATC
ATCTCTGGATATGCACAGGCGGGAAAGTTGGAATTGGCACATGATTATTTTGAAAGGATG
CCCCACAAGAATCGGGTTTCTTGGAATTCAATGATCTCGGGGTGTGAAAGAAATGCAGAC
TATGAAGGAGCAATAAAGTTATTCAGGGCGATGCAACAGGCAGGAGAGAAACCTGATAGA
CACACACTCTCCTCACTTCTAAGTGTTTGTGCTGAAACTGTGGCATTGTTCCTGGGTATG
CAGATTCATCAGTTAGTGACAAAGACTGTTATACCAGATATACCTTTAAACAATTCCCTA
ATAACTATGTATGCAAAATGTGGCAAAATACATGAAGCAAGGGCAATTTTTGAAAAGATG
AAATTTCAAAAGGATGTAATCTCATGGAATGCAATGGTCGGAGGATATGCATCTCATGGT
TTTGCATTTGAAGCGCTAGAGCTTTTTGAATTAATGAAGTGCCTTAAAGTGAGGCCAACT
CACATCACATTCATTTCAGTTCTGAATGCATGTGCTCATGCTGGTTTAGTGGAACAAGGT
CGGTTATATTTTAAATCTATGGAATCTGAATTCGGCATCAAACCTGAGATTGAACATTTT
GGCTCCCTTGTGGATATTGTTGGTCGAGATGGGCAGTTTGAGGAGGCCATGAAAGTGATT
AACACTATGCCAGTGGAGCCAGATAAGGCTGTCTGGGGTGCAGTACTAGGTGCTTGTAGG
GTGCACAACAATGTTGAGTTGGCACGAATAGCAGCTGAAGCACTAATGCGCCTTGAACCA
GAGAGTTCAGGCCCTTATGTTTTGCTTTATAACATGTATGCCGATGCTGGAAGGTGGGAT
GATGCAAATGAAATTAGAATGTTGATGGAAACAAATAAGATAAGGAAGGAGCCCGCTCAT
AGCAGGGTCGGCTCTACTTCCTCATAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400039184
PEP Infomation

pacid=37443989 transcript=PGSC0003DMT400058229 locus=PGSC0003DMG400022610 ID=PGSC0003DMT400058229.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MAVWWRNIISLRRQLSYLYSRDIASYIIVQQSVQKIRYHSTLRRKISDAAPDIRRANKNI
TNLIRNGRLEDARELFDKLIHRNTVTWNSMISGYVQQREIVKARYLFDEMPQRDVVSWNL
MISGYLSCRGKGYLEEGRNLFDEMPERDYVSWNTMISGYAKCGRMGEALEVFECMPVKNV
VSWNAVISGFLRNGDVKTAVEYFKRMPERDSASFSVLVSGLIQNEELDEAEHFLYEFGES
SDGKEDMVHAYNTLIAGYGQKGRVGDARRIFDKVPSCSGKGISKKKRFERNVVSWNSMIL
AYSKADDMVSARELFDQMTERDIFSWNTMVCGYVHASNMSEASNLFSKMPNPDVLTWNSI
ISGYAQAGKLELAHDYFERMPHKNRVSWNSMISGCERNADYEGAIKLFRAMQQAGEKPDR
HTLSSLLSVCAETVALFLGMQIHQLVTKTVIPDIPLNNSLITMYAKCGKIHEARAIFEKM
KFQKDVISWNAMVGGYASHGFAFEALELFELMKCLKVRPTHITFISVLNACAHAGLVEQG
RLYFKSMESEFGIKPEIEHFGSLVDIVGRDGQFEEAMKVINTMPVEPDKAVWGAVLGACR
VHNNVELARIAAEALMRLEPESSGPYVLLYNMYADAGRWDDANEIRMLMETNKIRKEPAH
SRVGSTSS*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400058229
Transcript Infomation

pacid=37443989 locus=PGSC0003DMG400022610 ID=PGSC0003DMT400058229.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCAGTTTGGTGGAGGAATATAATCAGCTTAAGGAGGCAGCTAAGCTATCTGTATAGC
