Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400054636
CDS Infomation

pacid=37424794 polypeptide=PGSC0003DMP400036756 locus=PGSC0003DMG400021203 ID=PGSC0003DMT400054636.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTTGTTTCAAAGCAAGAACATCTGTTCAATCTTCAGAAGGAGTATCTCAGTCGCTGCG
GCATTTTCCTCAAAACCCAATTCCCCTTTCTTCCAAGATTCAGCTTTTCACAACACAGAA
CAAGTTTTAGCATCGAAACTAGCTCCAATTCTGCAATCTTGCACAAATTCTACAGAAAAT
CTTGGTTCTGTTCTTCGTAAAGGGGAGCAGGTTCATGCCCAAGTAACTGTAAATGGAATC
GACAACTTGGGTATTCTTGGTACAAGAATCTTGGGGATGTATGTTTTGTGTAACAGGTTT
ATCGATGCCAAGAAATTGTTTTTTCAGCTTCAGTTGTGTTATGCTTCCCCTTGGAATTGG
ATGATTAGAGGGTATACAATAATGGGTCGTTTTGATCTTGCAATCTTGTTGTTCTTTAAG
ATGTTGGTTTTTGGTACTTGCCCTGATAAATACACTTTTCCTTGTGTGATTAAGGCTTGT
GCTGGTATAAATGCTGTGAATTTAGGTAAATGGCTACATGGGTTAGTACAAAGTTTAGGT
TTTGAGGATGATGTGTTTGTGGGTAGTGCTTTTATTAAGTTCTATGCTGAGAATGGTTGT
TTGGATGATGCTCGTCTTTTGTTCGATAAAATGTCTCAAAGGGATAGTGTCTTGTGGAAT
GTGATGCTTAATGGTTATGCTAAAGATGAACAGTCTGTGAATGATGTGGTTGGGTTATTT
ATGGAAATGAGGAAACATGAAACTAAGCCTAATTCAGTAACATATGCTTGTGTTCTTTCT
GTTTGTGCCTCGGAAACGATGGTTAAATTTGGTTGTCAGCTTCATGGGCTTGTTATGCGA
TGTGGGTTGGAAATGGATTCTCCAGTAGCCAATACATTGATTGCAATGTATGCTAAATTC
TGTTCCTTGTTTGATGCACGCAAGATCTTTGATTTAGTGCCACAAGCAGATCGTGTGACT
TGGAATGGGATGATTGGAGGGTATGTACAGAATGGGTATATCAATGAGGCGTTGGATTTA
TTTCAGGAAATGGTAGCTAGCAGTGTCAAACCAGACTCTATCACCTTTGCCAGTTTGCTC
CCCTCTGTTTCTATATCGGAAGATTTGTACCAGGGGAAGGCGATTCATGGTTATATCTTG
AGACATGATGTATCTATTGATGTTTTCTTAAAGAATGCCATTATTGATATGTACTTCAAG
TGCAGGAATGTTGTGGCAGCACGCAACATATTTAGCTGCAGCCCTGCGGTGGATATTGTT
ATTTGTACTGCTATGATTTCAGGATTTATTCTTAATGCCATGAGTTCTGATGCCATAGAT
GTTTTCCGATGGTTACTTAATAAGAAGATGAGGCCCAATCCTGTTACTCTAGCAAGTACC
TTACCAGCTTGTTCTGGTTTGGCTGCTTTGAGATTAGGTAAGGAACTGCATGGTGTCATT
GTTAAGCGCAGCTTTCAAGGAATACTTTATGTGGGAAGTGCGGTGATGGACATGTACGCA
AAGTGTGGAAGATTGGATCTTGCTCAACAAGTTTTCAGAAGGATGTCTGAAAGAGATGTT
GTTTGTTGGAATTCAATGATCACGAGTTGTTGCCAGAATGCTGAACCGGAATTGGCCATT
GACTTCTTCCAGCAGATGGGTGCAATTGGAGCCAAATATGATTGTGTCAGCATATCCAGT
GCTCTTTCTGCTTGTGCAAATTTGCCAGCTCTCCATTATGGGAAAGAGATCCATGGCTTC
ATTATGAAAAGTGCATTAAGTTCCGATGTTTTTGTGGAAAGTGCATTAATAGATATGTAT
GCTAAATGTGGGAACTTGGAGGTAGCTTGGCGCGTATTTGACTTAATGGCGCACAAGAAT
GAAGTATCATGGAATAGTATTATTGCAGCTTATGGAAATCATTGTCGACTTAAGGACTGT
CTGAATTTATTTCATGGAATGAGAAAAGATGGATTCCAGCCTGACCACGTCACTTTTCTT
