Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400057063
CDS Infomation

pacid=37433070 polypeptide=PGSC0003DMP400038359 locus=PGSC0003DMG400022171 ID=PGSC0003DMT400057063.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAGGATAATGAAGGTGGGGATGGAGTTGGTGGAGAGCCAATCGAGCAGTTTCACAGG
AATGAAGCGATCTCCGCTGTTGCTGATGATGGGTTCATGGTTGAAGAGGATGATGATTAC
GAAGATCTCTACAATGATGTTAATGTTGGTGAGAATTTTCTTCAATCTTTTAGAAAGAAT
GAGGATTTAGTATCTAGGAATGATGAGGTAGAGAGGAAGCCTGAGCAGCCTGCCCTTCCG
GCGCCACCACCGGTAGTGGCAGCACCGCAAGTGGTGGATGAGAGTGGGCGTGGCGATTTT
CAGGGTGTGGGTGGGGAGAGGAATCCTGTAAAAGAGGAGGATGTAGTGTCTGGGATTTCT
GCTAGAGCGTCAGTAGGTGCAGCTGTGTCTGGGCCTTCTGCTGGTGGTGGGTTTAGGGTT
GAGTTAAGTCACCCGTCAAGTAAGATGGGTGATTTAGCAGAGCGGATGGTGAATAGTAAT
GTTCCACATCAGGTGATGGCTCAACAGCCTCATGCTGGTGGTGTTGCAGTAGCTGCTGGA
AATTTGGGTAATGTTGGAAATATGGGGAATGATAATTTGATAAGGCAAGGAGGGGTTAAT
ATGAACGGGGTGGGTAATATTGTTGCTGGAGTTGGGGTCGCTAGTGGTGGAGGAGGAGGT
GGTGGTGGCGGTGGCGCGACAATTCTTTTTGTTGGTGATCTGCATTGGTGGACCACAGAT
GCTGAGCTGGAAACTGAGTTGAGCAAGTATGGACACGTGAAGGAGGTGAAATTTTTTGAA
GAAAAAGCTAGTGGGAAGTCTAAAGGATATTGCCAGGTTGAGTTTCATGATTCCTCAGCT
GCCACAGCTTGCAAAGAAGGTATGAATGGACACATGTTCAATGGGCGGCCATGTGTGGTA
GCCTTTGCATCATCACCGTATAATGTGAAGAGGATGGGTGAGGCTCAGGTGAATCGAAAT
CAGCAGGTGGCTCAAACTGCTGTTCCCCAAGCAAGGCGGGGGCCTGGTGAAGCTGCTGGT
AAAATTGGAAATAACAACACTCCTACTGGTGGCAATTATCAAGGTGGTGGTGGTGGTGGG
GATGGCAACAGGGGGGGTTATGGTAGAGGAAGTTGGGGTAGAGGAGGTCCTCAAGCTATG
GGAAATCGGGGGCCTGTGGGTCCTATGAGAAACAGGCCTGGTGGGATTGCAGGAAGGGGT
ATGATGGGTAACGGTGGAGGTGGATTTGGACAAGGTATGGGTGGTGCACCTCCTATTATG
CATCATCAAACAATGATGGGTCAAGGCTTTGATCCTGCTTTTGGAGGGCCTATGGGGAGA
ATGGGTGGTTATGGAGGATTTCCTGGTGGTCCAGCTCCACCATTTCCTGGTATGTTGTCA
TCTTTTCCACCTGTTGGAGGAGTTGGGATGCCTGGAGTAGCTCCGCATGTAAATCCTGCA
TTCTTTGGTAGAGGAATGCCAATGAATGGTATGGGAATGATGCCAGGTGCTGGTATGGAG
GGGCCTAACATGGGGATGTGGTCAGAACCTAATGCGGGTGGATGGGCTGGTGACGAGCAT
GGTGGTAGAGCAGGAGAGTCAAGTTATGCAGAAGAAGCTGGGTCTGATCATCAGTATGGA
