Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400054444
CDS Infomation

pacid=37428324 polypeptide=PGSC0003DMP400036631 locus=PGSC0003DMG400021132 ID=PGSC0003DMT400054444.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAGAAATCTGATGGGTTTCTCATTAGAAAAAGTCCACGACTTCGTGGGGTGTTCAAT
CTTGTGTGTTCCCTAGTCCTTATGTTTATGTTCTACAACCGTGAAGATATTGTGAGCAAT
TTAATTTTAAAGAAGTCATCTTTAGTTTCTAGTCAGTGGCACCCAAGTAGTAGATTTGAT
GGTTATTCTTCCCATACACGAGTGGTTCGTCGAGGGATGTTAGAAGTAAACGGGTCGGAT
GCTGATGATTTGGTGGTAAAAAAGCCTCAGTTATGTGCAGGATTGTTTGATCATGTGGGG
TTTAAAAGTAGTTGTGACTTCTTGAAAGTTCACCCGGATTGCTCGTCTGGAGGGTTCTTT
GATTACCTTAAGTTCTATTACTGTGGTTGTAATGGAAGTGCGTGGGCGTTTGCAGTATTT
GGTGTCTGGCTTGCTGCATTGTTCTATCTTTTGGGTAACACTGCAGCTGATTACTTTTGT
GGTTCGTTGGAGAAACTGGCTAGCTTGTTGAAGCTATCTCCTACAGTTGCTGGAGTTGTT
TTGCTCCCGCTTGGTAATGGTGCTCCGGATGTATTCGCGAGTATTGCTGCGTTTGTAGGA
AGTGGTGCTGGTGATGTTGGGCTTAACAGTGTTTTAGGTGGGGCTGTGTTTGTTACTTGC
ATTGTTGTGGGTGCTGTTTCTCTTTGTGTAGCTGATCAGGATGTTCAGGTTGACAAAAAA
TGCTTTATTAGGGATATTGTCTTTTTCATTGTAACGCTGATGTCACTATTATTGATCTTG
ATTGTTGGTGAAGTTAGTGTGGTAGCAACTATCGCATTTGTATTGATATATGTTGTTTAT
GCGTTTGTTGTTGCTGCTAATGAGATTTTGAGGAAGCATGCGCGAAGATTGAGATTGGAT
GTTGTTACCCCTTTGCTTCCTGTAAGAGGAAGTATATTTTCTGAAGGGACTCAGGAGGAG
GATTCTGTTTATAGCTCTTTGCTTGACGTTGAGACAGAGGACAATAGCATACAGTCACAT
GGTTCCTTGCCTCAGTGGATGTGGGCATCCAATGTGGCAATATATTCTAATCAGTCATTG
AGGGTGCATGATGGGGAAAGGCCTTTGTGGGGTTGGATTGACGAGGGTGTAGAAGTCAAG
AGCCCATCATTTTCCTGCTCTCAGCTCTGCTCACTTCTAGAGTTGCCATTGACTGTGCCA
AGACGATTAACCATTCCATTAGTTGAGGAAGAAACTTGGTCAAAACCATACGCTGTAGGC
AGTGCTACTTTAGCTCCTTTTCTTCTTGCAGCTTTATGGAATACTCAGGATAATGTGAGT
TACCTAGGCAGAAGTGTTGCTATAGTTCTTGGCATTTCTGTTGGTTGCACATTGGGTATA
CTTGCATACAAGCATACAAGAGCTGACCGTCCACCACAGATGTTTTTGCTTCCATGGGTT
TTGGGGGGTTTTATTATGAGTATCGTTTGGTTTTATATGATTGCGAATGAATTGGTGGCG
CTGCTGGTTGGATTGGGTGTTGTACTGGGGGTTAATCCCTCGATTCTTGGGCTCACTGTT
TTGGCTTGGGGCAATTCAATGGGTGATCTGGTCTCAAATGTTGCTTTGGCGATGAATGGT
GGAGATGGTGTGCAGATTGCTTTATCTGGATGCTATGCAGGTCCCATGTTCAATACACTT
ATTGGATTAGGAATCTCATTATTCCTTGGTGCCTGGTCAGACAAACCTTCTTCTTTCATA
CTTCCACGGGACAGAAGTTTGTTTTACACCATATGTTTCCTCATGTTTGGTCTTCTGTGG
GCCCTCGTTGTTCTTCCCAAAAATGACATGCGCCCTAACAAGATGCTTGGTGTAGGCCTT
ATCGTCATCTATTTGGTATTTCTGTCTGTTAGACTGAGTAGTGCGATGGGAATTGTTTCA
TTGTTTGGGCTTAGTGACTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400036631
PEP Infomation

