Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400055884
CDS Infomation

pacid=37425380 polypeptide=PGSC0003DMP400037634 locus=PGSC0003DMG400021709 ID=PGSC0003DMT400055884.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTTTCTATGGCTACAATGGTGATGCTGGTGAGTACCATTGGACTCCTAATTTCAAT
GTCTCTTATGATTATGATGCTTTTCCAATATCATATTCTTCCTATGAGCAAAGTACTAAT
TACAATTACTACTATACTACTCAAATACATCCAGAATTGAGTTACTCTGTACACAACTCT
GTTGAGCCAAAACTAATCCAGTATGAAATTGGTCCTAATTCATTGGAAACAAGAACCATA
GTTTCTTGTTATACCAAAGAACAGGATGACACTCAGTTTGATGAATATGATCCAACCCCT
TATGGTGGTGGTTTTGATATGGCTCAAATCTATGGAAAACCCCTTCCTCCCTCAAATGAA
ATATGTCATCCTCCTTCGAGTCCCAAGTCTAATGGACTTCCATTACATGGTTTCGACTAT
GGATCAAATAATTCGCCCTATGTAAGCCACACCAATCAGCTAGAACAACCTCAAATTCAA
AACAAAGAGAATGGTGTTAAAGATGAGCAAAAATCTTTATCTGGTGTGAAAGAAAAAACC
AGTCTTGAAAAACCTGCTCAACAAGATGAAGATTTTGTAGTTGGTAATGGAAAAACAGGG
GAAAAACCCATTCTTGAAAAACCAGTAGAACCCCTTCAACAAGATGAAGATTTTGTAGTT
GGAAATGGGAGTATAGGGGAATATGGATATGATTATGGGAGGCAATTGCAACAAATTCCA
TATGGTTCAGGTTTGGAATCTATGGATTTATGTGAAAGCTTATTTGGTTACTGGCCTTGC
ATAGCTAAGGAAAACAAGAGAAGAAATTGTAACTGTGTAAATGTTGCTGAAGATAACAGC
AGTAGCAGCAATGAACAATGGAAATGTACTGCAGATTATCTTTTTGGGAATCCTTATGGA
TATGGTGGTGATGGAAGAGATTGGGATTGTGTTTATAACAATCAAAGTTACTATTATCAT
CAGCAACAACTTTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400037634
PEP Infomation

pacid=37425380 transcript=PGSC0003DMT400055884 locus=PGSC0003DMG400021709 ID=PGSC0003DMT400055884.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MAFYGYNGDAGEYHWTPNFNVSYDYDAFPISYSSYEQSTNYNYYYTTQIHPELSYSVHNS
VEPKLIQYEIGPNSLETRTIVSCYTKEQDDTQFDEYDPTPYGGGFDMAQIYGKPLPPSNE
ICHPPSSPKSNGLPLHGFDYGSNNSPYVSHTNQLEQPQIQNKENGVKDEQKSLSGVKEKT
SLEKPAQQDEDFVVGNGKTGEKPILEKPVEPLQQDEDFVVGNGSIGEYGYDYGRQLQQIP
YGSGLESMDLCESLFGYWPCIAKENKRRNCNCVNVAEDNSSSSNEQWKCTADYLFGNPYG
YGGDGRDWDCVYNNQSYYYHQQQL*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400055884
Transcript Infomation

pacid=37425380 locus=PGSC0003DMG400021709 ID=PGSC0003DMT400055884.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTTTCTATGGCTACAATGGTGATGCTGGTGAGTACCATTGGACTCCTAATTTCAAT
GTCTCTTATGATTATGATGCTTTTCCAATATCATATTCTTCCTATGAGCAAAGTACTAAT
TACAATTACTACTATACTACTCAAATACATCCAGAATTGAGTTACTCTGTACACAACTCT
GTTGAGCCAAAACTAATCCAGTATGAAATTGGTCCTAATTCATTGGAAACAAGAACCATA
GTTTCTTGTTATACCAAAGAACAGGATGACACTCAGTTTGATGAATATGATCCAACCCCT
TATGGTGGTGGTTTTGATATGGCTCAAATCTATGGAAAACCCCTTCCTCCCTCAAATGAA
ATATGTCATCCTCCTTCGAGTCCCAAGTCTAATGGACTTCCATTACATGGTTTCGACTAT
GGATCAAATAATTCGCCCTATGTAAGCCACACCAATCAGCTAGAACAACCTCAAATTCAA
AACAAAGAGAATGGTGTTAAAGATGAGCAAAAATCTTTATCTGGTGTGAAAGAAAAAACC
AGTCTTGAAAAACCTGCTCAACAAGATGAAGATTTTGTAGTTGGTAATGGAAAAACAGGG
GAAAAACCCATTCTTGAAAAACCAGTAGAACCCCTTCAACAAGATGAAGATTTTGTAGTT
GGAAATGGGAGTATAGGGGAATATGGATATGATTATGGGAGGCAATTGCAACAAATTCCA
TATGGTTCAGGTTTGGAATCTATGGATTTATGTGAAAGCTTATTTGGTTACTGGCCTTGC
ATAGCTAAGGAAAACAAGAGAAGAAATTGTAACTGTGTAAATGTTGCTGAAGATAACAGC
AGTAGCAGCAATGAACAATGGAAATGTACTGCAGATTATCTTTTTGGGAATCCTTATGGA
TATGGTGGTGATGGAAGAGATTGGGATTGTGTTTATAACAATCAAAGTTACTATTATCAT
CAGCAACAACTTTAA