Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400054422
CDS Infomation

pacid=37428751 polypeptide=PGSC0003DMP400036616 locus=PGSC0003DMG400021125 ID=PGSC0003DMT400054422.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGATAGTAGCAAGTATGTGAGGTATACACCAGAACAAGTAGAGGCTTTGGAGAGGGTT
TATGCAGAATGTCCAAAGCCAACTTCTTTGAAGAGGCATCAGCTCATTAGGGAGTGTTCC
ATTCTTTCTAACATTGACCCTAAACAGATCAAAGTCTGGTTTCAGAACAGAAGATGCCGT
GAGAAACAGAGAAAGGAGGCATCTCATCTCCAGACTGTTAACAGAAAGCTGACTGCTATG
AACAAACTGTTGATGGAAGAAAATGACCGATTGCAGAAGCACGTTTCACATCTTGTGTAT
GATAATGGCTTCATGCGACAACAGTTGCATACTGTAAACAGTACGACCACGGATACCTGC
TGTGAGTCTGTGGTCGTGAGTGATCAGCAGCAGCAACAAAACCCAATACCTCAGCATCAT
CCGCAAAGGGATGCTAACAGCCCAGCTGGTCTTTTAGCAATAGCTGAAGAGACCCTGACA
GAGTTCCTTGGTAAAGCTACTGGAACTGCTGTCGACTGGGTGCAGATGATTGGGATGAAG
CCTGGTCCGGAATCTATTGGCATCGTCGCTGTTTCCCGCAACTGTAATGGTGTTGCAGCA
CGAGCCTGTGGCCTTGTGAGTCTAGAGCCCATGAAGGTTGCTGAGATCCTTAAAGATCGT
CCTTCTTGGTATCGCGATTGCCGTTGCCTTGATATACTGAATGTAATACCAACAGGAAAT
GGAGGGACTATAGAGCTCATATACCTGCAGACTTATGCACCAACTACATTGGCACCAGCT
CGTGATTTTTGGACGTTGAGATACACTACAAGTTTAGAAGATGGAAGTCTTGTGATATGT
GAAAGATCTTTGACGTCGAATACTGGAGGCCCTGTCGGGCCTCCTGCAACTAGTTCTGTT
AGGGCTAAAATGCTACCTAGTGGTTTCCTCATACGGCCTTGTGAGGGCGGGGGCTCAATC
ATCCACATTGTAGACCATATTGATCTCGACGCTTGCAGTGTTCCCGAAGTCCTCAGACCA
CTTTATGAATCGTCCAAGATCCTTGCTCAGAAAATGACAATGGCTGCCTTCCGATACATA
AGGCAGATAGCTCAAGAAACCAGTGGAGAAATTCAATATGCTGGAGGTCGGCAACCTGCC
GTTTTGAGGGCATTTAGTCAAAGATTATGCAGGGGCTTCAATAATGCGGTTAGTGGATTT
ATTGATGATGGTTGGACAATTATGGGTAGCGATGGTGTGGATGATGTAACAATCGCTGTA
AACTCATCACCAAGTAAATTCCTTGATGCACAATACAACACCTTGTCAATTCTCCCTACT
TTTGGAGGAGTACTGTGTGCACGAGCATCAATGCTTCTTCAGGATGTTTGCCCTGCTTTG
CTTGTCCGTTTCCTTAGGGAGCACCGTTCAGAGTGGGCTGACTATGGAGTTGATGCCTAC
TCTTCTGCATCTCTTAAAGCCAGTCCCTATGCTGTCCCTTGCGCCAGACCTGGTGTCTTC
CCCAGTAGCCAGGTCATTTTACCGCTTGCTCAAACTGTGGAACATGAGGAGTTTCTTGAG
GTTGTTCGGCTAGAGGGTCATGCTTTCTCTCCAGAGGACATAGCTTTATCGCGGGATATG
TATTTGTTACAGCTATGCAGTGGAGTTGAAGAGAATGCCACAGGTGCCTGTGCTCAGCTT
GTTTTTGCACATATTGATGAATCTTTTGGTGATGATGCTCCATTGCTTCCATCTGGTTTC
TCTGTCATTCCACTGGAGCCTAAATCAGATTCTCCTAGTGCTGCTCGGACTTTGGATTTA
GCTTCAACTCTTGAAGCTAGAACTGGTGGGACACGGCTAGCTGGTGAAGTTGAAGGACGC
AGTTACAACCATCGTTCAGTCTTGACAATTGCATTCCAGTTTGCTTTTGAGAATCACTAT