GAAACAACTCACGATAGAGGGGCTTGGCCAAATAATGTGAAAGAGAAAGATAGAGGATCA
GAGCGTGATTGGTCTGGTTCTACAGAGAGAAAACATCGAGAAGGCAGAGAACCTTCCTAT
GATAGAGACATGGCTCGTGAAAAGGATCGAGGGCATGACCAGGATTGGCCAGAGAAAAGA
TACCGTGATGATAGAGATGTCGCACGTGACAGAGAGAAGGACCGGGATCATGAACGTTCT
AGAGAACGAGGGCGTGATCGTGAGAGGGATCGAGATCGTCATAGGGATGATAGAGATAGA
TATGCTGATCATCATAGGTACAAGGACCGTGAGCAAGAATATGATGATGAAGACAGAGGA
AGATCATCAAGGGGACACAGTAAATCACGATTATCACATGAGGAAGACCATCGATCAAGA
TCAAGGGATGCTGATTATGGAAAGAGGCGGCGTATAACTTCTGAGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400038359
PEP Infomation

pacid=37433070 transcript=PGSC0003DMT400057063 locus=PGSC0003DMG400022171 ID=PGSC0003DMT400057063.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MEDNEGGDGVGGEPIEQFHRNEAISAVADDGFMVEEDDDYEDLYNDVNVGENFLQSFRKN
EDLVSRNDEVERKPEQPALPAPPPVVAAPQVVDESGRGDFQGVGGERNPVKEEDVVSGIS
ARASVGAAVSGPSAGGGFRVELSHPSSKMGDLAERMVNSNVPHQVMAQQPHAGGVAVAAG
NLGNVGNMGNDNLIRQGGVNMNGVGNIVAGVGVASGGGGGGGGGGATILFVGDLHWWTTD
AELETELSKYGHVKEVKFFEEKASGKSKGYCQVEFHDSSAATACKEGMNGHMFNGRPCVV
AFASSPYNVKRMGEAQVNRNQQVAQTAVPQARRGPGEAAGKIGNNNTPTGGNYQGGGGGG
DGNRGGYGRGSWGRGGPQAMGNRGPVGPMRNRPGGIAGRGMMGNGGGGFGQGMGGAPPIM
HHQTMMGQGFDPAFGGPMGRMGGYGGFPGGPAPPFPGMLSSFPPVGGVGMPGVAPHVNPA
FFGRGMPMNGMGMMPGAGMEGPNMGMWSEPNAGGWAGDEHGGRAGESSYAEEAGSDHQYG
ETTHDRGAWPNNVKEKDRGSERDWSGSTERKHREGREPSYDRDMAREKDRGHDQDWPEKR
YRDDRDVARDREKDRDHERSRERGRDRERDRDRHRDDRDRYADHHRYKDREQEYDDEDRG
RSSRGHSKSRLSHEEDHRSRSRDADYGKRRRITSE*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400057063
Transcript Infomation

pacid=37433070 locus=PGSC0003DMG400022171 ID=PGSC0003DMT400057063.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAGGATAATGAAGGTGGGGATGGAGTTGGTGGAGAGCCAATCGAGCAGTTTCACAGG
AATGAAGCGATCTCCGCTGTTGCTGATGATGGGTTCATGGTTGAAGAGGATGATGATTAC
GAAGATCTCTACAATGATGTTAATGTTGGTGAGAATTTTCTTCAATCTTTTAGAAAGAAT
GAGGATTTAGTATCTAGGAATGATGAGGTAGAGAGGAAGCCTGAGCAGCCTGCCCTTCCG