GCGATCATATCTGCTTGTGGCCACTCTGGTGGAGTTGAAGAGGGAAAACACTACTTCAAT
TGCATGACTAAGGAATATGGGATTACACCCCGAACAGAGCATTATGCATGCATGGTTGAC
TTGTTTGGGAGAGCTGGTCTTGTGGAAGAAGCATTTGGCGTGATTAAGAGCATGCCATTT
GCTCCAGATGCAGGCATTTGGGGTACATTACTTGGGGCTTGTCGCTTACATGGCAATACC
GAGCTTGCTGAAATGGCTTCTGAGCATCTATTGAGCCTGGACCCCCAAAATTCCGGCTAC
TATATGTTACAATCAAATCTACATGCTAACGCCGGTAAATGGGATATGGTTTCTAAAATT
CGTCTCATGATGAAGGAAAGAGGAGTGCAGAAAGTACCTGGTTACAGCTGGACTGAAGTT
AACAATAGCACTCATATATTTGTTGCTGCAGACGCGAGTCACCCGCAGTCTGCTCAGATA
TATCTTTTATTAGACAATCTTCTAATGGAGCTGCAAAATGAGGGTTATGTTCCTCAAATG
AATCTTCAAATACAACAGTCATTATCCCCAGAACTCTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400036756
PEP Infomation

pacid=37424794 transcript=PGSC0003DMT400054636 locus=PGSC0003DMG400021203 ID=PGSC0003DMT400054636.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MLFQSKNICSIFRRSISVAAAFSSKPNSPFFQDSAFHNTEQVLASKLAPILQSCTNSTEN
LGSVLRKGEQVHAQVTVNGIDNLGILGTRILGMYVLCNRFIDAKKLFFQLQLCYASPWNW
MIRGYTIMGRFDLAILLFFKMLVFGTCPDKYTFPCVIKACAGINAVNLGKWLHGLVQSLG
FEDDVFVGSAFIKFYAENGCLDDARLLFDKMSQRDSVLWNVMLNGYAKDEQSVNDVVGLF
MEMRKHETKPNSVTYACVLSVCASETMVKFGCQLHGLVMRCGLEMDSPVANTLIAMYAKF
CSLFDARKIFDLVPQADRVTWNGMIGGYVQNGYINEALDLFQEMVASSVKPDSITFASLL
PSVSISEDLYQGKAIHGYILRHDVSIDVFLKNAIIDMYFKCRNVVAARNIFSCSPAVDIV
ICTAMISGFILNAMSSDAIDVFRWLLNKKMRPNPVTLASTLPACSGLAALRLGKELHGVI
VKRSFQGILYVGSAVMDMYAKCGRLDLAQQVFRRMSERDVVCWNSMITSCCQNAEPELAI
DFFQQMGAIGAKYDCVSISSALSACANLPALHYGKEIHGFIMKSALSSDVFVESALIDMY
AKCGNLEVAWRVFDLMAHKNEVSWNSIIAAYGNHCRLKDCLNLFHGMRKDGFQPDHVTFL
AIISACGHSGGVEEGKHYFNCMTKEYGITPRTEHYACMVDLFGRAGLVEEAFGVIKSMPF
APDAGIWGTLLGACRLHGNTELAEMASEHLLSLDPQNSGYYMLQSNLHANAGKWDMVSKI
RLMMKERGVQKVPGYSWTEVNNSTHIFVAADASHPQSAQIYLLLDNLLMELQNEGYVPQM
NLQIQQSLSPEL*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400054636
Transcript Infomation

pacid=37424794 locus=PGSC0003DMG400021203 ID=PGSC0003DMT400054636.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTTGTTTCAAAGCAAGAACATCTGTTCAATCTTCAGAAGGAGTATCTCAGTCGCTGCG
GCATTTTCCTCAAAACCCAATTCCCCTTTCTTCCAAGATTCAGCTTTTCACAACACAGAA
CAAGTTTTAGCATCGAAACTAGCTCCAATTCTGCAATCTTGCACAAATTCTACAGAAAAT
CTTGGTTCTGTTCTTCGTAAAGGGGAGCAGGTTCATGCCCAAGTAACTGTAAATGGAATC
GACAACTTGGGTATTCTTGGTACAAGAATCTTGGGGATGTATGTTTTGTGTAACAGGTTT
ATCGATGCCAAGAAATTGTTTTTTCAGCTTCAGTTGTGTTATGCTTCCCCTTGGAATTGG
