Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400056445
CDS Infomation

pacid=37428465 polypeptide=PGSC0003DMP400037972 locus=PGSC0003DMG400021928 ID=PGSC0003DMT400056445.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGTTAATCCAAATTTTTTGAAAGCCCCTGAACTTGCATCGTATAATGTTCGAGGGAAT
CAACCAGCTTTAGGTGTTGATAAATTATGTTATTTAACCGATACCTTTTCAGACAATGGC
ATATGGGAAGAAATCAACCCTTTGGAATCCAAACTCCCAACTTTTATATTTCAACTTGCT
ATTGTTCTTTTTGTCACCCGTCTTTCTCTCCTTCTCCTCAAACCTCTCCGCCAACCTCAT
TTCGCTGCTGAATTGTTGGCAGGTATACTGGTGGGATCAATTGCAATTGCAAGTGAATTT
GCGCGAAAACATATTCCAACATTGGGTTCTGTATTTGCAGCTTCTCGAATTATGATGATG
GAGACGGTGGGAAACCTTGGACTAATTTATCATGTATTTCTTATTGGATTAGAAATTGAC
TTAAGAGCATTAACAAGTGTTGGACCTAAAGCCCTTGGCATTGGTATTGCTGGAGCTCTT
TTCCCCTTCTTTTTTGGAGCTTCCTTGTACACTTTTATCGCAGAGTATCCAGAGAATTTC
AGGTGGGGTTGTCTTTACTGGGGTGTAGCACTCTCAGTCACTGGCCTTCCTGTTATAGCA
GAAATATTTGCAAAATTAAAGCTTCTCCATTCAGAAATTGGAAGAATAGCCATGTCTTCC
GCACTTGTTAATGATTTTTCCTCATGGATTCTCCTTGTATTTTCATTAGCAATAACTAGT
AGCAGCTCAAGTACGTACTTGTCATTGTTTAGTGTTCTATTCTTCATCATTTTCAGTATT
TTTGTAATTCGTCCTGCACTTTTATGGATGCTTAGGAAGAGTACTAGAGAAGGAGAAGAC
TATAGTGAAGCAACAATTTGTGCTATACTCACAATGGTCTTGGCTTGTGGGTTGATCACT
GATATATGTGGAGTGAGCTCTGTTCTCGGTGCATTTGTATTTGGTCTTATCATACCATCA
GATCTATTAGGTCATAGGTTTGTGTTGACAGTTCAAGGTTTTGTATCTGACTTGTTACTG
CCTCTTTATTATGCTAGTTTGGGAATGAGGACTCATCTAGGGGGAATTAACAGAGAGGAC
ATGCTTATGATGGTTCTAATTAGCTTACTGTCTTTCATACCCAAGATTGTTTGCACTCTA
GCTATGTCTTACTTCTATAGAATGTCGTTGCATGAAGGATTTACTCTTGGAATACTAATG
AACACCAAAGGACTGCTAGCTGTCATGGCAATGAGCTTGGGCCGTGACCATACTGTCATG
AATGAAGATGGATTTGCCATCATGTTGTTTACTATTTTCTTCATGACCATAGTAACATCA
CCAATTGTTAACTTCCTCTATAGACGTACTAAGAAGTTCTTACCAAGCCAACATAGGGTG
TTACAGAACCTAAAACCAGATTCTGAGCTCCGAATCCTAACTAGTATTCATGAAGTACAA
ACTGCTGCTGGAATTACTGCACTTCTGGAAATCTCGCATGCCTCTAGAAGATCTCCAATT
TGCGTATTTGCTCTTCAGCTCATGCAACTGAAAAAACATACTACCGCTTTGCTCATTGTT
CATGGTGCTAGTGGCACTAGCTCAGAAAGTTACAGTAGAGCAGATGGACAAATTGATCAA
TTAGTTACGACATTCAATAACTTAGAGCATCAAAATCCGATGATATCTGTTCAGTTGTTG
ACTGCTATATCTCCTTATAGCACAATGCATGAAGATATATGCTGTCTTGCTGAGGAAAAA
CAGGTGACACTAATCATTCTCCCGTTCCACAAGAGACAAACTATACATAATAACATGGAA
GAAATGAATCCTGCTTACAAAGAGGTAAATAATAATACTTTAGAAAATGCACCTTGTGCT
GTTGGTATTCTTGTGGATCGTGGTTTTGGCACATTGTTAACTAGTAAAATAGATGATGAT
