Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400054004
CDS Infomation

pacid=37433488 polypeptide=PGSC0003DMP400036374 locus=PGSC0003DMG400020953 ID=PGSC0003DMT400054004.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTCAATACTAAGGCGTAGGAAGGGCACAGAAAACAAGAAAACAGAGCCGGAGTATGAA
GAATTTAAGGAGAAGAAGAGTAATGGAAGTTTGAGGAAGAGAAAGGGGAGATGGAGTTGT
GTGGATGGTTGCTGTTGGTTTGTTGGTTGTATATGTTGTATATGGTGGTTATTGTTGTTT
CTTTATAACGCAATGCCGGCATCTTTTCCACAGTATGTGACGGAGGCGATAACGGGGCCA
TTGCCGGATCCACCAGGAGTCAAATTGGCTAAGGAAGGGTTAAGAGCTAAGCATCCAGTG
GTATTTGTACCTGGGATTGTCACTGGTGGACTTGAGTTGTGGGAAGGACATCAATGTGCT
GAAGGTTTGTTTAGGAAGAGACTATGGGGTGGTACTTTTGGTGAATTGTACAAAAGACCT
CTTTGCTGGGTGGAACATATGTCACTTGATAATGAAACTGGATTGGATCCTTCTGGTATA
AGGATTAGACCTGTCTCTGGGCTTGTAGCAGCTGATTACTTTGCTCCAGGTTATTTTGTT
TGGGCTGTTTTAATTGCTAATTTGGCTCGCATTGGATATGAGGAGAAAAACATGTATATG
GCTGCTTATGATTGGAGGATCTCATTTCAGAACACTGAGGTGCGAGATCAAACTCTAAGC
AGGATTAAAAGTAACATAGAACTCATGGTGGCTTCGAGTGGTGGGAAAAAGGTGGTTATA
ATTCCGCACTCAATGGGTGTTCTATACTTCTTGCATTTCATGAAATGGGTAGAGGCGCCA
GCTCCAATGGGTGGAGGAGGTGGATCAGATTGGTGTGCTAAACATTTAAAAGCAGTAATG
AACATTGGAGGACCCTTTTTGGGTGTCCCGAAAGCAGTCTCAGGTTTATTCTCAGCTGAA
GCCAAGGATATTGCTGCTGCCAGGTCTATGGCCCCGAGTTTCTTAGAAAATGAAATGTTC
AACTTTCAAACTTTACAGCATGTAATGCGAATGACTCGTACATGGGATTCAACAATGTCA
ATGATACCTAAAGGTGGGGACACAATCTGGGGTGGACTGGATTGGTCCCCTGAAGAAGGC
CATGAGTGTAATGAAAAGAAGCCAAAGAACAATAGCACCCAGACATCAGAGAATGACAGG
ACAAGAAAGTCAGCTAATGCTACTCGTGTGAAGTATGGAAGATTAATATCATTCGGGAAG
CATGTAGCTGATTTGCACTCATCAGAGATTGAGAGGATTGACTTCAGAGATGCTCTTAAA
GGTAAAAGTCATGCCAATTCCACTTGCCGTGATGTGTGGACTGAGTACCATGATATGGGT
ATTGGAGGTGTCAAAGCTGTTGCAGATTACAAAGTTTACACAGCTGGATCTGTTTTGGAT
CTTCTTCATTTTGTTGCACCAAAGTTGATGAAGCGTGGTAGTGCTCATTTTTCATATGGA
ATTGCTGATGATCTGGATGACAAAAAATATGAACACTACAAATATTGGTCAAATCCCCTG
GAAACAAAATTACCCAATGCACCAGGGATGGAGATCTTCTCAATGTATGGAGTTGGAATT
CCAACTGAAAGAGCCTATGTATACAAACTAAGTCCTGGTGGAGATTGCTATATTCCTTTC
CAGATAGATACTTCGGCTGAGGGTGGAAGCGAAAGCCCTTGCTTGAAAGGCGGTGTCTTT
CATATTGATGGAGATGAGACTGTACCTATTCTAAGTGCAGGTTACATGTGTGTGAAAGGG
TGGAGAGGAAAGACCCGATTTAATCCATCAGGCATCCGTACATTTATAAGAGAGTACAAT
CACGCCCCTCCAGCTAATCTTTTAGAGGGCAGGGGAACACAAAGTGGTGCTCATGTTGAT
ATAATGGGAAATTTTGCACTTATTGAAGATATCATTAGAGTAGCTGCTGGGGCTACTGGA
GAAGACCTGGGAGGAGATCAAGTGTACTCGGGTATTTTCAAGTGGTCTGAAAGGATTAAA
CTGAAGCTTTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400036374
PEP Infomation

