Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400056799
CDS Infomation

pacid=37478850 polypeptide=PGSC0003DMP400038185 locus=PGSC0003DMG400022088 ID=PGSC0003DMT400056799.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTTCTTCATCTTCTCTCACTCTTTCTCAAGCTATCTTCTCTCCTTCTCTCCCTCGC
CATGGCTCATCTTCTTCGTCTTCTCCTTCTCTCTCTTTCTCCACTTTCTCTGGCCTTAAA
TCCACCCCTTTCACTTCCTCCCACCGTCGTATTCTTCCTTCCACTACCGTCACTAAACAA
CAGTTCTCTGTTCGTGCCTCCGCAGCTGTAGAGACTTTGGAGAAAACTGATGCAGCCATT
GTTGAGAAATCTGTTAACACTATTCGATTTTTGGCTATTGATGCTGTTGAAAAAGCTAAT
TCCGGTCATCCGGGTTTACCCATGGGATGTGCTCCAATGGGTCATATATTGTATGATGAA
GTAATGAAATATAACCCGAAGAATCCTTACTGGTTTAATCGTGACCGATTTGTTCTATCT
GCTGGTCATGGTTGTATGCTGCAATATGCTCTTCTTCATCTTGCTGGTTATGACTCTGTT
CAGGAAGACGATTTGAAAAGTTTCCGTCAATGGGGAAGCAGAATTCCCGGTCACCCTGAG
AATTTTGAGACACCTGGTGTTGAAGTTACCACTGGTCCTCTGGGGCAAGGTATTGCCAAT
GCTGTTGGATTGGCTGTTGCAGAGAAGCACTTGGCTGCTCGGTTCAACAAGCCTGACGCT
GAGATTGTTGACCACTATACATATGTTATTCTTGGTGATGGTTGTCAGATGGAGGGTATC
TCAAATGAAGTTTGTTCCCTTGCTGGCCATTGGGGACTTGGAAAGCTGATTGCTTTCTAT
GACGATAATCACATTTCCATTGACGGAGACACGGAAATTGCTTTCACTGAGGATGTCTCT
GCTCGTTTCGAGTCTTTAGGATGGCATGTAATCTGGGTGAAGAATGGTAACACAGGTTAT
GATGAGATTCGTGCAGCTATTAAGGAAGCTAAAGCTGTCAAAGACAAACCTACTATGATC
AAGGTAACTACAACGATTGGTTTTGGCTCTCCTAACAAGGCAAACTCTTACAGTGTGCAC
GGTAGTGCACTTGGAGCAAAGGAAGTCGAGGCAACTAGAAATAACCTGGGATGGCCTTAT
GAGCCTTTCCATGTGCCTGAAGATGTGAAGAGCCATTGGAGTCGTCATACACCGGAGGGT
GCTGCCCTTGAAACTGAATGGAATGCTAAGTTTGCTGAATATGAGAAGAAGTATGCAGAG
GAAGCTGCAGATTTGAAATCCATCATTACTGGTGAACTACCTGCTGGCTGGGAGAAAGCT
CTTCCTACTTACACTCCCGAGAGCCCAGCTGATGCCACGAGAAACTTGTCACAACAAAAC
CTTAATGCTCTTGCCAAGGTTCTACCTGGTTTCCTTGGTGGTAGTGCTGATCTTGCATCA
TCAAACATGACTCTTTTGAAAATGTTTGGTGACTTCCAAAAGAACACTCCAGAAGAGCGT
AATTTAAGGTTTGGTGTTCGTGAACATGGTATGGGAGCCATATGTAATGGAATTGCTCTA
CACAGCCTTGGCTTGATCCCCTATTGTGCTACTTTCTTTGTGTTCACTGACTACATGAGA
GGAGCCATGAGGATTTCAGCCTTGTCTGAAGCTGGAGTTATTTATGTTATGACTCACGAT
TCAATTGGTCTAGGAGAAGACGGTCCAACCCATCAACCCATTGAGCACTTGGCAAGTTTC
CGTGCCATGCCCAACATTCTGATGTTCCGTCCAGCAGATGGCAATGAGACAGCAGGAGCT
