Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400054510
CDS Infomation	pacid=37433929 polypeptide=PGSC0003DMP400036682 locus=PGSC0003DMG400021156 ID=PGSC0003DMT400054510.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGGTTTTTCCCTCTTTTTCTTTAGCTTCAAGAACCCCCATTTCACCTGCCAATTTTAC TGGGAGTGGAAAATGAAGAGGTATAGGAATGGAGAAATATGGGATTTTGAGGAAGAAATG CAGCTTCTTGGAGATGGATTTTGTGATCAGAGAGAAGTCATATTGGGATTGGATGGTGAT ACCACTTGTACTGTTTGTGTTTGTATGCCTCTTATCCCTTTTGCTGATGAACTGCCTGAC CCTCCTCCTATTCTCTCACGAGCAGTTGCTGGATGCTCCAATCACAATAGCGTCGGAGAA AGCGCCGCGAGGGATGCTTTAGAGCTAGTCATGGCTGATGCTCTTTCAAAAGCAGGCTCA ACACGTTTCTGTGTGCAAGCTGTTTGTTTGGCTGTCTCTGGTGTCAACCATCCAACAGAT ATAGAACGAATAATGAACTGGCTTAGAGATATATTCCCCAGCCATGTCCAATTCTTTGTT CAGAATGATGCTGTTGCAGCTCTTGCAAGTGGAACAATGGGAAAGCTTCATGGTTGTGTC CTTATTGCTGGTACAGGAACAATTGCTTATGGTTTCACTGAAGATGGGAGAGATGCTAGA GCTGCTGGTGCTGGGCCTGTATTAGGAGATTGGGGAAGTGGATATGGTATAGCTGCACAG GCATTGACTGCTGCAGTTAGAGCCTATGATGGTCGTGGTCCATACACTGCACTTACGCCA AGTATTCTAAGGAAGCTGGATCTTTCTTCTCCTGATGAGCTTATTGGGTGGACCTATTCA GATCCATCTTGGGCTCGGATTGCGGCTCTTGTTCCAGTGGTAGTGACTTGTGCAGAGGGA GGTGATGAAGTAGCAAATAAGATATTGAGAGATGCGGTTCAAGAATTAGCTTCCAGTGTT AAAGCTGTTGTTAGAAGACTACAGTTGTGTGGTGAAGACGGAAATGATACATTTCCTCTT GTTATGGTTGGAGGTGTTCTTGAAGCCAACAAGAAATGGGATATAGGAAGAGAAGTCATT AACTGCATATGCAAGGACTTCCCGGGGGTTCATCCCATTTGTCCGAAGGTGGAACCTGCC ATTGGAGCTGCTTTGCTTGCTTGGAACTTGTTGGCTAGGTATAGTCGACAAGGGACTTTG AGAAGTGAAACCTATTCTTCTTAA

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400036682
PEP Infomation	pacid=37433929 transcript=PGSC0003DMT400054510 locus=PGSC0003DMG400021156 ID=PGSC0003DMT400054510.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	MGFSLFFFSFKNPHFTCQFYWEWKMKRYRNGEIWDFEEEMQLLGDGFCDQREVILGLDGD TTCTVCVCMPLIPFADELPDPPPILSRAVAGCSNHNSVGESAARDALELVMADALSKAGS TRFCVQAVCLAVSGVNHPTDIERIMNWLRDIFPSHVQFFVQNDAVAALASGTMGKLHGCV LIAGTGTIAYGFTEDGRDARAAGAGPVLGDWGSGYGIAAQALTAAVRAYDGRGPYTALTP SILRKLDLSSPDELIGWTYSDPSWARIAALVPVVVTCAEGGDEVANKILRDAVQELASSV KAVVRRLQLCGEDGNDTFPLVMVGGVLEANKKWDIGREVINCICKDFPGVHPICPKVEPA IGAALLAWNLLARYSRQGTLRSETYSS*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400054510
Transcript Infomation	pacid=37433929 locus=PGSC0003DMG400021156 ID=PGSC0003DMT400054510.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGGTTTTTCCCTCTTTTTCTTTAGCTTCAAGAACCCCCATTTCACCTGCCAATTTTAC TGGGAGTGGAAAATGAAGAGGTATAGGAATGGAGAAATATGGGATTTTGAGGAAGAAATG CAGCTTCTTGGAGATGGATTTTGTGATCAGAGAGAAGTCATATTGGGATTGGATGGTGAT ACCACTTGTACTGTTTGTGTTTGTATGCCTCTTATCCCTTTTGCTGATGAACTGCCTGAC CCTCCTCCTATTCTCTCACGAGCAGTTGCTGGATGCTCCAATCACAATAGCGTCGGAGAA AGCGCCGCGAGGGATGCTTTAGAGCTAGTCATGGCTGATGCTCTTTCAAAAGCAGGCTCA ACACGTTTCTGTGTGCAAGCTGTTTGTTTGGCTGTCTCTGGTGTCAACCATCCAACAGAT ATAGAACGAATAATGAACTGGCTTAGAGATATATTCCCCAGCCATGTCCAATTCTTTGTT CAGAATGATGCTGTTGCAGCTCTTGCAAGTGGAACAATGGGAAAGCTTCATGGTTGTGTC CTTATTGCTGGTACAGGAACAATTGCTTATGGTTTCACTGAAGATGGGAGAGATGCTAGA GCTGCTGGTGCTGGGCCTGTATTAGGAGATTGGGGAAGTGGATATGGTATAGCTGCACAG GCATTGACTGCTGCAGTTAGAGCCTATGATGGTCGTGGTCCATACACTGCACTTACGCCA AGTATTCTAAGGAAGCTGGATCTTTCTTCTCCTGATGAGCTTATTGGGTGGACCTATTCA GATCCATCTTGGGCTCGGATTGCGGCTCTTGTTCCAGTGGTAGTGACTTGTGCAGAGGGA GGTGATGAAGTAGCAAATAAGATATTGAGAGATGCGGTTCAAGAATTAGCTTCCAGTGTT AAAGCTGTTGTTAGAAGACTACAGTTGTGTGGTGAAGACGGAAATGATACATTTCCTCTT GTTATGGTTGGAGGTGTTCTTGAAGCCAACAAGAAATGGGATATAGGAAGAGAAGTCATT AACTGCATATGCAAGGACTTCCCGGGGGTTCATCCCATTTGTCCGAAGGTGGAACCTGCC ATTGGAGCTGCTTTGCTTGCTTGGAACTTGTTGGCTAGGTATAGTCGACAAGGGACTTTG AGAAGTGAAACCTATTCTTCTTAA