Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400055488
CDS Infomation

pacid=37455128 polypeptide=PGSC0003DMP400037349 locus=PGSC0003DMG401021549 ID=PGSC0003DMT400055488.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCATCAATTGCACAAAATGGACATGTTAATGGAGAAGTTGTAGCCATGGAATTATGC
AAGAAATCAATTAATGTTGATGATCCATTGAATTGGGAAATGGCTGCTGATTCTTTAAGA
GGGAGTCATTTGGATGAAGTGAAAAAGATGGTGGCTGAATTTAGAAAGCCAATTGTGAAA
CTTGGGGGTGAAACTTTGACAGTTGCACAAGTTGCATCCATTGCAAATGCTGATAACAAA
AGTAATGGGGTCAAAGTGGAACTTTCTGAAAGTGCAAGGGCTGGTGTGAAAGCTAGTAGT
GATTGGGTTATGGATAGTATGAGTAAAGGTACAGATAGTTATGGTGTTACTACTGGATTT
GGTGCAACATCTCATAGAAGAACAAAAAATGGTGGTGCCCTTCAAAAGGAACTTATTAGG
TTCTTGAATGCCGGAGTTTTTGGGAATGGAACAGAATCATCTCACACTTTGCCACATTCA
GCAACAAGGGCAGCTATGCTTGTTAGGATCAATACTCTGCTTCAAGGCTACTCTGGCATT
AGATTTGAAATCTTGGAAGCAATTACTAAGTTGATCAACAGCAACATCACCCCGTGTTTG
CCCCTCCGTGGCACGATCACTGCCTCGGGTGATCTTGTCCCTCTGTCCTACATTGCTGGT
TTGCTCACTGGCAGGCCTAACTCCAAGGCTGTTGGACCAAATGGTGAGAAACTTAATGCT
GAGGAAGCGTTCTGCGCGGCTGGTGTTAGTGGTGGATTTTTCGAGTTGCAGCCTAAAGAA
GGACTTGCACTTGTGAATGGCACAGCAGTTGGTTCTGGTATGGCATCAATGGTCCTGTTT
GATTCCAACATTCTTGCTGTTATGTCTGAAGTTTTATCAGCGATTTTCGCTGAAGTGATG
AACGGAAAGCCCGAATTCACTGACTATTTGACACACAAGTTGAAGCATCACCCTGGTCAG
ATTGAGGCTGCTGCTATTATGGAACACATTTTGGATGGCAGCTCTTATGTCAAGGAAGCT
CAGAAGCTCCATGAAATGGATCCTCTTCAAAAACCAAAGCAAGATCGTTATGCTCTCCGA
ACATCTCCACAATGGCTTGGCCCTCAAATTGAAGTCATCCGTGCTGCAACTAAGATGATT
GAGAGGGAGATTAACTCAGTGAACGACAATCCATTGATCGATGTTTCAAGAAACAAGGCC
TTACATGGTGGCAACTTCCAAGGAACCCCTATTGGTGTCTCCATGGATAATACAAGATTG
GCCCTTGCATCAATTGGGAAATTGATGTTTGCCCAATTCTCGGAGCTTGTCAACGACTAT
TACAACAATGGATTGCCATCTAATCTCACAGCAGGAAGGAATCCAAGCTTGGACTATGGT
TTCAAAGGAGCTGAAATTGCGATGGCTTCTTACTGCTCGGAGCTTCAATTCTTGGCAAAT
CCAGTGACTAACCATGTCCAAAGTGCTGAGCAACACAACCAAGATGTGAATTCCTTAGGC
TTAATCTCAGCAAGGAAAACTGCTGAGGCTGTGGACATCTTGAAGCTAATGTCATCAACC
TATCTCGTGGCGCTTTGCCAGGCTATCGACTTGAGGCATTTGGAGGAGAACTTGAAGAAT
GCTGTCAAGAACACCGTAAGCCAAGTAGCCAAAAAGACTTTGACAATGGGTGCTAATGGT