ATGATTAGAGGGTATACAATAATGGGTCGTTTTGATCTTGCAATCTTGTTGTTCTTTAAG
ATGTTGGTTTTTGGTACTTGCCCTGATAAATACACTTTTCCTTGTGTGATTAAGGCTTGT
GCTGGTATAAATGCTGTGAATTTAGGTAAATGGCTACATGGGTTAGTACAAAGTTTAGGT
TTTGAGGATGATGTGTTTGTGGGTAGTGCTTTTATTAAGTTCTATGCTGAGAATGGTTGT
TTGGATGATGCTCGTCTTTTGTTCGATAAAATGTCTCAAAGGGATAGTGTCTTGTGGAAT
GTGATGCTTAATGGTTATGCTAAAGATGAACAGTCTGTGAATGATGTGGTTGGGTTATTT
ATGGAAATGAGGAAACATGAAACTAAGCCTAATTCAGTAACATATGCTTGTGTTCTTTCT
GTTTGTGCCTCGGAAACGATGGTTAAATTTGGTTGTCAGCTTCATGGGCTTGTTATGCGA
TGTGGGTTGGAAATGGATTCTCCAGTAGCCAATACATTGATTGCAATGTATGCTAAATTC
TGTTCCTTGTTTGATGCACGCAAGATCTTTGATTTAGTGCCACAAGCAGATCGTGTGACT
TGGAATGGGATGATTGGAGGGTATGTACAGAATGGGTATATCAATGAGGCGTTGGATTTA
TTTCAGGAAATGGTAGCTAGCAGTGTCAAACCAGACTCTATCACCTTTGCCAGTTTGCTC
CCCTCTGTTTCTATATCGGAAGATTTGTACCAGGGGAAGGCGATTCATGGTTATATCTTG
AGACATGATGTATCTATTGATGTTTTCTTAAAGAATGCCATTATTGATATGTACTTCAAG
TGCAGGAATGTTGTGGCAGCACGCAACATATTTAGCTGCAGCCCTGCGGTGGATATTGTT
ATTTGTACTGCTATGATTTCAGGATTTATTCTTAATGCCATGAGTTCTGATGCCATAGAT
GTTTTCCGATGGTTACTTAATAAGAAGATGAGGCCCAATCCTGTTACTCTAGCAAGTACC
TTACCAGCTTGTTCTGGTTTGGCTGCTTTGAGATTAGGTAAGGAACTGCATGGTGTCATT
GTTAAGCGCAGCTTTCAAGGAATACTTTATGTGGGAAGTGCGGTGATGGACATGTACGCA
AAGTGTGGAAGATTGGATCTTGCTCAACAAGTTTTCAGAAGGATGTCTGAAAGAGATGTT
GTTTGTTGGAATTCAATGATCACGAGTTGTTGCCAGAATGCTGAACCGGAATTGGCCATT
GACTTCTTCCAGCAGATGGGTGCAATTGGAGCCAAATATGATTGTGTCAGCATATCCAGT
GCTCTTTCTGCTTGTGCAAATTTGCCAGCTCTCCATTATGGGAAAGAGATCCATGGCTTC
ATTATGAAAAGTGCATTAAGTTCCGATGTTTTTGTGGAAAGTGCATTAATAGATATGTAT
GCTAAATGTGGGAACTTGGAGGTAGCTTGGCGCGTATTTGACTTAATGGCGCACAAGAAT
GAAGTATCATGGAATAGTATTATTGCAGCTTATGGAAATCATTGTCGACTTAAGGACTGT
CTGAATTTATTTCATGGAATGAGAAAAGATGGATTCCAGCCTGACCACGTCACTTTTCTT
GCGATCATATCTGCTTGTGGCCACTCTGGTGGAGTTGAAGAGGGAAAACACTACTTCAAT
TGCATGACTAAGGAATATGGGATTACACCCCGAACAGAGCATTATGCATGCATGGTTGAC
TTGTTTGGGAGAGCTGGTCTTGTGGAAGAAGCATTTGGCGTGATTAAGAGCATGCCATTT
GCTCCAGATGCAGGCATTTGGGGTACATTACTTGGGGCTTGTCGCTTACATGGCAATACC
GAGCTTGCTGAAATGGCTTCTGAGCATCTATTGAGCCTGGACCCCCAAAATTCCGGCTAC
TATATGTTACAATCAAATCTACATGCTAACGCCGGTAAATGGGATATGGTTTCTAAAATT
CGTCTCATGATGAAGGAAAGAGGAGTGCAGAAAGTACCTGGTTACAGCTGGACTGAAGTT
AACAATAGCACTCATATATTTGTTGCTGCAGACGCGAGTCACCCGCAGTCTGCTCAGATA
TATCTTTTATTAGACAATCTTCTAATGGAGCTGCAAAATGAGGGTTATGTTCCTCAAATG
AATCTTCAAATACAACAGTCATTATCCCCAGAACTCTAA