pacid=37433488 transcript=PGSC0003DMT400054004 locus=PGSC0003DMG400020953 ID=PGSC0003DMT400054004.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MSILRRRKGTENKKTEPEYEEFKEKKSNGSLRKRKGRWSCVDGCCWFVGCICCIWWLLLF
LYNAMPASFPQYVTEAITGPLPDPPGVKLAKEGLRAKHPVVFVPGIVTGGLELWEGHQCA
EGLFRKRLWGGTFGELYKRPLCWVEHMSLDNETGLDPSGIRIRPVSGLVAADYFAPGYFV
WAVLIANLARIGYEEKNMYMAAYDWRISFQNTEVRDQTLSRIKSNIELMVASSGGKKVVI
IPHSMGVLYFLHFMKWVEAPAPMGGGGGSDWCAKHLKAVMNIGGPFLGVPKAVSGLFSAE
AKDIAAARSMAPSFLENEMFNFQTLQHVMRMTRTWDSTMSMIPKGGDTIWGGLDWSPEEG
HECNEKKPKNNSTQTSENDRTRKSANATRVKYGRLISFGKHVADLHSSEIERIDFRDALK
GKSHANSTCRDVWTEYHDMGIGGVKAVADYKVYTAGSVLDLLHFVAPKLMKRGSAHFSYG
IADDLDDKKYEHYKYWSNPLETKLPNAPGMEIFSMYGVGIPTERAYVYKLSPGGDCYIPF
QIDTSAEGGSESPCLKGGVFHIDGDETVPILSAGYMCVKGWRGKTRFNPSGIRTFIREYN
HAPPANLLEGRGTQSGAHVDIMGNFALIEDIIRVAAGATGEDLGGDQVYSGIFKWSERIK
LKL*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400054004
Transcript Infomation

pacid=37433488 locus=PGSC0003DMG400020953 ID=PGSC0003DMT400054004.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTCAATACTAAGGCGTAGGAAGGGCACAGAAAACAAGAAAACAGAGCCGGAGTATGAA
GAATTTAAGGAGAAGAAGAGTAATGGAAGTTTGAGGAAGAGAAAGGGGAGATGGAGTTGT
GTGGATGGTTGCTGTTGGTTTGTTGGTTGTATATGTTGTATATGGTGGTTATTGTTGTTT
CTTTATAACGCAATGCCGGCATCTTTTCCACAGTATGTGACGGAGGCGATAACGGGGCCA
TTGCCGGATCCACCAGGAGTCAAATTGGCTAAGGAAGGGTTAAGAGCTAAGCATCCAGTG
GTATTTGTACCTGGGATTGTCACTGGTGGACTTGAGTTGTGGGAAGGACATCAATGTGCT
GAAGGTTTGTTTAGGAAGAGACTATGGGGTGGTACTTTTGGTGAATTGTACAAAAGACCT
CTTTGCTGGGTGGAACATATGTCACTTGATAATGAAACTGGATTGGATCCTTCTGGTATA
AGGATTAGACCTGTCTCTGGGCTTGTAGCAGCTGATTACTTTGCTCCAGGTTATTTTGTT
TGGGCTGTTTTAATTGCTAATTTGGCTCGCATTGGATATGAGGAGAAAAACATGTATATG
GCTGCTTATGATTGGAGGATCTCATTTCAGAACACTGAGGTGCGAGATCAAACTCTAAGC
AGGATTAAAAGTAACATAGAACTCATGGTGGCTTCGAGTGGTGGGAAAAAGGTGGTTATA
ATTCCGCACTCAATGGGTGTTCTATACTTCTTGCATTTCATGAAATGGGTAGAGGCGCCA
GCTCCAATGGGTGGAGGAGGTGGATCAGATTGGTGTGCTAAACATTTAAAAGCAGTAATG
AACATTGGAGGACCCTTTTTGGGTGTCCCGAAAGCAGTCTCAGGTTTATTCTCAGCTGAA
GCCAAGGATATTGCTGCTGCCAGGTCTATGGCCCCGAGTTTCTTAGAAAATGAAATGTTC
AACTTTCAAACTTTACAGCATGTAATGCGAATGACTCGTACATGGGATTCAACAATGTCA
ATGATACCTAAAGGTGGGGACACAATCTGGGGTGGACTGGATTGGTCCCCTGAAGAAGGC
CATGAGTGTAATGAAAAGAAGCCAAAGAACAATAGCACCCAGACATCAGAGAATGACAGG
ACAAGAAAGTCAGCTAATGCTACTCGTGTGAAGTATGGAAGATTAATATCATTCGGGAAG
CATGTAGCTGATTTGCACTCATCAGAGATTGAGAGGATTGACTTCAGAGATGCTCTTAAA
GGTAAAAGTCATGCCAATTCCACTTGCCGTGATGTGTGGACTGAGTACCATGATATGGGT
ATTGGAGGTGTCAAAGCTGTTGCAGATTACAAAGTTTACACAGCTGGATCTGTTTTGGAT
CTTCTTCATTTTGTTGCACCAAAGTTGATGAAGCGTGGTAGTGCTCATTTTTCATATGGA
ATTGCTGATGATCTGGATGACAAAAAATATGAACACTACAAATATTGGTCAAATCCCCTG
GAAACAAAATTACCCAATGCACCAGGGATGGAGATCTTCTCAATGTATGGAGTTGGAATT
CCAACTGAAAGAGCCTATGTATACAAACTAAGTCCTGGTGGAGATTGCTATATTCCTTTC
CAGATAGATACTTCGGCTGAGGGTGGAAGCGAAAGCCCTTGCTTGAAAGGCGGTGTCTTT
CATATTGATGGAGATGAGACTGTACCTATTCTAAGTGCAGGTTACATGTGTGTGAAAGGG
TGGAGAGGAAAGACCCGATTTAATCCATCAGGCATCCGTACATTTATAAGAGAGTACAAT
CACGCCCCTCCAGCTAATCTTTTAGAGGGCAGGGGAACACAAAGTGGTGCTCATGTTGAT
ATAATGGGAAATTTTGCACTTATTGAAGATATCATTAGAGTAGCTGCTGGGGCTACTGGA
GAAGACCTGGGAGGAGATCAAGTGTACTCGGGTATTTTCAAGTGGTCTGAAAGGATTAAA
CTGAAGCTTTAG