Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400056192
CDS Infomation

pacid=37445255 polypeptide=PGSC0003DMP400037819 locus=PGSC0003DMG400021831 ID=PGSC0003DMT400056192.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTTTATTGAAAATTTTAAGGTGGAAAGCCCAAATGTGAAGTATATAGAGAATGAAATT
CACTCTGTGTATGATTATGAAACCACAGAGCTTGTTCATGAAGAGAGAAATGGAACTTAT
CAATGGATTGTTAAGCCTAAATCTGTCAAATATGAATTCAAAACTGATACTCATGTGCCA
AAATTAGGGGTTATGCTTGTTGGATGGGGAGGAAACAATGGTTCAACATTGACTGGAGGT
GTTATTGCGAATCGAGAAGGAATTTCATGGGCAACGAAAGAAAAAGTGCAGCAAGCAAAT
TATTTTGGGTCTCTTACTCAGGCATCAACAATTCGAATTGGGTCTTACAATGGCGAGGAG
ATCTATGCACCCTTCAAGAGCCTCCTTCCCATGGTCAACCCAGACGACGTAGTATTTGGA
GGATGGGACATTAGCAACATGAATTTGGCAGATGCCATGGTCAGGGCTAAGGTTTTCGAA
GTTGATCTGCAAAAGCAGCTGAGGCCCTACATGGAATCCATGGTTCCTCTTCCTGGTATC
TATGACCCTGACTTCATTGCTGCTAACCAAGAAGCACGTGCCAACAACGTGATCAAAGGA
ACCAAGAAAGAACAAGTTGATCAAATTGTTAAAGATATTAGGGAGTTCAAGGAGAAGAAC
AAGGTAGACAAGATAGTGGTTCTATGGACTGCCAACACCGAAAGGTACAGCAATGTGGTT
GTTGGCCTTAACGATACCATGGAAAACCTTTTAGCTGCTGTGGATAGAAATGAGGCTGAA
ATATCTCCTTCTACATTGCATGCTATTGCTTGTATTCTGGAAAATGTGCCTTTCATCAAC
GGAAGCCCTCAAAACACTTTTGTTCCAGGTCTTATTGATTTGGCCATAAAGAGAAACACT
TTAATTGGTGGTGATGACTTTAAGAGTGGTCAAACCAAGATGAAGTCCGTGTTGGTTGAT
TTCCTTGTTGGAGCTGGTATTAAGCCAACGTCAATAGTGAGCTACAATCACTTGGGTAAC
AATGACGGAATGAATCTTTCTGCTCCTCAAACCTTCCGGTCTAAGGAGATCTCAAAAAGT
AATGTTGTTGATGACATGGTTGCTAGCAACTCCATTCTCTATGAATCTGGCGAGCACCCT
GACCATGTTGTTGTGATCAAGTATGTTCCATATGTTGGAGACAGCAAGAGGGCAATGGAT
GAGTACATGTCAGAGATTTTCATGGGCGGAAAGAGCACCATAGTTATGCACAACACTTGT
GAGGACTCTCTTTTGGCAGCTCCAATTATCTTGGACTTGGTCCTTCTCGCTGAACTCAGC
ACTCGCATTCAGCTCAAAGCTGAAGGGGAGGGGAAGTTCCACTCCTTCCACCCTGTGGCT
ACTATTCTCAGCTACCTCACCAAGGCTCCCCTGGTACCACCAGGTACTCCAGTGGTGAAT
GCCCTTTCAAAACAGAGGGCAATGCTTGAGAACATAATGAGAGCTTGTGTTGGTTTGGCA
CCAGAGAACAACATGATTTTGGAATACAAATGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400037819
PEP Infomation

