Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400055671
CDS Infomation

pacid=37458080 polypeptide=PGSC0003DMP400037484 locus=PGSC0003DMG402021616 ID=PGSC0003DMT400055671.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAAAAAGGCCTTGGGTCAAACTGTGAGGGACCTCAAGCGAGGGGTGAACAAAAATGTT
CTAAAGGTCCCTTCGCTGGAGCAAAAAGTGCTTGATGCAACTAGCAATGAGCCCTGGGGT
GCTCATGGATCACTTCTTGCAGATATTGCTCAAGCTTCAAGAAACTATCATGAGTACCAA
ATGATTATGGCTTTAATTTGGAAGCGTGTCAATGATACTGGAAAAAATTGGCGGCATGTT
TACAAGGCTTTAGTTGTTTTGGATTACTTAGTAGCCAGTGGGTCGGAGCGTGTCATAGAT
GAAATAAGGGAACATTCATATCAAATATCTATGTTATCTGATTTTCAATACATCGACTCT
AGTGGAAAAGATCAGGGAAGCTATGTTAGAAAGAAATCTCAGAGTCTTGTTGTTCTTGTC
AATGATAAGGAGAGGATACAAGAAGTCCGCCGAAAGGCAGCTACCAACAGGGACAAATTC
CACAACACATCAAGGGGTGATATGCATCGACCTGGTTCATATTCAAGTTCAGGAGGGTAT
GGTGACAGATATGAAGAGGAACGTTATAGAGGCAGAGATGAAGAGAGAAATGGACATGGG
AGAGAAAAAGAATGGGGTTATAGAGATGAGGAGAAATATGGTAGGTATGGTAATTCATAC
AGTCATGATGGGGATCGCTATGGTAGAGGTTATGATGACCGTAGCCAAGATGAAAACAGA
GATGATGATCATCGTGGAAGAAGTCAGAGTGTAGATGACTACAGTAATGACTCAAGAAGT
ACAAGCTATGACAACAGGGATCGTGCTTATGATGATGATGGTCAATGCTCTCCTAGAGAA
AGCGGTGCAAGGGCTGAGGATCGCTCTCAAGATGGAAGTGTTAACGGTATGCAACATGAG
AGAAGGTTTTCTGAACAAAACCTCGATATACCTCCCAGTTATGAGGAATCTATTGGTGCA
TCACAAAGCCCCACACATAGTGAGAGGAATGTGGAAACAACTTCAACATCTGCTCCTAAA
GCTTCCTCACCTCATGCGATTGAAAGTCCAAACAAGGAAGCCACCCCTGCCGTTGCACCA
GTTGCTGCTTCATTGTCCACTCCACTTTCAGCTACTACTCCACCAGAGAACAAGGATATT
GAGAGCTTTGATGAATTTGATCCTCGAGCTTCTTTTTCAGTGGCAAGGGCTCAATCAAAC
AATCCTATTCCAACTACTTCCATTGGCACTGAAGTGGATTTACTTGGCTCCTTATCTGAG
CCATTTTCTTCTAATTCATTAGTCCTTGCATCAACAACTACAACCACGTCTGAGATGTTT
GAGGACCCTTTTGGTGATGGTCCTTTCAAAGCCGTACCAACCTCAGACACAGTTCAAAAT
CAGCCGCAGAACATTTCTCCTCCATCTTTCCCTCCTAATTCAAATCTAAGTCCTGAACTG
TGTGCTGAGATTCCGAGTATAACATATGCAGCACCCAATTATGCTCATCAGGAGCTGTCC
ACATCAAACCATGATATTGATATATTGGCTGATATTCTCCCTCCCTCTGCTCCTTCACCT
TCTCTGCATCCCTCTAGTGACCATACAATTTCAAGTGTCCCATTTACAGCACAAACAGGT
TTTCCATCTTACAGTGGGCTAACTGTACAACCAACAGGTTATACAACTACCCATGTTCAG
GGTGCTTCACCAACAGGTTTTGCAGTTCAACCTGGTTTACAGTTACCACAGACTAGCTTT
CCTATTCACGGGCAACCTTTCTCTCAGATTGGGTTTACTGGTCAAATGAGCAATTCACCG
TACTTTTGTGGTTATTCAGTTCAACATGGCCAAAAACCACAGACAAGTTTTGGTCCGCAA
AGTGGTCAATTTGCACCTCTTAATGGCTTCCCATTTGCATCGGGTTCCTTTCCACATCCT
GAAAGTCAGGTAGCTGCTGGTCAGTCTCTGCAGAGCAATGTTAACTTTGGAGGTTACAAC
ACAGGATTGGGAGATACAAGTGCAGTTAGAATGCAAATGGGTCAAAGTCCTGCTGGACCA