TACAAGGTGGCTGTCCTTAAGAGGAAAACACCATCAATCCTTGCCCTCTCTCGGCAAAAG
TTGCCACAACTTGCTGGAACTTCTATTGAAGGAGCAGCAAAGGGTGGCTACATTGTATCA
GACAATTCATCTGGCAACAAACCTGATGTCATTTTGATCGGTACTGGCTCCGAGTTGGAA
ATTGCTGTCAAGGCTGCTGAGGAACTAAAGAAAGAAGGAAAGACAGTGAGGGTTGTTTCC
TTTGTTTGTTGGGAGCTTTATGATGAACAATCAGCTGAATACAAGGAAAGTGTCCTTCCA
TCATCTGTTACAGCTAGAGTTAGCATTGAAGCTGGATCAACATTTGGGTGGCAAAAATTT
GTTGGCGATAAAGGAAAAGCCATTGGGATTGACGGGTTTGGTGCTAGTGCTCCTGCTGAT
AAGATATACAAAGAGTTTGGTATTACAGCAGAAGCTGTTGTAGCTGCAGCTAAACAAGTT
TCTTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400038185
PEP Infomation

pacid=37478850 transcript=PGSC0003DMT400056799 locus=PGSC0003DMG400022088 ID=PGSC0003DMT400056799.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MASSSSLTLSQAIFSPSLPRHGSSSSSSPSLSFSTFSGLKSTPFTSSHRRILPSTTVTKQ
QFSVRASAAVETLEKTDAAIVEKSVNTIRFLAIDAVEKANSGHPGLPMGCAPMGHILYDE
VMKYNPKNPYWFNRDRFVLSAGHGCMLQYALLHLAGYDSVQEDDLKSFRQWGSRIPGHPE
NFETPGVEVTTGPLGQGIANAVGLAVAEKHLAARFNKPDAEIVDHYTYVILGDGCQMEGI
SNEVCSLAGHWGLGKLIAFYDDNHISIDGDTEIAFTEDVSARFESLGWHVIWVKNGNTGY
DEIRAAIKEAKAVKDKPTMIKVTTTIGFGSPNKANSYSVHGSALGAKEVEATRNNLGWPY
EPFHVPEDVKSHWSRHTPEGAALETEWNAKFAEYEKKYAEEAADLKSIITGELPAGWEKA
LPTYTPESPADATRNLSQQNLNALAKVLPGFLGGSADLASSNMTLLKMFGDFQKNTPEER
NLRFGVREHGMGAICNGIALHSLGLIPYCATFFVFTDYMRGAMRISALSEAGVIYVMTHD
SIGLGEDGPTHQPIEHLASFRAMPNILMFRPADGNETAGAYKVAVLKRKTPSILALSRQK
LPQLAGTSIEGAAKGGYIVSDNSSGNKPDVILIGTGSELEIAVKAAEELKKEGKTVRVVS
FVCWELYDEQSAEYKESVLPSSVTARVSIEAGSTFGWQKFVGDKGKAIGIDGFGASAPAD
KIYKEFGITAEAVVAAAKQVS*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400056799
Transcript Infomation

pacid=37478850 locus=PGSC0003DMG400022088 ID=PGSC0003DMT400056799.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTTCTTCATCTTCTCTCACTCTTTCTCAAGCTATCTTCTCTCCTTCTCTCCCTCGC
CATGGCTCATCTTCTTCGTCTTCTCCTTCTCTCTCTTTCTCCACTTTCTCTGGCCTTAAA
TCCACCCCTTTCACTTCCTCCCACCGTCGTATTCTTCCTTCCACTACCGTCACTAAACAA
CAGTTCTCTGTTCGTGCCTCCGCAGCTGTAGAGACTTTGGAGAAAACTGATGCAGCCATT
GTTGAGAAATCTGTTAACACTATTCGATTTTTGGCTATTGATGCTGTTGAAAAAGCTAAT