AAAACTAGGAGTTGCAGAATAGCCATGATCTTTATAGGGGGACGTGATGACAGAGAGGCG
TTGTCCTATGCTTTGCGTATGGCGAGACATCCAAAGGTATCTCTAATAGTTTTGAGGTTT
ATTCTGGATGAAACTTCAGCACAAAATGGTGATGCAGATTTATCTCTCACAATGGAAGGT
GAACATGAAGGTGAAGCTGAAAAGAAAGCTGATGACATTTTTGTAAATGAGTTTAGGCAA
AAGGTACAAAATGATGACTCAGTTGTTTATACAGAGGAGATGTCTAGTAATGGGGCAGAA
ACTGTGAAAACAATAAGATCACTAGGCCAAGATTTTGATCTCTATGTGGTAGGAAGAGGA
TTGGGCTTCTTTTCGCCGCTCAAAGGTGGATTAGATGAGTGGAACGACTGCCCGGAGCTC
GGATCCATTGGGGACTTGTTGCTCACATCAGACTTTTCTTCCACAGCTTCAATTTTAGTG
GTGCAACACCATGCTGAGCTCAATCCTGGATCATCAACTTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400037972
PEP Infomation

pacid=37428465 transcript=PGSC0003DMT400056445 locus=PGSC0003DMG400021928 ID=PGSC0003DMT400056445.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MVNPNFLKAPELASYNVRGNQPALGVDKLCYLTDTFSDNGIWEEINPLESKLPTFIFQLA
IVLFVTRLSLLLLKPLRQPHFAAELLAGILVGSIAIASEFARKHIPTLGSVFAASRIMMM
ETVGNLGLIYHVFLIGLEIDLRALTSVGPKALGIGIAGALFPFFFGASLYTFIAEYPENF
RWGCLYWGVALSVTGLPVIAEIFAKLKLLHSEIGRIAMSSALVNDFSSWILLVFSLAITS
SSSSTYLSLFSVLFFIIFSIFVIRPALLWMLRKSTREGEDYSEATICAILTMVLACGLIT
DICGVSSVLGAFVFGLIIPSDLLGHRFVLTVQGFVSDLLLPLYYASLGMRTHLGGINRED
MLMMVLISLLSFIPKIVCTLAMSYFYRMSLHEGFTLGILMNTKGLLAVMAMSLGRDHTVM
NEDGFAIMLFTIFFMTIVTSPIVNFLYRRTKKFLPSQHRVLQNLKPDSELRILTSIHEVQ
TAAGITALLEISHASRRSPICVFALQLMQLKKHTTALLIVHGASGTSSESYSRADGQIDQ
LVTTFNNLEHQNPMISVQLLTAISPYSTMHEDICCLAEEKQVTLIILPFHKRQTIHNNME
EMNPAYKEVNNNTLENAPCAVGILVDRGFGTLLTSKIDDDKTRSCRIAMIFIGGRDDREA
LSYALRMARHPKVSLIVLRFILDETSAQNGDADLSLTMEGEHEGEAEKKADDIFVNEFRQ
KVQNDDSVVYTEEMSSNGAETVKTIRSLGQDFDLYVVGRGLGFFSPLKGGLDEWNDCPEL
GSIGDLLLTSDFSSTASILVVQHHAELNPGSST*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400056445
Transcript Infomation

pacid=37428465 locus=PGSC0003DMG400021928 ID=PGSC0003DMT400056445.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGTTAATCCAAATTTTTTGAAAGCCCCTGAACTTGCATCGTATAATGTTCGAGGGAAT
CAACCAGCTTTAGGTGTTGATAAATTATGTTATTTAACCGATACCTTTTCAGACAATGGC
ATATGGGAAGAAATCAACCCTTTGGAATCCAAACTCCCAACTTTTATATTTCAACTTGCT
ATTGTTCTTTTTGTCACCCGTCTTTCTCTCCTTCTCCTCAAACCTCTCCGCCAACCTCAT
TTCGCTGCTGAATTGTTGGCAGGTATACTGGTGGGATCAATTGCAATTGCAAGTGAATTT