CGAGAAAATGTAGCTGCTATGGCTCGCCAATATGTACGAAGCATTGTAGGCTCTGTTCAG
AGAGTTGCTATGGCTATTGCACCCTCTCGACTCTGCTCTCAGCTGACACCTAAATCCTTC
CCTGGCTCACCAGAAGCTGTCACTTTGGCGAGATGGATTTGCAGGAGCTATAAGAATCAT
ACTGGTGGAGAATTGCTACAGGTGGAGTCTCAAGCTGCCGGTGATGCTGTTCTGAAGCAA
CTATGGCATCACACTGATTCAATAATGTGCTGCTCCGTCAAAATGAATGATTCTGCAGTT
TTTTCATTTTCAAACCAAGCCGGACTTGACATGCTTGAAACCACTCTAATAGCTCTTCAG
GATATAATGCTCGATAAGATCCTAGATGAAGCTGGTCGAAAGGTCCTCCTTTCAGAGTTT
CCCAAGATTATGCAGCAGGGCTTTGCCTATCTGCCGGCAGGGCTATGTGTATCGAGCATG
GGGAGGCCAGTGTCGTATGAGCAAGCTGTTGCATGGAAGGTCCTTAATGATGACAACTCC
AGTCACTGCCTAGCTTTCATGTTCACAAACTGGTCTTTTATTTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400036616
PEP Infomation

pacid=37428751 transcript=PGSC0003DMT400054422 locus=PGSC0003DMG400021125 ID=PGSC0003DMT400054422.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MDSSKYVRYTPEQVEALERVYAECPKPTSLKRHQLIRECSILSNIDPKQIKVWFQNRRCR
EKQRKEASHLQTVNRKLTAMNKLLMEENDRLQKHVSHLVYDNGFMRQQLHTVNSTTTDTC
CESVVVSDQQQQQNPIPQHHPQRDANSPAGLLAIAEETLTEFLGKATGTAVDWVQMIGMK
PGPESIGIVAVSRNCNGVAARACGLVSLEPMKVAEILKDRPSWYRDCRCLDILNVIPTGN
GGTIELIYLQTYAPTTLAPARDFWTLRYTTSLEDGSLVICERSLTSNTGGPVGPPATSSV
RAKMLPSGFLIRPCEGGGSIIHIVDHIDLDACSVPEVLRPLYESSKILAQKMTMAAFRYI
RQIAQETSGEIQYAGGRQPAVLRAFSQRLCRGFNNAVSGFIDDGWTIMGSDGVDDVTIAV
NSSPSKFLDAQYNTLSILPTFGGVLCARASMLLQDVCPALLVRFLREHRSEWADYGVDAY
SSASLKASPYAVPCARPGVFPSSQVILPLAQTVEHEEFLEVVRLEGHAFSPEDIALSRDM
YLLQLCSGVEENATGACAQLVFAHIDESFGDDAPLLPSGFSVIPLEPKSDSPSAARTLDL
ASTLEARTGGTRLAGEVEGRSYNHRSVLTIAFQFAFENHYRENVAAMARQYVRSIVGSVQ
RVAMAIAPSRLCSQLTPKSFPGSPEAVTLARWICRSYKNHTGGELLQVESQAAGDAVLKQ
LWHHTDSIMCCSVKMNDSAVFSFSNQAGLDMLETTLIALQDIMLDKILDEAGRKVLLSEF
PKIMQQGFAYLPAGLCVSSMGRPVSYEQAVAWKVLNDDNSSHCLAFMFTNWSFI*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400054422
Transcript Infomation

pacid=37428751 locus=PGSC0003DMG400021125 ID=PGSC0003DMT400054422.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGATAGTAGCAAGTATGTGAGGTATACACCAGAACAAGTAGAGGCTTTGGAGAGGGTT
TATGCAGAATGTCCAAAGCCAACTTCTTTGAAGAGGCATCAGCTCATTAGGGAGTGTTCC
ATTCTTTCTAACATTGACCCTAAACAGATCAAAGTCTGGTTTCAGAACAGAAGATGCCGT
GAGAAACAGAGAAAGGAGGCATCTCATCTCCAGACTGTTAACAGAAAGCTGACTGCTATG
AACAAACTGTTGATGGAAGAAAATGACCGATTGCAGAAGCACGTTTCACATCTTGTGTAT
GATAATGGCTTCATGCGACAACAGTTGCATACTGTAAACAGTACGACCACGGATACCTGC
