Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400053918
CDS Infomation

pacid=37459245 polypeptide=PGSC0003DMP400036329 locus=PGSC0003DMG400020918 ID=PGSC0003DMT400053918.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGCCAATCTTCCTCAGCTCACGGCTTCTCCCCCACCGATTCCAATTATCCCCACCAC
CGTTGTTCCGGCACCGGCCATTCCCAATCGGAATTTTTCTACCCTACACTTTCCGAAGAA
GACGATTTCCCCATTTCACAACCCTGTGAAAACCGAGATTACACTGATGGTCTTCCTGAC
GAATGTTTAGCCCTAATTTTCCAGTCCTTGAGCTCCGGTGATCGGAAAAGATCTTCCCTT
GTCTGCCGGAGATGGCTTCTGGTTGAAGGGGTTAGCCGTCACCGGCTTTCTCTCAACGCA
AAAGCTGAAATCATTCCGGATATACCCACCATCTTCTCTCGTTTCGATTCCGTCACCAAA
CTCGCTCTCCGATGTGACCGAAGATCGGTTAGCATCAACGATGAAGCTTTGATCCTCATC
TCCCACCGATGCGTTAACCTAACGCGCCTAAAGCTTCGTGGTTGCCGAGATATCACCGAT
TTGGGAATGGCTTGTTTGGCAAAGAATTGTGAGAAATTGAAGAAATTCTCTTGTGGGTCT
TGTATGTTTGGAGCTGAAGGTATGAATGCTTTGCTTATTAACAGCATTTCACTCGAAGAA
CTCTCTGTTAAACGTTTACGGTGTATGAATCATACTGTATCTGTTGAACCGATTAGCATT
GGATCTAATGCTGCTTGTTCGCTTAAATCTATATGTTTGAAAGAGCTTTATAATGGACAA
TGTTTTGGACCTTTGATCATGGGATCGAAGAATTTGAAGACGTTGAAATTGTTGCGATGT
TTGGGTGATTGGGATAGAGTCTTGGAGACGATTGCAAGTAGGGAGAATCATTTAGTTGAG
ATTCATTTAGAGAGGGTTCAAGTGAGTGACATTGGACTCAGGGCGATATCCAAGTTTTCG
GACTTGGAGATTCTTCATTTGGTGAAAGCTCCTGAATGTACAGATGCTGGAGTTGTTGAT
GTGGCTAGACATTGTAAGTTGTTGAGGAAGGTTCACATTGATGGATGGAGGACGAATCGA
ATAGGTGATGTTGGTTTGGGTGCCATCGGCGAATATAGTGTAAACCTCAAGGAATTGGTA
ATTATGGGTTTGAATCCTACGGTGACTAGTTTATTAGCCATTGCTTCTAATTGTCAAAAG
TTAGAAAGATTAGCACTTTGTGGTAGTGAGAGTATTGGGGATGCTGAAGTAACTTGTATT
GCTACAAAATGTATGGCTTTGAAGAAGCTTTGTATTAAGGGATGTGAGGTAACAGATGAA
GGGATTGTGTCTTTCGCGTGGGGATGTCCTAATTTGGTGAAAATTAAGGTTAAGAAGTGC
AAGAACGTAACTGGTGAAGTTGCAGATTTGTTGAGATCAAGAAGGGGATCTTTGACGGTG
AATCTTGATGTTGGGGAAGTTGATGTGGAGGTTGTGGATGGTAGCGCTAGTGATGGTGGA
GCATTAGAAGAAGGCATAGAGTTTCCGCCGATTGCAAGAACTGTTCCCATCCTTGGTGCT
GGTGGTGTCGTTGATATTGATACCCCATCGACCGGTAATTTTGGTCGATCATCATCATCT
ACTTCAAGGATTGGCTTTCTTGGAGGAAGGGGCTTCGTTGCTTGCACTTTCCGTAGGTGG
TCAAATGGTAACGCCAATGAGAACTTATGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400036329
PEP Infomation