AGAGACATTGCATCATATATAATTGTTCAACAATCAGTTCAAAAAATACGTTATCATTCA
ACATTGAGGCGCAAGATTTCTGATGCTGCTCCAGATATACGTAGAGCGAACAAGAACATC
ACAAATTTGATTCGAAATGGTCGATTAGAGGATGCTCGGGAATTATTTGATAAGTTAATA
CATCGAAATACAGTTACTTGGAACTCAATGATTAGTGGGTATGTGCAACAGCGTGAGATT
GTGAAAGCACGGTACCTGTTTGATGAAATGCCACAGAGAGATGTTGTTTCTTGGAATTTG
ATGATTTCTGGTTATTTGTCTTGTAGAGGGAAAGGGTATTTAGAGGAGGGTAGGAATCTG
TTTGATGAAATGCCTGAGAGAGATTATGTTTCTTGGAATACTATGATTAGTGGGTATGCT
AAATGTGGGAGAATGGGTGAAGCATTGGAGGTTTTTGAATGTATGCCAGTGAAGAATGTT
GTGTCTTGGAATGCAGTGATTTCGGGTTTTTTGCGTAATGGGGATGTGAAAACTGCTGTT
GAGTATTTTAAGAGAATGCCAGAGAGGGATTCAGCTTCTTTTAGTGTACTGGTATCGGGG
TTGATACAGAACGAGGAATTGGATGAGGCGGAACATTTTCTCTATGAATTTGGAGAGAGT
AGTGATGGGAAAGAAGATATGGTTCATGCGTATAACACTTTGATTGCTGGATATGGTCAG
AAAGGAAGAGTTGGTGATGCTAGACGCATTTTTGATAAAGTTCCATCTTGTAGTGGTAAG
GGAATTAGCAAAAAGAAGAGATTTGAGAGGAATGTCGTATCGTGGAATTCCATGATCCTG
GCTTATAGCAAAGCAGACGATATGGTTTCTGCTAGGGAACTTTTTGATCAGATGACGGAG
AGGGATATATTTTCATGGAACACAATGGTTTGTGGCTATGTCCATGCCTCAAATATGAGT
GAAGCATCAAATCTGTTTTCTAAAATGCCAAATCCTGATGTACTAACATGGAATTCAATC
ATCTCTGGATATGCACAGGCGGGAAAGTTGGAATTGGCACATGATTATTTTGAAAGGATG
CCCCACAAGAATCGGGTTTCTTGGAATTCAATGATCTCGGGGTGTGAAAGAAATGCAGAC
TATGAAGGAGCAATAAAGTTATTCAGGGCGATGCAACAGGCAGGAGAGAAACCTGATAGA
CACACACTCTCCTCACTTCTAAGTGTTTGTGCTGAAACTGTGGCATTGTTCCTGGGTATG
CAGATTCATCAGTTAGTGACAAAGACTGTTATACCAGATATACCTTTAAACAATTCCCTA
ATAACTATGTATGCAAAATGTGGCAAAATACATGAAGCAAGGGCAATTTTTGAAAAGATG
AAATTTCAAAAGGATGTAATCTCATGGAATGCAATGGTCGGAGGATATGCATCTCATGGT
TTTGCATTTGAAGCGCTAGAGCTTTTTGAATTAATGAAGTGCCTTAAAGTGAGGCCAACT
CACATCACATTCATTTCAGTTCTGAATGCATGTGCTCATGCTGGTTTAGTGGAACAAGGT
CGGTTATATTTTAAATCTATGGAATCTGAATTCGGCATCAAACCTGAGATTGAACATTTT
GGCTCCCTTGTGGATATTGTTGGTCGAGATGGGCAGTTTGAGGAGGCCATGAAAGTGATT
AACACTATGCCAGTGGAGCCAGATAAGGCTGTCTGGGGTGCAGTACTAGGTGCTTGTAGG
GTGCACAACAATGTTGAGTTGGCACGAATAGCAGCTGAAGCACTAATGCGCCTTGAACCA
GAGAGTTCAGGCCCTTATGTTTTGCTTTATAACATGTATGCCGATGCTGGAAGGTGGGAT
GATGCAAATGAAATTAGAATGTTGATGGAAACAAATAAGATAAGGAAGGAGCCCGCTCAT
AGCAGGGTCGGCTCTACTTCCTCATAG