Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400055629
CDS Infomation

pacid=37456909 polypeptide=PGSC0003DMP400037450 locus=PGSC0003DMG400021602 ID=PGSC0003DMT400055629.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAGATGAGGATGAGGATGATTTTGTGTTTGTTGGTAATAATTTCGATAATTGGATGT
GTTCATGGAGATGAGAATGAGTCATTCAGGAAGCAACCCACAAAAGTGAAGACGGTGAAG
GGTACCAAGATGTGCGTCAAGGATTGGGAGTGTAACAAATTGTCTAAATTTTGTTGTAAT
TTGACAATAACTGATTATCTCGACACTGACCAATTTGAGCTCCTTTTCACTAAGAGGAAC
TCACCCGTAGCTCATGCTGTTGGATTCTGGGATTATGGATCTTTCATTAGGGCTACAGCA
CTTTACCAGCCGCTTGGATTTGGTACCACCGGTGGTAAGAAAATGCAGATGAAGGAGATT
GCTGCTTTCCTTGGACATGTCGGTAGCAAAACTTCTTGTGGTTATGGAGTCGCCACTGGC
GGACCACTCGCTTATGGTCTATGCTATAACAAGGAAATGAGTCCCAGCCAAGATTACTGT
GATGACTACTTCAAATTAACCTACCCATGCACTCCTGGAGCCAGATATTACGGTCGTGGT
GCCTTGCCTATCTACTGGAACTACAATTATGGAGCTATTGGTGAAGCCCTCAAGCTTAAT
CTGTTGGATCATCCCGAATACATTGAACAAAATGCTACCATGGCTTTCCAGGCTGCAATT
TGGAGGTGGATGAACCCAATGAAGAAGGGTCAGCCTTCAGCTCATGATGCCTTTGTTGGC
AACTGGAAGCCCACAAAAAATGATACTTTGTCTAAACGACTTCCTGGTTTTGGTACCACC
ATGAATATTCTCTATGGTGATGCTGTTTGTGGCCAAGGTGATGTTGACTCAATGAACAAC
ATCATCTCCCATTACCAGTACTACCTTGACTTGATGGGTGTTGGTCGCGAGGAAGCAGGG
CCTCACGAAGTACTCAACTGCGCAGAGCAAAAACCTTTTAACCCAACCGCCGCCCCTGCT
GCTGCTTCTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400037450
PEP Infomation

pacid=37456909 transcript=PGSC0003DMT400055629 locus=PGSC0003DMG400021602 ID=PGSC0003DMT400055629.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MEMRMRMILCLLVIISIIGCVHGDENESFRKQPTKVKTVKGTKMCVKDWECNKLSKFCCN
LTITDYLDTDQFELLFTKRNSPVAHAVGFWDYGSFIRATALYQPLGFGTTGGKKMQMKEI
AAFLGHVGSKTSCGYGVATGGPLAYGLCYNKEMSPSQDYCDDYFKLTYPCTPGARYYGRG
ALPIYWNYNYGAIGEALKLNLLDHPEYIEQNATMAFQAAIWRWMNPMKKGQPSAHDAFVG
NWKPTKNDTLSKRLPGFGTTMNILYGDAVCGQGDVDSMNNIISHYQYYLDLMGVGREEAG
PHEVLNCAEQKPFNPTAAPAAAS*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400055629
Transcript Infomation

pacid=37456909 locus=PGSC0003DMG400021602 ID=PGSC0003DMT400055629.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAGATGAGGATGAGGATGATTTTGTGTTTGTTGGTAATAATTTCGATAATTGGATGT
GTTCATGGAGATGAGAATGAGTCATTCAGGAAGCAACCCACAAAAGTGAAGACGGTGAAG
GGTACCAAGATGTGCGTCAAGGATTGGGAGTGTAACAAATTGTCTAAATTTTGTTGTAAT
TTGACAATAACTGATTATCTCGACACTGACCAATTTGAGCTCCTTTTCACTAAGAGGAAC
TCACCCGTAGCTCATGCTGTTGGATTCTGGGATTATGGATCTTTCATTAGGGCTACAGCA
CTTTACCAGCCGCTTGGATTTGGTACCACCGGTGGTAAGAAAATGCAGATGAAGGAGATT
GCTGCTTTCCTTGGACATGTCGGTAGCAAAACTTCTTGTGGTTATGGAGTCGCCACTGGC
GGACCACTCGCTTATGGTCTATGCTATAACAAGGAAATGAGTCCCAGCCAAGATTACTGT
GATGACTACTTCAAATTAACCTACCCATGCACTCCTGGAGCCAGATATTACGGTCGTGGT
GCCTTGCCTATCTACTGGAACTACAATTATGGAGCTATTGGTGAAGCCCTCAAGCTTAAT
CTGTTGGATCATCCCGAATACATTGAACAAAATGCTACCATGGCTTTCCAGGCTGCAATT
TGGAGGTGGATGAACCCAATGAAGAAGGGTCAGCCTTCAGCTCATGATGCCTTTGTTGGC
AACTGGAAGCCCACAAAAAATGATACTTTGTCTAAACGACTTCCTGGTTTTGGTACCACC
ATGAATATTCTCTATGGTGATGCTGTTTGTGGCCAAGGTGATGTTGACTCAATGAACAAC
ATCATCTCCCATTACCAGTACTACCTTGACTTGATGGGTGTTGGTCGCGAGGAAGCAGGG
CCTCACGAAGTACTCAACTGCGCAGAGCAAAAACCTTTTAACCCAACCGCCGCCCCTGCT
GCTGCTTCTTGA