TCTTTCCTTACACAGGCAGCTACTGCATCCCGTATGCCTTCACAAAATCAAATAAATAAT
GTGTCAATGTCCCCACTCTCTACTCCAGTTTCAACAGCTCTCGTCATCGGCAACCAACCA
GCCAAAGACAAATTTGAGACAAAATCTACCGTGTGGGCGGATACACTGAGTCGTGGATTG
GTCAATTTGAACATTTCTGGATCTAAGACAAATCCTTTAGCTGATATTGGAGTTGATTTT
GATGCTATTAACCGCAAGGAGAAGAGGATGGAGAAACCTAGTATAACCCCTGTGACATCA
ACTGTTACAATGGGTAAAGCAATGGGTTCTGGTTCTGGTATTGGCCGTGCTGGTGCAGGT
GCTCTAAGGCCTTTGTCAAATCCAATGGCAGGGGTTGGCATGGGCATGGGTGTTGGTGCT
CCTGGAGTATATGGAGTAAGCCAGCCTATGGGCATGGGGATGGCTAGACCAATGCCTATG
GGAATGAGCATGAACATGAACATGGGGCAAGGAGTACAAATGCAACAATCAACTGGTGGA
TCTATTATGCCAGGAGGCTACAATCCCATGATGGGCACAGGTAACTATGGCCAACAATCA
TTCGGTGGTGGATACCAATAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400037484
PEP Infomation

pacid=37458080 transcript=PGSC0003DMT400055671 locus=PGSC0003DMG402021616 ID=PGSC0003DMT400055671.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MKKALGQTVRDLKRGVNKNVLKVPSLEQKVLDATSNEPWGAHGSLLADIAQASRNYHEYQ
MIMALIWKRVNDTGKNWRHVYKALVVLDYLVASGSERVIDEIREHSYQISMLSDFQYIDS
SGKDQGSYVRKKSQSLVVLVNDKERIQEVRRKAATNRDKFHNTSRGDMHRPGSYSSSGGY
GDRYEEERYRGRDEERNGHGREKEWGYRDEEKYGRYGNSYSHDGDRYGRGYDDRSQDENR
DDDHRGRSQSVDDYSNDSRSTSYDNRDRAYDDDGQCSPRESGARAEDRSQDGSVNGMQHE
RRFSEQNLDIPPSYEESIGASQSPTHSERNVETTSTSAPKASSPHAIESPNKEATPAVAP
VAASLSTPLSATTPPENKDIESFDEFDPRASFSVARAQSNNPIPTTSIGTEVDLLGSLSE
PFSSNSLVLASTTTTTSEMFEDPFGDGPFKAVPTSDTVQNQPQNISPPSFPPNSNLSPEL
CAEIPSITYAAPNYAHQELSTSNHDIDILADILPPSAPSPSLHPSSDHTISSVPFTAQTG
FPSYSGLTVQPTGYTTTHVQGASPTGFAVQPGLQLPQTSFPIHGQPFSQIGFTGQMSNSP
YFCGYSVQHGQKPQTSFGPQSGQFAPLNGFPFASGSFPHPESQVAAGQSLQSNVNFGGYN
TGLGDTSAVRMQMGQSPAGPSFLTQAATASRMPSQNQINNVSMSPLSTPVSTALVIGNQP
AKDKFETKSTVWADTLSRGLVNLNISGSKTNPLADIGVDFDAINRKEKRMEKPSITPVTS
TVTMGKAMGSGSGIGRAGAGALRPLSNPMAGVGMGMGVGAPGVYGVSQPMGMGMARPMPM
GMSMNMNMGQGVQMQQSTGGSIMPGGYNPMMGTGNYGQQSFGGGYQ*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400055671
Transcript Infomation

pacid=37458080 locus=PGSC0003DMG402021616 ID=PGSC0003DMT400055671.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAAAAAGGCCTTGGGTCAAACTGTGAGGGACCTCAAGCGAGGGGTGAACAAAAATGTT
CTAAAGGTCCCTTCGCTGGAGCAAAAAGTGCTTGATGCAACTAGCAATGAGCCCTGGGGT
GCTCATGGATCACTTCTTGCAGATATTGCTCAAGCTTCAAGAAACTATCATGAGTACCAA
ATGATTATGGCTTTAATTTGGAAGCGTGTCAATGATACTGGAAAAAATTGGCGGCATGTT
TACAAGGCTTTAGTTGTTTTGGATTACTTAGTAGCCAGTGGGTCGGAGCGTGTCATAGAT
GAAATAAGGGAACATTCATATCAAATATCTATGTTATCTGATTTTCAATACATCGACTCT