pacid=37459245 transcript=PGSC0003DMT400053918 locus=PGSC0003DMG400020918 ID=PGSC0003DMT400053918.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MGQSSSAHGFSPTDSNYPHHRCSGTGHSQSEFFYPTLSEEDDFPISQPCENRDYTDGLPD
ECLALIFQSLSSGDRKRSSLVCRRWLLVEGVSRHRLSLNAKAEIIPDIPTIFSRFDSVTK
LALRCDRRSVSINDEALILISHRCVNLTRLKLRGCRDITDLGMACLAKNCEKLKKFSCGS
CMFGAEGMNALLINSISLEELSVKRLRCMNHTVSVEPISIGSNAACSLKSICLKELYNGQ
CFGPLIMGSKNLKTLKLLRCLGDWDRVLETIASRENHLVEIHLERVQVSDIGLRAISKFS
DLEILHLVKAPECTDAGVVDVARHCKLLRKVHIDGWRTNRIGDVGLGAIGEYSVNLKELV
IMGLNPTVTSLLAIASNCQKLERLALCGSESIGDAEVTCIATKCMALKKLCIKGCEVTDE
GIVSFAWGCPNLVKIKVKKCKNVTGEVADLLRSRRGSLTVNLDVGEVDVEVVDGSASDGG
ALEEGIEFPPIARTVPILGAGGVVDIDTPSTGNFGRSSSSTSRIGFLGGRGFVACTFRRW
SNGNANENL*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400053918
Transcript Infomation

pacid=37459245 locus=PGSC0003DMG400020918 ID=PGSC0003DMT400053918.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGCCAATCTTCCTCAGCTCACGGCTTCTCCCCCACCGATTCCAATTATCCCCACCAC
CGTTGTTCCGGCACCGGCCATTCCCAATCGGAATTTTTCTACCCTACACTTTCCGAAGAA
GACGATTTCCCCATTTCACAACCCTGTGAAAACCGAGATTACACTGATGGTCTTCCTGAC
GAATGTTTAGCCCTAATTTTCCAGTCCTTGAGCTCCGGTGATCGGAAAAGATCTTCCCTT
GTCTGCCGGAGATGGCTTCTGGTTGAAGGGGTTAGCCGTCACCGGCTTTCTCTCAACGCA
AAAGCTGAAATCATTCCGGATATACCCACCATCTTCTCTCGTTTCGATTCCGTCACCAAA
CTCGCTCTCCGATGTGACCGAAGATCGGTTAGCATCAACGATGAAGCTTTGATCCTCATC
TCCCACCGATGCGTTAACCTAACGCGCCTAAAGCTTCGTGGTTGCCGAGATATCACCGAT
TTGGGAATGGCTTGTTTGGCAAAGAATTGTGAGAAATTGAAGAAATTCTCTTGTGGGTCT
TGTATGTTTGGAGCTGAAGGTATGAATGCTTTGCTTATTAACAGCATTTCACTCGAAGAA
CTCTCTGTTAAACGTTTACGGTGTATGAATCATACTGTATCTGTTGAACCGATTAGCATT
GGATCTAATGCTGCTTGTTCGCTTAAATCTATATGTTTGAAAGAGCTTTATAATGGACAA
TGTTTTGGACCTTTGATCATGGGATCGAAGAATTTGAAGACGTTGAAATTGTTGCGATGT
TTGGGTGATTGGGATAGAGTCTTGGAGACGATTGCAAGTAGGGAGAATCATTTAGTTGAG
ATTCATTTAGAGAGGGTTCAAGTGAGTGACATTGGACTCAGGGCGATATCCAAGTTTTCG
GACTTGGAGATTCTTCATTTGGTGAAAGCTCCTGAATGTACAGATGCTGGAGTTGTTGAT
GTGGCTAGACATTGTAAGTTGTTGAGGAAGGTTCACATTGATGGATGGAGGACGAATCGA
ATAGGTGATGTTGGTTTGGGTGCCATCGGCGAATATAGTGTAAACCTCAAGGAATTGGTA
ATTATGGGTTTGAATCCTACGGTGACTAGTTTATTAGCCATTGCTTCTAATTGTCAAAAG
TTAGAAAGATTAGCACTTTGTGGTAGTGAGAGTATTGGGGATGCTGAAGTAACTTGTATT
GCTACAAAATGTATGGCTTTGAAGAAGCTTTGTATTAAGGGATGTGAGGTAACAGATGAA
GGGATTGTGTCTTTCGCGTGGGGATGTCCTAATTTGGTGAAAATTAAGGTTAAGAAGTGC
AAGAACGTAACTGGTGAAGTTGCAGATTTGTTGAGATCAAGAAGGGGATCTTTGACGGTG
AATCTTGATGTTGGGGAAGTTGATGTGGAGGTTGTGGATGGTAGCGCTAGTGATGGTGGA
GCATTAGAAGAAGGCATAGAGTTTCCGCCGATTGCAAGAACTGTTCCCATCCTTGGTGCT
GGTGGTGTCGTTGATATTGATACCCCATCGACCGGTAATTTTGGTCGATCATCATCATCT
ACTTCAAGGATTGGCTTTCTTGGAGGAAGGGGCTTCGTTGCTTGCACTTTCCGTAGGTGG
TCAAATGGTAACGCCAATGAGAACTTATGA