Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400054496
CDS Infomation

pacid=37426889 polypeptide=PGSC0003DMP400036668 locus=PGSC0003DMG401021149 ID=PGSC0003DMT400054496.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGATATCTCACCTCAATCACCTGTTTAGTACTCCTATTTCTGAAAAGGGTTCCACTTCT
CATAGTCCCCAGAAATTTTCGTCATTGAATATTCGTTGTTTTCGTAGTTCACCTAATGCT
AAGATTGAAGTCCCTGAATTATCAACTCAGACACCCATTTCCCCTGCTGTCAATAAAATA
TCACGGGTTGCAAGAACTGATGGACAAGCAGTACTCTTTGAATACTTGCATTGTACAAGA
GGTTTTAATTATGTAGATGCTGAGCACATTAGCAAGAACTCACCTTGTTTTCTTCAAAGT
CTGTTGTCCAAGGTTGATAATGATCAAGATGTAACAAGGGCATTAACCCGTTACTTCAGG
TACCATCCGATTAATGAGTTTGAGCCCTTTTTAGAGAGCTTGGGGTTGAAGCAATCCGAG
CTTACATCTATGCTTCCACGAGATTTGATATTTTTGAGTGATGATCATGTCTTGTTTGAT
AATTATCATGTTCTTTGTTATTACGGCATCCCTCGCACTAAAATTGGGAAGATTTATAAG
GAAGCGACTGATGTATTTGGATATGACCATGGAGTATTAGATATGAAATTGAGGGCTTAT
GAGAAACTGGGTTTGAGCAGATCAACAGTTATAAAGTTGGTGACTTGTTCCCCTACTCTT
TTGGTTGGTGAGACGAACAGTGAACTTATTCAGGTTCTTGAAAAACTGAAAATTTTAGGG
TTTGAAAATGATTGGATGGGAGGATATTTATCCAACAGGCACTCCTACAATTGGGGTAGA
ATGCTTAACACATTGCATTTTCTCAATGAAGTAGGATATAGTGATGAAAAGATGGCGACT
TTGTTTACGATGAACCCTGCATTCTTATTTGAAGGCTCTGGGAAACAGATTTATGTATTG
GTTGGGCAATTACTGAAGTTGGGTGTTAAAATGAATGACATATACTTACTTTTCTGTCAA
AATCCTAATATGCTATCTCTGAAGTGTACTAAAAATCTTTGGCATGCATTGTACTTCTTA
TCGGAGATAGGATTAGAGACCGAAATAATTGCAAATATTGTATCTACACATATACAACTT
CTGGGTTCACATTCTCTGAAGGGACCAAAGACTCTTTTGAGGGACTTCAAGGGTGACAAG
TTTTGTTTATGTCAGACTATAAAGGATGATCCTTTGAATTTGTTCAGATTAGCTTCAAAA
TCAAAATTTGACGTGGAGCAAATGACTTCCCAGGACCCGGGAAAATTATTTCAGAAAACT
ACTTTTTTATTGAGATTAGGTTATGTAGAAAATTCAGATGAGATGGCAAAAGCTTTGAAG
CAGTTCCGCGGACGAGGAGACCAGTTGCAAGAGAGGTTTGATTGCCTAGTAAACGCTGGT
TTGGACTGCAATGTTGTAATTAATATGATTAAACAGGCTCCCACGACACTGAACCAGAGC
AAAAATGTGCTTGAGAAGAAAATTGTTCTACTGAAAACATATTTAGGTTATCCGGTGGAA
TCGATTGTATCATTTCCATCTTACCTCTGCTACGATGTGGACAGAGTCCATCTTCGGTTT
TCAATGTATGCATGGCTGAAGCAAAAGGGTGCTGCAAAACCAACATTATCAGTGAGCACT
CTTCTTGCTTGTTCAGATGCTCGCTTTGTAAAATATTTTGTTGACATACATCCAGAAGGT
CCAGCAATGTGGGAAAGTTTAAAAAGTTCACTTCAATCCAGCTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400036668
PEP Infomation