GCGCGAAAACATATTCCAACATTGGGTTCTGTATTTGCAGCTTCTCGAATTATGATGATG
GAGACGGTGGGAAACCTTGGACTAATTTATCATGTATTTCTTATTGGATTAGAAATTGAC
TTAAGAGCATTAACAAGTGTTGGACCTAAAGCCCTTGGCATTGGTATTGCTGGAGCTCTT
TTCCCCTTCTTTTTTGGAGCTTCCTTGTACACTTTTATCGCAGAGTATCCAGAGAATTTC
AGGTGGGGTTGTCTTTACTGGGGTGTAGCACTCTCAGTCACTGGCCTTCCTGTTATAGCA
GAAATATTTGCAAAATTAAAGCTTCTCCATTCAGAAATTGGAAGAATAGCCATGTCTTCC
GCACTTGTTAATGATTTTTCCTCATGGATTCTCCTTGTATTTTCATTAGCAATAACTAGT
AGCAGCTCAAGTACGTACTTGTCATTGTTTAGTGTTCTATTCTTCATCATTTTCAGTATT
TTTGTAATTCGTCCTGCACTTTTATGGATGCTTAGGAAGAGTACTAGAGAAGGAGAAGAC
TATAGTGAAGCAACAATTTGTGCTATACTCACAATGGTCTTGGCTTGTGGGTTGATCACT
GATATATGTGGAGTGAGCTCTGTTCTCGGTGCATTTGTATTTGGTCTTATCATACCATCA
GATCTATTAGGTCATAGGTTTGTGTTGACAGTTCAAGGTTTTGTATCTGACTTGTTACTG
CCTCTTTATTATGCTAGTTTGGGAATGAGGACTCATCTAGGGGGAATTAACAGAGAGGAC
ATGCTTATGATGGTTCTAATTAGCTTACTGTCTTTCATACCCAAGATTGTTTGCACTCTA
GCTATGTCTTACTTCTATAGAATGTCGTTGCATGAAGGATTTACTCTTGGAATACTAATG
AACACCAAAGGACTGCTAGCTGTCATGGCAATGAGCTTGGGCCGTGACCATACTGTCATG
AATGAAGATGGATTTGCCATCATGTTGTTTACTATTTTCTTCATGACCATAGTAACATCA
CCAATTGTTAACTTCCTCTATAGACGTACTAAGAAGTTCTTACCAAGCCAACATAGGGTG
TTACAGAACCTAAAACCAGATTCTGAGCTCCGAATCCTAACTAGTATTCATGAAGTACAA
ACTGCTGCTGGAATTACTGCACTTCTGGAAATCTCGCATGCCTCTAGAAGATCTCCAATT
TGCGTATTTGCTCTTCAGCTCATGCAACTGAAAAAACATACTACCGCTTTGCTCATTGTT
CATGGTGCTAGTGGCACTAGCTCAGAAAGTTACAGTAGAGCAGATGGACAAATTGATCAA
TTAGTTACGACATTCAATAACTTAGAGCATCAAAATCCGATGATATCTGTTCAGTTGTTG
ACTGCTATATCTCCTTATAGCACAATGCATGAAGATATATGCTGTCTTGCTGAGGAAAAA
CAGGTGACACTAATCATTCTCCCGTTCCACAAGAGACAAACTATACATAATAACATGGAA
GAAATGAATCCTGCTTACAAAGAGGTAAATAATAATACTTTAGAAAATGCACCTTGTGCT
GTTGGTATTCTTGTGGATCGTGGTTTTGGCACATTGTTAACTAGTAAAATAGATGATGAT
AAAACTAGGAGTTGCAGAATAGCCATGATCTTTATAGGGGGACGTGATGACAGAGAGGCG
TTGTCCTATGCTTTGCGTATGGCGAGACATCCAAAGGTATCTCTAATAGTTTTGAGGTTT
ATTCTGGATGAAACTTCAGCACAAAATGGTGATGCAGATTTATCTCTCACAATGGAAGGT
GAACATGAAGGTGAAGCTGAAAAGAAAGCTGATGACATTTTTGTAAATGAGTTTAGGCAA
AAGGTACAAAATGATGACTCAGTTGTTTATACAGAGGAGATGTCTAGTAATGGGGCAGAA
ACTGTGAAAACAATAAGATCACTAGGCCAAGATTTTGATCTCTATGTGGTAGGAAGAGGA
TTGGGCTTCTTTTCGCCGCTCAAAGGTGGATTAGATGAGTGGAACGACTGCCCGGAGCTC
GGATCCATTGGGGACTTGTTGCTCACATCAGACTTTTCTTCCACAGCTTCAATTTTAGTG
GTGCAACACCATGCTGAGCTCAATCCTGGATCATCAACTTAA