Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400057629
CDS Infomation

pacid=37426346 polypeptide=PGSC0003DMP400038783 locus=PGSC0003DMG400022377 ID=PGSC0003DMT400057629.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGTATCCAAGAAAATGGGAATGGGGGTGTTTTGAAGTATAAGAGGATGGATTCTGAT
GGAATGGAAGAGGATGTTGCTGTATTATGTGAAGAGAAAAGAAATGATATGAGCAGCAGA
AAATATGTTTTGGTTTGTGCCATCTTTGCCTCACTTAATTCTGTGCTGCTTGGATATGAT
GTTGGTGTTATGAGTGGAGCTATTATATTCATTCAGCAAGACTTGAATATTAGTGAAGTA
CAAGAAGAAGTTCTTGTTGGAATCTTGAGCATAGTTTCACTTTTGGGGAGTTTAGCAGGA
GGAAGAACTTCAGATGCCATCGGCAGGAAGTGGACCATGGCTTTTGCAGCCATTGTGTTT
CAATCTGGGGCTCTTATAATGTCTCTCGCTCCTGACTTCAAGGTGTTAATGATAGGCAGA
TTTTTGGCTGGAATCGGTATTGGTTTTGGAGTTATGATTGCACCTGTTTATATTGCAGAG
ATATCACCCACGGTTGCTAGAGGGTCTTTCACTTCCTTCCCTGAGATATTCATCAATCTA
GGAATTCTTTTAGGTTATGTTTCAAATTATGCATTTTCTGGTTTATCCCCCCATATAAAC
TGGAGAGTCATGCTTGGTGTGGGGATTCTCCCCTCAGTTTTTATTGGTATCGCGCTATTT
GTCATTCCAGAATCTCCAAGGTGGTTGGTGATGAAAAACCGGATTGATGAAGCAAGGTTA
GTCCTACTTAAAACTAATGAAAATGCTAATGAAGTGGAAGAGAGGCTAGCAGAAATTCAG
CAAGCTGCAGGGCATGTTAATGCTGAGAAGTATGAAGAGAAAGCAGTGTGGCGTGAACTG
CTAAATCCTTCACCTGGAGTTAGAAGAATGCTGATTACAGGTTGTGGTATTCAGTGCTTT
CAACAGGTCACAGGTATCGATGCCACTGTGTATTACAGTCCAACAATTTTTAAGGATGCA
GGAATTAAGGGTAACACTCAGCTCCTAGCTGCAACTGTTGCTGTTGGATTCACAAAAACA
ATATTCATTTTGATAGCCATATTGCTCATTGACAAAGTTGGCAGGAAACCTTTGTTATAT
GTCAGCACAATTGGTATGACTACTTGTCTGTTTGGCCTTGGCCTCACACTTTCTCTACTG
GGTAATGGTTCAGTTGGTATCAAGCTGGCAATCTTATGTGTGTGTGGAAATGTAGCATTC
TTTTCCGTGGGGATTGGACCAATTTGTTGGGTCTTGACATCTGAAATCTTCCCTCTGAGA
CTTCGAGCTCAAGCATCAGCTCTTGGTGCAGTAGGGAGCAGGGTTAGTAGTGGTGTGGTT
GCAATGTCTTTCCTCTCCGTTTCTCGTATGATTACAGTAGGAGGAACATTTTTTGTGTTT
GCTGCTATATCAGCTCTCTCTGTTGCTTTTGTTCATAAATGTGTTCCAGAAACAAAGGGG
AAATCATTGGAAGAAATCGAAATGATGTTCCAGAATGATAGGCCACAACAAGGTGGTGAA
TTGGAGCTTGAAGATGTCAAACATCTAATGCAGACACAATGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400038783
PEP Infomation