pacid=37426889 transcript=PGSC0003DMT400054496 locus=PGSC0003DMG401021149 ID=PGSC0003DMT400054496.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MISHLNHLFSTPISEKGSTSHSPQKFSSLNIRCFRSSPNAKIEVPELSTQTPISPAVNKI
SRVARTDGQAVLFEYLHCTRGFNYVDAEHISKNSPCFLQSLLSKVDNDQDVTRALTRYFR
YHPINEFEPFLESLGLKQSELTSMLPRDLIFLSDDHVLFDNYHVLCYYGIPRTKIGKIYK
EATDVFGYDHGVLDMKLRAYEKLGLSRSTVIKLVTCSPTLLVGETNSELIQVLEKLKILG
FENDWMGGYLSNRHSYNWGRMLNTLHFLNEVGYSDEKMATLFTMNPAFLFEGSGKQIYVL
VGQLLKLGVKMNDIYLLFCQNPNMLSLKCTKNLWHALYFLSEIGLETEIIANIVSTHIQL
LGSHSLKGPKTLLRDFKGDKFCLCQTIKDDPLNLFRLASKSKFDVEQMTSQDPGKLFQKT
TFLLRLGYVENSDEMAKALKQFRGRGDQLQERFDCLVNAGLDCNVVINMIKQAPTTLNQS
KNVLEKKIVLLKTYLGYPVESIVSFPSYLCYDVDRVHLRFSMYAWLKQKGAAKPTLSVST
LLACSDARFVKYFVDIHPEGPAMWESLKSSLQSS*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400054496
Transcript Infomation

pacid=37426889 locus=PGSC0003DMG401021149 ID=PGSC0003DMT400054496.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGATATCTCACCTCAATCACCTGTTTAGTACTCCTATTTCTGAAAAGGGTTCCACTTCT
CATAGTCCCCAGAAATTTTCGTCATTGAATATTCGTTGTTTTCGTAGTTCACCTAATGCT
AAGATTGAAGTCCCTGAATTATCAACTCAGACACCCATTTCCCCTGCTGTCAATAAAATA
TCACGGGTTGCAAGAACTGATGGACAAGCAGTACTCTTTGAATACTTGCATTGTACAAGA
GGTTTTAATTATGTAGATGCTGAGCACATTAGCAAGAACTCACCTTGTTTTCTTCAAAGT
CTGTTGTCCAAGGTTGATAATGATCAAGATGTAACAAGGGCATTAACCCGTTACTTCAGG
TACCATCCGATTAATGAGTTTGAGCCCTTTTTAGAGAGCTTGGGGTTGAAGCAATCCGAG
CTTACATCTATGCTTCCACGAGATTTGATATTTTTGAGTGATGATCATGTCTTGTTTGAT
AATTATCATGTTCTTTGTTATTACGGCATCCCTCGCACTAAAATTGGGAAGATTTATAAG
GAAGCGACTGATGTATTTGGATATGACCATGGAGTATTAGATATGAAATTGAGGGCTTAT
GAGAAACTGGGTTTGAGCAGATCAACAGTTATAAAGTTGGTGACTTGTTCCCCTACTCTT
TTGGTTGGTGAGACGAACAGTGAACTTATTCAGGTTCTTGAAAAACTGAAAATTTTAGGG
TTTGAAAATGATTGGATGGGAGGATATTTATCCAACAGGCACTCCTACAATTGGGGTAGA
ATGCTTAACACATTGCATTTTCTCAATGAAGTAGGATATAGTGATGAAAAGATGGCGACT
TTGTTTACGATGAACCCTGCATTCTTATTTGAAGGCTCTGGGAAACAGATTTATGTATTG
GTTGGGCAATTACTGAAGTTGGGTGTTAAAATGAATGACATATACTTACTTTTCTGTCAA
AATCCTAATATGCTATCTCTGAAGTGTACTAAAAATCTTTGGCATGCATTGTACTTCTTA
TCGGAGATAGGATTAGAGACCGAAATAATTGCAAATATTGTATCTACACATATACAACTT
CTGGGTTCACATTCTCTGAAGGGACCAAAGACTCTTTTGAGGGACTTCAAGGGTGACAAG
TTTTGTTTATGTCAGACTATAAAGGATGATCCTTTGAATTTGTTCAGATTAGCTTCAAAA
TCAAAATTTGACGTGGAGCAAATGACTTCCCAGGACCCGGGAAAATTATTTCAGAAAACT
ACTTTTTTATTGAGATTAGGTTATGTAGAAAATTCAGATGAGATGGCAAAAGCTTTGAAG
CAGTTCCGCGGACGAGGAGACCAGTTGCAAGAGAGGTTTGATTGCCTAGTAAACGCTGGT
TTGGACTGCAATGTTGTAATTAATATGATTAAACAGGCTCCCACGACACTGAACCAGAGC
AAAAATGTGCTTGAGAAGAAAATTGTTCTACTGAAAACATATTTAGGTTATCCGGTGGAA
TCGATTGTATCATTTCCATCTTACCTCTGCTACGATGTGGACAGAGTCCATCTTCGGTTT
TCAATGTATGCATGGCTGAAGCAAAAGGGTGCTGCAAAACCAACATTATCAGTGAGCACT
CTTCTTGCTTGTTCAGATGCTCGCTTTGTAAAATATTTTGTTGACATACATCCAGAAGGT
CCAGCAATGTGGGAAAGTTTAAAAAGTTCACTTCAATCCAGCTGA