Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400057541
CDS Infomation

pacid=37424875 polypeptide=PGSC0003DMP400038725 locus=PGSC0003DMG400022349 ID=PGSC0003DMT400057541.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCTAAAAGGCCATACCCATCACTCTAATTTGGATTCTTCTTTGGCTTTTTACTCTCGT
TTGAGATATGATGATGTAACTCCGGTAATATACAATTTTAGCTATTTGTTAAAAGCTTGT
GCAGATAACTCTGATGTTGTGAAGGGTAAACAGGTACATGCGCAGTTGATTCTTCATGGG
TTTTCAGATAGTTTGTTTGCGATGACTAGTGTTGTGAACCTTTATGCTAAATGTGGGATG
GTTGGTGATGCATATAAGATGTTTGATAGAATGCCTGAGAGGGATTTGGTTTGTTGGAAT
ACGGTTATTTCAGGATATGCACAAAATGGGATGTCAAAGAGAGCGTTGGAGTTGGTTCTA
AGGATGCAAGAGGAAGGGTGTAATAGGCCGGATTCGGTTACGATTGTGTCCATTTTGCCT
GCTTGTGGTGCAATTGGGTCCTTTAAAATGGGGAAGTTGATTCATGGATATGTTTTCAGA
AATGGTTTTGAGTCGCTTGTGAATGTCTCGACTGCTTTGGTCGATATGTATGCTAAATGT
GGGTCAGTGGGTACTGCTAGGTTGGTTTTTGATAAGATGGATTCTAAGACGGTTGTATCG
TTGAATGCTATGATAGATGGATATGCACGGAATGGATATTACGATGAAGCTCTTATCATC
TTTCAGAAAATGTTGGATGAAGGATTCAAACCGACGAATGTGACTATTATGAGCACTTTA
CATGCGTGTGCTGAAACAAGGAATATTGAGCTTGGACAATATGTTCACAAACTAGTCAAC
CAACTAGGTCTTGGTTCTAATGTTGCAGTTGTTAACTCGTTGATTTCAATGTATTGCAAG
TGCCAAAGAGTGGATATTGCAGCTGAATTGTTTGAAAACTTGAGAGGAAAAACACTTGTT
TCATGGAATGCTATGATATTGGGCTATGCACAAAATGGATGCGTAATGGATGCATTAACT
CACTTTTGTAAAATGCATCTGATGAACATCAAACCTGATTCATTTACAATGGTAAGTGTT
GTTACTGCTCTTGCTGAGTTATCAGTATTGCGCCAAGCTAAGTGGATACATGGATTTGCT
GTAAGAACTTGTTTGAACAGGAATGTTTTTGTAGCCACTGCACTTGTTGACATGTATGCA
AAATGTGGAGCAGTTCACACAGCAAGAAAGCTATTTGACATGATGGATGATAGGCATGTT
ACAACATGGAATGCCATGATAGATGGATATGGCACACATGGCTTTGGAAAGGAAGCTGTT
GAATTATTTGAGGGAATGCGAAAGGTTCATGTAGAGCCTAACGACATAACATTTCTCTGT
GTCATCTCAGCTTGCAGCCACTCTGGCTTTGTAGAGAAGGGGCACAACTATTTCACGATC
ATGAGGGAAGAATACAACTTGGAGCCTTCAATGGACCATTATGGGGCAATGGTTGACCTA
ATTGGTCGAGCTGGTCGGCTGAGTGAGGCTTGGAACTTCATTGATAATATGCCTATCAGA
CCAGGACTCAATGTCTATGGTGCAATGTTGGGAGCTTGCAAGATTCACAAAAATGTAGAT
TTGGGGGAGAAGGCAGCAGACAAGCTATTTGAGCTAGATCCCGATGATGGTGGATATCAT
GTGCTTCTTGCTAATATGTACGCCACGGCTTCAATATGGCATAAAGTTGCTAACGTCAGA
ACTATGATGGAGAGAAAAGGTATTCAAAAGACACCTGGATGGAGTCTAGTTGATTTAAGA
AACGAGGTCCACACATTCTACTCAGGAAGCACTAGCCATCCTCAGTCAGAGAAGATCTAT
GCTTACCTTGAGAAACTATTTGATAGGATTAAAGCTGCTGGATATATACCTGATACTGAT
TCAATTCACGATGTGGAAGATGTTGTTCAGGAGCAATTGCTAAAGAGCCACAGTGAGAAG
CTTGCTATTGCATTTGGGCTTTTAAATACGAGTGCTGGTACAACTATTCACATCAGGAAA
AATCTCCGGGTTTGTGGTGACTGCCATACTGCAACAAAGTACATCTCGCTTGTCATGAAA
CGAGAAATTATTGTACGTGATATGCACCGTTTCCACCATTTTAAGAATGGAGTCTGTTCA
TGTGGAGATTACTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400038725
PEP Infomation