GCGCCACCACCGGTAGTGGCAGCACCGCAAGTGGTGGATGAGAGTGGGCGTGGCGATTTT
CAGGGTGTGGGTGGGGAGAGGAATCCTGTAAAAGAGGAGGATGTAGTGTCTGGGATTTCT
GCTAGAGCGTCAGTAGGTGCAGCTGTGTCTGGGCCTTCTGCTGGTGGTGGGTTTAGGGTT
GAGTTAAGTCACCCGTCAAGTAAGATGGGTGATTTAGCAGAGCGGATGGTGAATAGTAAT
GTTCCACATCAGGTGATGGCTCAACAGCCTCATGCTGGTGGTGTTGCAGTAGCTGCTGGA
AATTTGGGTAATGTTGGAAATATGGGGAATGATAATTTGATAAGGCAAGGAGGGGTTAAT
ATGAACGGGGTGGGTAATATTGTTGCTGGAGTTGGGGTCGCTAGTGGTGGAGGAGGAGGT
GGTGGTGGCGGTGGCGCGACAATTCTTTTTGTTGGTGATCTGCATTGGTGGACCACAGAT
GCTGAGCTGGAAACTGAGTTGAGCAAGTATGGACACGTGAAGGAGGTGAAATTTTTTGAA
GAAAAAGCTAGTGGGAAGTCTAAAGGATATTGCCAGGTTGAGTTTCATGATTCCTCAGCT
GCCACAGCTTGCAAAGAAGGTATGAATGGACACATGTTCAATGGGCGGCCATGTGTGGTA
GCCTTTGCATCATCACCGTATAATGTGAAGAGGATGGGTGAGGCTCAGGTGAATCGAAAT
CAGCAGGTGGCTCAAACTGCTGTTCCCCAAGCAAGGCGGGGGCCTGGTGAAGCTGCTGGT
AAAATTGGAAATAACAACACTCCTACTGGTGGCAATTATCAAGGTGGTGGTGGTGGTGGG
GATGGCAACAGGGGGGGTTATGGTAGAGGAAGTTGGGGTAGAGGAGGTCCTCAAGCTATG
GGAAATCGGGGGCCTGTGGGTCCTATGAGAAACAGGCCTGGTGGGATTGCAGGAAGGGGT
ATGATGGGTAACGGTGGAGGTGGATTTGGACAAGGTATGGGTGGTGCACCTCCTATTATG
CATCATCAAACAATGATGGGTCAAGGCTTTGATCCTGCTTTTGGAGGGCCTATGGGGAGA
ATGGGTGGTTATGGAGGATTTCCTGGTGGTCCAGCTCCACCATTTCCTGGTATGTTGTCA
TCTTTTCCACCTGTTGGAGGAGTTGGGATGCCTGGAGTAGCTCCGCATGTAAATCCTGCA
TTCTTTGGTAGAGGAATGCCAATGAATGGTATGGGAATGATGCCAGGTGCTGGTATGGAG
GGGCCTAACATGGGGATGTGGTCAGAACCTAATGCGGGTGGATGGGCTGGTGACGAGCAT
GGTGGTAGAGCAGGAGAGTCAAGTTATGCAGAAGAAGCTGGGTCTGATCATCAGTATGGA
GAAACAACTCACGATAGAGGGGCTTGGCCAAATAATGTGAAAGAGAAAGATAGAGGATCA
GAGCGTGATTGGTCTGGTTCTACAGAGAGAAAACATCGAGAAGGCAGAGAACCTTCCTAT
GATAGAGACATGGCTCGTGAAAAGGATCGAGGGCATGACCAGGATTGGCCAGAGAAAAGA
TACCGTGATGATAGAGATGTCGCACGTGACAGAGAGAAGGACCGGGATCATGAACGTTCT
AGAGAACGAGGGCGTGATCGTGAGAGGGATCGAGATCGTCATAGGGATGATAGAGATAGA
TATGCTGATCATCATAGGTACAAGGACCGTGAGCAAGAATATGATGATGAAGACAGAGGA
AGATCATCAAGGGGACACAGTAAATCACGATTATCACATGAGGAAGACCATCGATCAAGA
TCAAGGGATGCTGATTATGGAAAGAGGCGGCGTATAACTTCTGAGTGA