AGTGGAAAAGATCAGGGAAGCTATGTTAGAAAGAAATCTCAGAGTCTTGTTGTTCTTGTC
AATGATAAGGAGAGGATACAAGAAGTCCGCCGAAAGGCAGCTACCAACAGGGACAAATTC
CACAACACATCAAGGGGTGATATGCATCGACCTGGTTCATATTCAAGTTCAGGAGGGTAT
GGTGACAGATATGAAGAGGAACGTTATAGAGGCAGAGATGAAGAGAGAAATGGACATGGG
AGAGAAAAAGAATGGGGTTATAGAGATGAGGAGAAATATGGTAGGTATGGTAATTCATAC
AGTCATGATGGGGATCGCTATGGTAGAGGTTATGATGACCGTAGCCAAGATGAAAACAGA
GATGATGATCATCGTGGAAGAAGTCAGAGTGTAGATGACTACAGTAATGACTCAAGAAGT
ACAAGCTATGACAACAGGGATCGTGCTTATGATGATGATGGTCAATGCTCTCCTAGAGAA
AGCGGTGCAAGGGCTGAGGATCGCTCTCAAGATGGAAGTGTTAACGGTATGCAACATGAG
AGAAGGTTTTCTGAACAAAACCTCGATATACCTCCCAGTTATGAGGAATCTATTGGTGCA
TCACAAAGCCCCACACATAGTGAGAGGAATGTGGAAACAACTTCAACATCTGCTCCTAAA
GCTTCCTCACCTCATGCGATTGAAAGTCCAAACAAGGAAGCCACCCCTGCCGTTGCACCA
GTTGCTGCTTCATTGTCCACTCCACTTTCAGCTACTACTCCACCAGAGAACAAGGATATT
GAGAGCTTTGATGAATTTGATCCTCGAGCTTCTTTTTCAGTGGCAAGGGCTCAATCAAAC
AATCCTATTCCAACTACTTCCATTGGCACTGAAGTGGATTTACTTGGCTCCTTATCTGAG
CCATTTTCTTCTAATTCATTAGTCCTTGCATCAACAACTACAACCACGTCTGAGATGTTT
GAGGACCCTTTTGGTGATGGTCCTTTCAAAGCCGTACCAACCTCAGACACAGTTCAAAAT
CAGCCGCAGAACATTTCTCCTCCATCTTTCCCTCCTAATTCAAATCTAAGTCCTGAACTG
TGTGCTGAGATTCCGAGTATAACATATGCAGCACCCAATTATGCTCATCAGGAGCTGTCC
ACATCAAACCATGATATTGATATATTGGCTGATATTCTCCCTCCCTCTGCTCCTTCACCT
TCTCTGCATCCCTCTAGTGACCATACAATTTCAAGTGTCCCATTTACAGCACAAACAGGT
TTTCCATCTTACAGTGGGCTAACTGTACAACCAACAGGTTATACAACTACCCATGTTCAG
GGTGCTTCACCAACAGGTTTTGCAGTTCAACCTGGTTTACAGTTACCACAGACTAGCTTT
CCTATTCACGGGCAACCTTTCTCTCAGATTGGGTTTACTGGTCAAATGAGCAATTCACCG
TACTTTTGTGGTTATTCAGTTCAACATGGCCAAAAACCACAGACAAGTTTTGGTCCGCAA
AGTGGTCAATTTGCACCTCTTAATGGCTTCCCATTTGCATCGGGTTCCTTTCCACATCCT
GAAAGTCAGGTAGCTGCTGGTCAGTCTCTGCAGAGCAATGTTAACTTTGGAGGTTACAAC
ACAGGATTGGGAGATACAAGTGCAGTTAGAATGCAAATGGGTCAAAGTCCTGCTGGACCA
TCTTTCCTTACACAGGCAGCTACTGCATCCCGTATGCCTTCACAAAATCAAATAAATAAT
GTGTCAATGTCCCCACTCTCTACTCCAGTTTCAACAGCTCTCGTCATCGGCAACCAACCA
GCCAAAGACAAATTTGAGACAAAATCTACCGTGTGGGCGGATACACTGAGTCGTGGATTG
GTCAATTTGAACATTTCTGGATCTAAGACAAATCCTTTAGCTGATATTGGAGTTGATTTT
GATGCTATTAACCGCAAGGAGAAGAGGATGGAGAAACCTAGTATAACCCCTGTGACATCA
ACTGTTACAATGGGTAAAGCAATGGGTTCTGGTTCTGGTATTGGCCGTGCTGGTGCAGGT
GCTCTAAGGCCTTTGTCAAATCCAATGGCAGGGGTTGGCATGGGCATGGGTGTTGGTGCT
CCTGGAGTATATGGAGTAAGCCAGCCTATGGGCATGGGGATGGCTAGACCAATGCCTATG
GGAATGAGCATGAACATGAACATGGGGCAAGGAGTACAAATGCAACAATCAACTGGTGGA
TCTATTATGCCAGGAGGCTACAATCCCATGATGGGCACAGGTAACTATGGCCAACAATCA
TTCGGTGGTGGATACCAATAA