TCCGGTCATCCGGGTTTACCCATGGGATGTGCTCCAATGGGTCATATATTGTATGATGAA
GTAATGAAATATAACCCGAAGAATCCTTACTGGTTTAATCGTGACCGATTTGTTCTATCT
GCTGGTCATGGTTGTATGCTGCAATATGCTCTTCTTCATCTTGCTGGTTATGACTCTGTT
CAGGAAGACGATTTGAAAAGTTTCCGTCAATGGGGAAGCAGAATTCCCGGTCACCCTGAG
AATTTTGAGACACCTGGTGTTGAAGTTACCACTGGTCCTCTGGGGCAAGGTATTGCCAAT
GCTGTTGGATTGGCTGTTGCAGAGAAGCACTTGGCTGCTCGGTTCAACAAGCCTGACGCT
GAGATTGTTGACCACTATACATATGTTATTCTTGGTGATGGTTGTCAGATGGAGGGTATC
TCAAATGAAGTTTGTTCCCTTGCTGGCCATTGGGGACTTGGAAAGCTGATTGCTTTCTAT
GACGATAATCACATTTCCATTGACGGAGACACGGAAATTGCTTTCACTGAGGATGTCTCT
GCTCGTTTCGAGTCTTTAGGATGGCATGTAATCTGGGTGAAGAATGGTAACACAGGTTAT
GATGAGATTCGTGCAGCTATTAAGGAAGCTAAAGCTGTCAAAGACAAACCTACTATGATC
AAGGTAACTACAACGATTGGTTTTGGCTCTCCTAACAAGGCAAACTCTTACAGTGTGCAC
GGTAGTGCACTTGGAGCAAAGGAAGTCGAGGCAACTAGAAATAACCTGGGATGGCCTTAT
GAGCCTTTCCATGTGCCTGAAGATGTGAAGAGCCATTGGAGTCGTCATACACCGGAGGGT
GCTGCCCTTGAAACTGAATGGAATGCTAAGTTTGCTGAATATGAGAAGAAGTATGCAGAG
GAAGCTGCAGATTTGAAATCCATCATTACTGGTGAACTACCTGCTGGCTGGGAGAAAGCT
CTTCCTACTTACACTCCCGAGAGCCCAGCTGATGCCACGAGAAACTTGTCACAACAAAAC
CTTAATGCTCTTGCCAAGGTTCTACCTGGTTTCCTTGGTGGTAGTGCTGATCTTGCATCA
TCAAACATGACTCTTTTGAAAATGTTTGGTGACTTCCAAAAGAACACTCCAGAAGAGCGT
AATTTAAGGTTTGGTGTTCGTGAACATGGTATGGGAGCCATATGTAATGGAATTGCTCTA
CACAGCCTTGGCTTGATCCCCTATTGTGCTACTTTCTTTGTGTTCACTGACTACATGAGA
GGAGCCATGAGGATTTCAGCCTTGTCTGAAGCTGGAGTTATTTATGTTATGACTCACGAT
TCAATTGGTCTAGGAGAAGACGGTCCAACCCATCAACCCATTGAGCACTTGGCAAGTTTC
CGTGCCATGCCCAACATTCTGATGTTCCGTCCAGCAGATGGCAATGAGACAGCAGGAGCT
TACAAGGTGGCTGTCCTTAAGAGGAAAACACCATCAATCCTTGCCCTCTCTCGGCAAAAG
TTGCCACAACTTGCTGGAACTTCTATTGAAGGAGCAGCAAAGGGTGGCTACATTGTATCA
GACAATTCATCTGGCAACAAACCTGATGTCATTTTGATCGGTACTGGCTCCGAGTTGGAA
ATTGCTGTCAAGGCTGCTGAGGAACTAAAGAAAGAAGGAAAGACAGTGAGGGTTGTTTCC
TTTGTTTGTTGGGAGCTTTATGATGAACAATCAGCTGAATACAAGGAAAGTGTCCTTCCA
TCATCTGTTACAGCTAGAGTTAGCATTGAAGCTGGATCAACATTTGGGTGGCAAAAATTT
GTTGGCGATAAAGGAAAAGCCATTGGGATTGACGGGTTTGGTGCTAGTGCTCCTGCTGAT
AAGATATACAAAGAGTTTGGTATTACAGCAGAAGCTGTTGTAGCTGCAGCTAAACAAGTT
TCTTAG