TGTGAGTCTGTGGTCGTGAGTGATCAGCAGCAGCAACAAAACCCAATACCTCAGCATCAT
CCGCAAAGGGATGCTAACAGCCCAGCTGGTCTTTTAGCAATAGCTGAAGAGACCCTGACA
GAGTTCCTTGGTAAAGCTACTGGAACTGCTGTCGACTGGGTGCAGATGATTGGGATGAAG
CCTGGTCCGGAATCTATTGGCATCGTCGCTGTTTCCCGCAACTGTAATGGTGTTGCAGCA
CGAGCCTGTGGCCTTGTGAGTCTAGAGCCCATGAAGGTTGCTGAGATCCTTAAAGATCGT
CCTTCTTGGTATCGCGATTGCCGTTGCCTTGATATACTGAATGTAATACCAACAGGAAAT
GGAGGGACTATAGAGCTCATATACCTGCAGACTTATGCACCAACTACATTGGCACCAGCT
CGTGATTTTTGGACGTTGAGATACACTACAAGTTTAGAAGATGGAAGTCTTGTGATATGT
GAAAGATCTTTGACGTCGAATACTGGAGGCCCTGTCGGGCCTCCTGCAACTAGTTCTGTT
AGGGCTAAAATGCTACCTAGTGGTTTCCTCATACGGCCTTGTGAGGGCGGGGGCTCAATC
ATCCACATTGTAGACCATATTGATCTCGACGCTTGCAGTGTTCCCGAAGTCCTCAGACCA
CTTTATGAATCGTCCAAGATCCTTGCTCAGAAAATGACAATGGCTGCCTTCCGATACATA
AGGCAGATAGCTCAAGAAACCAGTGGAGAAATTCAATATGCTGGAGGTCGGCAACCTGCC
GTTTTGAGGGCATTTAGTCAAAGATTATGCAGGGGCTTCAATAATGCGGTTAGTGGATTT
ATTGATGATGGTTGGACAATTATGGGTAGCGATGGTGTGGATGATGTAACAATCGCTGTA
AACTCATCACCAAGTAAATTCCTTGATGCACAATACAACACCTTGTCAATTCTCCCTACT
TTTGGAGGAGTACTGTGTGCACGAGCATCAATGCTTCTTCAGGATGTTTGCCCTGCTTTG
CTTGTCCGTTTCCTTAGGGAGCACCGTTCAGAGTGGGCTGACTATGGAGTTGATGCCTAC
TCTTCTGCATCTCTTAAAGCCAGTCCCTATGCTGTCCCTTGCGCCAGACCTGGTGTCTTC
CCCAGTAGCCAGGTCATTTTACCGCTTGCTCAAACTGTGGAACATGAGGAGTTTCTTGAG
GTTGTTCGGCTAGAGGGTCATGCTTTCTCTCCAGAGGACATAGCTTTATCGCGGGATATG
TATTTGTTACAGCTATGCAGTGGAGTTGAAGAGAATGCCACAGGTGCCTGTGCTCAGCTT
GTTTTTGCACATATTGATGAATCTTTTGGTGATGATGCTCCATTGCTTCCATCTGGTTTC
TCTGTCATTCCACTGGAGCCTAAATCAGATTCTCCTAGTGCTGCTCGGACTTTGGATTTA
GCTTCAACTCTTGAAGCTAGAACTGGTGGGACACGGCTAGCTGGTGAAGTTGAAGGACGC
AGTTACAACCATCGTTCAGTCTTGACAATTGCATTCCAGTTTGCTTTTGAGAATCACTAT
CGAGAAAATGTAGCTGCTATGGCTCGCCAATATGTACGAAGCATTGTAGGCTCTGTTCAG
AGAGTTGCTATGGCTATTGCACCCTCTCGACTCTGCTCTCAGCTGACACCTAAATCCTTC
CCTGGCTCACCAGAAGCTGTCACTTTGGCGAGATGGATTTGCAGGAGCTATAAGAATCAT
ACTGGTGGAGAATTGCTACAGGTGGAGTCTCAAGCTGCCGGTGATGCTGTTCTGAAGCAA
CTATGGCATCACACTGATTCAATAATGTGCTGCTCCGTCAAAATGAATGATTCTGCAGTT
TTTTCATTTTCAAACCAAGCCGGACTTGACATGCTTGAAACCACTCTAATAGCTCTTCAG
GATATAATGCTCGATAAGATCCTAGATGAAGCTGGTCGAAAGGTCCTCCTTTCAGAGTTT
CCCAAGATTATGCAGCAGGGCTTTGCCTATCTGCCGGCAGGGCTATGTGTATCGAGCATG
GGGAGGCCAGTGTCGTATGAGCAAGCTGTTGCATGGAAGGTCCTTAATGATGACAACTCC
AGTCACTGCCTAGCTTTCATGTTCACAAACTGGTCTTTTATTTAA