pacid=37426346 transcript=PGSC0003DMT400057629 locus=PGSC0003DMG400022377 ID=PGSC0003DMT400057629.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MGIQENGNGGVLKYKRMDSDGMEEDVAVLCEEKRNDMSSRKYVLVCAIFASLNSVLLGYD
VGVMSGAIIFIQQDLNISEVQEEVLVGILSIVSLLGSLAGGRTSDAIGRKWTMAFAAIVF
QSGALIMSLAPDFKVLMIGRFLAGIGIGFGVMIAPVYIAEISPTVARGSFTSFPEIFINL
GILLGYVSNYAFSGLSPHINWRVMLGVGILPSVFIGIALFVIPESPRWLVMKNRIDEARL
VLLKTNENANEVEERLAEIQQAAGHVNAEKYEEKAVWRELLNPSPGVRRMLITGCGIQCF
QQVTGIDATVYYSPTIFKDAGIKGNTQLLAATVAVGFTKTIFILIAILLIDKVGRKPLLY
VSTIGMTTCLFGLGLTLSLLGNGSVGIKLAILCVCGNVAFFSVGIGPICWVLTSEIFPLR
LRAQASALGAVGSRVSSGVVAMSFLSVSRMITVGGTFFVFAAISALSVAFVHKCVPETKG
KSLEEIEMMFQNDRPQQGGELELEDVKHLMQTQ*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400057629
Transcript Infomation

pacid=37426346 locus=PGSC0003DMG400022377 ID=PGSC0003DMT400057629.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGTATCCAAGAAAATGGGAATGGGGGTGTTTTGAAGTATAAGAGGATGGATTCTGAT
GGAATGGAAGAGGATGTTGCTGTATTATGTGAAGAGAAAAGAAATGATATGAGCAGCAGA
AAATATGTTTTGGTTTGTGCCATCTTTGCCTCACTTAATTCTGTGCTGCTTGGATATGAT
GTTGGTGTTATGAGTGGAGCTATTATATTCATTCAGCAAGACTTGAATATTAGTGAAGTA
CAAGAAGAAGTTCTTGTTGGAATCTTGAGCATAGTTTCACTTTTGGGGAGTTTAGCAGGA
GGAAGAACTTCAGATGCCATCGGCAGGAAGTGGACCATGGCTTTTGCAGCCATTGTGTTT
CAATCTGGGGCTCTTATAATGTCTCTCGCTCCTGACTTCAAGGTGTTAATGATAGGCAGA
TTTTTGGCTGGAATCGGTATTGGTTTTGGAGTTATGATTGCACCTGTTTATATTGCAGAG
ATATCACCCACGGTTGCTAGAGGGTCTTTCACTTCCTTCCCTGAGATATTCATCAATCTA
GGAATTCTTTTAGGTTATGTTTCAAATTATGCATTTTCTGGTTTATCCCCCCATATAAAC
TGGAGAGTCATGCTTGGTGTGGGGATTCTCCCCTCAGTTTTTATTGGTATCGCGCTATTT
GTCATTCCAGAATCTCCAAGGTGGTTGGTGATGAAAAACCGGATTGATGAAGCAAGGTTA
GTCCTACTTAAAACTAATGAAAATGCTAATGAAGTGGAAGAGAGGCTAGCAGAAATTCAG
CAAGCTGCAGGGCATGTTAATGCTGAGAAGTATGAAGAGAAAGCAGTGTGGCGTGAACTG
CTAAATCCTTCACCTGGAGTTAGAAGAATGCTGATTACAGGTTGTGGTATTCAGTGCTTT
CAACAGGTCACAGGTATCGATGCCACTGTGTATTACAGTCCAACAATTTTTAAGGATGCA
GGAATTAAGGGTAACACTCAGCTCCTAGCTGCAACTGTTGCTGTTGGATTCACAAAAACA
ATATTCATTTTGATAGCCATATTGCTCATTGACAAAGTTGGCAGGAAACCTTTGTTATAT
GTCAGCACAATTGGTATGACTACTTGTCTGTTTGGCCTTGGCCTCACACTTTCTCTACTG
GGTAATGGTTCAGTTGGTATCAAGCTGGCAATCTTATGTGTGTGTGGAAATGTAGCATTC
TTTTCCGTGGGGATTGGACCAATTTGTTGGGTCTTGACATCTGAAATCTTCCCTCTGAGA
CTTCGAGCTCAAGCATCAGCTCTTGGTGCAGTAGGGAGCAGGGTTAGTAGTGGTGTGGTT
GCAATGTCTTTCCTCTCCGTTTCTCGTATGATTACAGTAGGAGGAACATTTTTTGTGTTT
GCTGCTATATCAGCTCTCTCTGTTGCTTTTGTTCATAAATGTGTTCCAGAAACAAAGGGG
AAATCATTGGAAGAAATCGAAATGATGTTCCAGAATGATAGGCCACAACAAGGTGGTGAA
TTGGAGCTTGAAGATGTCAAACATCTAATGCAGACACAATGA