GAACTTCATCCAGCAAGATTCTGTGAAAAGGAATTGCTACAAGTTGTGGAAAGGGAATAC
TTGTTTACCTATGCTGATGACCCCTGCAGCTGCACCTACCCTTTGATGCAGAAGCTGAGA
CAAGTCCTTGTTGATCATGCAATGAAGAATGGTGAAAGTGAGTCGAATGTGAACAGCTCA
ATCTTCCAAAAGATTGTAGCTTTCGAGGACGAATTGAAGGCTGTGTTGCCTAAAGAAGTT
GAGAGTGCAAGAGTTGTTCTTGAAAGTGGCAACCCTGTAATTCCTAACAGGATAACAGAA
TGCAGATCATATCCATTATACAGGTTTGTAAGGAAAGAACTTGGAACAGAAGTGTTGACA
GGTGAAAAAATTCGATCTCCCGGTGAGGAGATTGATAAGGTATTCACAGCATTTTGCAAT
GGACAAATCATTGATCCATTGTTGGAATGTCTCAAGAGCTGGAATGGTGCTCCTCTTCCA
ATTTGCTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400037349
PEP Infomation

pacid=37455128 transcript=PGSC0003DMT400055488 locus=PGSC0003DMG401021549 ID=PGSC0003DMT400055488.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MASIAQNGHVNGEVVAMELCKKSINVDDPLNWEMAADSLRGSHLDEVKKMVAEFRKPIVK
LGGETLTVAQVASIANADNKSNGVKVELSESARAGVKASSDWVMDSMSKGTDSYGVTTGF
GATSHRRTKNGGALQKELIRFLNAGVFGNGTESSHTLPHSATRAAMLVRINTLLQGYSGI
RFEILEAITKLINSNITPCLPLRGTITASGDLVPLSYIAGLLTGRPNSKAVGPNGEKLNA
EEAFCAAGVSGGFFELQPKEGLALVNGTAVGSGMASMVLFDSNILAVMSEVLSAIFAEVM
NGKPEFTDYLTHKLKHHPGQIEAAAIMEHILDGSSYVKEAQKLHEMDPLQKPKQDRYALR
TSPQWLGPQIEVIRAATKMIEREINSVNDNPLIDVSRNKALHGGNFQGTPIGVSMDNTRL
ALASIGKLMFAQFSELVNDYYNNGLPSNLTAGRNPSLDYGFKGAEIAMASYCSELQFLAN
PVTNHVQSAEQHNQDVNSLGLISARKTAEAVDILKLMSSTYLVALCQAIDLRHLEENLKN
AVKNTVSQVAKKTLTMGANGELHPARFCEKELLQVVEREYLFTYADDPCSCTYPLMQKLR
QVLVDHAMKNGESESNVNSSIFQKIVAFEDELKAVLPKEVESARVVLESGNPVIPNRITE
CRSYPLYRFVRKELGTEVLTGEKIRSPGEEIDKVFTAFCNGQIIDPLLECLKSWNGAPLP
IC*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400055488
Transcript Infomation

pacid=37455128 locus=PGSC0003DMG401021549 ID=PGSC0003DMT400055488.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCATCAATTGCACAAAATGGACATGTTAATGGAGAAGTTGTAGCCATGGAATTATGC
AAGAAATCAATTAATGTTGATGATCCATTGAATTGGGAAATGGCTGCTGATTCTTTAAGA
GGGAGTCATTTGGATGAAGTGAAAAAGATGGTGGCTGAATTTAGAAAGCCAATTGTGAAA
CTTGGGGGTGAAACTTTGACAGTTGCACAAGTTGCATCCATTGCAAATGCTGATAACAAA