pacid=37428324 transcript=PGSC0003DMT400054444 locus=PGSC0003DMG400021132 ID=PGSC0003DMT400054444.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MEKSDGFLIRKSPRLRGVFNLVCSLVLMFMFYNREDIVSNLILKKSSLVSSQWHPSSRFD
GYSSHTRVVRRGMLEVNGSDADDLVVKKPQLCAGLFDHVGFKSSCDFLKVHPDCSSGGFF
DYLKFYYCGCNGSAWAFAVFGVWLAALFYLLGNTAADYFCGSLEKLASLLKLSPTVAGVV
LLPLGNGAPDVFASIAAFVGSGAGDVGLNSVLGGAVFVTCIVVGAVSLCVADQDVQVDKK
CFIRDIVFFIVTLMSLLLILIVGEVSVVATIAFVLIYVVYAFVVAANEILRKHARRLRLD
VVTPLLPVRGSIFSEGTQEEDSVYSSLLDVETEDNSIQSHGSLPQWMWASNVAIYSNQSL
RVHDGERPLWGWIDEGVEVKSPSFSCSQLCSLLELPLTVPRRLTIPLVEEETWSKPYAVG
SATLAPFLLAALWNTQDNVSYLGRSVAIVLGISVGCTLGILAYKHTRADRPPQMFLLPWV
LGGFIMSIVWFYMIANELVALLVGLGVVLGVNPSILGLTVLAWGNSMGDLVSNVALAMNG
GDGVQIALSGCYAGPMFNTLIGLGISLFLGAWSDKPSSFILPRDRSLFYTICFLMFGLLW
ALVVLPKNDMRPNKMLGVGLIVIYLVFLSVRLSSAMGIVSLFGLSD*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400054444
Transcript Infomation

pacid=37428324 locus=PGSC0003DMG400021132 ID=PGSC0003DMT400054444.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAGAAATCTGATGGGTTTCTCATTAGAAAAAGTCCACGACTTCGTGGGGTGTTCAAT
CTTGTGTGTTCCCTAGTCCTTATGTTTATGTTCTACAACCGTGAAGATATTGTGAGCAAT
TTAATTTTAAAGAAGTCATCTTTAGTTTCTAGTCAGTGGCACCCAAGTAGTAGATTTGAT
GGTTATTCTTCCCATACACGAGTGGTTCGTCGAGGGATGTTAGAAGTAAACGGGTCGGAT
GCTGATGATTTGGTGGTAAAAAAGCCTCAGTTATGTGCAGGATTGTTTGATCATGTGGGG
TTTAAAAGTAGTTGTGACTTCTTGAAAGTTCACCCGGATTGCTCGTCTGGAGGGTTCTTT
GATTACCTTAAGTTCTATTACTGTGGTTGTAATGGAAGTGCGTGGGCGTTTGCAGTATTT
GGTGTCTGGCTTGCTGCATTGTTCTATCTTTTGGGTAACACTGCAGCTGATTACTTTTGT
GGTTCGTTGGAGAAACTGGCTAGCTTGTTGAAGCTATCTCCTACAGTTGCTGGAGTTGTT
TTGCTCCCGCTTGGTAATGGTGCTCCGGATGTATTCGCGAGTATTGCTGCGTTTGTAGGA
AGTGGTGCTGGTGATGTTGGGCTTAACAGTGTTTTAGGTGGGGCTGTGTTTGTTACTTGC
ATTGTTGTGGGTGCTGTTTCTCTTTGTGTAGCTGATCAGGATGTTCAGGTTGACAAAAAA
TGCTTTATTAGGGATATTGTCTTTTTCATTGTAACGCTGATGTCACTATTATTGATCTTG
ATTGTTGGTGAAGTTAGTGTGGTAGCAACTATCGCATTTGTATTGATATATGTTGTTTAT
GCGTTTGTTGTTGCTGCTAATGAGATTTTGAGGAAGCATGCGCGAAGATTGAGATTGGAT
GTTGTTACCCCTTTGCTTCCTGTAAGAGGAAGTATATTTTCTGAAGGGACTCAGGAGGAG
GATTCTGTTTATAGCTCTTTGCTTGACGTTGAGACAGAGGACAATAGCATACAGTCACAT
GGTTCCTTGCCTCAGTGGATGTGGGCATCCAATGTGGCAATATATTCTAATCAGTCATTG
AGGGTGCATGATGGGGAAAGGCCTTTGTGGGGTTGGATTGACGAGGGTGTAGAAGTCAAG
AGCCCATCATTTTCCTGCTCTCAGCTCTGCTCACTTCTAGAGTTGCCATTGACTGTGCCA
AGACGATTAACCATTCCATTAGTTGAGGAAGAAACTTGGTCAAAACCATACGCTGTAGGC
AGTGCTACTTTAGCTCCTTTTCTTCTTGCAGCTTTATGGAATACTCAGGATAATGTGAGT
TACCTAGGCAGAAGTGTTGCTATAGTTCTTGGCATTTCTGTTGGTTGCACATTGGGTATA
CTTGCATACAAGCATACAAGAGCTGACCGTCCACCACAGATGTTTTTGCTTCCATGGGTT
TTGGGGGGTTTTATTATGAGTATCGTTTGGTTTTATATGATTGCGAATGAATTGGTGGCG
CTGCTGGTTGGATTGGGTGTTGTACTGGGGGTTAATCCCTCGATTCTTGGGCTCACTGTT
TTGGCTTGGGGCAATTCAATGGGTGATCTGGTCTCAAATGTTGCTTTGGCGATGAATGGT
GGAGATGGTGTGCAGATTGCTTTATCTGGATGCTATGCAGGTCCCATGTTCAATACACTT
ATTGGATTAGGAATCTCATTATTCCTTGGTGCCTGGTCAGACAAACCTTCTTCTTTCATA
CTTCCACGGGACAGAAGTTTGTTTTACACCATATGTTTCCTCATGTTTGGTCTTCTGTGG
GCCCTCGTTGTTCTTCCCAAAAATGACATGCGCCCTAACAAGATGCTTGGTGTAGGCCTT
ATCGTCATCTATTTGGTATTTCTGTCTGTTAGACTGAGTAGTGCGATGGGAATTGTTTCA
TTGTTTGGGCTTAGTGACTAA