pacid=37445255 transcript=PGSC0003DMT400056192 locus=PGSC0003DMG400021831 ID=PGSC0003DMT400056192.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MFIENFKVESPNVKYIENEIHSVYDYETTELVHEERNGTYQWIVKPKSVKYEFKTDTHVP
KLGVMLVGWGGNNGSTLTGGVIANREGISWATKEKVQQANYFGSLTQASTIRIGSYNGEE
IYAPFKSLLPMVNPDDVVFGGWDISNMNLADAMVRAKVFEVDLQKQLRPYMESMVPLPGI
YDPDFIAANQEARANNVIKGTKKEQVDQIVKDIREFKEKNKVDKIVVLWTANTERYSNVV
VGLNDTMENLLAAVDRNEAEISPSTLHAIACILENVPFINGSPQNTFVPGLIDLAIKRNT
LIGGDDFKSGQTKMKSVLVDFLVGAGIKPTSIVSYNHLGNNDGMNLSAPQTFRSKEISKS
NVVDDMVASNSILYESGEHPDHVVVIKYVPYVGDSKRAMDEYMSEIFMGGKSTIVMHNTC
EDSLLAAPIILDLVLLAELSTRIQLKAEGEGKFHSFHPVATILSYLTKAPLVPPGTPVVN
ALSKQRAMLENIMRACVGLAPENNMILEYK*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400056192
Transcript Infomation

pacid=37445255 locus=PGSC0003DMG400021831 ID=PGSC0003DMT400056192.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTTTATTGAAAATTTTAAGGTGGAAAGCCCAAATGTGAAGTATATAGAGAATGAAATT
CACTCTGTGTATGATTATGAAACCACAGAGCTTGTTCATGAAGAGAGAAATGGAACTTAT
CAATGGATTGTTAAGCCTAAATCTGTCAAATATGAATTCAAAACTGATACTCATGTGCCA
AAATTAGGGGTTATGCTTGTTGGATGGGGAGGAAACAATGGTTCAACATTGACTGGAGGT
GTTATTGCGAATCGAGAAGGAATTTCATGGGCAACGAAAGAAAAAGTGCAGCAAGCAAAT
TATTTTGGGTCTCTTACTCAGGCATCAACAATTCGAATTGGGTCTTACAATGGCGAGGAG
ATCTATGCACCCTTCAAGAGCCTCCTTCCCATGGTCAACCCAGACGACGTAGTATTTGGA
GGATGGGACATTAGCAACATGAATTTGGCAGATGCCATGGTCAGGGCTAAGGTTTTCGAA
GTTGATCTGCAAAAGCAGCTGAGGCCCTACATGGAATCCATGGTTCCTCTTCCTGGTATC
TATGACCCTGACTTCATTGCTGCTAACCAAGAAGCACGTGCCAACAACGTGATCAAAGGA
ACCAAGAAAGAACAAGTTGATCAAATTGTTAAAGATATTAGGGAGTTCAAGGAGAAGAAC
AAGGTAGACAAGATAGTGGTTCTATGGACTGCCAACACCGAAAGGTACAGCAATGTGGTT
GTTGGCCTTAACGATACCATGGAAAACCTTTTAGCTGCTGTGGATAGAAATGAGGCTGAA
ATATCTCCTTCTACATTGCATGCTATTGCTTGTATTCTGGAAAATGTGCCTTTCATCAAC
GGAAGCCCTCAAAACACTTTTGTTCCAGGTCTTATTGATTTGGCCATAAAGAGAAACACT
TTAATTGGTGGTGATGACTTTAAGAGTGGTCAAACCAAGATGAAGTCCGTGTTGGTTGAT
TTCCTTGTTGGAGCTGGTATTAAGCCAACGTCAATAGTGAGCTACAATCACTTGGGTAAC
AATGACGGAATGAATCTTTCTGCTCCTCAAACCTTCCGGTCTAAGGAGATCTCAAAAAGT
AATGTTGTTGATGACATGGTTGCTAGCAACTCCATTCTCTATGAATCTGGCGAGCACCCT
GACCATGTTGTTGTGATCAAGTATGTTCCATATGTTGGAGACAGCAAGAGGGCAATGGAT
GAGTACATGTCAGAGATTTTCATGGGCGGAAAGAGCACCATAGTTATGCACAACACTTGT
GAGGACTCTCTTTTGGCAGCTCCAATTATCTTGGACTTGGTCCTTCTCGCTGAACTCAGC
ACTCGCATTCAGCTCAAAGCTGAAGGGGAGGGGAAGTTCCACTCCTTCCACCCTGTGGCT
ACTATTCTCAGCTACCTCACCAAGGCTCCCCTGGTACCACCAGGTACTCCAGTGGTGAAT
GCCCTTTCAAAACAGAGGGCAATGCTTGAGAACATAATGAGAGCTTGTGTTGGTTTGGCA
CCAGAGAACAACATGATTTTGGAATACAAATGA