Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400057784
CDS Infomation

pacid=37424547 polypeptide=PGSC0003DMP400038898 locus=PGSC0003DMG400022433 ID=PGSC0003DMT400057784.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGATGGTGTCATTAAGAGGAGGTCTTTATGTGCAATTGTTTCTTGTTTTCTGCTTTTT
CTCTTAGCTTACAACAGTTCCACTGTGTTCTATGTTCAAGTCCCGGTTCCGGGAAACTCT
TCGCCGGAGATTTCAAGTTTTTTAACTGAAAATGTCGCCAGAAAATCAAGAAAGTTGGTT
TCTTTATCTACTTCAGCTAAACTTTCATCCTCTGTGATATATGCAGTAAAAGAAGAAACC
CCACTTGTAAAACCAAACACCCAGTTGATAATTTCCCGGAAAAATCCAAACTTGGTGGGT
TTTACATATGATTCAGTGGCTTATCAACCTAGAAGAAGGAGAAAGAAGAAGCCTTTGGTG
AAGGTTCTTCCTTCAGGGGACAGAATCAATGTGTTTTCAATGAGAATGAAGGAGTTTTTT
GGTTCTAAATCATCCAATTCTTCCTGTAAGTTTCGATTTTTCATGACTTGGATTTCTTCC
ATTGAATCTTTTGGTGAAAGGGAACTGTTTGCTGTTGAGAGTCTGTTTAAGGCACACCCA
AATGGCTGTTTGGTCATTATGTCTACTTCAATGGATTCTCCAAGAGGAATGCAAGCTTTA
AACCCTTTCTTGGAGAAAGGATTAAGGGTAACTGCAATTTCACCTGATTTTATGTACTTG
TTTAAAAATACTATTGCTCAAGCCTGGATTGATAACTTAATGAAGGGTAATATTGACCCC
GGGGAAGTTTCTTTAGGTCAGAATCTCTCAAATTTGTTAAGACTTGGTTTACTGTATAAG
TTTGGTGGGATTTATTTAGATACTGATGTTATAGTGTTGAAGAGTTTTGGGAAGCTAAGG
AATGTTATTGGGGCTCAAACTATTGATGTTGAAACAAGAAATTGGAGTAGGTTAAATAAT
GCTGTAATGATTTTTGATAAGAGGCATCCTTTGTTGTACAAGTTTATTGAAGAATTTGCA
CTTACCTTTGATGGGAATAAATGGGGTCATAATGGTCCTTATTTGGTTTCAAGGGTTGTG
TCAAGGGTAAGAGGAAGAGATGGATACAATTTCACTGTTTTGCCCCCAATGGCTTTTTAT
CCAGTTGATTGGAATAGGATTGGTAGTCTCTTTCTTGGGCCGAGGAACGAGACTCAATCG
AAATGGTTGCTCTTGAAACTCCAGCAGATTCAGAGTGGAAGTTTGGCTGTGCATCTTTGG
AACAAGCAAAGTAGAGAGCTTGAGGTTGAAGAAGGAAGCATAATTCAACATATAATGTCA
GATTGTTGTGTTTTCTGCAATTCTTACTCATCAAAGTTGTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400038898
PEP Infomation

pacid=37424547 transcript=PGSC0003DMT400057784 locus=PGSC0003DMG400022433 ID=PGSC0003DMT400057784.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MDGVIKRRSLCAIVSCFLLFLLAYNSSTVFYVQVPVPGNSSPEISSFLTENVARKSRKLV
SLSTSAKLSSSVIYAVKEETPLVKPNTQLIISRKNPNLVGFTYDSVAYQPRRRRKKKPLV
KVLPSGDRINVFSMRMKEFFGSKSSNSSCKFRFFMTWISSIESFGERELFAVESLFKAHP
NGCLVIMSTSMDSPRGMQALNPFLEKGLRVTAISPDFMYLFKNTIAQAWIDNLMKGNIDP
GEVSLGQNLSNLLRLGLLYKFGGIYLDTDVIVLKSFGKLRNVIGAQTIDVETRNWSRLNN
AVMIFDKRHPLLYKFIEEFALTFDGNKWGHNGPYLVSRVVSRVRGRDGYNFTVLPPMAFY
PVDWNRIGSLFLGPRNETQSKWLLLKLQQIQSGSLAVHLWNKQSRELEVEEGSIIQHIMS
DCCVFCNSYSSKL*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400057784
Transcript Infomation

pacid=37424547 locus=PGSC0003DMG400022433 ID=PGSC0003DMT400057784.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGATGGTGTCATTAAGAGGAGGTCTTTATGTGCAATTGTTTCTTGTTTTCTGCTTTTT
CTCTTAGCTTACAACAGTTCCACTGTGTTCTATGTTCAAGTCCCGGTTCCGGGAAACTCT
TCGCCGGAGATTTCAAGTTTTTTAACTGAAAATGTCGCCAGAAAATCAAGAAAGTTGGTT
TCTTTATCTACTTCAGCTAAACTTTCATCCTCTGTGATATATGCAGTAAAAGAAGAAACC
CCACTTGTAAAACCAAACACCCAGTTGATAATTTCCCGGAAAAATCCAAACTTGGTGGGT
TTTACATATGATTCAGTGGCTTATCAACCTAGAAGAAGGAGAAAGAAGAAGCCTTTGGTG
AAGGTTCTTCCTTCAGGGGACAGAATCAATGTGTTTTCAATGAGAATGAAGGAGTTTTTT
GGTTCTAAATCATCCAATTCTTCCTGTAAGTTTCGATTTTTCATGACTTGGATTTCTTCC
ATTGAATCTTTTGGTGAAAGGGAACTGTTTGCTGTTGAGAGTCTGTTTAAGGCACACCCA
AATGGCTGTTTGGTCATTATGTCTACTTCAATGGATTCTCCAAGAGGAATGCAAGCTTTA
AACCCTTTCTTGGAGAAAGGATTAAGGGTAACTGCAATTTCACCTGATTTTATGTACTTG
TTTAAAAATACTATTGCTCAAGCCTGGATTGATAACTTAATGAAGGGTAATATTGACCCC
GGGGAAGTTTCTTTAGGTCAGAATCTCTCAAATTTGTTAAGACTTGGTTTACTGTATAAG
TTTGGTGGGATTTATTTAGATACTGATGTTATAGTGTTGAAGAGTTTTGGGAAGCTAAGG
AATGTTATTGGGGCTCAAACTATTGATGTTGAAACAAGAAATTGGAGTAGGTTAAATAAT
GCTGTAATGATTTTTGATAAGAGGCATCCTTTGTTGTACAAGTTTATTGAAGAATTTGCA
CTTACCTTTGATGGGAATAAATGGGGTCATAATGGTCCTTATTTGGTTTCAAGGGTTGTG
TCAAGGGTAAGAGGAAGAGATGGATACAATTTCACTGTTTTGCCCCCAATGGCTTTTTAT
CCAGTTGATTGGAATAGGATTGGTAGTCTCTTTCTTGGGCCGAGGAACGAGACTCAATCG
AAATGGTTGCTCTTGAAACTCCAGCAGATTCAGAGTGGAAGTTTGGCTGTGCATCTTTGG
AACAAGCAAAGTAGAGAGCTTGAGGTTGAAGAAGGAAGCATAATTCAACATATAATGTCA
GATTGTTGTGTTTTCTGCAATTCTTACTCATCAAAGTTGTAA