AGTAATGGGGTCAAAGTGGAACTTTCTGAAAGTGCAAGGGCTGGTGTGAAAGCTAGTAGT
GATTGGGTTATGGATAGTATGAGTAAAGGTACAGATAGTTATGGTGTTACTACTGGATTT
GGTGCAACATCTCATAGAAGAACAAAAAATGGTGGTGCCCTTCAAAAGGAACTTATTAGG
TTCTTGAATGCCGGAGTTTTTGGGAATGGAACAGAATCATCTCACACTTTGCCACATTCA
GCAACAAGGGCAGCTATGCTTGTTAGGATCAATACTCTGCTTCAAGGCTACTCTGGCATT
AGATTTGAAATCTTGGAAGCAATTACTAAGTTGATCAACAGCAACATCACCCCGTGTTTG
CCCCTCCGTGGCACGATCACTGCCTCGGGTGATCTTGTCCCTCTGTCCTACATTGCTGGT
TTGCTCACTGGCAGGCCTAACTCCAAGGCTGTTGGACCAAATGGTGAGAAACTTAATGCT
GAGGAAGCGTTCTGCGCGGCTGGTGTTAGTGGTGGATTTTTCGAGTTGCAGCCTAAAGAA
GGACTTGCACTTGTGAATGGCACAGCAGTTGGTTCTGGTATGGCATCAATGGTCCTGTTT
GATTCCAACATTCTTGCTGTTATGTCTGAAGTTTTATCAGCGATTTTCGCTGAAGTGATG
AACGGAAAGCCCGAATTCACTGACTATTTGACACACAAGTTGAAGCATCACCCTGGTCAG
ATTGAGGCTGCTGCTATTATGGAACACATTTTGGATGGCAGCTCTTATGTCAAGGAAGCT
CAGAAGCTCCATGAAATGGATCCTCTTCAAAAACCAAAGCAAGATCGTTATGCTCTCCGA
ACATCTCCACAATGGCTTGGCCCTCAAATTGAAGTCATCCGTGCTGCAACTAAGATGATT
GAGAGGGAGATTAACTCAGTGAACGACAATCCATTGATCGATGTTTCAAGAAACAAGGCC
TTACATGGTGGCAACTTCCAAGGAACCCCTATTGGTGTCTCCATGGATAATACAAGATTG
GCCCTTGCATCAATTGGGAAATTGATGTTTGCCCAATTCTCGGAGCTTGTCAACGACTAT
TACAACAATGGATTGCCATCTAATCTCACAGCAGGAAGGAATCCAAGCTTGGACTATGGT
TTCAAAGGAGCTGAAATTGCGATGGCTTCTTACTGCTCGGAGCTTCAATTCTTGGCAAAT
CCAGTGACTAACCATGTCCAAAGTGCTGAGCAACACAACCAAGATGTGAATTCCTTAGGC
TTAATCTCAGCAAGGAAAACTGCTGAGGCTGTGGACATCTTGAAGCTAATGTCATCAACC
TATCTCGTGGCGCTTTGCCAGGCTATCGACTTGAGGCATTTGGAGGAGAACTTGAAGAAT
GCTGTCAAGAACACCGTAAGCCAAGTAGCCAAAAAGACTTTGACAATGGGTGCTAATGGT
GAACTTCATCCAGCAAGATTCTGTGAAAAGGAATTGCTACAAGTTGTGGAAAGGGAATAC
TTGTTTACCTATGCTGATGACCCCTGCAGCTGCACCTACCCTTTGATGCAGAAGCTGAGA
CAAGTCCTTGTTGATCATGCAATGAAGAATGGTGAAAGTGAGTCGAATGTGAACAGCTCA
ATCTTCCAAAAGATTGTAGCTTTCGAGGACGAATTGAAGGCTGTGTTGCCTAAAGAAGTT
GAGAGTGCAAGAGTTGTTCTTGAAAGTGGCAACCCTGTAATTCCTAACAGGATAACAGAA
TGCAGATCATATCCATTATACAGGTTTGTAAGGAAAGAACTTGGAACAGAAGTGTTGACA
GGTGAAAAAATTCGATCTCCCGGTGAGGAGATTGATAAGGTATTCACAGCATTTTGCAAT
GGACAAATCATTGATCCATTGTTGGAATGTCTCAAGAGCTGGAATGGTGCTCCTCTTCCA
ATTTGCTAG