pacid=37424875 transcript=PGSC0003DMT400057541 locus=PGSC0003DMG400022349 ID=PGSC0003DMT400057541.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MLKGHTHHSNLDSSLAFYSRLRYDDVTPVIYNFSYLLKACADNSDVVKGKQVHAQLILHG
FSDSLFAMTSVVNLYAKCGMVGDAYKMFDRMPERDLVCWNTVISGYAQNGMSKRALELVL
RMQEEGCNRPDSVTIVSILPACGAIGSFKMGKLIHGYVFRNGFESLVNVSTALVDMYAKC
GSVGTARLVFDKMDSKTVVSLNAMIDGYARNGYYDEALIIFQKMLDEGFKPTNVTIMSTL
HACAETRNIELGQYVHKLVNQLGLGSNVAVVNSLISMYCKCQRVDIAAELFENLRGKTLV
SWNAMILGYAQNGCVMDALTHFCKMHLMNIKPDSFTMVSVVTALAELSVLRQAKWIHGFA
VRTCLNRNVFVATALVDMYAKCGAVHTARKLFDMMDDRHVTTWNAMIDGYGTHGFGKEAV
ELFEGMRKVHVEPNDITFLCVISACSHSGFVEKGHNYFTIMREEYNLEPSMDHYGAMVDL
IGRAGRLSEAWNFIDNMPIRPGLNVYGAMLGACKIHKNVDLGEKAADKLFELDPDDGGYH
VLLANMYATASIWHKVANVRTMMERKGIQKTPGWSLVDLRNEVHTFYSGSTSHPQSEKIY
AYLEKLFDRIKAAGYIPDTDSIHDVEDVVQEQLLKSHSEKLAIAFGLLNTSAGTTIHIRK
NLRVCGDCHTATKYISLVMKREIIVRDMHRFHHFKNGVCSCGDYW*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400057541
Transcript Infomation

pacid=37424875 locus=PGSC0003DMG400022349 ID=PGSC0003DMT400057541.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCTAAAAGGCCATACCCATCACTCTAATTTGGATTCTTCTTTGGCTTTTTACTCTCGT
TTGAGATATGATGATGTAACTCCGGTAATATACAATTTTAGCTATTTGTTAAAAGCTTGT
GCAGATAACTCTGATGTTGTGAAGGGTAAACAGGTACATGCGCAGTTGATTCTTCATGGG
TTTTCAGATAGTTTGTTTGCGATGACTAGTGTTGTGAACCTTTATGCTAAATGTGGGATG
GTTGGTGATGCATATAAGATGTTTGATAGAATGCCTGAGAGGGATTTGGTTTGTTGGAAT
ACGGTTATTTCAGGATATGCACAAAATGGGATGTCAAAGAGAGCGTTGGAGTTGGTTCTA
AGGATGCAAGAGGAAGGGTGTAATAGGCCGGATTCGGTTACGATTGTGTCCATTTTGCCT
GCTTGTGGTGCAATTGGGTCCTTTAAAATGGGGAAGTTGATTCATGGATATGTTTTCAGA
AATGGTTTTGAGTCGCTTGTGAATGTCTCGACTGCTTTGGTCGATATGTATGCTAAATGT
GGGTCAGTGGGTACTGCTAGGTTGGTTTTTGATAAGATGGATTCTAAGACGGTTGTATCG
TTGAATGCTATGATAGATGGATATGCACGGAATGGATATTACGATGAAGCTCTTATCATC
TTTCAGAAAATGTTGGATGAAGGATTCAAACCGACGAATGTGACTATTATGAGCACTTTA
CATGCGTGTGCTGAAACAAGGAATATTGAGCTTGGACAATATGTTCACAAACTAGTCAAC
CAACTAGGTCTTGGTTCTAATGTTGCAGTTGTTAACTCGTTGATTTCAATGTATTGCAAG
TGCCAAAGAGTGGATATTGCAGCTGAATTGTTTGAAAACTTGAGAGGAAAAACACTTGTT
TCATGGAATGCTATGATATTGGGCTATGCACAAAATGGATGCGTAATGGATGCATTAACT
CACTTTTGTAAAATGCATCTGATGAACATCAAACCTGATTCATTTACAATGGTAAGTGTT
GTTACTGCTCTTGCTGAGTTATCAGTATTGCGCCAAGCTAAGTGGATACATGGATTTGCT
GTAAGAACTTGTTTGAACAGGAATGTTTTTGTAGCCACTGCACTTGTTGACATGTATGCA
AAATGTGGAGCAGTTCACACAGCAAGAAAGCTATTTGACATGATGGATGATAGGCATGTT
ACAACATGGAATGCCATGATAGATGGATATGGCACACATGGCTTTGGAAAGGAAGCTGTT
GAATTATTTGAGGGAATGCGAAAGGTTCATGTAGAGCCTAACGACATAACATTTCTCTGT
GTCATCTCAGCTTGCAGCCACTCTGGCTTTGTAGAGAAGGGGCACAACTATTTCACGATC
ATGAGGGAAGAATACAACTTGGAGCCTTCAATGGACCATTATGGGGCAATGGTTGACCTA
ATTGGTCGAGCTGGTCGGCTGAGTGAGGCTTGGAACTTCATTGATAATATGCCTATCAGA
CCAGGACTCAATGTCTATGGTGCAATGTTGGGAGCTTGCAAGATTCACAAAAATGTAGAT
TTGGGGGAGAAGGCAGCAGACAAGCTATTTGAGCTAGATCCCGATGATGGTGGATATCAT
GTGCTTCTTGCTAATATGTACGCCACGGCTTCAATATGGCATAAAGTTGCTAACGTCAGA
ACTATGATGGAGAGAAAAGGTATTCAAAAGACACCTGGATGGAGTCTAGTTGATTTAAGA
AACGAGGTCCACACATTCTACTCAGGAAGCACTAGCCATCCTCAGTCAGAGAAGATCTAT
GCTTACCTTGAGAAACTATTTGATAGGATTAAAGCTGCTGGATATATACCTGATACTGAT
TCAATTCACGATGTGGAAGATGTTGTTCAGGAGCAATTGCTAAAGAGCCACAGTGAGAAG
CTTGCTATTGCATTTGGGCTTTTAAATACGAGTGCTGGTACAACTATTCACATCAGGAAA
AATCTCCGGGTTTGTGGTGACTGCCATACTGCAACAAAGTACATCTCGCTTGTCATGAAA
CGAGAAATTATTGTACGTGATATGCACCGTTTCCACCATTTTAAGAATGGAGTCTGTTCA
TGTGGAGATTACTGGTGA